|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000379:224156..234132+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_011862 ID=XLOC_011862|Name=XLOC_011862|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9977bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:224156..234132+ (Clytia hemisphaerica)
GCATTAAAATGATATGTCAATACTTTACACACATCTATACAATACTTTTG
AAAATACAACACACATACACACATAAACGAACCTTTTGAGAAGACAAGTT
TCAAAAAGAGGCGTTCAGAATTTTATATACGAGCAGGCACTCGTGAAGAC
AAgaacgaaattttcagaagacAAATTTTACAATAATACACGGTTTAGAG
ACGAAGCAAGCACAcatcataaaagaaatcaaaatggccgaagaaaagaa
attctttaGAAGGGTGAGTTATTTatactttttattattttctgcATTAG
GAAACTATAGGAAATACACTATAACATTTTTGCCGTCATTAGAACTTTGT
TTTAAGCTTGACACCTtttctaaagatatttatttccATGATATAGAAAG
AAGgcagaaatttctaaaaatttgcaCTCGAGCAGCACAGGATGGGAAGA
AagttgtttcttttcttttttgaaatgctGTACTTCTTCCAAGCAAATAG
TAGAAGATTCTTTAAAAGGAATATTTTGTTGTAGATTCTATTTCCACGAG
TTCTTAATGATCTGTCCAAATTTTACTGGATTTCGAAAGTCTAATGGCCG
TGGtttattttcatggtttttCAATATCCAGAACTGATATAAAAGCTAGA
ATAACCCTGAGCGACAGTATTTCTCCATTTTCTATATTATATAAACGGTT
ATCAGAAAACTTTTACAGCTTTACAGATGAGACATATTTATTGCAGGATC
GTGATTTTTAAGGtttcttccaaaaaaaatctattACTCAAAGGTTTTTC
TAAAGGTTGGTGGctttttaaatgtttcaaataaagattttcCTATCATT
GGCATATTTCTCTTTGATACTTTTTNAATCACGATTTTTAAGGTTTCttc
cgaaaaaaatattactCAAAGGTTTTTCTAAAGGTTGGTGGctttttaaa
tgtttcaaataaagattttcCTATCATTGGCATATTTCTCTTTgatactt
ttttgtttttgaaaactacttttaaaatttcccattttgtcaaaattagc
ATTAGAGTTTCAAATCTTCGAAATTCTATCATAATAAAAATGCTAAAACT
TTTATAAAACACGtggaaaacaaaagtaaaatcacTCAGTCAAGGGGTTT
AAAGTGAGCATTGAGGTAGTTAAAATAGATCTCCTAAATTTTATATTGAC
CACAATAACCAGTTTTCTCAGTTTCCTTGGAAAAATCTAAGCAGAGTCTA
TTTTCATGACAAATTCatgtgaattttcaaaattggcttgcaaagtttaa
aaaaatgcagtGTGTCTGGAAAAAAGCAGAATAAAACGATTTGACCTGAT
TAGTCCATTCCTGTTTCAATTACCTAAGGAAGTGAAATGAtgaattttga
ggattttactttgtaTAAAATATGAGCTTTGTTTTTTTGATTCGACACCC
TGTATACCCAAAGCTAGGTGTCTAATGAAAAACCAGAAAAActcaatcaa
aatcaattgattAATCCAGATGACAAAATGAAATGTTTACCTGTAACCAT
GAATGACCAAAACCTGAAAAGAGAAATGAAaagattaaattatttttgat
aataAACCCCCAGAGGAGTGTAAGGGTTGAGGaatgctgggtatgtgcgt
ggTAGACCTTTTTACCCTTAGAGAGGctgttttttgctgaaaaggtgatc
ttttaaagctcaaaaatttttgaaggtcTGTCAAGGTCACTGGATTTAGC
