XLOC_044286 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044286
Unique NameXLOC_044286
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044286 ID=XLOC_044286|Name=XLOC_044286|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7473bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGACAATGACACTAACAACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCG GGGTCTCCCGTCACACCGTTTCAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGC CCATAGATACACTACAAGAAACACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCA CCGAATTTTGTATGTAGCGTTTTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAAC TCTTCCCGTAGCATTTAAAGTTGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACG GTGTAACCGTAACAATCTCGGCAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAG CTTCGCAACGCGACCGCCATTATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGA CCTCCGATTTGTCGGGCGATCAGGGCGAGGTAGGTTTGATTTATTTTGTT TAGCGGTCGTATACATTTAACATATCTTTCGGTCACCTATGGAATATTTG GAAGTTTTGCTCAAATGATTCAATAGAAATTTCCTACATTCTAGGCCAGC CTTCGATAACGGCGGTCGCAATTAATAATTTCTAAAAGAAATTTATGATA GCAGCATCATTTCAAACAAGAGAGGGCAATTAAACTAGAGCCATTTATTA ATCATTTGGATTAATTTTCGTGTTATGCAAAAATGCGTTAAAATTATATT GTCGACCATGCGCAGTGGTAGCGTACGAAAAGTGGGCGCGTTTGAAAAGA TATTTCAATAAACTTTAAAATCCAACTGGCCGTCTTCTATAAAAAAATGT CGCATAAGCTTTAAAGATATGGCTGGCAAACGGAGTCTAATATAACCACA TTTTTGTCATCAAGAACGAACTTTTTGCACGTAAGGAACTTGAGGATTGC ATGTTCAAGTAATCGGGTCACGAACCCATGCACCTTACAATTAACTTTTT TCGTTCCAAAAGAAAGTATGAGAAAATAGGAAGCATGAGAATTCACCAAA TATAAAAACAAACAAAAATCTATACAGTCGGTATTAGCATTTAGCATCAT TTTTAGTCGCTATTGTAAGGGAGGAGGAGGGCATTCGGAGAAAAGTCTTT ATCGGTAGATTTGAGACAGAGTTCATAAAATGCCGTTGATGTCTGTAACA CTGGATTCATTTTTCGTAAAATTTTCACCCCAATTCCGAGCTTAACTGAT ATTTCTTCACACTTTCACATATTTTAAAATATTTTTACATAAAAAAATGA AGGATATTTTAAGTGGATTATTGAGTGTCTAAAAGCGATTCCATATGAGA AGGAAGAGACCAATGAGGGTGTCGCTAACATGATCGAATTTTTTAGTTTG TATAAAATAAGAATTAAATATCAATAAAATTCGTTTGCGAAAAAAAAGTC AAAAGGGAACAAGTCCGATTTTTAAAGTCAATCCACTAACCAGCGCCAAG TTGTATATCTTAATTTAATTCCTGTAAAATAGAGGTCTTAATATTAACTA TACCCGTAACAGCTTTTCTTCTATTTCGTTCAAAAGTGATCTTTCTTGTC TACGTATAGCTGATCCTTCTATTTAAAAATGAATTGAGAAAACCTGTAAT ATTTCTATGTCGGAGACAACGGCTTGCTCGTCTGTGTTCCAGCTTTTGGG TAGATTGCGAAATTGGGCTTTGGTTTATTACTCGAGTGCGTTTGCCTCAA AAAAGGTCCGCAGAAAAAAATCGTTAAAAAGCAAAGTGGATAACTTTCAA ACGGATAAACAATCAATTGAGATATAGTACACACTGTTACCGCACTTAAA TTGAAAACAGTCTGAAAGACATACATCAAAACCACAATCCTCCAAATTGT TTTTCTTCTTATTTTAAGCAATCTATTCGCAAAAAACCTCAAACTCAGGA TACCCCTAGTACTTTCAAGCAAGAAAAATACACATAAGAAAAAATAGTCA ATAGTCGTTAAGGAGCTTCTTTTGTCGATCCCCGCAAAAATTAAAACAAA ATCAATAGGCCGCTAATTCTTAAATAAATATAGTTCTTGACATTTCCGCA