XLOC_022682 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_022682
Unique NameXLOC_022682
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001757:24880..36938-

Legend: gene
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>XLOC_022682 ID=XLOC_022682|Name=XLOC_022682|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12059bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001757:24880..36938- (Clytia hemisphaerica)
CGGAAATGATTTCTATATACAACATTGAAAGCTAATAACATACGATTTCA ATGTGGATCATTGAAATCGTCCAAGGTTTATATTACGATGGGATTTCAAT GCAACGCATTGAAACTTTTACTTTTGATGGAGTACATTGAAACTTGGCTG TCAGTTTGAAATTTGCCAGCACTAGCCTGTTCGATGCAAAGTTCTAGCCT GTGGAAGATAAGAGTGAGTGACAGACAGGACAGAGCAGACGGGAATGAAG GAACAAAGACTCACCCTGCTCAATAATCATGTAATCATAATGTAATGTTG GAAAGACTTCAGATGATGGCATTCACTGCAAATGCATATTAATTTGGATA TACTTTTAATTCGGAAATATTCTCATTCTGTAACTCAGGTTTGTTATCTT TGTATTTTAATGATCAGCCAGGTTGTTTGAACGACCCTGCCGATGGTGCA CCAGCCTCGATGGCACCGGGCATAGTAGTGGATGTCTGGTGTAGGATAAG AATACTTTTTACCATCCAACAACCCCGACACCGGACTTATGGAAGTCAGA AGTCCAAACAAAGTTTGATGTGTCCGGTGCACATTAATTTTTTTCCCAAC ACATGTCTGGTGCCTAGAGCTCCCTGGCATTTAACAATTTTAACGGACAC CGGACTAGCGGACTCCGGTGTAGCAAAAAGATACTTTTTGACACCAGACA TAGGTGCCGTGGTATAGTGGTAGTCAACCTTGGCTTCTGTGCAGGGGGCC AGGGTTCGATTCCCACTCACTGCAGTTCACTTGGCAAGTGAACGTTCCTT AGCCCGGATTAACCCCTATGTGAAGGGAATTGGAGTCAGTTCAAGGTGCT GATGGGACGCTCATTAGTAGGCGTCTATAGTTGTGAGAATAGGCCTCTAA AGCCTCCCTGCAACTCAACCAAATAGAAAATAGCCTCCACTGATGCAAGT 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GACTTTCATCGAAAAGATCTATCACTCCAAAACTAAATACAAACAAGTAT GGTTAATTTTGTAAGATGAATATAAAGTATTATATTCAAAATAATATGTT TTCAATATAATGATACAAGGCACAAGAAATTTTTATTTTAGTACATTTAT TATTCAATATTCGTTTGTTGCTGATTTATGATCTTCAGGAGAATGACAAT ATTTGTGGTGGTTCATGGACTGCTGCCAAGAATGTTGGAAGAAAGAAGAA ATCACTTGACGAGACAGGGCTGGAAGTAGCCACGTGTCGACATGTAATCG CACAGAAAGCAATAAATATGAAACAAGGTGATTTCTGAATAAAAATAACT GTTCTATTTTTATCGTTTTCACTTTTTGTTTCGTATATTGGTATCGCTTT ACTGAAAAATCATATTTTTATCAATATTTATTTTTTTTAAAAGGTGAACA ATATGGGTATGCACTTTATCTCATGAAACATTACATGGTTAAGTGGAAAG TAGAATATTGCTGGGCAGATGTCATGTGTAAGTTGTGGAAGTTTGCTCAA AGGATTGATCCGGATATATGTAAATTAATGAAGCCAGCCTTATCAACAAT GCATGCTAAAGGACATAGCATACAATGCCAGGTTTTTATTTTCATTTTAT GATATATTGTATTTTACATACTAACTAACATGAAAGTGAAGAGTCTGTAC TCATAAAGAAGGGTTTGTACGACTCCCTTATTAAATATTTATTCAAATAG TTTCAAAAATATTTCTTCTTTAAAACCTTCAATAAGAAAATTTTGAATAT TCTTAAAAGAAAGTGAGCAAAATTTCCCAAAAACCTACTTCGGTGAAAAA CATTGTTTAGGTTAACATTCTTTTTTCTTGCTTTTTGTAGGTAAATTGGG ATGGGTTATGGATAGAAGGAACAGGCAGGTCGACAGGAGAAGAAACTGAG CAATTCTTTAGTTTAGATGTCGAAATACAACCAAATATCAATTTCCTGAA AGTAAGTACCGGGTGAACCACGAAAAAGTATGAGAGTTTGGCAACGTGGT GCGGCCAGGACAGTGTGATTTTTGGAGAAATTAAGTACTTTCATTGATAT TTTTCTGAATAGAATTGCTCAAATTTAATACCCTCTTTTTCACGTTGTTT GATGCTTTTGTAAAGTGTTGATTTTTACCTATTATTGCACATTCAGTCGT