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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00034775 ID=TCONS_00034775|Name=TCONS_00034775|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3755bp gCATTTAATAAACTCACGTGTTTTCAATGGAAGTATAATTGAATGTATCA TCATCAGAAAAATCATTTCCGTCTTCACTTGTGTTTGCCTTCTTGGGAAT TTGAGAAGAAGGTAGTAGAACTTTCGCAGCCTTTCTCTTTCCAGGATTTG ATGCACTTTGTAATCCAAATGCTTCGTCTGGTGTTAAATTGTTCTTTCGA GTACTTTCCCTGACTGTCTGTTTACTGTAAAATGCACCAGCATTAACACT GACATTCTGAGATTTTGATTTGGCCATCTTCTTTGATTTGGAATTCACGT GCGTCGTCGGATGAGAGTTGTATAGAAAGAACTTTTGAAAATTCGTGCAT TATTAACGGCCATGTGAAAATGATCCGTGGTCGGATATGTTCTCAAAGTT TACGCTtataaaatgaagtttttatGTTAGGCGGTGTGATAGATTGATTC CGGAATTTCCGATATTTCCGATAATTCCCTTTTTTCccgaatgaaaaaaa aactacgtGGTCACACTGCAAGACAATCGGCTTCATCAAAGTTTGTTTAG TCTGTATGACCTAGACATATCCCATAATccatttggaaaattttaaatct GAGACGAATCTAACATGGCGGCTTGCTTCGAGAGAACATGGCGTGCTTTT TGatggaagaaaatgaaaactcggttttttcttttttggtttgTGGGCTT TAACTATTTACATGAAGATAATGATGATACTTCTCTCTGTCCATTGTGTC AACACATTTGTGTGATTATGTATTAAGCCATTACTCACTCAATAcctttt tttaatagaaaaaagTCATGCCAAAAGTTAAAGGAAACAGAAAGTTTTGT ATTCATTGCAAATCTACAATATCACGTTCGCATTATTATTCATTTGGACA TAACAGAGGGTTATGTGCCAATATCAAAAAGCATCTTCTCCACCCTTTAA ATGCTTCAAAACAAGTTGATACCAGTCAGCGTCAGGAATCATCCAATTTA CAAAACCAAAATTTTGGCAATCATCCTTGTGAGGAAGAAGAGAAACAACA AGAATCACAACCAGTCACAATTGATGATGTAGATTTTGACTTAGATAATG CTGAAGCCGGTGATGCTGACTCAAATGATGATTTCTCAAGTGATTCAGAT AGTGATAGTGAATTGGATGAAGTCGATCCATCAGATAGTGAGAATGATGA GGTCGCAGATCATTCTGTGGATGTTGAATGCCCTCGAGCAAAATGTTTGG CATTGGTTTTGCGTGCAATCTTCCTTTTCCAAGTTCATGCTTTTATTTCC AATGCATCCATCGTAGTGCTTCTTGGGATGATCAGGGTGGTCATAAACTT AATTGCATCGCTGGCTTGTTTCGATATTCTTTCTTCATTTGCAAAAGAAT TTCCATCAACATTGTATTCCGCATACAAGAAGGCAGGCATAACAGTTGAT GATTTCGAAACCTGGGTTGTTTGCCCTCAGTGTAATTCTTTATACAAATT CGACAATTGTTTTGAAACTAGAAAAGGACATAGTAAAAAGACAGTGAAAT CCTGTACCTTCAAACCACCATTTACAAGAGCTGTTCAATGTAACacaaaa ttattgaaagttcGATTTACAGCAGCTGGAAACACAACATATGTACCGAA GAAAATCTATTGTACAAGAAGAATTGATTCAACAGTTCAGAAGTATCTTC AGAGACCAAAATTCAAAGAGCTTCTTCTAGAATCTAAAAAAGCAACACAA GACGATAATGTAATTAAAGATATTTACGATGGAAAAACATGGAAAAACTT TACAGATGAGGAAGGGGAATTATTTTTCACTGATAAGAGAAATCTAGGGT TGATGATGAATATTGACTGGTTCCAACCTTTCACCAACTCAGATTACTCA CTGGGTGTCATTTATATGGTACTGCTGAACCTACCACGTGAGGAGAGATT TAAATACGAAAATGTAATTGTTTGCGGGATTATTCCTGGCCCTAAGGAAC CATCAAAAAATGTTAACACATTTTTAAAACCTATCGTGACTGACCTATTA AATGGCTGGAAAGGTGTGATGCTCAAGGATGGAATATATGGCAAAAGTTT GTACAAGTATGCACTAATAAGCCTATCCAGTGACATCCCAGCTACACGTA AATGTTGTGGTTTTCTTGGATTCTCAGCAAAGCTTGgttGTAGCAAATGT TTTAAGAAATTTCCAACAAAGAATTTTGGAGATAAAACTGATTACTCCGG CTTCGATATTGAAAATTGGGATTTACGAACTGGAAAACAACACAAGGTAG CTGCTGGCTTGATAGAAAGGTGCAAAACCAAGACAGGGAAGgaaaagatg