TATGGTAGCTCATTCATATCTTTATACTTTTTCAGGCAAAACGTTCACAA TTACGATTAGCGTTAATACGGACCCACCGCAAGTCGCCACTTATATGCGG GCTATCAAAGTGACGGTTGATGGACCAAGAGAGCCTAGAAGTAAGTCATT TTTTCATTTTATTCGTCCCGTGTCCAGTAACCGTATTTACATTGGACGGA AAAATGACCGTTCTCGAAAATATAACTTCCAAGTACGTCACTCTCAGAGG AAACTTTAAATCGCCTGAAAACTCAGACTTGAAAGCCCCTAAATCCGAGC AACGGTAGAATGGCTTACGTCAGAGTGCGTACAATAAAATTCCGGTTGTT CTTGATTCATCTCCGGTTATTTGGCATCTAAAACCGTTAATTTTGATTAA CGAGTCTACCAGTCCTTTTCAAACAAACATTTTAATTTTCTTGGGTTTTT TTATGTGTCTATAATGCGGGCACGAGTTTAAACGATTATTGGGTTATAAT TACTGTAAGTAAGAGGGTCGCAAATAACAAAATTATTTTTAAATGTGATC TTTCGAACCGATTTTTGTATGACGCATTAACATCCGGTCTTGGCAGTTTC CGTTGACAATTAAAAAAAACATTTTTTATTGAAAAGGCAAACAAAAAGAT GACAAAATGTTGAAACCTTTTTTGCGTCGTATGTTTCGACTTACAAAGAT TTTGATAAAAGTGAACTGAAGCTAAATTTAGATGTGATGAATTAGACACA AAAACTTAATTTTCCGCATTTGTAGTCCGTCGAGGATTTATCTTCAAGAA AGCAAAAACACATTGAGATCGTAAAAAATAAATTTTTCGAATTCTGGGAA TTTTAAGGTGGAAGTAGAATTAGAGGAAAATTTCAACCCAGAAAGCGAGG TGACGTAATCTTGATCACGTCATAGACGGCGTTTTGAGGCTCAAAAGTAA AAGATCTTGTCTTGTGCGGAAAAAGTTCCGAAATCATAACAAAAGATCCT CTTTAGAATATAGGCGCTTAACTTTTTGTCGTATCTCTCACTAGTAGCAA AGGTTCCTATCACACTTTGTCTTTGTTAGTCAATTTTATGTGAGTTTTGT AAGCCAGCTTTACTTTAACAAAAAAAAAATCCCCTATTCTAATCATTTTA GAAATTTTCTTGTTTTCACATAATAATTTTTTGATAAAAAATTGTTTCAC TCACTCTCGTAGTATATCTCATTTTGAAAACGATGTGAATCTCATTTAAA GCTTATTAAGTTGAATCATAACATACAATATGGGGGACTTATACTAAGAG ATCCGCCGTGACGATTTTTTGTCCAATCGCGCGCCGACCCAATCCCTTAA CTTAAAAGATGTCAGCCGACAGACTAGTGACTCAAACCTAATCTTCATTG TCTTTACTTCTATTGAAAGAGAACAAATGAGTCGCCGGGATCTATTTTTC GAACGAGAGTAAAAAGTTCACGCAACAAATTCTTAAAACCTTAAGGATAC CTTAAAGAAGAAATTCTGGGATTTTCCTATCCAAAATTTTCTTTCCATGT AATCTGCTCTCAGAAGTCTTTAATCCCTGCATACATACTTTTACAAAGCC TTGAGAAAAGAGGAACAAGAAAGAACCAGTTTGAAGTGTTTACTTGAGCA TTTACGCAAAACAAGCGAGACAATCGGGATTGCCAAAAATTAAAAAATGA TCTAATTATTCTAGTTACTGACGACTACTGAGAATGGACTTCATATTTCC CCTATACGGCAGGGATACAAAAAGAAGAAGAAGAATTATATTTGAAAAAT TTGAAAAGTTAAAATTGGCGACAAGCCTAAAAATTGGGAAGAGAAATCGG GCAAAATTGACACAAAAGAACTTACTTTCAAAGTTTTCTTTTCTTTACAT CGTAATTAAATCAGAAGCTTTAGGGGTAACCAATTTCATTAAGTACATTT TGAAATCTACAATAATAAAAATCGAATTTCAGCTGGACCAAAAAACCCAA AAATGAAATTATACTCCAAGATAAAAACTCAATAGAAACAAAATTCGCAA ACATGAAAATTCCACAGTGAGCTGCATTTAAAGAAAATTTATATAATGGG CATCATCAAGCACAAAAAGCAAGGGCCAAACATGAATGATATGTATGGAA TGAACTAAAGTCTTTTTTGGTTTACATTAAGAGAGAAATTTTAACAAAAC TAGAAAGTGTCATGGTGAAATCCACGAGAAAAACCAGTTTTAAAGGGTTT TCTTGTTAATTTTTTGGCCACTAGACACAAAGAAAAGAAATTCGACATTT TGTTCAAGAGTAAAACCACTTGGCGCGAGTGCTGCGGTTGTGTGGTTGTT TGACCCTGTCACGCATTCTGCTTGTTACGTTCTAACCATAATCCTTTTTC TCGCGGGAAAGGAGCGACATTTTGTAGCGGTTTGATTTTCAGTGTTAATA