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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:179058..184382- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10965.4.p1 ID=MSTRG.10965.4.p1|Name=MSTRG.10965.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5325bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:179058..184382- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAATCCAACAAAAAATATAACATTTAGAATCCGAAAAATAAGAAAAT
GGTATTCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTTAA
TGTTAGCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTTTT
TCCTATGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAATCA
AGAACAAGCTGGTAAGAATGATATCTCTTTATTGTTAGAAAGATATTTCA
GATATTTGGTCTATAAAGTAAGTAGTAAGTTTGTGAGCGCAGTCGAGGGC
GAAGGCTCCCTTTTCTCTAGCTGTCTACGCAAATCTAGGGGAGGGTGCTA
CTCCTTCCCTTGTATTACTCCACTTACCTTTGATCCGTCTCCTTAATTGT
TGAACATCAAGCAGAGAGGCATCACGAGTACTACTTTGGGAATCTTTGGT
ATGACCCGGCTGGGGGTTGAACCCAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCTAG
AAGTCAATCTCTTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGTTG
CGCGGCCTTGAGCCTCCCGCCTGGTTTTTACACAAATGATTGAAACTAAA
ATTTACCGCTTAATTTCGAAAAATATATCACTCAAAAACAAAGGAATTGC
TAGATTCAATCCGTCATCAAAAATACGGCGCATATTTTAAGGCTTCAATT
TTTCTTGTCTGAGAAAGGTTAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTTGA
AACTCAATGGTTGAACCCACAACCTTGCACACCGTAGCTCAACCTTCATG
CTACGGCCGCTAGCATGAAAGATATAAAGGTTATTCAAAAATCTTAAGCA
AAATCCACCCCCTCCTTTATAGATGTCCCTCCTTTGTAGATGCACTTTCT
CTTTAATGCACTCATCTTTTTAGAAATCTAACCCTCCTTGGATGAACTAG
CGTAAATCTGTGAAGGGTTCAGTAATTTAAAACCACAGTTTCCATAATAA
TTAATAAACGCAACTGGAAAATCCTCAGTTTAGTATAATCACCATTTGTC
ATTAAAGTTGAGAGGCATTCTTAGTTACTCTCGGGTACCTAATAGCCGCC
CCCCCCCCCCCCGCGCTTATTAATTTTTGGGAAAATGTTTTTGAAAGTTC
CCTTTTTTGTCTTAATTCTGCTGTATTAGCCTCCTTTTCAAACATTTTCC
ACCCAGGACATTTTTATTCCAAACCCCCCGCTTATTAAATTTTGAGATTT
TTTTCAACCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTACAAGATTACTTCCAT
TTTACAATTAATTTATGTGGTAAGGATAGCACTTAGTCAGTCAATTTCTA
TTTCTACATCCTCGCAAGAGCCCCCATAGATATCATGCATATCTTTGAAA
AATTCCAAATCACGCATCACGACTCAAATCACGATCACGTTTTGACCCCT
GATCACGCAAAAAAATTCCAAATCACGTAATCACGCTAGAAAAGAGTCCC
TAACACGTCATCACGCAAACGGCTTGGGGGGCCTTTCGCAACACAAGAAA
GGGTTGGATTAGCAAAAGAAAATCCTTATACTTAGCTGACCTTTCAAAAT
GAAAGTCCTAAATTTTCTAAGATAAAGAAATTCATTCATTTTATTAAGCT
TTCACTGAAAGATTTTAAAGCTGCTATTTTACGTTTGTAAAAAGTGTGAA
CATACCATGCAGGGGGCGGGGTACAGAGGCAGGGTACTAACCCATAGGGT
ACTAACTTGATTTTTTACGAAAATTTTGTTTAGTACCACCCACCCATATT
TAGTACCGGGTACTACTTCATTTTTGCTGTAAAAAATAGAGACACCAACC
CTAAAATCTTAAATTTTACAGATTAGACCAAGAGAGGGGTACTATTGTTC
GTTTTTCAGACTGAAAATTGACAGATAATTCAAGCAAACTATCAATGATG
GAGTCAGAAGCTTTTGTCCTTTGATTTTCATCGCACACTTCTTAACCATT
TTGGAAGTTTTGTCTTCAAAAAAATCAAAAAATTTCTCAAAAGAGTAAAA
AGAATTGTCGATTAAAAAAGATTTCAAATAAAAAAAATCAATATTTGGAA
AAAGTCAAAATATTTCAACAAACTACTTTTTTTATTGAAAAACAGCAAAA
TTCTGTGAAAAAGTACCCAAATAGTATCCTGTACTTGCTTGAAGAGTGAA
AAATATACACCCCCACCCCCAAAGTAGTACCGGGTACTAACTTTTTTGAA
ATGCAAAAATAGACACCACCACCTGGCTATGGGTCAGTACCCTGTGTCTG
TAACCCCACCCTGTACCATGAGGTTTCAAAGAATATTAAAGCTAACAAGT
GACTTATATGGACATACCTGACATATCAACAGAAAACATGAAATTTATAA
TAAACAAGACGTCAAACAATCTCGGAAAACCACTTTTTATTACCGGATCG
GTCGACCGGAAAAAATGTTTTTCTTGTTATCATGAAAATTTGACCCCATT
ACATTTTGGAATTACTATTTTGCTTCATTGTGCAAAAAATCTACATAATC
CTATTAGCTAATATCGAGAAAAGCTAATAACGAACGAATGAACGAACAAG
CACTGGTTAATTTATTGGTAGGTCCAAAAACTATTTCAAAATCAGACAGA
AGATTTCCATACGGATTAGCGATACAACCCTGTATATCATCAACCTCAAC
CAAGTGTAACAGTGAACTCTCCAGAAAATACAATGACTCTCTCGACAATT
TGGCAAGGGATAAGAATTTTCTTTAAATTAGAGAAGGTTCGAATTACAGA
GAGTAATTCAAACCACTTTCCACCTGAGGGGACCAATTTTTTAGTTCGAG
TTACAGAAATACTTAAATAATAGAGTTTCGAATTAGAGAGGGTAATCCTA
CAATTAGAAAAGAAGATCTGATGTAAGTCTAACTCTCTTTATTAACCCAA
GTAAAAATTCTGTATGTAGACTTTGAGTATCAGTGCACCAATAAGCCAAA
ACAAAACAACAAGCCTGTAAACCTTTGTGTTCAATTTTTAGCCTGGGTTG
CTTCGATTGCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTG
GCATGTCATTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTT
GTGTGGCATTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATC
TCTATTTATCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTAT
ACACCAACCTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCT
GTCAACAACTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCA
ATATCATCACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATG
GTTGTCTATGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGG
ATATATGCCGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGA
ACAAAGAAGAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTT
GAATTCAGAGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGT
ATCTCGATTCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTG
TAAGTTTTTAACACAATTTTTCTACAGTGAAATTCCCATAACTCCAACAC
GCAGATAGGCCACATTTCCAACGGGATTGTTTTATTTAAAGGCTTGTATG
GGATATATAGTAATGGGCCAGTGTTAGTAATCCTCTATACAAGTTGAAAA
AGATAAGTAAGCGTCAAAATAAGGTTAGCAAAAATGTATTTATTTAAAAG
TTTTATTTTAATTTGGTTACATATCCTTTTTAGGTTTTCCAAAATATTGA
TTCAGGGTTTTATCTGCGATTTCCTCTAAAATTTAACCTTGAAAATTATT
TACTTTCACTTTAAGATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTC
AACAGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTC
GATTAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATC
ACCTATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTT
TTTCGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGG
TATGCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTA
ACTTGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAA
TGGCATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGGTAAGTGATTGTGTT
ATTATACTGTGTTGTGCGAAGTGAGAAGGGGTTGTGGGTAGTAGGTTTTT
GAGGTGATTGGGTATGCCTGAGCTAAAAAATCGAAAATTGACTCTTTAAG
AGAAATAAAATAGAACCTTAGTGTGCTTAAGTATGACTTTCTGAGAGATT
TTTCTCAAAGTTTGTTTAACAATAAATCTTGGTCTAAAAATTACTGAAAT
CGTAGCCAGAGTGTCAGGCATGATGTATAACCTCCGTTCAACAGGTTTTC
GCTACACCTATATAAACATGAATAAATACCATAACACATATTTTTCATTC
TCTCAAGAACTTTATATCAAAGACCACATACGGCATTAATAAAATATTTT
TCTCTTTTAAATAGGTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATT
TCATGTTTATCTTTACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATG
CATTTAGCAAGAACTATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGA
AGAACATCAATCACAAATCGAATGAAATTGCGTAAGTATTCCCTTGTTCG
GTAGAGGTGCATTTCTATTCAATTTTAGTGAAATTTCATGAGGAAAATAT
ATTTTTTTAAATCCTAAAGAAAACTGATAATCCAAGTTCGGATTCGAAGG
GAAGTATCGACGTACTGAAGATTGAACCTCCTCAAAAGGTGGTATAGGAT
TATTTCAGTACAAGAAAACAAATACATTGACAAAGATTTTATAAGGAACA
CTCGTAAACCTATCAACATTCTGCAATATTTGAACTTTTGCACCTATTAT
CTTTAGGATAAGCAAGAACATCAACGAATAAGAACTCAGAAAACAAAACC
AGCTGATTCCTTGCTGAGAAAAAGGCCCAATTTTTTATTTTTTTAATAGT
AAAATATAGTAAAACATAGTAACTTTTTGAATATCTTAACTTGTTATTCA
CTGAAAAAGCATAATAAAAAAACAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:179058..184382- >MSTRG.10965.4.p1 ID=MSTRG.10965.4.p1|Name=MSTRG.10965.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5208bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:179058..184382- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTTATCTTT
ACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGCAAGAAC
TATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATCAATCAC
AAATCGAATGAATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTCAACA
GCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTCGATT
AGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATCACCT
ATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTTTTTC
GCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGGTATG
CGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTAACTT
GTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAATGGC
ATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGCCTGGGTTGCTTCGATTGC
AACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCATGTCATT
ACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGTGGCATT
GGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTATTTATC
ATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACACCAACCT
TGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCAACAACT
ATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATATCATCAC
AGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTGTCTATG
GGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATATATGCCG
TTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAAAGAAGA
GGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAATTCAGAG
CGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCTCGATTC
TTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTATGGTATTCAA
ATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTTAATGTTAGCTA
TGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTTTTTCCTATGGT
GTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGAACAAGC
TGGTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTTATCT
TTACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGCAAGA
ACTATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATCAATC
ACAAATCGAATGAATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTCAA
CAGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTCGA
TTAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATCAC
CTATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTTTT
TCGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGGTA
TGCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTAAC
TTGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAATG
GCATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGCCTGGGTTGCTTCGATT
GCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCATGTCA
TTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGTGGCA
TTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTATTTA
TCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACACCAAC
CTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCAACAA
CTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATATCATC
ACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTGTCTA
TGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATATATGC
CGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAAAGAA
GAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAATTCAG
AGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCTCGAT
TCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTATGGTATTC
AAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTTAATGTTAGC
TATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTTTTTCCTATG
GTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGAACAA
GCTGGTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTTAT
CTTTACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGCAA
GAACTATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATCAA
TCACAAATCGAATGAATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTC
AACAGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTC
GATTAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATC
ACCTATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTT
TTTCGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGG
TATGCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTA
ACTTGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAA
TGGCATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGCCTGGGTTGCTTCGA
TTGCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCATGT
CATTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGTGG
CATTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTATT
TATCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACACCA
ACCTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCAAC
AACTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATATCA
TCACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTGTC
TATGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATATAT
GCCGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAAAG
AAGAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAATTC
AGAGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCTCG
ATTCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTATGGTAT
TCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTTAATGTTA
GCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTTTTTCCTA
TGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGAAC
AAGCTGGTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTT
ATCTTTACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGC
AAGAACTATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATC
AATCACAAATCGAATGAATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGT
TCAACAGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGG
TCGATTAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTA
TCACCTATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCC
TTTTTCGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGG
GGTATGCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATT
TAACTTGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATC
AATGGCATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGCCTGGGTTGCTTC
GATTGCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCAT
GTCATTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGT
GGCATTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTA
TTTATCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACAC
CAACCTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCA
ACAACTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATAT
CATCACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTG
TCTATGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATAT
ATGCCGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAA
AGAAGAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAAT
TCAGAGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCT
CGATTCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTATGGT
ATTCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTTAATGT
TAGCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTTTTTCC
TATGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGA
ACAAGCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:179058..184382 - |
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