gaaaaacagcttggAGTGAGATTTTCACAATTGTTTGATTTACCTTACTT TGATCCAATTGAGATGCACGTCATAGACCCAATGCATAATCTCCTGTTAG GAACTGGTAAATTATTGATAAAACTTTGGCTGAAAACTGGAACTTTGACG GAACAGAAGCTGAAAACAATCGACAGGTTGCAAAACCATATTAAAGTTCC AAGTGGTTACAGCAAGATGGCTAGACATATATCAAAGTATTACAAGAGGT TCAAAGCAGAAGAATGCAAAACATTTCTTCTGATTTACTCTTTGTACTGT TGCAAAAGGATTCTCGGACGTAAAAAGTTAGCAAACTTAACAAAATATGT CAATGCATGTCGTTTGCTGTGTCGCAAGTCAATTAAGAAGGAGGATATCA GTCGCGCTCATGAGTTGCTTCTAGATTTTTGCAAAGGATTTCAAGAGTTA TATGGTAAAGAAAATTGCACCCCGAATATGCATCTTCACTTGCACTTGAA AGaatgtttggaaaattttggtcCAGTTTATGCCTTCTGGTGCTTCTCCT TTGAAAGGTATAACGGGACACTGGGTAATTTCCACACCAATAATTACAAC ATTGTATCAACTTTCATGAAAAAGATTGTCTTGAGTCAAAATATATCGTC CATGGACCACAGTTTGTATGACTCATTTTTGAAACCAAAGTCTGCTCCTC GACAAATACAAAGTcggaagaaaaaggaaaagtctTTTCTTGATGATCAA CACAAACATATTGCCTCAGCCCTGTCAATGGAACAAGTAAACCTTTCAAC GTTTTATAATGATTATGATCATGTCACATTTGATGGCATCAAGTATTCTT CCATCAAGCATAAAAATGGCGAGTCAGCTGATAAATTCGTTATGGTACCA ATACCGGACAAGAAAGAGCCTAACAACATCATTTTGCGTCCAGGAGAAAT TTTGAATCTttataaaattcaaattgttaAACCAAGATGTGAATTTGATT ATGTGGCTGAGTGTCGATGGTTTAAACCGTATGATTATCAGGACGAGTTT GGGTTGGATTGTCCCTTGAAGGTTTGGAATTCAAATTATGAACACTGGAA GTTTTATACTTATGTGAGGCTTTCTGATATAAAGACAAAGTTTATATGTA TAAAAAAAAACTGCACCTTTAAAAGGAACGATTTAATTTATCGacggaaa aagaaaatttatgataCAGTACATTTTGTATTAGATTTATAAGGTTTGgg taagttttttttgtttcagattTGACGTGTcatttgaatcatttttttAC TCATGTATTTGCATTGTCGAGGATAAATGATTGTGTAGTTCGCACACTTT CACTATTTGTCACTGATTTGCCCCTAAATTTTCTCAAAGGATTCAACAAA TTTCT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00034775-protein >TCONS_00034775-protein ID=TCONS_00034775-protein|Name=TCONS_00034775-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=924bp
MPKVKGNRKFCIHCKSTISRSHYYSFGHNRGLCANIKKHLLHPLNASKQV DTSQRQESSNLQNQNFGNHPCEEEEKQQESQPVTIDDVDFDLDNAEAGDA DSNDDFSSDSDSDSELDEVDPSDSENDEVADHSVDVECPRAKCLALVLRA IFLFQVHAFISNASIVVLLGMIRVVINLIASLACFDILSSFAKEFPSTLY SAYKKAGITVDDFETWVVCPQCNSLYKFDNCFETRKGHSKKTVKSCTFKP PFTRAVQCNTKLLKVRFTAAGNTTYVPKKIYCTRRIDSTVQKYLQRPKFK ELLLESKKATQDDNVIKDIYDGKTWKNFTDEEGELFFTDKRNLGLMMNID WFQPFTNSDYSLGVIYMVLLNLPREERFKYENVIVCGIIPGPKEPSKNVN TFLKPIVTDLLNGWKGVMLKDGIYGKSLYKYALISLSSDIPATRKCCGFL GFSAKLGCSKCFKKFPTKNFGDKTDYSGFDIENWDLRTGKQHKVAAGLIE RCKTKTGKEKMEKQLGVRFSQLFDLPYFDPIEMHVIDPMHNLLLGTGKLL IKLWLKTGTLTEQKLKTIDRLQNHIKVPSGYSKMARHISKYYKRFKAEEC KTFLLIYSLYCCKRILGRKKLANLTKYVNACRLLCRKSIKKEDISRAHEL LLDFCKGFQELYGKENCTPNMHLHLHLKECLENFGPVYAFWCFSFERYNG TLGNFHTNNYNIVSTFMKKIVLSQNISSMDHSLYDSFLKPKSAPRQIQSR KKKEKSFLDDQHKHIASALSMEQVNLSTFYNDYDHVTFDGIKYSSIKHKN GESADKFVMVPIPDKKEPNNIILRPGEILNLYKIQIVKPRCEFDYVAECR WFKPYDYQDEFGLDCPLKVWNSNYEHWKFYTYVRLSDIKTKFICIKKNCT FKRNDLIYRRKKKIYDTVHFVLDL Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0001217:33152..43254- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00034775 ID=TCONS_00034775|Name=TCONS_00034775|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10103bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:33152..43254- (Clytia hemisphaerica) GCATTTAATAAACTCACGTGTTTTCAATGGAAGTATAATTGAATGTATCA
