XLOC_020219 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_020219
Unique NameXLOC_020219
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001217:33152..43254-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_020219 ID=XLOC_020219|Name=XLOC_020219|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10103bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:33152..43254- (Clytia hemisphaerica)
GCATTTAATAAACTCACGTGTTTTCAATGGAAGTATAATTGAATGTATCA TCATCAGAAAAATCATTTCCGTCTTCACTTGTGTTTGCCTTCTTGGGAAT TTGAGAAGAAGGTAGTAGAACTTTCGCAGCCTTTCTCTTTCTAGGATTTG ATGCACTTTGTAATCCAAATGCTTCGTCTGGTGTTAAATNGAAGGTAGTA GAACTTTCGCAGCCTTTCTCTTTCCAGGATTTGATGCACTTTGTAATCCA AATGCTTCGTCTGGTGTTAAATTGTTCTTTCGAGTACTTTCCCTGACTGT CTGTTTACTGTAAAATGCACCAGCATTAACACTGACATTCTGAGATTTTG ATTTGGCCATCTTCTTTGATTTGGAATTCACGTGCGTCGTCGGATGAGAG TTGTATAGAAAGAACTTTTGAAAATTCGTGCATTATTAACGGCCATGTGA AAATGATCCGTGGTCGGATATGTTCTCAAAGTTTACGCTTATAAAATGAA GTTTTTATGTTAGGCGGTGTGATAGATTGATTCCGGAATTTCCGATATTT CCGATAATTCCCTTTTTTCCCGAATGAAAAAAAAACTACGTGGTCACACT GCAAGACAATCGGCTTCATCAAAGTTTGTTTAGTCTGTATGACCTAGACA TATCCCATAATCCATTTGGAAAATTTTAAATCTGAGACGAATCTAACATG GCGGCTTGCTTCGAGAGAACATGGCGTGCTTTTTGATGGAAGAAAATGAA AACTCGGTTTTTTCTTTTTTGGTTTGTGGGCTTTAACTATTTACATGAAG ATAATGATGATACTTCTCTCTGTCCATTGTGTCAACACATTTGTGTGATT ATGTATTAAGCCATTACTCACTCAATACCTTTTTTTAATAGAAAAAAGTC ATGCCAAAAGTTAAAGGAAACAGAAAGTTTTGTATTCATTGCAAATCTAC 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GTTTTCTCGTTTTAAATTTTATATATCGCCCTGTGAAGTTTCTTGCCTAA AAATCTTTTGTTTTTTTATAGTAATCAGCAAAGCTAGTTTGTGTATCTCA TTTCAGGTCGATCCATCAGATAGTGAGAATGATGAGGTCGCAGATCATTC TGTGGATGTTGAATGCCCTCGAGCAAAATGTTTGGCATTGGTTTTGCGTG CAATCTTCCTTTTCCAAGTTCATGCTTTTATTTCCAATGCATCCATCGTA GTGCTTCTTGGGATGATCAGGGTGGTCATAAACTTAATTGCATCGCTGGC TTGTTTCGATATTCTTTCTTCATTTGCAAAAGAATTTCCATCAACATTGT ATTCCGCATACAAGAAGGCAGGCATAACAGTTGATGATTTCGAAACCTGG GTTGTTTGCCCTCAGTGTAATTCTTTATACAAATTCGACAATTGTTTTGA AACTAGAAAAGGACATAGTAAAAAGACAGTGAAATCCTGTACCTTCAAAC CACCATTTACAAGAGCTGTTCAATGTAACACAAAATTATTGAAAGTTCGA TTTACAGCAGCTGGAAACACAACATATGTACCGAAGAAAATCTATTGTAC AAGAAGAATTGATTCAACAGTTCAGAAGTATCTTCAGAGACCAAAATTCA AAGAGCTTCTTCTAGAATCTAAAAAAGCAACACAAGACGATAATGTAATT AAAGATATTTACGATGGAAAAACATGGAAAAACTTTACAGATGAGGAAGG GGAATTATTTTTCACTGATAAGAGAAATCTAGGGTTGATGATGAATATTG ACTGGTTCCAACCTTTCACCAACTCAGATTACTCACTGGGTGTCATTTAT ATGGTACTGCTGAACCTACCACGTGAGGAGAGATTTAAATACGAAAATGT AATTGTTTGCGGGATTATTCCTGGCCCTAAGGAACCATCAAAAAATGTTA ACACATTTTTAAAACCTATCGTGACTGACCTATTAAATGGCTGGAAAGGT GTGATGCTCAAGGATGGAATATATGGCAAAAGTTTGTACAAGTATGCACT AATAAGCCTATCCAGTGACATCCCAGCTACACGTAAATGTTGTGGTTTTC TTGGATTCTCAGCAAAGCTTGGTAAATATATTTTGTTTTCCTCCAGAGTT TTCTTTAAAGCTCTATGTAAGGTGTAAACAGCGATAAAATCAGTCTCCTA AAATTACATGTTTTCACCATATACTTTAATCAGAAATTTTTGCGAGAACA ACTTTATCGCTAATTAGCAAATCACAAAAATTTTGATTTGGTGTGGATTT