XLOC_024394 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_024394
Unique Name	XLOC_024394
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002350:2..6572-

gene from alignment at sc0002350:2..6572-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_024394 ID=XLOC_024394|Name=XLOC_024394|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6571bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002350:2..6572- (Clytia hemisphaerica)
AATCACGTTGAACAAAAACCAACTGACCAGATTACCTGCAAACATATCAC
TTTATATATCAAGCATCACCATCCTCGATCTAGATGACAATAATTATAAT
AATAACTTCGAACAAAAGGACTTCGAAGGGTATGATTCTATCATAGCTAT
ATTCCTTCCGAGAAATGGTATTGAAAATTTGGAACCTCATGTTTTTCAGA
ATCTTTCTTTACATTTTTATACAAAGGAAGAAAGAAAATATCTGAATTGT
ACCCTTCGGAAGCTACAGCACCATGGAGAGACATTTCCGGTGACGTTCTT
GGACCTTACGTGGAAACGCACGCTGGTAACAGATACATTGTCTCATTCGT
TGATCATTTCAGTGGATGGCCTGAGTGTTTTGCAGTGCCAACTAATGAAN
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TCCATTGCGTCCATTGAGTCTAGTCCATTGAGTCTCACTAACATTCTGTA
GTGTTAATGTAAATTTTGATGATTTAATTTATACAATACCACAAATATCA
CTAGCCAATCAAATGCGAGTATTCAGTCATGTGATTTTAAGTGGACATGT
GGAAAGTTTGGATGTTTATTTCCTTATTTTTTATTTTCGAAAGTTCTTTG
GTAGATGAAGAAGTTGTGTTGAGTTTTTGCCTGGTTTTTACAGGGGTTTT
TATTTTGCTTTTAGAAAACAATACTTGAAATGACAACAAGTTTAGTCAAA
GTTGACGCAACCTAGTCTTAAGATCCATTCTCTCTAACCAAAACTTACAC
CACATAAAAGANCGCAACCTAGTCTTAAGATCCATTCTCTCTAACCAAAA
CTTACACCACATAAAAGAAAAATCCCATCAGATGCTACTCAGTGAGAGCA
TGGGTATTTAAGACTTAGTTTGAATTTGCTTATATTTGGTTTGAATTTCG
TGCCAAAATAAGCTGTGAATAATTAATAATGTGTATAAAAACGACTTTAT
TTTCATTTTCAGGAAAAACCTAAAGAAAAATAACTGACAATCAAAATTAT
GAATATGCTATTCCACCATCTTCTCATTTTATTGGCTTGCATTGTTTCCA
GTTTTGCATCAAGTTCAACAACTTGTCCAACAAAATGTAAGTGTTATTGG
GAACGTGGTCATAGTGCCGTCGATGTGTTTTGTACAAACCAAAATATCAC
CAACAAAGATATTCTAGATATTGCATCCCAATTGGATACAAAAAAAACTG
TGCATTTAAGTCTCAGCAGTAATCTGATCACCGAATTTCAAGCTGAACTT
TTTGTTAATTTCACTAAACTTGATCGAATCACATTGAACAAAAACCAACT
GACCAGATTGCCTGCAAACATATCACTTTATATACCAAGCATCACCATTC
TCGATGTAGAAGACAATAATATTAATAAAATTAAACAAAAGGACTTTGAA
GGGTACGATTCTATCATATCTATATTCCTTCAAAGAAATGGTATTGAAAA
TTTGGAACCTCGTGTTTTTCAGAATCTTTCAAAACTAGAATATCTGTACG
CAGGAGGTAATAAATTGACGACTTTACGAAAGGGTACGTTTACCGGATTA
GCTAAGTTACGACGATTATTCTTAGCTGGTAATGATATAACGACTGTTGA
AACTGGAGTCTTTGGTGATCTTCCGTCTTTGAGTTGGATATACTTGCAGT
TCAATAAGATAACAACAGCACGAAGAGATTGGTTTGGTTCAGCTGTTCCT
GAAATATTCAGACTATTGAGACTCGAGAACAACCCATTGATATGCGATTG
TGTTATGCATTATACAATTACTTATTTTGAAAGTTACCATGATGGAACAG