ACAATTAACGATTACATTAAGGGAATAAATTAATGCAAGAAATAATTAAA GCGGAACTAATTAATGCCAATTTAAATTTATGGGGTGTCATTCGCATTAA TTTATTCCGCATTTATCAATTCTTGAATTAAATTATTCTCTTAAGGTAAT CACGAGTAACAATGAGAAAACTGTAATTTGTCCGAGTTCGTAAGACGAAA GATTTACTATCCGCAAAATTTTAGTACAGCTAAAACGAGATTGAATGAAT GATGAAGCTAATACCAAATAAATATTTAAACTTTATAATATTTTTATTTT ATGCTATTAGGACGAGAGGAAACAATTACAGAGCATGCGATACATTGGAA TCGGATTAAAATTGAATCTCTAGTGCAAAGTCTTGTGAAAAATTCAAAGG GGTAACGCTTGTCAATGTAATTTCTTGATGTTCCAAATGATTTGTCGCCT TCTTATTCCCGACATCTTACTTTCATTTGATCATTTTTGATTGGTCAGCA ATCGGTAATTTTGGACTAACCTTCTTAAAAATATATATGTATATTCTATT ATTTGCGTACTCAGCCTTTTAAAACAAAAGAAACAACAATTAACTCTCCT GCACTTACCACAGGAAAAAAATGTTAAAAGTACAGGCCTGGGTTTGGTAT GGGAAAATGGAACAACCTTAGCCATTTTCCAGGCCTCAGTTTTTTTCGGG GCCGGAAAAGACCAGTTTCCAAGCCTGTGATTTTTGTTCAGGTTTAGGAA GTGGTCATTTGCGGCCGCGAAAAAAAACAAGGCCTGGGATTTTAACATTT TTTCCGAATACGGCACGCTCCTCAAATCTATTGTTAGATCTGTTCCAACA TATTTCATCTCTATATCATAAAGAATATTCCCTTTAATACTATAAATATT TGTTGCTCTCGATCTTAACTATCGTTTTGGCATAATTTATATCTATAATT TGGTTTTCAGGTAGAAAGAGAATGGGAAAATGCTCGGGAAGATTTTTCAA CTCATGCTAAAAAGACGAGAATCAATACAAACAACATGCCAGCTATCGTG GAAGATATCAAAGCTGCTGCACTTCCAGGTAACATATTTTTGGATATAAT TGAGTTCCCAGTTTGAATATAACTGAGTTATAATCCAATTTGAAGCACTC AAGGAAGATGAACAGTTCGTGTTGGTCTTTATGGATCTGAAGTCTCTAAA ATCGAATTCAATCAACTCGATACCAGCAAGTTCTTTACAAAATACGTGTG TAATGGGCTCGAAGGGTTCGATGAATTGAAAATTATTCCTGGAACATTAA AGGCAAAAGAATCTCTTTTGGAAAGATTGGCCAAAATTGCATATGTAGAT ATTGAACAAAGTATCTCCTTGACCATCACTGAAAGAATCATTCCGAGAAT TCAATCTGAAATCCAAAAGCACTTTTTTGATAAAGTCTTTTGGTCAGCGA CTTTGAAAAAGCGTGGAGGTATTAAACCGTTTAACAAACCCTCTTAAAAA CTAAAACTATTCTCAGAATTAGATCATATTTGAACCAAGAGCAGGCAGAC TTAATATTTAATAGTTTTATATTATCTACTTTTAAGTATTGCCCTCTCAT TTGGATATTTTGCAGTAAGATGACCCACAATCTTTTCAATGAACTCATTA CAGAGCCCTTAGGGCTAAACAAAATCTTCTCCATCTTAATTATGATGAGC TTCTGGTCAAAGCAAATTGAGTATCAATTCATACTCAAAATCTCCAACTC ATGCTAGTGGAAAATTGTAATAAGAGTGTCAACAATATTGGAAATAAACT AGGCTGGGACCATTTTGAAATTATCCAGCGAGAAAGCAGGGAGTGATGAG GATATGTTACTTTCATTTTAGATAAATGTAAAAGAAGATCCGTTTACCGT ATGCATAATTGGCAAGTGCACCAATGCTATCAAAAAGAATTTGGTCCTAC TTGAATGCACCAGAGGAAGTAAGATCAATGAAAATGAAAAACTTAAAATA TACCAAAGAAGTTTTCCGTGGATCTACAATCAAACCAACTAAAGGTTACA AGGTAAAACTTTAAGGAGTTACTTAAGATAACTTCCTTAAACAATTTATT ACTACGCCTCTATACGGTAAATTGGGAAACCTTCACTATCAGCCTATCAG TTCTACCGATTAAAGTGTTGGAATCTAACCTATAGGGAGATCGATTTTAG AGACGGGTTTATTCATTGTAATTCATTCAGTGTGTTCAGTGTTATTTCAT TTCGAAAATCTCAGTATTTTGGAAGAAGTACTTCTTTTTTTAAGCATCAA AGTCATTTATCATCTACAGTAAAACGTTTTTTACAGCAATGTTTTAAGAG CAGTGATTATTTTCTTTTTTTGATTTTTGAAGCCGAAGATAAAAGATTAC TCGCTGAACTGTACATGAAGATAAAACGATCTGAAGAAGAACTCGATCTG AAGAAGAACTCGATCTGCTGAAACGAGACATGAATAGATATTTGTCGTTT TATCGAACAAAAATTACTGAACTGGAATATATCATAGTAAGTATCAGAAT TTGTCTTGTGATAGGGGATGTATATCTTCTAAATTAATCTTGTTCAAGGT