XLOC_025197 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_025197
Unique NameXLOC_025197
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002744:7621..16194-

Legend: gene
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>XLOC_025197 ID=XLOC_025197|Name=XLOC_025197|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8574bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002744:7621..16194- (Clytia hemisphaerica)
CGCTTGGTTCGCGCTCGCGCTATATTTTTCGTGTTTTCATGTGTTATGTA ACATGAGATATCGAAAGTGAAAGTGTTTTTCACTACCAAGATTCTAGTTT TCAGCTCGCTTTTTTTTCAAAATCAATCCTCAATCGATCCTCGAACGCAG AAAACTAAAAAGATCAATACTTTTTAAATTGAATGTGGAGGCAGTTTATT TTATTTGCTAACTGCTCAAGTAGTTCAATCTCAAACAAAACAACAAACAC AAAAATGGCAGAAGTGTCTTCAGTGGTAAGACCTTTTTTGCGTCTCCCGC GCCCCCTCCCCTTTGTCATATTTTTTACCGTGAGATCGAGTAACTTGCAT CAGGGGAGGCTAACATGCATAGCCATCAAATGACTGACCAATAAAAACAG CAAAATTTCAAAACCATTAAACCTGCAGCTCTACTCTACCATTTTTGTTT TGATTTAACTTTGTATTTTAATTTAATGACCAGCTGGGTCATTCATTTGA GGGCTATGCATGTTAGCCTCCACTGATGCAAGTTACCCGATCTCACGGTA CCAGTTAAAATCAATAAGATCAATAATCGAATCAAGAAAAGATTGATATG TGATTGCTTCTCCAACCCTCTGCTGAACATATCTGCACATCACAATATGT TAGAGTGTCTTCGCGAGGCGAAGTTGACAGCTATGTCATACATTTCTAGT CATTCTAGTCTGAGCTTCCATAAGGCAGTTTGATGCGTTTTTTTCGTATA TACTTTTTCAGTTCCAAATTCTCATCCTCCTTGACCTTGCACATGCATCA TTTTTTCGATTTCTATTTCTATTTGGTTGAGTCGCAGGAGGCTTTGAGGC TCTTTCGCAGCTATAGGCGCTTTCAATTAATTAGCGCCCGTCAGCACCTT GAACTGACTACCCAATTCCCCTCACACGTCATGGGTTGATCCAGGCTAGG 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTTTATAAACATGAGAAATGATCAATT TGAGAGTTTTGGACTTTTGAGTGAACATTTGGGTTAAAATTACATTTCTT CCTCAAAGCTTTAATTTATCTCTAACAAAGGAAGCATGAAGCAGCAATTT TCACCCTGATATTCTTATATAAGATATTCTTATAAAAAAAAGCGTGTAAT TCAAGCTCACCTCACCTCACCTCACGAAGTCTTCATGTATCAAAACAGGA GGGATTTCTACCCATTCGCAAAAAATCTTTTCCCGATAGGAAAACAACAC CATGAAATTTCATCCTCATCGGAAAACAATGCAACTCTAACCTCACTTGA ATAAACTATGAGAATACCCATTTTTGCGTTTAGTTCCTTTATCTTATTTC TAACGGAGTCTACTGCGCAAATCCTTTATTTATTTCAAATATTAGGTTAG ATTGATTTATTTTGTGTATATTAAGTTTTATGTTTAATTGATTGTAGATC ACAGAAGAGACTTGTGTTATTGATGGGTCATTCAACGGATTAAATGCTGG AAAGTATGGACTTCATATTCACGAGTTTGGTGATTTGTCTGCGTTCTGTG AAAGGTAAATTATAGCCCGGATTTACGAATTTAAAAACATCTGATGATGA ATACTTGTTCTTATGCGAAGCGTCAAGACAGGAGAAATGTTAGATCTTTT TCTTGTACACAATAATATGGTACGTTTTTAACGGCTGTTTACCTGGGATG TCATTTATTATAATGTCTAAAAAACTCTTTAACCTTAAGATGATATTTAT TGAGCATAGTATTTATTTTATAGCACTGGTGACGATTACAATCCAACAGA AAGTTGCCATGGTGACCGAGAAAACACATCTAGAGTAAAGTTTCTTTTGA 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TATTAACCAAGGAGACAATGTAAACATTTTCTAAGAACGAGAAACGGCGT CTGATGTGCTTTTAAAGGAAGAAAACTCATTTTGTGTATTTTTGAAGGAA AAAATCAAAAGATCTTTCGTAGATTTTAAAGTAATATTTCCGATATCTTG AAATTTGATAACTTTTCACGGATACCAATCCCATTTTCAAAAGAAAAAGG TTGAAAATTTTGTGTATCTTTCAAAAAAACTTTGACTTCTACTTGAAGAA AATGATAGACAATGTTCATAGTACCAGTGTTTCTAACAGTTAGGTTTTGT TAATAAATATTTTGACTTTATTTTTTTTTCAGATTAGCCTGTGGAATCAT TGCTCGTTCAGCTGGTTTATTTCAAAACAAAAAGATGGTATGCTCGTGTT CTGGTAAAACCATTTGGCAAGAAAGAGAAGATGCTAAGAATGAAATGGGA TGATAATAAAAACATTGTTGTGTTTCATCAAATGACCGAACCACAAGCAA CAATATTTGGCAAGGAATAGAAATTGCTTGAGTTTAACGGAAGTTTAACA AAGCTAAGAACACCAACGTACCCTCGCGTATTACGAATCCAATGTCTCGA AATTGAATATCGACTTATATGAAGATGGATTTTTGTTTCATCAGGTTTTA TTATTATGACTTGAGAATATGGATAAGGCGCTACATTTGATTTTTCGTGA TGAATGGGTTTCCATTATAAAATCGGCAAGATTTTCAGTCTGGAAATGAA ATGAGGGAAATATTATGTACTGCTTTGAAATTATGTCAATTGCAGTTATT CAAATTTATTCGATTTATTGTACCGGAATTCAATGCTAGAATTATTGACG TACAGTATTGTGTTATGGAAGAAATAGTGTGGAGAGACATTTTCATAATT ACAGCTATCATTTATTAATTTGCGTAATTTATTACTTTTTTGATATAAAG AAACATTATCACTGAAAATCTTTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041194TCONS_00041194Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00041193TCONS_00041193Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00041194-proteinTCONS_00041194-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002744supercontigsc0002744:7621..16194 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CCScopper chaperone for superoxide dismutase Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
45.94 45.16 18.62 15.4 18.19 11.69 11.68 12.25 9.44 7.23 7.98 6.13 4.52 4.92 5.74 6.27 8.56 8.53 3.74 4.15 10.28 9.28 28.51 26.02 6.5 9.01 6.99 7.12 12.82 15.92