TCATCAGAAAAATCATTTCCGTCTTCACTTGTGTTTGCCTTCTTGGGAAT
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GAAAGGTATAACGGGACACTGGGTAATTTCCACACCAATAATTACAACAT
TGTATCAACTTTCATGAAAAAGATTGTCTTGAGTCAAAATATATCGTCCA
TGGACCACAGTTTGTATGACTCATTTTTGAAACCAAAGTCTGCTCCTCGA
CAAATACAAAGTCGGAAGAAAAAGGAAAAGTCTTTTCTTGATGATCAACA
CAAACATATTGCCTCAGCCCTGTCAATGGAACAAGTAAACCTTTCAACGT
TTTATAATGATTATGATCATGTCACATTTGATGGCATCAAGTATTCTTCC
ATCAAGCATAAAAATGGCGAGTCAGCTGATAAATTCGTTATGGTACCAAT
ACCGGACAAGAAAGAGCCTAACAACATCATTTTGCGTCCAGGAGAAATTT
TGAATCTTTATAAAATTCAAATTGTTAAACCAAGATGTGAATTTGATTAT
GTGGCTGAGTGTCGATGGTTTAAACCGTATGATTATCAGGACGAGTTTGG
GTTGGATTGTCCCTTGAAGGTTTGGAATTCAAATTATGAACACTGGAAGT
TTTATACTTATGTGAGGCTTTCTGATATAAAGACAAAGTTTATATGTATA
AAAAAAAACTGCACCTTTAAAAGGAACGATTTAATTTATCGACGGAAAAA
GAAAATTTATGATACAGTACATTTTGTATTAGATTTATAAGGTTTGGGTA
AGTTTTTTTTGTTTCAGATTTGACGTGTCATTTGAATCATTTTTTTACTC
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TCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0001217:33152..43254- >TCONS_00034775 ID=TCONS_00034775|Name=TCONS_00034775|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=13875bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001217:33152..43254- (Clytia hemisphaerica) GAACTGGTAAATTATTGATAAAACTTTGGCTGAAAACTGGAACTTTGACG GAACAGAAGCTGAAAACAATCGACAGGTTGCAAAACCATATTAAAGTTCC AAGTGGTTACAGCAAGATGGCTAGACATATATCAAAGTATTACAAGAGGT TCAAAGCAGAAGAATGCAAAACATTTCTTCTGATTTACTCTTTGTACTGT TGCAAAAGGATTCTCGGACGTAAAAAGTTAGCAAACTTAACAAAATATGT CAATGCATGTCGTTTGCTGTGTCGCAAGTCAATTAAGAAGGAGGATATCA GTCGCGCTCATGAGTTGCTTCTAGATTTTTGCAAAGGATTTCAAGAGTTA TATGGTAAAGAAAATTGCACCCCGAATATGCATCTTCACTTGCACTTGAA AGAATGTTTGGAAAATTTTGGTCCAGTTTATGCCTTCTGGTGCTTCTCCT TTGAAAGGTATAACGGGACACTGGGTAATTTCCACACCAATAATTACAAC ATTGTATCAACTTTCATGAAAAAGATTGTCTTGAGTCAAAATATATCGTC CATGGACCACAGTTTGTATGACTCATTTTTGAAACCAAAGTCTGCTCCTC GACAAATACAAAGTCGGAAGAAAAAGGAAAAGTCTTTTCTTGATGATCAA CACAAACATATTGCCTCAGCCCTGTCAATGGAACAAGTAAACCTTTCAAC 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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
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Annotated Terms
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Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
| IPR004242 | Transposase_21 |
Blast
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