TACTTTTATTAAAAAAAGGGTAGTCTAACTTAAAGTCAAAGACGTGACTT TATGTCAATTGACGTCAAATTCCAAGTAGAAAGTGATGGATTTATCGATC TTTGAAACGTCAAATTACTCGAGTTACATCAAGAATTCGGTGATATCCGC TGAAAAGTCTTCTATATATTTTTTTGAGAGCTTTCGAATGGTATAAGTGT TTAGGCTTTAGCGACTTTGAATTTCACGTTTTCCTGGGGTTGGAAATTTA GCTTGGAAACCGCAAAAATCGTTGCTATGACGTCACTAGGGCCGCCAAGT TTTTGGCACCACTTTTAAATCATATCTTCTAATGGTGGATGACATCTGTT TGGTAGAATATTCACAATTTGAACCATTCGACCCTTATCGACTCTACTAA TCGTATGTAATTCATTTTTCCTCCTAATTTATATTTCCCCAGGAGACCGA ATCGAATAATGCAGTTGAAATTATTATGGCAAAAAGACGCTTGAGTTTTG CACAACATCAACTCGCTGACGGTGTTCAGTATTTTTCCACAATTTTTAAC GCCGGACATTCGATTCCGATAGAATTTCGAATTAATTTTGAAGACGATGA AAATCAACAAGTGGAAGAAGAAACTTTTGTTCCTCAAGAAGATTTGGTAA TTCCGCTGCTGAGTCATGATATGTTGAAAGACCTGGCAGTAGAGGTCTCT AGCAATTTCAACATAGATGATTGTTTGATGAGTATTGATGGAAATGTTAG TAGCCCTTCGATCTCAGTCAAGGAGCAATCGGTGGTCGAAACGGAAGCTC TGCATGTACCGTGATTTCACTTTAACTGGTTATTATGAGACGAGCTCAAA GTGTCACTGATAAAGTTTTAACTTTTGTCTTGATTTCAAATGAAATCTTA TGCATTCATCAGAGAAAGTAATGAAGATTTTTTTTTTTCGATTCCCACGC GAGCCCACCTAACGGTGCATGTGTTTATATGGTACCGGTTGAACACTTCG ATGAATTTATGAGAGAAATCTTTAAGGAACAATATGTGAATATTGGAGTC TTCACATGTCAATAACTTCTTTATTTTTACATAATATAGTAAATTCATCC AAACTTTCTGGTTTAGAACCTTTTGCAAATAATTATTTTGATCTTTTTGT GTGCGTATGACTTAATCCAGGTTTTTTAATCGATTTTTAGTAGAAAACAA GAATTTATTTAAATCTTGATTTATTTCTGTGCTCATTTTCTTTTTCGTAA GGAAACTTTTATAAGCATAATTAAGCTGAAACTTAAATCGATCATGACTG CTAGGCATACCTTTAAGCACAATTGCTAAAGTTTTGTGAAACGAAATGAA GAACACCGAAATTTGCCCTCACAAACGGGTGTTGCCTTTAGGAAAAATGA TGCAATCTAACATTTACATACCACAAGCATCCCCCAATAAGTTTTTCATG GTTTTTGTATTATGAATTTTTCAATTATTTTATACCCTGTACCGAAAATA CAGTAATTTTCTTTTAACATAATGGTGGACATAATATTTGATACAAATTT GCAAAGCACAAATAATTTGAATTTGCTGTAACTTATGGTTTGAAATATAT AGTTTTAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038015TCONS_00038015Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038014TCONS_00038014Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038013TCONS_00038013Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038012TCONS_00038012Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038011TCONS_00038011Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038010TCONS_00038010Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038009TCONS_00038009Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038008TCONS_00038008Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038007TCONS_00038007Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038008-proteinTCONS_00038008-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001757supercontigsc0001757:24880..36938 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.79 3.58 1.86 1.77 4.49 3.06 5.14 5.63 4.34 3.8 3.06 3.66 4.2 4.96 5.89 8.16 7.86 9.91 7.24 7 12.07 8.82 4.4 4.8 0.44 0.85 6.26 3.73 2.1 1.67