XLOC_023227 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_023227
Unique NameXLOC_023227
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001911:24859..34391-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_023227 ID=XLOC_023227|Name=XLOC_023227|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9533bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001911:24859..34391- (Clytia hemisphaerica)
AAAGTTGTGCATAGCACTCCTTATCACACGCCTAAATTACTAAAATTAAG
GTTTTAGGAGTGTGATTGACCACACGCCTGAAATTTTCAAATGATGCAGC
CTGCTTTAGGTATCAGTAACACAGTTGCATAGATAAAAACTCAGTTTGCG
GCTGATGGGGCATCCTGCTGATCATCTGATAATCTTCAGGTAATTTCATT
ACGTAATCTTTATGTGCTTAATTATTTAAGTCATAATGGTGTCGTCCTTA
GAAAATAGTCTTTAGGCACGCTAAGCAGTCTCCCAAATTAGCAAAAAATA
ATGATCCCAGGAGAGTCCTCGCATCGATTCTTGTATTTTCATACATTGGT
TTCGAAATCTTCAGAAAGCAATTATTTAGGTGTTGGGTAGAATGTAAATG
ACTACCAAGGCAAAGGTTTTTTCAATCTGCGGAAACGTTTAGACGGGGGT
ATGGTGGTTCTGTTATNATTGTGAATGTTTTCTGCACACCACGCTGAAGC
TCTAAAGGGATGTGTGAAAACAAACAATCTGACGAATATGCAATCTCGAA
ATCGTAAGGACCGCGTTCGTCTAAAAGGACTGGGAATGACAACAAAGTTG
CGCGATTGTGTTTATGAATAANNTTTCCGCGGGAGGACTATTTTCCTCAG
ATGTATAATTTTCAAGTGCCTTTAGAGGTTTACCGTGCGCGTAAGAAAAT
TATGAACATCTGTTATCAGGTTAGGGGTATGGTGGTTCTGTTATTATCAG
TTAGGGTCAGGGTTGGACTCAAAGGTATTTGTTTGTTTCGATTACTGCTG
TGTCTCGTTGGCGCAACCAGTTAGGCTTCGAGTTTGGAAATCAAGGTTGC
TTGCATTTGGTGGTTCGAGCCAAGGTAAGGGAGTATATTTCAGAAATAGG
TTAAAAAAGTCAAAATATAACTTAGAACAGTTCAAAAACTCAGAATAACA
TCAGAAAGTAGAATGGAAGATAGGAAATAGAGAAAGTAGAGAAAATCCTG
GAGAGTCATTTAGAATCTACCCACGACCAATTATTTATGCCTAATGACTC
TTAGGGGACTTCTTTTTTTGTTTTTTTTAGAGATGAAAAGGATGTCACTT
CATAACATAATGAGATGTGGCCCTCTTGCCCTCTTTCTTGTTTAACAGAA
AAGAGCCAGATCCTGCCAGAGCTTTTATTGGTAATCTGCCATCAGTAATT
GAACTCCACCGCAAGGTTTGATCAAGTTTGTGTAGTCCCAGGAGGTGCAG
TCACAGGAGGTAGGAGCTAGGTGGTCGTTTCTAATTTAATTTGGAAATTC
CAAAAACTTAAAATACCTGGTATTAAATTAAGGGTGGGGAGGACATCAAA
TATACCATTTTAAAACTATTGCATGCTACTAAATTTAGGGTTGAGAGGGT
ATTTATTTCAATTCTTGTTAGTATATATCCCAATTCCTGAATATAACATT
TTGTCAATTTTTGTCTTGATGTTGCAGGATTTTGATGAAAAGAAATTTTT
ATACATGCTTGGTACAGTGTTTTGATACTGAAAATATAAGTTTCTCCATT
TCAATTCTAGGTACTTTCTCAAGGGGTATGCAGTTACCACAAGACATTAT
TAGTAGTATGTGTCTTTTTGAACAATTTTTTATTACAACCCCCTTGCAGT
TTATACTACCATCTGTTAAATCTTTTTCAATTATAACTTTGTATGCAATG
CATGCTTAACCCCCTGCTCTCCCTGCCTTTTCAATAATGTAAAGCAAGTG
CCCTAGTTTTTGATTTTGTCTAATATTTTCAAATTAGTTTGCAACTTTTT
TCATTTCATTTCATTGCAATTTTTTGTCCCACTAAACAATGTTTTCTTTC