ATTTTAGTAAATCACGTTTTTTTTTAATTTAGCGTGGATTAATTTTAACG AAAAGAAGAAAATGTAGTGTAGACTGAATCATGTAACATTTTTGATATTT AAGTTTTTTTTCAATTTTTCAGGTTGTAGCAAATGTTTTAAGAAATTTCC AACAAAGAATTTTGGAGATAAAACTGATTACTCCGGCTTCGATATTGAAA ATTGGGATTTACGAACTGGAAAACAACACAAGGTAGCTGCTGGCTTGATA GAAAGGTGCAAAACCAAGACAGGGAAGGAAAAGATGGAAAAACAGCTTGG AGTGAGATTTTCACAATTGTTTGATTTACCTTACTTTGATCCAATTGAGA TGCACGTCATAGACCCAATGCATAATCTCCTGTTAGGTAAGATTTTTTAC TTAATGCCTTCAATTCGACACATGGTTTTAGGTTACAATTCGTTCCCTGG GTGGAGTATTGAAATTCAAATCTCAGGCTAAAGGCTTATTTATTATTGTG ACTCACTGAAGGAATATTGCTACGTACTGTTTACACCCTAAAGATTCCTT AGATTTGCAAGGCTAATTTTTTAACTTGTCAAAGGGCTTGATCCTTTATA ACAATTTGGTTGCTTGCAAAGAATGTATATTAAGCATAGGTTTTACCGAG AAAATATTTTTTGAAGTTTTGATTTTAAAGAGTGAATCGTCTAAAATTTC CCATATTTGCTACATTTTTTTTTTCTCAATCTCTATTTCAAAACACCTCT CCCAACTGAGATATTCCAGGTTATGGACCTAGATTAAAATTCTTTCCAAA TTGTACCAAAATTACAGAATAAGCCTAAAGTTTCTTCTCTATTTTAAGGA ACTGGTAAATTATTGATAAAACTTTGGCTGAAAACTGGAACTTTGACGGA ACAGAAGCTGAAAACAATCGACAGGTTGCAAAACCATATTAAAGTTCCAA GTGGTTACAGCAAGATGGCTAGACATATATCAAAGTATTACAAGAGGTTC AAAGCAGAAGAATGCAAAACATTTCTTCTGATTTACTCTTTGTACTGTTG CAAAAGGATTCTCGGACGTAAAAAGTTAGCAAACTTAACAAAATATGTCA ATGCATGTCGTTTGCTGTGTCGCAAGTCAATTAAGAAGGAGGATATCAGT CGCGCTCATGAGTTGCTTCTAGATTTTTGCAAAGGATTTCAAGAGTTATA TGGTAAAGAAAATTGCACCCCGAATATGCATCTTCACTTGCACTTGAAAG AATGTTTGGAAAATTTTGGTCCAGTTTATGCCTTCTGGTGCTTCTCCTTT GAAAGGTATAACGGGACACTGGGTAATTTCCACACCAATAATTACAACAT TGTATCAACTTTCATGAAAAAGATTGTCTTGAGTCAAAATATATCGTCCA TGGACCACAGTTTGTATGACTCATTTTTGAAACCAAAGTCTGCTCCTCGA CAAATACAAAGTCGGAAGAAAAAGGAAAAGTCTTTTCTTGATGATCAACA CAAACATATTGCCTCAGCCCTGTCAATGGAACAAGTAAACCTTTCAACGT TTTATAATGATTATGATCATGTCACATTTGATGGCATCAAGTATTCTTCC ATCAAGCATAAAAATGGCGAGTCAGCTGATAAATTCGTTATGGTACCAAT ACCGGACAAGAAAGAGCCTAACAACATCATTTTGCGTCCAGGAGAAATTT TGAATCTTTATAAAATTCAAATTGTTAAACCAAGATGTGAATTTGATTAT GTGGCTGAGTGTCGATGGTTTAAACCGTATGATTATCAGGACGAGTTTGG GTTGGATTGTCCCTTGAAGGTTTGGAATTCAAATTATGAACACTGGAAGT TTTATACTTATGTGAGGCTTTCTGATATAAAGACAAAGTTTATATGTATA AAAAAAAACTGCACCTTTAAAAGGAACGATTTAATTTATCGACGGAAAAA GAAAATTTATGATACAGTACATTTTGTATTAGATTTATAAGGTTTGGGTA AGTTTTTTTTGTTTCAGATTTGACGTGTCATTTGAATCATTTTTTTACTC ATGTATTTGCATTGTCGAGGATAAATGATTGTGTAGTTCGCACACTTTCA CTATTTGTCACTGATTTGCCCCTAAATTTTCTCAAAGGATTCAACAAATT TCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00034775TCONS_00034775Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00034774TCONS_00034774Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00034775-proteinTCONS_00034775-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001217supercontigsc0001217:33152..43254 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.12 0.17 0.03 0.03 27.84 22.09 7.86 8.62 2.98 5.15 3.42 2.46 1.33 1.36 0.23 0.25 0.09 0.13 0.08 0.1 0.04 0 0.13 0.09 1.7 2.15 0 0.04 0.02 0.05