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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044286 ID=XLOC_044286|Name=XLOC_044286|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7473bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCGACAATGACACTAACAACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCG
GGGTCTCCCGTCACACCGTTTCAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGC
CCATAGATACACTACAAGAAACACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCA
CCGAATTTTGTATGTAGCGTTTTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAAC
TCTTCCCGTAGCATTTAAAGTTGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACG
GTGTAACCGTAACAATCTCGGCAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAG
CTTCGCAACGCGACCGCCATTATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGA
CCTCCGATTTGTCGGGCGATCAGGGCGAGGTAGGTTTGATTTATTTTGTT
TAGCGGTCGTATACATTTAACATATCTTTCGGTCACCTATGGAATATTTG
GAAGTTTTGCTCAAATGATTCAATAGAAATTTCCTACATTCTAGGCCAGC
CTTCGATAACGGCGGTCGCAATTAATAATTTCTAAAAGAAATTTATGATA
GCAGCATCATTTCAAACAAGAGAGGGCAATTAAACTAGAGCCATTTATTA
ATCATTTGGATTAATTTTCGTGTTATGCAAAAATGCGTTAAAATTATATT
GTCGACCATGCGCAGTGGTAGCGTACGAAAAGTGGGCGCGTTTGAAAAGA
TATTTCAATAAACTTTAAAATCCAACTGGCCGTCTTCTATAAAAAAATGT
CGCATAAGCTTTAAAGATATGGCTGGCAAACGGAGTCTAATATAACCACA
TTTTTGTCATCAAGAACGAACTTTTTGCACGTAAGGAACTTGAGGATTGC
ATGTTCAAGTAATCGGGTCACGAACCCATGCACCTTACAATTAACTTTTT
TCGTTCCAAAAGAAAGTATGAGAAAATAGGAAGCATGAGAATTCACCAAA
TATAAAAACAAACAAAAATCTATACAGTCGGTATTAGCATTTAGCATCAT
TTTTAGTCGCTATTGTAAGGGAGGAGGAGGGCATTCGGAGAAAAGTCTTT
ATCGGTAGATTTGAGACAGAGTTCATAAAATGCCGTTGATGTCTGTAACA
CTGGATTCATTTTTCGTAAAATTTTCACCCCAATTCCGAGCTTAACTGAT
ATTTCTTCACACTTTCACATATTTTAAAATATTTTTACATAAAAAAATGA
AGGATATTTTAAGTGGATTATTGAGTGTCTAAAAGCGATTCCATATGAGA
AGGAAGAGACCAATGAGGGTGTCGCTAACATGATCGAATTTTTTAGTTTG
TATAAAATAAGAATTAAATATCAATAAAATTCGTTTGCGAAAAAAAAGTC
AAAAGGGAACAAGTCCGATTTTTAAAGTCAATCCACTAACCAGCGCCAAG
TTGTATATCTTAATTTAATTCCTGTAAAATAGAGGTCTTAATATTAACTA
TACCCGTAACAGCTTTTCTTCTATTTCGTTCAAAAGTGATCTTTCTTGTC
TACGTATAGCTGATCCTTCTATTTAAAAATGAATTGAGAAAACCTGTAAT
ATTTCTATGTCGGAGACAACGGCTTGCTCGTCTGTGTTCCAGCTTTTGGG
TAGATTGCGAAATTGGGCTTTGGTTTATTACTCGAGTGCGTTTGCCTCAA
AAAAGGTCCGCAGAAAAAAATCGTTAAAAAGCAAAGTGGATAACTTTCAA
ACGGATAAACAATCAATTGAGATATAGTACACACTGTTACCGCACTTAAA
TTGAAAACAGTCTGAAAGACATACATCAAAACCACAATCCTCCAAATTGT
TTTTCTTCTTATTTTAAGCAATCTATTCGCAAAAAACCTCAAACTCAGGA
TACCCCTAGTACTTTCAAGCAAGAAAAATACACATAAGAAAAAATAGTCA
ATAGTCGTTAAGGAGCTTCTTTTGTCGATCCCCGCAAAAATTAAAACAAA
ATCAATAGGCCGCTAATTCTTAAATAAATATAGTTCTTGACATTTCCGCA
TATGGTAGCTCATTCATATCTTTATACTTTTTCAGGCAAAACGTTCACAA
TTACGATTAGCGTTAATACGGACCCACCGCAAGTCGCCACTTATATGCGG
GCTATCAAAGTGACGGTTGATGGACCAAGAGAGCCTAGAAGTAAGTCATT
TTTTCATTTTATTCGTCCCGTGTCCAGTAACCGTATTTACATTGGACGGA
AAAATGACCGTTCTCGAAAATATAACTTCCAAGTACGTCACTCTCAGAGG
AAACTTTAAATCGCCTGAAAACTCAGACTTGAAAGCCCCTAAATCCGAGC
AACGGTAGAATGGCTTACGTCAGAGTGCGTACAATAAAATTCCGGTTGTT
CTTGATTCATCTCCGGTTATTTGGCATCTAAAACCGTTAATTTTGATTAA
CGAGTCTACCAGTCCTTTTCAAACAAACATTTTAATTTTCTTGGGTTTTT
TTATGTGTCTATAATGCGGGCACGAGTTTAAACGATTATTGGGTTATAAT
TACTGTAAGTAAGAGGGTCGCAAATAACAAAATTATTTTTAAATGTGATC
TTTCGAACCGATTTTTGTATGACGCATTAACATCCGGTCTTGGCAGTTTC
CGTTGACAATTAAAAAAAACATTTTTTATTGAAAAGGCAAACAAAAAGAT
GACAAAATGTTGAAACCTTTTTTGCGTCGTATGTTTCGACTTACAAAGAT
TTTGATAAAAGTGAACTGAAGCTAAATTTAGATGTGATGAATTAGACACA