AAAAATACAAAAATGTTTTTGCGATCTTTTTATTATTCTTAATGTCTTAC
TGCACTTTTCTTTTACAGATAATCTTAACTGAGAGCTCAGAGGTTACAAA
AATCGCTGGTTTGGTTTTAAAGATGCTAATTACTCAGACAGAAATGTCTA
AGGAACTTAAATTGACGACTTTCAAAATGAATCCAAAGAGAAATGTACTA
TCAAATAATGTTTGGGATCTAACGATTTTTTTGTGATTTTATAGTTAAAT
ACTATTTATTAATGAGGATGAAATTTGTTCGCTTTATAGCTTTATACAGT
ATGGAGCTCTAAAATGAGATGATTTTTGTCGATTATATTAATTGTATTTT
TGACAAAATCATATGCCCATAGCAAAAACTTTCATAGTAATATAATTTTT
TTTTCCTTTGTACATTAGCTGTTGTCTGTCATAATCTTATTATATTTATT
ACCCACTTTTTTGAAAAATTCTCTTTATAGATTCTCAGAATGTTTCTTAA
TAATGTTATTCCTGAAGATATTGATCTGAAACACTTCTTAAAAATCTTTG
AATCTTAGTAGAAAAACTTTCGGAATCTTAGTAGAATAACTTTCGTAGTT
AAAAAGGGTCCGCATAATCGCCTTTGGGAGCAGGCAAAAACTTAAGAGTT
TTAGGTGGGACCAAGGATTCAAGATATCAGGTGGGGATTATATATAGTGC
TGGGACCTCAAATTTTTGGTGGGACCCAGTGGGAAGTTGACCCCCTTTTC
ACACTATGAATCTATGATGGAGGACAAGCTGGAGTTTTTACAAGTTCTAA
TGTGATTTGGTTGCTATTTTTCATAATTCACAAACTAATTACTTTAATCG
TAGAAATTTTAGCGAGACTAATTTTAGCGTTTTAGCGAGTTTTCCCTATT
TTCGCTAAAATAAATCTCGCTAAAACACGCCGAATTGACAGATCGCTAAA
ATTTATCCACGCGAAATTTCTGGTTATATTGCCTTGATATATTTTTATCG
ATAGGAAGGGTTTCAGTGCAAAGAAATGCTAGAAAACTAACTAATTCAAT
ACTGTAATACGAGTATTCGCTAAAATTTATCCACGCGAAATTTTTTGAAA
TCGTGATTCGCTAAAATAAATCAAAAAAAATCAAGATTTTGACGACTCGC
TAATATACGCTAAAATTAGTCTCGCTAAAATTTCTACGATTAAAGTAATT
GATTGTAAATTTTATCAATCTGGGTGGCATCTGTGGTATAGTAGGGCTCA
CTACTAAAAAGTTTAGTTAGTTGTAAAAACTGGCGAAAGAACGGCAAAGT
TGGAGGGGCAGAAGGCTGAATAAGTTTATTTAAATTGAGAAAAATATTGT
CTTATGCTTATTTTTAAGCGATCCACACAATTTTTGCTAAGTAGTCTGGT
TGGTTTTAATAATTTCTTACGTTTTAGGTTTTATGTGTTAGATTAAGTCA
TGCGTCCAAAAAGGAAAAGATTTATCAAAGGAAAAGGATGTCTCTCAGAG
GAATTTAAAGCCCATATTCGTAAAATGGCCTTAGCAGACCCAGACGTTGT
TGCGAGACTGTCATCGCAAGAGGTACTAGAAATGAAGAAATTGGAAAAGA
AAACTAAAAAGCGCAAGAAGAAGTGTTCAGAACGAAAAAGGTTATCATCA
GTTTTCCTAGAGTTTTTTATTTTTCTTCTGCAAATAATTGATCAGTGACA
GCTTTCTTTTTGGAATTCATTAATCAATTTTGTGTCATGCACGTTTTTAG
AATCGTCTCCACATAAAAACTATTTTGTCTTCTACTTACAAAGATGACAG
TGCTGTCTCAGGATGTCCCTTCTGATTTTTTCGTTAACGTTGATTTAATT
TGATGAGCTTAAAATTATTTTCTTATAGAAAAAATAGTGGCAATTATGTC
ACTATAGACTTTGATGATGATGATAAAGCTCCTGTTAAAGAGAAGAAGGT
TGTCACACTTTTATTCGATTCTGATAACGAAGACGTAAGTTGATACGTTT
GTTATACCATATTGTTTTTTGTTTTTTTTTATTATTTTTCTCATATTATA
GCTAAATCAAAACTGGAAAGTATTATTACCTAGAAAAATAAAATTATCAT
TCATTATTTTAAAAACATTTCTTGCAGCCATTGGAATCAATGGTAGATGA
TTCTGCTGATATTTTACCATCATCATTATCATCCTCTAGAAGTTTAGTAA
ATCAAGGTCCGAGTGGAAATGATAATGATATTATGATAACTAACAACAAC
GACGCTTTAGAAGCTTTTGACTCAGAGTCTGATGTAAGTTTTTGATTTTT