TTTTTAGTAATTTTCGAGATGTATTATATGATTTTCTTTGTAGAATCCTT
TCATGCTCCTGAGCAAaaccttttgaaattttgggtTTTGGGACAAAAAA
GGTACATTTTCAGGTGTTcgaaaacaaaaaagacaaaTGGGTTTGACACA
GACGTTTTTTCTATGAAAACTTATTTGTAAATTCTGACCCTAGGTGCCTC
TTTTTTTCTGGTTTTGTAAGAGTCAGTTAAGGTCCagggatttttttatt
tagctCATTTTAAGGAGCTTCCAGCTTTTTTAACTTCCAACATAGACATT
TTTTGCTAATCATTTTGAAACTAAAAAATTAGCAGAGAAAACATTAAGAA
AAAGCAGAGGCACATATTGAGATCATGGAACTTGGGCATTTCCACATCGA
CTCGtgcaatgtttaaaaaatttggattttccgatatttttattttttgg
aacattttaCATTGTACAGAACATTCTACCAAAGCAACAAGGAAAGACTT
GAATAGAGATGTTTTAATGGGAATAGAACACCTTTGACATAGCTggaacg
ccccccccccctgagggAGGGATAAAACATCCAGCAGCAATTGGTACCTA
attttagcctgtggctagggggggGNGGTTGAGGaatgctgggtatgtgc
gtggTAGACCTTTTTACCCTTAGAGAGGctgttttttgctgaaaaggtga
tcttttaaagctcaaaaatttttgaaggtcTGTCAAGGTCACTGGATTTA
GCTTTTTAGTAATTTTCGAGATGTATTATATGATTTTCTTTGTAGAATCC
TTTCATGCTCCTGAGCAAaaccttttgaaattttgggtTTTGGGACAAAA
AAGGTACATTTTCAGGTGTTcgaaaacaaaaaagacaaaTGGGTTTGACA
CAGACGTTTTTTCTATGAAAACTTATTTGTAAATTCTGACCCTAGGTGCC
TCTTTTTTTCTGGTTTTGTAAGAGTCAGTTAAGGTCCagggattttttta
tttagctCATTTTAAGGAGCTTCCAGCTTTTTTAACTTCCAACATAGACA
TTTTTTGCTAATCATTTTGAAACTAAAAAATTAGCAGAGAAAACATTAAG
AAAAAGCAGAGGCACATATTGAGATCATGGAACTTGGGCATTTCCACATC
GACTCGtgcaatgtttaaaaaatttggattttccgatatttttatttttt
ggaacattttaCATTGTACAGAACATTCTACCAAATCAACAAGGAAAGAC
TTGAATAGAGATGTTTTAATGGGAATAGAACACCTTTGACATAGCTGGAA
CGCTCCTCCTGGAATCCCCCCCTGAGGGAGGGATAAAACATCCAGCAGCA
ATTGGTACCTAattttagcctgtggctaggggggagtaaccatgttaggg
gtcacctaatttttttcagatggacctgggggctagattctatgtttggt
gatctttttctgaacttgtttttctttcatcatAAACTTCACTATGGAAA
AATTTgacgtgtcattggcttaggggtcacctaaaatatttggaaaccag
ggttacctaaatcttaggggtcacctgaattcttagggggcacctaaaac
ctgctgccaagccatgttTGATGACCTTGACACATGGGCCTGGTTATTCA
AAAGTCGATTACTGTAGATTAAATCACGATTGGCGCTAATCGCCATGGGA
TCAACTTCTCCTGTTCGAACGTCAGATTAACTTAAcatgtttccaaatat
tttccaaatagTTTCCTTATCTTGACGTCACTTTACGAATGTTTCCAAAA
TATCCTGGGTGTCAGAGCAGGattaaaatttaactttttaattAGGGTTT
TAATCAAGATTTAAACCTAATTTTTTCAACTGCTGACGATCAGCACTAAT
CAATTTTGAGCAACTGGGCCCTGGACTTTGGTCACCTTTGATGGAATGAA
GGTTTCAAGAAAGTCTTTAAATAGGCAACGGCCCCCGAGGAGATGAAGGc
agaaattttcaatcatttcacagactttttttctgatttttgtataTATC
TTATATAgtgtacaagaaaaaacaaaatttgaattatagaactTCAAGTT