AAAACTTAATTTTCCGCATTTGTAGTCCGTCGAGGATTTATCTTCAAGAA
AGCAAAAACACATTGAGATCGTAAAAAATAAATTTTTCGAATTCTGGGAA
TTTTAAGGTGGAAGTAGAATTAGAGGAAAATTTCAACCCAGAAAGCGAGG
TGACGTAATCTTGATCACGTCATAGACGGCGTTTTGAGGCTCAAAAGTAA
AAGATCTTGTCTTGTGCGGAAAAAGTTCCGAAATCATAACAAAAGATCCT
CTTTAGAATATAGGCGCTTAACTTTTTGTCGTATCTCTCACTAGTAGCAA
AGGTTCCTATCACACTTTGTCTTTGTTAGTCAATTTTATGTGAGTTTTGT
AAGCCAGCTTTACTTTAACAAAAAAAAAATCCCCTATTCTAATCATTTTA
GAAATTTTCTTGTTTTCACATAATAATTTTTTGATAAAAAATTGTTTCAC
TCACTCTCGTAGTATATCTCATTTTGAAAACGATGTGAATCTCATTTAAA
GCTTATTAAGTTGAATCATAACATACAATATGGGGGACTTATACTAAGAG
ATCCGCCGTGACGATTTTTTGTCCAATCGCGCGCCGACCCAATCCCTTAA
CTTAAAAGATGTCAGCCGACAGACTAGTGACTCAAACCTAATCTTCATTG
TCTTTACTTCTATTGAAAGAGAACAAATGAGTCGCCGGGATCTATTTTTC
GAACGAGAGTAAAAAGTTCACGCAACAAATTCTTAAAACCTTAAGGATAC
CTTAAAGAAGAAATTCTGGGATTTTCCTATCCAAAATTTTCTTTCCATGT
AATCTGCTCTCAGAAGTCTTTAATCCCTGCATACATACTTTTACAAAGCC
TTGAGAAAAGAGGAACAAGAAAGAACCAGTTTGAAGTGTTTACTTGAGCA
TTTACGCAAAACAAGCGAGACAATCGGGATTGCCAAAAATTAAAAAATGA
TCTAATTATTCTAGTTACTGACGACTACTGAGAATGGACTTCATATTTCC
CCTATACGGCAGGGATACAAAAAGAAGAAGAAGAATTATATTTGAAAAAT
TTGAAAAGTTAAAATTGGCGACAAGCCTAAAAATTGGGAAGAGAAATCGG
GCAAAATTGACACAAAAGAACTTACTTTCAAAGTTTTCTTTTCTTTACAT
CGTAATTAAATCAGAAGCTTTAGGGGTAACCAATTTCATTAAGTACATTT
TGAAATCTACAATAATAAAAATCGAATTTCAGCTGGACCAAAAAACCCAA
AAATGAAATTATACTCCAAGATAAAAACTCAATAGAAACAAAATTCGCAA
ACATGAAAATTCCACAGTGAGCTGCATTTAAAGAAAATTTATATAATGGG
CATCATCAAGCACAAAAAGCAAGGGCCAAACATGAATGATATGTATGGAA
TGAACTAAAGTCTTTTTTGGTTTACATTAAGAGAGAAATTTTAACAAAAC
TAGAAAGTGTCATGGTGAAATCCACGAGAAAAACCAGTTTTAAAGGGTTT
TCTTGTTAATTTTTTGGCCACTAGACACAAAGAAAAGAAATTCGACATTT
TGTTCAAGAGTAAAACCACTTGGCGCGAGTGCTGCGGTTGTGTGGTTGTT
TGACCCTGTCACGCATTCTGCTTGTTACGTTCTAACCATAATCCTTTTTC
TCGCGGGAAAGGAGCGACATTTTGTAGCGGTTTGATTTTCAGTGTTAATA
AAAATGTAATTCTTAAACTGTATGTATAACTAGATATGTTCAGGACTACT
TCAAAAACAAATAATTAAAAGAGTTTCATTATTCTACAGCATGGTTTAGA
AAATTTGCTAATTTTTCTCGATAAATTACATGTTCTTGGGTTTATTTGTA
TCGGCAATACTTGACGGAAAAAACTACTTTTTCCTATTTAAATCTACTTC
AAATTTGGTAAATGTGAAGTGAGGGGGTCATATTTACTTCATATAAATGG
GTAGACCATCGCTGAATTGCAATTAGTTGTGACATTTAAAGAAGGGCTAA
TGAAATTATTGGCACTGTGCAAAAAAATTTTAAATGCAATGAGATGAAAG
TCTCAATATTATATCTTAATAGTCGGATTCGCTGTTGGAGGGTAATGGTA
TACAATTGTATTATTATCCCATTGTGAGGTAAATCGCATACAAATTTCCT
TCTGCCGTTTTTCGACCTTAAAAATGGATCCTATAATTTATTTTTGACTT
TCTTCGAAAAGTTTATAGTCCTTCCAACGCAAACCACAAGAAAGGAGCAC
AAAAACATATTTTCAGTTAAAGTTTATAGAGGTCCACGATAGTATCTTTC
TCAATATTTTTCCCTCGAAAGCAAAATATTTTTTTCTCAAAATGATAAAA
TTTCTTTGATTTTTTGTAAGTTTTCCACAGTAAAAGAGCTAGCTGATTTT
ATTCAATTCCCGGGATTCGATTTAATCAGAAAAGGGAAGGACCTTAAAAT
CAAATTGATCTCTACCTCGAAAATGTCCTAAACTTTAGATTCGAACTGCC
TCTCTAGAAACTAAACTGTTACATTACAGAAAAAGAAATAGAACAAACGA
ATTAAAATTTGAAAGAGAAGAACAATATGTTCTTTATGAAATTAACCTTA
GAGAGATAGGACTCTCGGGCAGACGTACATCTGGGTGTGAAACAAAAAGG
TGTGAAAAAATAAAATTCTAAAGATATTTCTTCACTTCTTATTTCTGATA
AATTTCGAGGAATTTTCGGAAAGATGAAAGCTGGTCGGCGAATTTAAATG
TTCAGAAAAAAAAGTTGTTAATTTAAATTTAATATTCTCATTAAAAATTT
ATGTTTAAGAGCTTTAAAATATATGATATACTACTGGCCTACGATTTATA
AGAGGATTTGTGAATATTTTTGTCTTTAGGAAGATGAAGTTTTAGAATGT
GAGAAAAATAACGCACTCGAGACATCAAAACTAAAATTTAAGACGATTTT
CTTCCTCGTATTTTTCAAATGAAGAATAAAGTACTAATTCTTAAGAAATT
TTTCAAACGTGGACGAGAATCATCAATTATTCATAACCTTATGAATATTA
AATACAGCTACTGAAACTGAAAACACCCATTCTGCTAGAACTTCTTCTAG
TCAAAAAAAAGTTTCAGTTTTCTCAGCACTTAAAAACTAAAGGAAATCAT
TTGTCAAGAAAAATGCTTGAAAAAAGATGTTTAGTCCTTTAAAGGAAGTA