GCTTGCAATATTTTTGTATATTCATCCTATAGTTTGTGCAAAATTATGAA
TTCATGTTAATAAGTGTCCATTTAAAATGTCAATGCTGATCTAAAAAATC
TAAATAAAGTAAATGTTTTTATAGCCAAAACTTTGAAAAAAAGTTCGCTC
ATTATTTTGAAACCTTTTAAAATTGCTAACATTTTTTAAAGTTATCAGTG
GAAAATGAAGATCACATCGTTGATTATCATCTTTCTTATCAATTGGAATT
GAGAAAACAGAACTGCCTAGTCCCTGCTGATCCCAGATTCCTGAAAGTTG
CTATACCAGATTTTGATCAACAAAAGGCTAACCTCAAGGTAACTTTATGT
TAAGATTTTTATCAATCATTCCACCCAGCTGTATTCCACTTGCTTAGATA
CTAAACATATAATTTGTGTCTACTGATTCACAAGTTGTATTTCACTTAGG
GTGTATGGTGTATATTAATTGTTAGAAGGTTTACAATTTGTCAAGTTGAC
AAAAATCATCTTATAATGTATATAATTATTTGTTTAAAGCGAAATAAATA
TGTTGTCGTGACTCGGAAATACTTTCAAAAGAGCGAAGATGTTGATGGTA
ATTGGATTTATTTTTGTTCATGTGACAAAGCAACATCAACATACATCGAG
TCACTTTCATTTGATGCTGATTTATCACAAGACATCAAAGGTAACTACTT
GAGTATTATTTTGAAACTATAACAGTGTCAATGGTAATTTCGGAATTAAT
TAGGTGTAGTCTAAAAATAAGCTCAAGCTATTTAAAAACCTTGTTATAGA
GTGCTGCATCCATATTAATTGTCTTGTACCAATCATTGCGGAAATTGACT
ATTGGGAGGAAGAAGAAAGTATAATTGGTATGCACGTTTCCTTTAGAATC
TGAGTATACCCCTGGAGAGGGGAGTTTTTCACACTTCTACTTAGCTTATG
AATTTTTACAATGGGGCCTACGATTTACTTAAGAAATACTGGAGTTGAGC
AGTTACCCTACGCTACAATTAAGCACAGCAGAGTAGGAGATTAATAATAA
GGGTGATTTTACGCATTGGCAATGCTTTTAAGTGTTTTTAAGATTCGAGT
CTGCTAAATGTAATGCTTAACCGTTATAGTTTAAACCCTTCTTTAAGATT
TCTTTTGAAATTGATTTTGAAAAAAATGAGTAAGTCTTTATTTTTGTTTT
TTTAATTTAAGGGTACCAAGAGAGTTTCATACGGGTAGGTAAAACGCCAA
ACGAAATTCAATATAATATTCGTACGTATAAAGGTTTCAGCCTTTTGAAA
CAAAAGAAGCAACAATTTTTTCACCTTTGCACACGGTATGCGTCCAAATT
CTTTTGTTAAATCTGATGTATCAGTATAGGTGACGCGTCTTCTATATATA
TAAATATATACATAGAATATTATCTTTAAGCAACCAAGCTATAAGACATA
AATTTTATTATTTATTATATTAATTATTATTATTTTATTTGAGGAGCAAC
CACACTTTATGAAGAAATAAAATATATCTTCATATTTAGGAAGACGAGAT
AAGTGATATTCTTCGTGAAAAAGGAAAAATTCTTGTGGTTTATCGTGGTT
CAGTGGGAATCGTGTCAAATGAAAGATCACAACTGATTTGTTACGTTTGC
TCGAGTGGTGTCTGTATACACTGTAATGAAGTTCGACGTCGCAGAGATGA
TAAGGATTCGAATAATCCGGCCTTTTTTGATGAATTCTTGGAGTCTGCTC
ACAGTGTATCATCAGAACGTAATAGGAAAGCAATATCGTGCAATAGGATT
CCATTTCACGCAGACGAAAACATGACCAGAAATCTACACCTTCACCCTTG
TCAATATCTTAAAACTGAAGACTCCTTGCTCGTGTGTCAAGATAATATCA
GTTGTTGTTCTGAAATCATTGGTGTTTCATCTCGTCGTCTGAAGCTATTC
ATGAAAAACACCTATTTTGAGTGCATTGGTAATTTTCATTTATTAAGACG
TCCCGAATAAAATGTATATGATATATAATATAATAAAGAGTTGACTCAAT
ATCTTTGTTTCAAACTCAGAGTTTCATGGTGCACAGGCACCAATCTTCAG
TGAAAATCAAAAATAAAGATATTGAGTCAACTCTTTATTATAGTAACGCT
CTATTTACTTATTGAGCACTGTATTGCTGACCAATACGGTTTAGGGGCCG
TAATGTACAAATAAATACCTCGTGGGTTAAGCATTTTGTTGGGTTATTAA
GAAAGAGACCAAGTAATACATTGCTGACATCTTTTCAATGTATTGTGATC