TCATCTTTTATGAATCGTCAGCTATCAAATAGCTGATAGCTGACGATTCG
TAAAAGATGAAACTTGAagttctataattcaaattttgttttttcttgta
cacTGTATGAAGCTCTGGTCCTGATCGTTGAGCGAGCACTCTTTGATGGA
ATCGTCTATCACTTATTGATATTGATATATCTTATATATACTTGAATCTT
CATGATGTTTGATCGTCTAAGATATCAAGCTAAATGGTTCTGGAAGTAGA
GGTTAATGATGTGGACGCAAATAAAGCTTGAAAAAGGATGGAGAGGTACT
TACTTTTAGAAGTTTTTTGTccgccattttattttatttcttttgcgGAC
CATGTGGAGCCATTTGTAAACACGCGTCGATGAGAGACCGTCCTAtccgg
gttttttttttaacctgaATAAACTCCGGATGATCTGATAAACGGAAATG
TCCTTGAGGCCATTCAATTAAGTGGCTCCCTCCCGTGAGTTTGTGGGAGG
GGGTAGTAGGTAGGGTAAGTAGGGGTATATAGTATGTCTGGTATGTGAGG
GGTATGTTCAAAggccaaagttcgaaaatcgaaaatttcccACTTTGATT
GAGCCAACATGTTCAAGGGAATTTACATATGATTTGTATAAAGCCATGGA
CCCTTTTCTaaccactttaggttcccggggggtactagggttgctaGCTG
ACAGGGGGTAccacccgactttcgaactttggacccttaccgggactaaa
aaggaggaaacgaaggaaaattttggcaattttacgacccttagcgggac
aaatttgaccaattttgaccaaatttcaatctttctcagggggtaaaaag
ttagcGGGACAGTCCAAataaggtacccttaagggcggcacataccgtac
cctacatttgcctaagtacccccccccctgggtttAGCCTACGCCTTGAT
AGCTTTTTTAAGTGCCACATTTCGTGTGCTgtccaaaaatcacgaaaatt
acatttttactttagcgAATTTAACGAAGGTTTTTTCGTGAAATTTATGC
AAGGTAGATaaagatgaaatttttaaagaaaaattgcctTAAAGCTGATT
AATATTCCATGCTTGAATCCTAATTTCAAATAACTCTTTATTATTTAATA
AAGGCAAAAGAAATATGTTGGATTCGGAAAAATCCTATTCATCACAATCT
CACAGTTTCATTGAtagatttcaattttaaagatttttgccGAAAGTTAT
AGATGAGATTTAAATCAATTCTTGTAACATCTTCAGAAATTGATTTGTGA
GTTTTTAACGTTAACTTTTGACAAACTTTCGCAAAAGAGCGAAAATAAAT
CGCGAAAAATTGCGCAAAAGTTTTCTGTAGTGAATGTCTGTACCAGAGAA
GCAGATCAGAGAGAGACTTGCATAATATTTGAGATAATTTGCAGGAAATG
GCAGAGAATTTGTAATGAAAATTACCGAGGGagggacttaggcaaaaatg
ggtgctgggtatatGTGGACAataaaggtcggtttttcgccTTGTAAAGT
CTCGAAGGGCTACAAATTTTGGAAAGtatcaaagtagtctctctaaggtt
gGAAAATcgaagaaagtttttcaaaaatgaccacTTCTTCGCAAAAACTA
GTCTCCATAAGGTACGATATTGAAAGGTCCCACACATAACCGTCATCTGC
CAATAACagtaccccccccctttataaattTCGTATAAAAGTTAGCACAA
AAAAAAAGCTGTATGAAAATTTGCCTAAGAGAAAATAAACTCGCTAAGCC
TTTggcaaatatttttgaaattcaaaaccttGTGGGATGCATGATTTTTA
CAAACTTGTAGCATGAAAAATCCCATCTGACAAAAGTAATTGAACAGGCT
CTTGAAAGGCTGGCAAAAGTCAAAGAACGGAGAAAGTAACTTCAAAAAGC
ACTAGAGATTATTGGCAATAATATTGTTTGAAATTAGCAATCTAGTTGAA
AGGAGGAGTCATTCAGGTCTTTACTAGAAATTAGCTACAACAAGACAATA
