XLOC_012404 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012404
Unique NameXLOC_012404
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000405:115499..126820-

Legend: gene
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>XLOC_012404 ID=XLOC_012404|Name=XLOC_012404|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11322bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000405:115499..126820- (Clytia hemisphaerica)
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TCCTAAATAGTTTTATTCATTCTTCCAATCGTACAGCTTTTATCAGACAG TATTACCGGTCTATGCTTGGCATCGTATCTGCAAGAAGACGGATTGCCCT TATCGTTGTTACATCATATTTGTCGACAGATCGTGGAGGGGNGATCAGTG CATAATACACAGCCAGTCAGCCAGCCAGCGTAATTTTTTCCTTGAAATTC TTGATTCCCGAAAACCTCAGAAAAGAATTGAATTTGAAAAATAATTTATT TTATACTCTTAAATAGTTTTATTCATTCTTCCAATCGTACAGCTTTTATC AGACAGTATTACCGGTCTATGCTTGGCATCGTATCTGCAAGAAGACGGAT TGCCATTATCGTTGTTACATCATATTTGTCGACAGATCGTGGACGGGCTT TATTTCTTACACTCCAAGTCAGTCGTTCATCATAACTTAAACGTATGTCT GCTTGTTTTATCAGGATTTTCTTTTTTAGAGATCTTGTATGTGAGAAAAG TCAGAATGTCTTTGAAGTGTAATCAGCATTTTTTTAGTATTTTAGTTCTA TTGTTTATGAAATGTTCATGAAGCTTTGTTTGCCAAAAATATGACATTAT CGAGATGATTAAATGATATCACTTCATAATCTCAAATTTTCAAATATTTT TATGATTTCAAATGTGCGTACACACCCAAAGGAAAAGTGGCAGTTTCGAC GTTTTTTTATTACGAGGAGGAAGGGAGGGTAAATAACATGGAATGGGTCG GGAATTTACTTGTTTATCATAATTTTAGTCCATGATTCCCTTTCCAAGTC TAATTTAAATCTCATCTGCATGTGCTTTTCTCCCTATAACATCTTAGCTT GAAACCACTTTCATCAACGAGCAAAACGAAGTCACATTAAGCGGTTATGC GATGGTGAGAAGGATATGTGATTTGTGTATATCCCCCTCATCTTCTTCCT CTTTCAATGACAAAACAGAAGAGGAAGAACAGAATGGTGGGCGTGGCAAG TTGTTGTTTCGCCAAGACATGAAAGCTGGGAAGAAAGGAGATATTTATAA TATGGTAAGAAGATTTTTCCAAGGGAAATTTTCCTGCCGTTTTCAAATTT TGTTCAGTTGTAGGAACAGCAAAATCTCTTAAAGTGGTCACTCGTTAAAA ATAAAAACAAAATTTCCACATATATTCTTTCTTCTACATTAGACTAGCAC TGCTACTCGCATGACATTTTTAACACTCCCCAAAGGTTATGGCGAATTAA CTCTCTTTTTCCAACTTAAAATGTCACGACTTCAGCGACAAAAGTTTTCC TAAGCAGCCAATTTATGAATGATCAATCAAAACTTGTCAAACATTCTTGA CTGTGAAATAAAATTCAATCAGTCTATAATAGTCTATTAGGTTTATTTCA AAGGGGGAAGAGTATATTGGAGTCATTTATAATGCGTGTAATACAGTAGT ATAGGCGTAATATGATAATACGATTATTCGATTATTGTCACGGGATATAG TTTGTATATAAACTAAAATTTGTTCCCTCCATTACTTTTTGCTTTATTTA TACTATGTCTGAATTAGTCGCCCATCTTGCTAGACTAGGGGAATAGAGAG AATATCAAATTTTTTTTAGGGTTTGATTGCACTTTCCTTGTATCAAGGAC ATTCTCTTATCCAATTACCAATCGACTTTCCAGAAGATCTACCCGATGCT CTTCTCTCCTTCTTAAAAAGGTTTGTTTTCATCGATCTTTTAACGCCTTA GTGCAAAATAGTTTCCTTCCCAGTTGGTGTAAAAAAATTAGATTTGAATT TTGGTTGCGGTATAAAATTTTGGGTAAATGTTTTGGTCGGAGATAAAAAA AATCGGGTACAAGTTTTGGTTGGGTGATAAAATGTCGGGGAAATATTTCG CCGGGGAAAAATTTCGTCACCCCCTCAAAATTTTCGTCACTTTCTCCCGA