TTTGGGGTTGGTGCAATGGTATTGGAAGATTGGAAGATTTCTACCGCAAG
AACAAATTAAATTGTAGTTCCTGCTTTGTCAATGAATGCCAAAACAATGC
AACATGTCAAGTTGTTGACCAATTCAGTCAGATAAGTAACGTTTCAATGG
GATATACATGTCAATGCAAAGAAGGTTATCATGGTCAACAATGTCAATTA
TCAACTCCAGATACTGGTTTCATCATCTTAATGGTGGTGTTGGCGATATT
AGTTTTGATTGGATTGGTTGGGTTGGCTATCTTTTTGAGACGTCGAAGAG
GACACAAAGATAATGGCGAGGAGGTGAACATGTCTCAAAACAAATGATCA
GAGAAATTGGAAGGCGTCCCTGTGTAGTTGAATCATGGAGGTTAAATACC
GTCAAATCTCTCACTAACTAATTCGAACTTCTGCAATTCGTATCTTTCCG
TATTTGGAACTGAAATATTGGTCCCCTCAACTGGACAATGATATAAAATA
CTCTCTGTAATTCGAATACTTCTTAAATTCGAAGAAGATTATCTGCCCTT
CAAAAATCGAATTAGAGAGAGTCAACTGTATATCGATGTAATCAATAACG
CTATAGCTAAAGATCTTTAGAACACACTTTAAATCTTTTATAGTCAAATA
ACTGGATGTTTTATGTTAATGTTGGTGTTCTTTTGTAGTGTTTTAACANN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTACTCAGTGAGA
GCATGGGTATTTAAGACTTAGTTTGAATTTGCTTATATTTGGTTTGAATT
TCGTGCCAAAATAAGCTGTTAATAATTAATATGTGTATAACACAAACTAT
AAAATCACTTTATTCTCATTTTCAGGAAAAACCTAAAGAAAAATAACTGA
CAAACAAAATTATGAATATGCTATTCCACCATCTTCTCATTTTATTGGCT
TGCATTGTTTCCAGTTTTGCAANGAATATGCTATTCCACCATCTTCTCAT
TTTATTGGCTTGCATTGTTTCCAGTTTTGCATCAAGTTCAACAACTTGTC
CAACAAAATGTAAGTGTTATTGGGATCATAGTGCCGTCGATGTGCATTGT
GAAAACCAAAATATCACCAATAAAGATCTTCTGGATATTACATCACAATT
GGATAAAAATAAAACTGAATATTTAGATCTCAGCAGAAACCTAATCACCG
AATTTCAAGCTGAACTTTTTGTTAATTTCACTAAACTTGATCGAATCTTG
TTGAACGAAAACCAACTGACCAGATTGCCTGCAAACGTATCACTTTATAT
ACCAAGCATCACCATTCTCGAGCTAGAAGACAATAATATTAATAAAATTA
AACAAAAGGACTTTGAAGGGTACGATTCTATCATAACTATATTTCTTCAA
AGAAATGGTATTGAAAATTTGGAACCTCGTGTTTTTCAGAATCTTTCACA
ACTAGAATATCTGTACGCAGGAGGTAATAAATTGACGACTCTGCGAAAGG
GTACGTTTACCGGATTAGCTAAGCTACGACGATTATTCTTAGCTCGTAAT
GATATAACGACTGTTGAAACTGGAGTCTTTGTTGATCTTCCATCTTTGGT
GACCTTGGACTTGCCGTACAA

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00040201	TCONS_00040201	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00040200	TCONS_00040200	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00040199	TCONS_00040199	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00040200-protein	TCONS_00040200-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0002350	supercontig	sc0002350:2..6572 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.07	11.57	8.57	5.19	4.63	2.58	7.18	9.49	4	3.17	2.45	4.53	5.66	5.72	10.87	12.89	0.79	2.99	0	0.63	0	1.01	7.98	7.97	0.86	2.02	4.75	3.52	3.67	5.35

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