ACTATATTATCTACACTCGATGTGTTGTTATTGATAAGGTTTATCTATCT
TTAGATTTCTATATTAGAGCGGCATAGGAAAACATTTACTAACTGTTTAA
GGCAACTTCCTATACCCGTTCCTTGTCGAGTAAAGGGGTTAAAGGGTTTT
CAGGATAATTAAATGATTTGGCACTTTTTGTACGTGCACGTTTAGTTTTC
GCTGAAAGCATTTCAATGTTTGTCTTGTATTTTTAAGTGAATGACAGCCG
TTGTACAGGTTGTGGGGCTTTTCAGAGCTACGATGGTTTGAATGACTCGA
TTCTCAATATGGGGAAGTTCCTGATTCACTATTCATTAATGAGAGATTAC
ATGTTTCATTTTCTGCACGGAAAAAGGTAAAGCAGTGTTAATGAATGCAA
GGCAAATATTTAAGAAATACTGCTCAGATAAATATGGGACCTCGTGGATT
TACTTGTACTTCCATGCACCCTCTTTTCATCATAAATTTCATACACCTTT
ATTTTTAGTTGTACACTTCATGGCTATTACGAAGTTTTCTCGTTGAGTCA
GAAAAGCTCTGGCCACGAAAAATGCGAGCTGACGTACAAAGACTTCAAAG
ATTCGTGGTATTCCTTTTTGGAGCTACTTGACATCGACTTCAACGAAGGA
TCGATTTGTAAAATCTGCAAACAAGATCCTGCTGCAATTATATGTGATGC
AACAAGTTTGGGTCATCAGAAGAAATTCTCGGCCCTGGTGCTACAGGAAA
ATCCATCCGAATTATGTACCCAAAAGTTTTCGTGAGTTCTTGTTTATTTA
GATTTTACCGAATTTGCTATGGCACTACGGTATCTCAGCATTTTATAAAA
AAACGACAGTTTTGTTAAAAGTTTTGTGACTGTATGAATTGAAGCTTTTA
AGCATCAGTGAATCAGCTTATTTTTTATGCTTCTTCATACTAAATAAATC
TCACTCTATACTGCTAGGAAACATGCTGATCGCTTGGCTATCGCTGACAA
AGATTTACGGGACTCATTCAAGGAATGGGTAACCAAAAAGAATGCGTCGA
TGGAATTTTCCAAAAAGCTTGAAATTATCTACCCCGTCATATTCCGTACG
TTAAAGTGGGCTCGTGACACGTTCGGTGATGATCTGCCAAAATCGATCAA
ACTTTTTTTCAAGTGCCTTTACTCTTCAAGTCCAGTCTGTTCCTACTTTG
GCGAAAACGATTTGAATTTGAGTTTAAGGATGCTTGAACCAAAGTGTAAG
AGTGATGCTGCGTTAATGAAGAAATTCCAACTCAAGCTTCCTCTGCTTTT
TAACATCCTCACTGATTGCAATTTGGAAACATGTCTCCCAGAAGAACACT
GGAAAGGGTTACTACTTTACCTGTCAGACAAGACTGGGATACCTTACCGT
TATGCCTCCGATGTATACAGCGGTGGATCTTTTATCGAAGAGAATGAACT
CAGCAGGTAAAAGTATCTGTTTTGAAGTTTAACATTATATGTAACCCCAT
TTAACATCCTTCCCAAAAATAAAGGCACGTTCCCTATTTTAAAAATCTTT
TAAAGATTTACTGTTTTATACCAAATTATTTTCACATTTGTATGGTAAAT
GGGTGTAAAATGGCGGTGCCGCAGATAAACATTTTGCCATTTTGTGATCT
AAACTAAATACTTCAAACCAATCCCCTTATTTTTACTTTATCCCACCTCT
AATCTCCTGTCCACTCTATGAGGAAAAGAGTTAAGGGATCCCGCCTTAAA
GAAGGAGATGTTCACACTGAGGTAAATCAAAGAATTCTTTAGAGTTTCTT
AAATTTCTTCCTTTATAAGGTTTCCATTTAAGTTAGTGGTGACCTTTACC
AAAAGCTTTGGAATCCCTGATCTTAATTGACTGATTACATTTGCTTTTAT
TAAATTGCAAATTACTATTACGTATTCCATTTAAGCTTTCCAAATCTTCC
ACCCTTGCGACCGAGAGGCAGCTACGAGCAGGATGCAATAAATACAAAAT
ACGGCAATTGTCGCAAAAATTATAAAGGTCACCCAAACTTGACATCTGGT
ATATTCACTATCTACTGCCCACACGGTAAAATTTTTTGTGTTCCCATTCT
TTTTATAAATGATCATTTTGCCTACCACATTTAAAAGTTATTATGTATGG
ATACAACTTGATTGTAGTCGTTTCAATGTTTTGGTGCAAACAAGTAAATA
CAGACAATCTATGAAAACTAATGCGTATCTTTTAGGTATTTGTTATGGCT
