XLOC_000986 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000986
Unique NameXLOC_000986
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000012:62297..121597-

Legend: gene
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>XLOC_000986 ID=XLOC_000986|Name=XLOC_000986|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=59301bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:62297..121597- (Clytia hemisphaerica)
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GTCAGCTTTCGTCAATGTTCTTATTTTAAGGGCAACTTTAGGTCACTACC TTCAGGACGATGAATGTGTATAAAACTTTTTAATGGTCATTTGCTAAATA TATGAAGGGTTAAATTGACAGCTTCAAGTTGGAAGGGGCCATCACTGTTT GTCATCAGAATCCATATTAAGAAACAATTTGTTTTAAGCCTAAAGACTTA AAAATGGCCCTCAAGGAGAAAGGTGTTTACTTGCAAGGGTCAATGTTTAC ATAGATGTCCATTGGGTCACTTTTGGCTATTGGCCAATTGAAAAAGTCTA TCCTATTGAGCTTTTTGAAAGGATCATGTTTCGCTTATGGTATAACGTTT CAACTTTTTGTTTGTTTACAATCGGATACCAAAAGATTTGGCATCGTGTC AATCCTTAGAAAATATTATTCCACAATGTGAAAAAATAGAAACATATTAT AGACTTTAAAGTCGATAAGTTTTTATGGCCTCGTCCAATAGAAGGTTTAA TATAATGCAGCTTAAGATCGAGCTTGTCCTTAGCTTGTCCTTGATTCTAT TCGGTATCTTATTGCTAGAAACTTCATTATTTTTCTAGTCTTTACATGAA ATTAGCTCGTTCGACTTTCAATCATTTTTGACTGCAGCAAAAATTTTCCA TATTTTAGTATTTTGTGTCAGTTTTCTTAAATTTGACATTCGAAAAGATT TATGCGTTATCGGCTATCAATATAGGCTTATGCATATCCAAGGGCTTAGC CTCTAAATAAAGACTTTAAATGTATGGAATTCCATATCGTGCGAGTGTGA CCTTCATCGTATATTTCAGTACATCTCAGTCTTCCCATAGACTTTATTTA TCAGACCAAGTTCAAAGTCTAAAATTCCTTTACTATTGCACATGTATTCA GGGCAAAACCGGAGAGGTCTTGTGGCGACACCGTTACAAAGAAACAGTGT 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ATATCCTTACATAATGATTTATCTAAAATAAGGTTATTAAGAGCCGGTTT AAAAAGGTCCGGTAGTTGAAAGGGTATCAAACTTGTACATGAAAGCTAAC AATTTGACTCAAAAGTATCGATGAGAACGACTTGTGTACTGTTAAGTTAA GGTATTTCTTCATCTGTTGCTACAGTAGACGTTTGCACAGTTTTCAAATT AAAAGACTGCATACCTCAAACAGTCATACAGGGTGTAGATAGACGGTTGC CGGGGAGAAGTGCAAAGTGATGCAATTTCGTCCCATTTTATTAGTTGTAA TCCTGTTATCAACTTAATTCGTTGATAAAAGTTTTGATGAGAAATACCTT TGATTTATAGTTAGCACTCATTCTATTTATCCTGTCTAATGATAGTTTGC CATCTTTAAAGTATACCGCGATAGTGGTTTAGTATATGCCATCATCTCCT TTGTCCATAACCTAAGATTGTACAAAGAATATCTTGGAAGCGTGGAACCA TCCATTGTGTAGTTTAGAATGATTTGCATTTGAAATCTCAGATTATAGGT ATTCCTCCCCTAAGCGTTGTCTATTAATTAGAACATGTACCTACTTACAA TGGAGTTTCTTCAACTCGAGCCTCTATAACTCGAATGTCTCCTTAACTCG AACGAGTTTTATGGTCCTTTCAGTTAACAATGCCTTAAAAACCTTATGTA CTCCATAACTCGAAATTTGTGTTTCACTTTGCGTGTTCGAGTTATAGAGA CTCAACTGTAGTATCTAGACAGCATGACCAAAATATGACAAAGACGGTGT CACACAATTAGTGCAACTGTATTATTCAAGGTTATTAAAAAATTACAATC ATTTTGCATGTAAAATATCCGGTGATTTCCAACGCAATTCACACTCATTT CTGCTCTTATTACGATGATTCTGCGTGACGGATGTAAGGGTTGTCATTTT TTAGACATGGCAGTTTTCCAGTGAGAATGAAGTGGTCGCTTCCAAAGCCC GGAAGATTTTAATATCCGCTTGTGTTTTCAATCACAAATTAAATCAAATA GTGTCTATTTCATAAAGAGAAAGGCGGCTTCTATTTTGTAGGTTACTTGT CCCTTTGTCTCCCGTTTTTCTTATTTTGGCGTATTTTTGTTTAGATTGTA AATCGTTTTGGAAGTTTTTTTCTCTCGCCACTTCAGTCGACACTCGATAA CTTGATTTAACTCTCAACTTGTCCTGCTCGTCACCATTTAATTAGATCTA GAAGCGATTACCTTTTTCTGTTAGTTAGATAACTCATTAATTCGTTCAAT CTCCTTGTCAAAGTAGAAAAAATCGCGCGACGTCATCTTTGTGTGACGTC ATGTTTTTGTTTTTCGCACCTTTTGAGAGAGCTTTGATGACACCATTTTG TTTTTGAACAACTTCAAAAGAAGTTATCAACCAACCAATCAATCAATCAA TCAATCAATTTCATCCTAATATTTTTTCTTCTCGGTCTTTCTCTCTTCAC