AAATAGAATTGCATAAGTATTGCACATGAAATTTCAGTATTAACGTCAAA
GCGAGgttgaaattttattggttaCAAGTCTTTTTAataccgtttttttt
tttgtgtgttcTCAAAAGTTTCATGAATGGAAATACTGACAGTGCTAACG
ATGTACTTGATGCATTTATTCATTCATATGAAACCAAAACGTCAAGAGCT
TGTTAATATGTTATTACATACGTATATAGACAAATCCTAAAAAGGAAATT
TCATTTACGGTTTTTAAGGTCAATTTAGTAAAAGACCTTTTTCATTGTCA
ATGATGTTTTCGTTTTGACATTTAATATCCTTTATTTGCGTTTTGTTGAT
ACTTGATATGTGGATTGTGGAATGAATTCAACTATTCCTTTTTTGTACGA
ATGATACCAAGGGGTCGAAAGTTTAAGTGGGAGAGTATTGTTTTATACTT
TATGTCCATGTATAGAATTGTGTGCTCTCCTTCTTCTTGCTTTGAACAAT
ACAGTTTGCATCGTAAGAAGGTGGTTTTTAAAGGAgggtttgattttttg
aaacgtAATCACTTTATGTTGAAATAGTATGGTATTTCAAGTGCACAAGT
TTCATAAGGACGCCATAAAGTCTGTTTGTTGCCTTATTAGTTAGAGTCTA
GTGGAAAGAGATCATTGATATTAAAAGATGTTATTAAATAAAACTCCACT
CTcgcttttttagatttttatatcCAGAGCTTGCAAAGTTGAGCTTCGTC
GTTCATTTAGATAtcaattcgaatttttcttacATGAAGACATTATTTTG
ATAGACTTTTGTTTTTCCTAGCTTGTTCATTTGCACTTTTTAGCTTAGTT
TCTAATACTTTCTTGCTCTCGTTTCAGTTATTTCGCAAAATGGAAAGAAC
CAACTCAGTCATAAGTGATACCTTACCTGTCGTCACAGAAGAATCGTACT
ATCCAGATGGTGCTGACGCTTTCGGTGACAGCGTTGAGCCACCTGCAGGG
GACATGGGTAACGAATCGATCAATACAAATTACGCTTTAGTCGAAAGTGG
GAAATCATCCAAATATGGAGCCGCCAAGAAGCGCCGCAGCTTCCTTCACT
CGAAACAATTCCGAAGTTTCAGATCTGCATCGCTGAGCGTTTCCATGCTT
GAGAAACCGTCTGATGATCGTAAAGCGCATGCATTTTTGGCAGGTTGGAA
CGTCAGTAATTTGATCCAAGGAACCGGAATCTTGGGCGTTCCATATGCAG
TCCAACAGGGTGGATGGGCGGCCGTGGCAATGATCTTCATTGTCGCAATC
TTGTGTTGCCATACTGGTAAACTCCTTATTGAATGCATGTATGAGAAATC
AAAAAAGACTGGAATCAAGCGACGCCTTAGAGTCAATTACCCTGAAGTGG
CCGAAGCAGTGATGGGCCGTAAAGGACTAGTTATTCTTGGAATCATCCAA
TCAGTGGAGATGTTCGGTGGAGTTATCATGTATGTGGTTCTTCTTGGTAC
CGTCTGGGCAGACatgtttcaaaaatatacaGGACTAGGTATGAAAGAAT
GGGCAGCTCTTAATTGTTGCATCAGCTTGCCAACACTGTTTATCACTAAG
ATGTCTATCGTCTCTTGGTTATCCATGTTATCTGTCTTCTCATTGATGTC
AGCCCTGGTGACTCTCATCGCGTTTTGTTTCACTCAAATCTCTGTATGGT
CGTTGGTCAATGTTCCACCATTTGATCCACAAACCTTCCCCGTTGGCTTT
GGTATTATTGTCTTCTCATATTGTGCTCATGCCGTCTTTCCAAGTATTGA
AGGATCTATGAGAAAACCAGAACAGTTTAATGGTATGATGAACTCGTCTT
TCCTGCTAGCCGCTATCGTCAAAGGTGCTCTCGGTACATTCATGGTTCTA
ACCTTTGGAAATCTAACAGAGGAAGTTGCTACAGTCAATCTAGCTGCTTA
TCCAATCTGGAGTAAAGTGGCAACCTTCCTAGTCATCGGTAACGTACTTT
TGGCTATCCCCTTGGGAATGTTCGTCGTCAGTTTAACTTTCGATGATGCC
TTTCTAACCTACTTCCCTCACTTGAATCGTGACTCNCAATCAGTGGAGAT