CATTTTTTCCCCGATAATGTAATGTGCTAATCTTTTTGTGTAAAATCCAT TTTCCGTCTCAGACGAAAAACCTCGCTCTGACCACTGTTTTACGTTTTTT ATTTCAAGTTGTTTGGATGTTGAGGAAGACAAACGATCAACTGCAGCGCA ACTTCTTCAACATGCATTCATCTGCGATAAAATCATCGACAACCCGAAAA CGAAACATACTCAACAAAACAATGGTGCTTCGAAAAACGACCATTCTGAG AGTAACNCTCCTGGTGTGAAATGTCTGCAGATATTGATAGGTACAAAATT ATTAATATTTCTTTAGGCTTTGCAGGTACCAGAGATGCTAATTATTGTTT TAATTCCCAATACTATACATATGGTGAGCCTGAAAACAAATTTTCCGGAT TTTTTTGAATAATTTTTTTCCTTCTCAACTTAAAAGTACAGCAATTTTTC TCGATTTAAAGGCATAATTTTCATTTTATATTCAAAGGTATTTTCTTCAA TATCAAGGCCTTTTCAAATTAAAAATGGTAAAAAGAACTGCCGAAAAATA AGCGACCAAGACTCAGCCAAGATTAAGACGTTCTAATAAGAAAGTGTACA AATGCCTTGAAACTCTCTTTTGTTTTCTCTCACTCAAAGGCAAGAAACAT CATCATCAGGAAGCGAGTCAGACTCAGACGAAGATTAAGACGTTCTAATA AGAAAGTGTATAAATGCCTTGAAACGCTCTTTTGTTTTCTCTCACTCAAA GGCAAGAAACATCATCATCAGGAAGCGAGTCAGACTCAGACGAAGATAGC GGAGGAATCTTCAAAAAGCCAACAACAGCAACAACAATAAGAAAGACAAC GTTGAAGAAAACGAGGCCGTCTTACCACGACTCTTCTGACGGTGGTATCG TTTTTAATGACGATTCGGTGNATTGATCATGCAACCATTTTTTAGAGAGA ACTTTCAAGGGAAATCCAGGTTGTTGAATGAATTTGATACAATAGAATGG TTAGGGAAAGGTGGATTTGGAAGTGTCTTAAAGGTAGGAAAAGTTTTTGT TTCAGGCTATCGCTTTTATATCGCTATGAGGTTGAATTATTTCATTCCTT GAAAAACAGTGTTTATTCAAATGATCCGTCAATCTTTAGGACGCGTTCTC AGTTTGTTTAGATTTAAACAAAGAAGTCCATCACTCCGTTACTTCCGTAA ATATTTTTTATTTCAAATGCATGTACAAGCCGCAACCAAGAGAACAATGC GAATCTCGATTTAATTTTTTATTCGGGTATGTTAAAAACAGGGTGGTATG GGCGCGGTATGGTATGGTATATCGCGGCGCTCCTGGGTCCATACCTACCG GTACGGTACAGGACCGAAAAGTTGAGCGACCTCATATGAGCATATCTCAT ATACGCGTTTTCAGTTTTCAGTTTTTTTTTATTCTTGGTGGGGTTAAGAA AACAAGCCGACATGGTCCAGACCTATCGGCACAAAACCGAAAAAGTTGAT CTCATATGATACCAGTTGCACTTAATGGGATAATCAATCCGCATTTTTTG ATTTCAGGTGAAGAACAAACTTGACGGCAACTTTTACGCATTGAAACGTA TACGATTGAACCCAAGCAATTTACAGTTGNTCTATCTGACAAAGATTGTT GGATTATGGGATTTATGGCGTCAGTAAAATGTGTATTAAGATTGAAATAA AGCAGCTTCTAATATAAATTTGATAAATTTTATATTATACCCCACAAAAA AGTAACAATAGATGCATCGAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022123TCONS_00022123Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022122TCONS_00022122Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022121TCONS_00022121Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022120TCONS_00022120Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022120-proteinTCONS_00022120-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000405supercontigsc0000405:115499..126820 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.44 2.68 1.06 0.64 19.13 14.16 9.77 11.21 5.56 8.78 6.34 5.16 7.19 8.09 6.16 7.51 10.55 10.17 6.86 8.18 8.15 9.37 4.22 5.76 11.17 11.61 4.65 2.62 3.19 2.97