TTTTTTACACGAAAGAAAGTGTACGTACCAAAAAAAAAACGAGTTTCCTG
CATACACTACATCACGAGGCAAATTTCCCAAGTTTTACACATAATGTAGA
AGAAGCTATAAATCTTTAATAGCGTAAGGAGAATGCAGGTTTCATTTAAC
TCAAAAAATGCGTCATTAACATAGAGTTACGTATTTTCCAACTCAGCCTC
GATTGTGATTTGGCAATCATAGGACCAAAGCTAATATACTATATTAGAAA
CATTAAAATCACACATTTGACTGAACATCCCCCTATCTTTTCCATTAATA
GGACACAGACGAAATGACGATCGAGACGGAGGATTTGTCGATCATTATGG
ATTACGAATGGGCGAATTGGGAATCGAACATTTTCGTGGAAATATCCCGT
TTTCTGATCTACATCACCCATCAATGCCACCGAACTCTTTCCCACCACAT
CTACCAGGAGGTGAGTCGATTTCTTTTCGCTTTATTAGATTGATTTTTGA
CGACATAACTTCAGATAGTAAATCTGCTTTTTTGAACCTTTGAAAGACCA
GTTTTTTTAAACTTGGGTAATAATGCCTATATTATTAAAAATTTCAGTGA
ATCATCCCACATTACATGGGATTTTCAAATTTTTAACATCATCTTATCAT
CATTTCTTTTTCTTTTTTATAGAAATTGGCATGAGGTCACCATCATCCTG
GGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCGGCGGTGGAGCAGGTT
ATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCTTACACAGGAGGTGGC
GGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACAATCATTACAACTTTC
AAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTACTAACAACAACAATA
ATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCGCCATTGCCTGGCAAC
TATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATCGCATCGTACATCACC
AAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGAGTTTGAGTAATACCT
ATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGTGGTGGGCTACAGTGT
GGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACATGCACGGGGGGAGCAC
TACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACAGTGTTACTATAAACA
ATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGTCTGAATCTACCTTTA
CCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGGCGGTGGTGGGCGAAC
CATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTCATCTCAACGTTTATC
GATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGCTCGTACGGTGGATAT
CAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAGTTTAGACCAAAACGG
CAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACGAAAACGGTTCAACGC
CCAAAGTATGGCGCCCATATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- >XLOC_044286 ID=XLOC_044286|Name=XLOC_044286|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCGACAATGACACTAACAACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCG GGGTCTCCCGTCACACCGTTTCAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGC CCATAGATACACTACAAGAAACACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCA CCGAATTTTGTATGTAGCGTTTTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAAC TCTTCCCGTAGCATTTAAAGTTGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACG GTGTAACCGTAACAATCTCGGCAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAG CTTCGCAACGCGACCGCCATTATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGA CCTCCGATTTGTCGGGCGATCAGGGCGAGATGTCGACAATGACACTAACA ACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCGGGGTCTCCCGTCACACCGTTT CAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGCCCATAGATACACTACAAGAAA CACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCACCGAATTTTGTATGTAGCGTT TTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAACTCTTCCCGTAGCATTTAAAGT TGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACGGTGTAACCGTAACAATCTCGG CAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAGCTTCGCAACGCGACCGCCATT ATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGACCTCCGATTTGTCGGGCGATC AGGGCGAGGCAAAACGTTCACAATTACGATTAGCGTTAATACGGACCCAC CGCAAGTCGCCACTTATATGCGGGCTATCAAAGTGACGGTTGATGGACCA AGAGAGCCTAGAAGCAAAACGTTCACAATTACGATTAGCGTTAATACGGA CCCACCGCAAGTCGCCACTTATATGCGGGCTATCAAAGTGACGGTTGATG GACCAAGAGAGCCTAGAAGACACAGACGAAATGACGATCGAGACGGAGGA TTTGTCGATCATTATGGATTACGAATGGGCGAATTGGGAATCGAACATTT TCGTGGAAATATCCCGTTTTCTGATCTACATCACCCATCAATGCCACCGA ACTCTTTCCCACCACATCTACCAGGAGGACACAGACGAAATGACGATCGA GACGGAGGATTTGTCGATCATTATGGATTACGAATGGGCGAATTGGGAAT CGAACATTTTCGTGGAAATATCCCGTTTTCTGATCTACATCACCCATCAA TGCCACCGAACTCTTTCCCACCACATCTACCAGGAGAAATTGGCATGAGG TCACCATCATCCTGGGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCGG CGGTGGAGCAGGTTATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCTT ACACAGGAGGTGGCGGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACAA TCATTACAACTTTCAAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTAC TAACAACAACAATAATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCGC CATTGCCTGGCAACTATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATCG CATCGTACATCACCAAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGAG TTTGAGTAATACCTATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGTG GTGGGCTACAGTGTGGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACATG CACGGGGGGAGCACTACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACAG TGTTACTATAAACAATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGTC TGAATCTACCTTTACCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGGC GGTGGTGGGCGAACCATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTCA TCTCAACGTTTATCGATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGCT CGTACGGTGGATATCAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAGT TTAGACCAAAACGGCAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACGA AAACGGTTCAACGCCCAAAGTATGGCGCCCATATTGAAAATTGGCATGAG GTCACCATCATCCTGGGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCG GCGGTGGAGCAGGTTATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCT TACACAGGAGGTGGCGGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACA ATCATTACAACTTTCAAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTA CTAACAACAACAATAATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCG CCATTGCCTGGCAACTATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATC GCATCGTACATCACCAAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGA GTTTGAGTAATACCTATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGT GGTGGGCTACAGTGTGGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACAT GCACGGGGGGAGCACTACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACA GTGTTACTATAAACAATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGT CTGAATCTACCTTTACCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGG CGGTGGTGGGCGAACCATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTC ATCTCAACGTTTATCGATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGC TCGTACGGTGGATATCAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAG TTTAGACCAAAACGGCAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACG AAAACGGTTCAACGCCCAAAGTATGGCGCCCATATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:1067445..1074917 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 646-1494:850 |
| Aaloc | 487-642:1221 |
| Aaloc | 382-483:5437 |
| Aaloc | 1-378:7474 |
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