AAAATGTAATTCTTAAACTGTATGTATAACTAGATATGTTCAGGACTACT TCAAAAACAAATAATTAAAAGAGTTTCATTATTCTACAGCATGGTTTAGA AAATTTGCTAATTTTTCTCGATAAATTACATGTTCTTGGGTTTATTTGTA TCGGCAATACTTGACGGAAAAAACTACTTTTTCCTATTTAAATCTACTTC AAATTTGGTAAATGTGAAGTGAGGGGGTCATATTTACTTCATATAAATGG GTAGACCATCGCTGAATTGCAATTAGTTGTGACATTTAAAGAAGGGCTAA TGAAATTATTGGCACTGTGCAAAAAAATTTTAAATGCAATGAGATGAAAG TCTCAATATTATATCTTAATAGTCGGATTCGCTGTTGGAGGGTAATGGTA TACAATTGTATTATTATCCCATTGTGAGGTAAATCGCATACAAATTTCCT TCTGCCGTTTTTCGACCTTAAAAATGGATCCTATAATTTATTTTTGACTT TCTTCGAAAAGTTTATAGTCCTTCCAACGCAAACCACAAGAAAGGAGCAC AAAAACATATTTTCAGTTAAAGTTTATAGAGGTCCACGATAGTATCTTTC TCAATATTTTTCCCTCGAAAGCAAAATATTTTTTTCTCAAAATGATAAAA TTTCTTTGATTTTTTGTAAGTTTTCCACAGTAAAAGAGCTAGCTGATTTT ATTCAATTCCCGGGATTCGATTTAATCAGAAAAGGGAAGGACCTTAAAAT CAAATTGATCTCTACCTCGAAAATGTCCTAAACTTTAGATTCGAACTGCC TCTCTAGAAACTAAACTGTTACATTACAGAAAAAGAAATAGAACAAACGA ATTAAAATTTGAAAGAGAAGAACAATATGTTCTTTATGAAATTAACCTTA GAGAGATAGGACTCTCGGGCAGACGTACATCTGGGTGTGAAACAAAAAGG TGTGAAAAAATAAAATTCTAAAGATATTTCTTCACTTCTTATTTCTGATA AATTTCGAGGAATTTTCGGAAAGATGAAAGCTGGTCGGCGAATTTAAATG TTCAGAAAAAAAAGTTGTTAATTTAAATTTAATATTCTCATTAAAAATTT ATGTTTAAGAGCTTTAAAATATATGATATACTACTGGCCTACGATTTATA AGAGGATTTGTGAATATTTTTGTCTTTAGGAAGATGAAGTTTTAGAATGT GAGAAAAATAACGCACTCGAGACATCAAAACTAAAATTTAAGACGATTTT CTTCCTCGTATTTTTCAAATGAAGAATAAAGTACTAATTCTTAAGAAATT TTTCAAACGTGGACGAGAATCATCAATTATTCATAACCTTATGAATATTA AATACAGCTACTGAAACTGAAAACACCCATTCTGCTAGAACTTCTTCTAG TCAAAAAAAAGTTTCAGTTTTCTCAGCACTTAAAAACTAAAGGAAATCAT TTGTCAAGAAAAATGCTTGAAAAAAGATGTTTAGTCCTTTAAAGGAAGTA TTTTTTACACGAAAGAAAGTGTACGTACCAAAAAAAAAACGAGTTTCCTG CATACACTACATCACGAGGCAAATTTCCCAAGTTTTACACATAATGTAGA AGAAGCTATAAATCTTTAATAGCGTAAGGAGAATGCAGGTTTCATTTAAC TCAAAAAATGCGTCATTAACATAGAGTTACGTATTTTCCAACTCAGCCTC GATTGTGATTTGGCAATCATAGGACCAAAGCTAATATACTATATTAGAAA CATTAAAATCACACATTTGACTGAACATCCCCCTATCTTTTCCATTAATA GGACACAGACGAAATGACGATCGAGACGGAGGATTTGTCGATCATTATGG ATTACGAATGGGCGAATTGGGAATCGAACATTTTCGTGGAAATATCCCGT TTTCTGATCTACATCACCCATCAATGCCACCGAACTCTTTCCCACCACAT CTACCAGGAGGTGAGTCGATTTCTTTTCGCTTTATTAGATTGATTTTTGA CGACATAACTTCAGATAGTAAATCTGCTTTTTTGAACCTTTGAAAGACCA GTTTTTTTAAACTTGGGTAATAATGCCTATATTATTAAAAATTTCAGTGA ATCATCCCACATTACATGGGATTTTCAAATTTTTAACATCATCTTATCAT CATTTCTTTTTCTTTTTTATAGAAATTGGCATGAGGTCACCATCATCCTG GGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCGGCGGTGGAGCAGGTT ATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCTTACACAGGAGGTGGC GGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACAATCATTACAACTTTC AAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTACTAACAACAACAATA ATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCGCCATTGCCTGGCAAC TATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATCGCATCGTACATCACC AAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGAGTTTGAGTAATACCT ATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGTGGTGGGCTACAGTGT GGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACATGCACGGGGGGAGCAC TACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACAGTGTTACTATAAACA ATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGTCTGAATCTACCTTTA CCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGGCGGTGGTGGGCGAAC CATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTCATCTCAACGTTTATC GATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGCTCGTACGGTGGATAT CAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAGTTTAGACCAAAACGG CAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACGAAAACGGTTCAACGC CCAAAGTATGGCGCCCATATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917-

>XLOC_044286 ID=XLOC_044286|Name=XLOC_044286|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1067445..1074917- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGACAATGACACTAACAACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCG
GGGTCTCCCGTCACACCGTTTCAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGC
CCATAGATACACTACAAGAAACACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCA
CCGAATTTTGTATGTAGCGTTTTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAAC
TCTTCCCGTAGCATTTAAAGTTGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACG
GTGTAACCGTAACAATCTCGGCAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAG
CTTCGCAACGCGACCGCCATTATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGA
CCTCCGATTTGTCGGGCGATCAGGGCGAGATGTCGACAATGACACTAACA
ACCACTGAACATAATTTTGGACCAATGCGGGGTCTCCCGTCACACCGTTT
CAAACCGGAAAAGGGTCCCCTGATTGGGCCCATAGATACACTACAAGAAA
CACCAGGCGAACTTGTCAAGACTGATTCACCGAATTTTGTATGTAGCGTT
TTACCCGCACACTGGAGATGCAATAAAACTCTTCCCGTAGCATTTAAAGT
TGTCGGGTTAAGTGGTGACATCCCGGACGGTGTAACCGTAACAATCTCGG
CAGGAAATGATGATAATTTCTCTGCTGAGCTTCGCAACGCGACCGCCATT
ATGAAAAATCAAGTGGCTCGATTCAATGACCTCCGATTTGTCGGGCGATC
AGGGCGAGGCAAAACGTTCACAATTACGATTAGCGTTAATACGGACCCAC
CGCAAGTCGCCACTTATATGCGGGCTATCAAAGTGACGGTTGATGGACCA
AGAGAGCCTAGAAGCAAAACGTTCACAATTACGATTAGCGTTAATACGGA
CCCACCGCAAGTCGCCACTTATATGCGGGCTATCAAAGTGACGGTTGATG
GACCAAGAGAGCCTAGAAGACACAGACGAAATGACGATCGAGACGGAGGA
TTTGTCGATCATTATGGATTACGAATGGGCGAATTGGGAATCGAACATTT
TCGTGGAAATATCCCGTTTTCTGATCTACATCACCCATCAATGCCACCGA
ACTCTTTCCCACCACATCTACCAGGAGGACACAGACGAAATGACGATCGA