TTCAGGTGATGGATAAAGAAGAGTCGCCAAATGTTCCGTTTACAATATTC
AGGAGAAGGTTTAATAGGGGTGTGTTTCTTGAATTTACACAAATTACTCA
AAAAATAATTTAACTCTGTGAAAGATCAAAGTATTTTGTCTTTTTGATTA
GAGCTTTGAGGGATATAAACCACACTTCAAGATCTTGNAAAGTCCAGGGG
CTGGAAATGATTTAAAACCACCTGTATATATCGAGAAAAAAGCCGTGTTA
AAAAAATAATTAGAATTAAGTTTCGCCAATGATCTAGATATAAAAGTTAA
TTTGACGAATTTAGGAAATTTTTAGGGTAGTCCGCCGAATTCGGTAAAGT
TTCTTCTCTCTAACTAGAGACTTATTAAATAATCTAACTAGAGAGTTATT
TGCCAGTTCCCTATCAAAAATATGGCTGTTTCTCATCATGTTGAGCACTT
CGATGCGGTGTCATTATGTTAGAAAAGAAAGTAGATTTTAACCAAAAGTC
AGACTAAAATCAAAATGTACCTAATCCATACTCTTCCTAACCATGACCAT
AATAATATATAATATATCATTACACTTTTTAAGGGTACACTGTATATAAT
GTAAAATAGTTTTCGCTTACGACTTGATCAGGTATTGTTTTTGAAAACAA
ATTCATCTTTGTCAATACTCCACATCTGCCATCAGTTACCCTGACATGGA
TCAGTTCACTCCTTGCAGATTTTTGATGCCCATTTAACATATTAGATGCC
TTTTTCTGAAAAATAAGTTAATCTATTTTTAAAAAAATATTTCAAATCCG
CATCAAGTAAACATGAGCGACCAAGATCATGTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038711TCONS_00038711Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038710TCONS_00038710Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038709TCONS_00038709Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038708TCONS_00038708Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038707TCONS_00038707Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038706TCONS_00038706Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038705TCONS_00038705Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038704TCONS_00038704Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038703TCONS_00038703Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038702TCONS_00038702Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038701TCONS_00038701Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038700TCONS_00038700Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038699TCONS_00038699Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038698TCONS_00038698Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038697TCONS_00038697Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038702-proteinTCONS_00038702-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001911supercontigsc0001911:24859..34391 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.47	3.44	2.11	2.95	32.46	26.76	30.8	40.05	27.52	24.64	21.01	19.21	21.25	19.07	9.61	9.14	17.69	15.85	9.92	10.79	14.83	13.41	7.64	7.25	8.13	22.28	11.77	7.15	9.33	7.24