GTTCGGTGGAGTTATCATGTATGTGGTTCTTCTTGGTACCGTCTGGGCAG
ACatgtttcaaaaatatacaGGACTAGGTATGAAAGAATGGGCAGCTCTT
AATTGTTGCATCAGCTTGCCAACACTGTTTATCACTAAGATGTCTATCGT
CTCTTGGTTATCCATGTTATCTGTCTTCTCATTGATGTCAGCCCTGGTGA
CTCTCATCGCGTTTTGTTTCACTCAAATCTCTGTATGGTCGTTGGTCAAT
GTTCCACCATTTGATCCACAAACCTTCCCCGTTGGCTTTGGTATTATTGT
GTTCTCATATTGTGCTCATGCCGTCTTTCCAAGTATTGAAGGATCTATGA
GAAAACCAGAACAGTTTAACGGTATGATGAACTCGTCTTTCCTGCTAGCC
GCTATCGTCAAAGGTGCTCTCGGTACATTCATGGTTCTAACCTTTGGAAA
TCTAACAGAGGAAGTTGCTACAGTCAATCTAGCTGCTTATCCAATCTGGA
GTAAAGTGGCAACCTTCCTAGTCATCGGTAACGTACTTTTGGCTATCCCC
TTGGGAATGTTCGTCGTCAGTTTAACTTTCGATGATGCCTTTCTAACCTA
CTTCCCTCACTTGAATCGTGACTCTAAATTTCATTGGGTCTGGCTCCTTA
TCACGCGGCCGCTTTTGATCGCATTCGCTCTTTTCTTGGCTATAATGGTA
CCCCATTTCGGACTCTTAATGGGAGTAATAGGTTCCCTCACTGGTACCTG
TTTATGTTTCttatttccttgttatttccaCTTGAAATTGAGATGGAACA
CTTTAGCTAAATGGGAAGTTGCTGTTGATGTTGCCATCATGGTCTTTGGT
CTAATTGCTGGATCCTTGGGATTTGCATTTTCAACGAAAGCCCTTATTAT
GACTTATCTATAGATTAAAGTGGTGATTCTGATATCGCGAAATGAAAGca
tttttaatgaaatattcACGTTTGGGTGTAATTCCTAAAATCAATGGTAA
CCTGTGGTAATATAAAAACAACTCTTGTTGACAAAGGAGTCTAAATTGTG
TAAGAGACTATTCTGAGATCGTATTTTAGTTGTTCAAAACATCTTAACGA
GGTATCAACGTCAATAGTGTGTGTATTGACAAATTTTGTGTAAGGATGAA
AAAATATGATCCTTTTGAATGTGTAATAACAAAAATGGCAGAACATTAGA
AATAGAAGGCAATACTTGAACTTTCGTACAACCTTCAAtgtatcaaattt
ctttttgttcagTTTATTTATCAAATAATGTATGGTCCTTGATCTAAATA
TTTGTCAAGGCTTACTTTTTTATGTAAACTTCCCTGAGGCCAATTTTTGT
TTCTGTTTGGTAATTTTCCGATTCAAGATTCgacttgtttttaatatttt
tggcaCATGGctagtttttcattttgatatcaCATGCACCCCATAGTTGA
ACGTCtaatcattattcaaaaatgTACAACGATCAAGCTTTCTTGACTTA
AGGGAAGTGATTTACaagcaacaaaaaaattattattgatattcaaaaaa
tgtaaattctGGGCCAGTCTGCCTTTAGGGCTTTCAATTATTCGAGTTAA
GTAAAATTTGAGggatttgaagaattttcaccCCTTCTTTATATAATGGC
CTCTTAAGACTTTAACCGCAGGATTGCTTCAAATCTACATTTGATCTCCG
CCTTTATAACTCAAATCACTCTTCTTGGGTAAACAAATTCCTATTGTAta
gcaaattattttgaaatataaatataCAATATTAGCATATAAAATCTGTA
CAGCtatatattttttgtcaatccttaattttattacaaattttttttaa
cgatttagcttttttgatataaaaatattttgtattataTAACATAACAA
ACTAAATGAAATTGACAAAGAATTAATATAGAATcgaattgtaaaaattt
gttgtatTACTCCTCTGATTTTAAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000379 | supercontig | sc0000379:224156..234132 + |
|