GACGGAGGATTTGTCGATCATTATGGATTACGAATGGGCGAATTGGGAAT
CGAACATTTTCGTGGAAATATCCCGTTTTCTGATCTACATCACCCATCAA
TGCCACCGAACTCTTTCCCACCACATCTACCAGGAGAAATTGGCATGAGG
TCACCATCATCCTGGGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCGG
CGGTGGAGCAGGTTATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCTT
ACACAGGAGGTGGCGGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACAA
TCATTACAACTTTCAAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTAC
TAACAACAACAATAATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCGC
CATTGCCTGGCAACTATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATCG
CATCGTACATCACCAAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGAG
TTTGAGTAATACCTATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGTG
GTGGGCTACAGTGTGGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACATG
CACGGGGGGAGCACTACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACAG
TGTTACTATAAACAATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGTC
TGAATCTACCTTTACCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGGC
GGTGGTGGGCGAACCATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTCA
TCTCAACGTTTATCGATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGCT
CGTACGGTGGATATCAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAGT
TTAGACCAAAACGGCAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACGA
AAACGGTTCAACGCCCAAAGTATGGCGCCCATATTGAAAATTGGCATGAG
GTCACCATCATCCTGGGGAGGCCACTACAACTTCCCAAGCGGTGGAAGCG
GCGGTGGAGCAGGTTATGGTCACAACCTGTCACCCACCAACAGTGATTCT
TACACAGGAGGTGGCGGTGGTATCGTCCACAATAACTCATACAACCAACA
ATCATTACAACTTTCAAGTCTCAAGTCAAGCGGTGGCAGCACAACTGGTA
CTAACAACAACAATAATAATACTATAAACAATAATAATAACGACATGTCG
CCATTGCCTGGCAACTATACCGACCAACGAATGTTTAATTCACAATTATC
GCATCGTACATCACCAAGCAATTCGACAGGTGCTAATTCACCACCACAGA
GTTTGAGTAATACCTATCACGAAAGTAGTGCTATTAACGGTACAGGTGGT
GGTGGGCTACAGTGTGGAGGCAACCACCATACCTACCAGAATTCAAACAT
GCACGGGGGGAGCACTACCAACCCAGCTCACAGCTTTCTCGGCACTAACA
GTGTTACTATAAACAATAATTACTTAATGAATGTTTCACCGGGAGGTAGT
CTGAATCTACCTTTACCAAAGCAGTATACCTCACCCAACGGAGGAGGAGG
CGGTGGTGGGCGAACCATTGAGGAAGACGCCAATAATAACCAACTAAGTC
ATCTCAACGTTTATCGATCACCACCGACCTTATACGATGTCCATAGCGGC
TCGTACGGTGGATATCAGAGTAATTTGAAACATGGTTATGAAGGACATAG
TTTAGACCAAAACGGCAACGTTAACGGTCACCATGGTGAAGAACTAGACG
AAAACGGTTCAACGCCCAAAGTATGGCGCCCATATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044286XLOC_044286-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000020_pilongenomesc0000020_pilon:1067445..1074917 -
Properties
Property NameValue
Aaloc646-1494:850
Aaloc487-642:1221
Aaloc382-483:5437
Aaloc1-378:7474