AATTTTCAAATAATTATTTTTTTGGAATTCTCTTTTTCTCCAGAGACAAT TCAAGACAATTGAAGAGGCGTTACCGACAACTGATGTGCTATACATGACA CGAATTCAAAGAGAAAGATTTGCAGACCAACAAGAATACGAGAAGGTAAT TATCCCTCTCATCACGACACCTGGCCTCATCATTTAAAAATATTACCGTC CTTTTCTCGCGAATTTTCCGTCTCCTCAGAATATTCAAGGGGAACTGCGT CAATTCACATTCACACCTTAATGTTTATCATCCATTCCGCGCACAACAAC ATGTTTCATAATGCTCTAAAGGGATGTGGCGAATATGATGATCTACCCTG GCTAGCTATTCAGTCGAAACATTCAAGACCGCGTTTTTTCTTAGAAGCAA 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TGGTAGTCGCCACCTGATATTAGAGAAGTCGCTCCTTCGATGTATTCATC GCAACTTTGGCGATAGATATATTTTTTAACTTTGGATTTTTGCCCCCTTT CCGGGCAGGTTCTTGTAACTAACACAGCCCCCTGGGAAATATTATTGAAA CATTTTCATTAGCATTTTATCTGTTTAAGATTTCTTTTCTTTTCATCTAA TCAACTCGAGAAATTGACATTTTAGTAACCAGATTAAACCCTTGCTGGGC CAATTGAATTTCACTGATCCCCTTTTTCATGCTACACCACCTAATGTTTG CCAAAATTGCCAAAATTGTCGAAAGAAATACAGTAACAAGATCAATGAAT CCATTTTGATTAAAAATGCACCTTCGAACACTTAAGGGTGGCTTGAAAGA AACTTTTTTAAATGAATATTAGTTCGAAATGGTAAAAAATTCACATTGTA ACTCAATATGAAATACGGAATTGGCTTCTACATAAACATGCAATTTATTT ACGACGATAGAGGGGGAGAAATTTCCAACCGTGAATCTTTCGTTATGCTG TCAAACAGCCATTTATCAAAACAAGAAAAATATGATCCTTTTAACCGCGC ACTCAACCATCTCGCAAATCATTCCATTTATTACAAATATCAACAGTTTT TATCCCACATAAAATTTAAACCTTTTGTTTACCACCTTGTTGCAAAAGTG AGGCGTGATTTTTCGCGAATTTTTACGAAATTTAAGCAACGGGAAGACTA TAAAATTCAAATTTTGGCTAAAACTCCAAAGACAATATAAGAAATTAAGC GGGAAAAAGCCCATTCGCGAAATTTAATCTATCAACGCGATATTATTTGA AAAAGTGCCCGCAAAAAAAATGTATTCTTTGAAGTAAATTGGAAATGAAT CCTAAAAGAAATGTTTTCAATCAAATCATTCGAGTTGAGGCTCAAGGTCT CAAAATTCAGAACAACCGGGCTCCGCCAAAAAAATACAGACTTTTATAGA AAATGGCGTTCGCTTAACTGTTTTTTTTTTTCAATTTTTAGGTGCATGGT TATTTCGTGTTGACACCGAAAATGTTGACGAAAGCGAAGAACAAGATGAT CGTTATGCACCCATTCCCAAGAGTCAACGAAATCAGGTATGAAACATCCT TCAAACTTCCCTCTCAGACGAAGTATGTACTAAAAGAAACTTTCCCGACT CAAAGTTAAGCAAAATTTTGGAAAATTTTGGAGAATATGAGTTAATGTTT ACGTTTTGTGTAAATTTCAAGAAGCTAGGGGTTCTTTTGTTCCGATTCTA AATAAGCAGGACTCTCTTTATCCGTGTAACATCATTTTCGATGCTCAGAT CTTTAAAACACTTTGTAGTTTTGTGGTCGTTTGAGCCTGATGTATTGTGT ATGGCATTTAAGATAAATACTATACGACAGAACGTTTTCTCTTTTCAGTA CTGAAGTGGATTGCGACCCAAGGGCTGCTTATTTCCGTCAAATGGAATAC GGGATGTTTGTTCGAATGGCTTTACTTTCCATGTTGACTGGTCGATTTTA ATGGACAGAGAAAACCGAAAATTTACGTAATCTTTGTCATAAAAGAAAAC GTCACAAAAAGCGAAAATATTGTAGCCATCTGAGCACTAATTTTATAGCT CGACAAAAGAATATATTATAATGGATTGTAGGGCAATTTTGTAGTCATTA ATTTTTAAGTCGGACAATTTTCGGTCAAAGAATTTATCACTTTCCCAAAA GAGACATTGCAAATTCGTTTCTAATTATTTCGTTAATTGGTATTGTCGAC AGTAATTAGATGTTTGTGATATTATTTTTGCGGTTCATATTTGAGATTTT TTTATTTTTGTAGCTTTTTTTCCAGATCCCTTTTTTAGTTTTATATATTT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
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TCONS_00001866TCONS_00001866Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
CAD like proteinTCONS_00001872-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000012supercontigsc0000012:62297..121597 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CADPREDICTED: CAD protein isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
115.19 116.93 30.33 19.54 352.91 262.06 65.48 68.81 33.41 55.49 69.79 60.06 58.77 71.71 54.63 81.64 37.12 40.53 17.95 18.05 48.11 40.83 123.69 114.42 56.67 52.91 23.35 29.23 107.42 119.44