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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000192_pilon:406249..413132- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039029 ID=XLOC_039029|Name=XLOC_039029|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6884bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:406249..413132- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGAGAAGGACTATTCACCTCTTTCAATACAAGTTGTAAGAGGGTT
GAATGACAAACTGTATGAAAAAAGAAAGACAGCAGCTTTGGAAATTGAAC
GGTACTGTATTATTTACTGTTCTAATTTTTAGAAGAATTTGTCTTCATGT
AGGATTGTTATAGTCTCTGTACACTGGATTTATTTTGTTTTTGTGTCTCA
CTGATAAAAATATGAATAAATTGTTTGATGTTTATTATTTAACTTTTATT
TAACTCATCCCTTGTTTGTACCATGTAAAACATCAGGTCACCAATTCAAA
TTACTTTTAAAATAAAAGATTTGATTTCCATTTCTTATGCAGAATGGTCA
AAGAATTTCAAGCCAACAATGATGTAAAACAAATTCGAAAACTGATCACC
ATTCTTACAGATGAATTTGCAGTTTCCCACAACCCACATAGTAGAAAAGG
AGGTCTCATCGGTCTTGCAGCAACTGCTATTGCTCTCGGAAAGGTAGTTT
AATTTGATTTCCATTTGCTTCTGATATCAGGTTTGGTACTATCTTAGCCC
TTTATTTCTTAACCAATATAAAAAACCTGCATTTTAAAGTAAATTTTTAG
TGATTTTGAAACGAAATTACAACAGTATTTATGTTAGCAAAAGTAGTCTG
TTAAACCCTATAGAATAAGAAAAGTGCTTCAATGGAATTATTGGTTTATT
AGCAAGAGCAAAGTTTTGTTTTTGCACCTTATTGATTTCAATTTATAATC
ATAATCACCAACTATATGCCCTTGACGATTTTAATTTACTACTGATTTCT
ATGATTATTATTGTTTTTTTAGGATGCAACATTCTATCTCTCAAGTCTTG
TACCACCTGTCTTATCATGCTTCTCAGACCAAGACAGTCGTGTTCGCTAC
TATGGATGTGAAGCTCTCTACAACATTGCAAAAGTAGCAAGAGGTTCTAT
TCTTCCCTACTTCAATGAAATTTTTGATGGTCTCAGCAAGGTAGGTCCTT
TTAATATTTGAACTAACCAATTGAGACTCAAACGAATTTGAAAAAGTCTC
TGGAAGGCTTAAAAAAGTTTGTAAAGAACATATTTTATATCAGACAAACA
ATATAACTAGAAGAAAAACCAACTTCAAATAAACAGGAACGTAAAAGTAG
AGAAAAGAAAAGAAAGACATGAAGTCTGACATCAGGCCATCATATTTTTA
ACTAAAACATCACACTGTCAAATTCAAAGCTTCTTCTCTTTTAGTTAGCT
GCTGATCCAGACCCTAATGTAAAAAACGGAGCCGAGTTGCTAGATCGTCT
CATAAAGGTATCATATATTGTTGTCTTTTGTAAAATAAAATTCTTTATAT
GCAGCATGCAATTTGCACAAGGTATCAATGATGATAAATCTTTTAAAATT
CCAAATGGGGTCAGAAAACCTTGATTTTTGTAAGTTAGGTGTTTGCTGTA
AGAGTGCTGTGCTATAAACAACTTTTCCAGTGAAATCCAAACTTATTAGC
ATCTAATGGATTCCCATCCTCAGAAATTATTGCTCTGTGTTGAGTTGTGT
ATGTGATATTGCCAATATTCAATATTGTAGTATAAATCTTTAAAAGATGA
TAAGATTGAATTTTAATGCTTAATTTTTTGTAATTCTTTTTTAGGATGTT
GTTACTGAAAGCTCGAATTTTGACTTGCATTCTTTTGTACCCATTCTTCG
TGAGCGAATATACACTACAAATCCTCATGCTAAGCAGTTTATTGTGTCTT
GGGTATGTTATGTTATGTCTGCTCATACATTAAACTATTGATATACATTA
TTTAGAGCTTTTATATTGGGATAGCTTATTCTTTCCTTACATGCTATGAC
ATGTGGCTACTGAAAGAAACCAGAAAGCAGGAAATCTTTCTAAAAGCTTT
ATTCTAACAATTCTTGGTTGTAGAGAAATCCCATACCAGGCTGGTAAGCA
TAGTTTGGGCAATACCGTATTACTTCGAATAAACGCCCGGGGCGTTTATT
AATTTTTTTGGATTTTAGGGGGGGCATTTATTCGAGGGGCGTTAAAAAGA
GGGGGGCGTTTATTACAAAAATACAAAACTTGATAAGAATTGAAAGGACG
AGAAATAAACAAAATAAACAAATATAAATGTTGTTTCGTTGTATTATTCT
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GGGGGCGTTTATTCGAGGGGGCGTTTAATAAATAATTTTTGAAAAAAGGG
GGGCGTTTATTCGAGGGGGGCGTTTAAAAGAAGGGGGCGTTTATTCGAAG
TAATACGGTATACCTGCTACAGATATTTGAGATTAAGTTTCTTGTTGTTT
GACCTTTTCCAAAATAGTCAGAACAGATCAACCTCCCATGTAATTTCCTT
TTTTTAGTATTTTAGTCAAAATTCAAATTAATTGTTTTTCCAATTTTTAC
TGTTTTTATAGTTTTGATGTTATTGCTTTTTTAGCTGTCTGCCCTTGATG
CAGTTCCAGAATTGGATCTATTGGTATACTTGCCAGAGTTTCTTGATGGA
CTTTTCAATATTTTTCGCGATAAAAGTGGTGAAATCAGGAAAATGTAAGT
ATAATTTTCTTCTTTTCCATTTATTCAAAAGAAGAGTCATTGTCTTCTTG
TAACAAACATCATTGATTATTGATTATTAGTTTGGAATTTAAGAGTCTTT
TTGATAAAGTTTTATTTTACTTTAAGGACAAAATAAATTATTTTTTGCTT
AGGGTTCACTTATCGTTATAGGTGTGAATTCATTCTTGGCGAGTTTCTTA
AAGATATCAAGAAGAATCATTCCACTGTCAACTTTGCAGCTATGGTTAAC
AATTTAGTACATCACTCGCAATCTGAAGGTATATTATTTTCTTACTCCTC
AAAAGTAACATATATTTACTTCAAAGTAAACAGTTCGATTCCTTTAATAC
TGTATTTTCTTCCTTTGGGATATATTTTTCTATTTCTCTTTTTTTTCTTA
GCAGTTAAAAAAGTATAACTGTATAATATTTCAATTATTTACTCGACCCC
TACAAATGAAAACTTACTGAAAGTGATTCTCAGGTAATAGGATTGGCCAT
GTTGATCATGCAATTTATAATTTTTTCTTTAAGATGAAATAATTCAGTTC
ACAGCAGTAACATGGCTCAAAGAATTCGTCTCACTATCAGGAAGAACAAT
GTTACCATTTTGTGCTTTGATACTCTCTTCTATTCTTCCTTGTGTTTCAT
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GGTGAGAAACAACTTTTTCAGATCCAATAAGCATCAATTAGAAAATTCCT
TTCCTCCTGTACAATCAATCTCATTTCGCTCACAAAGCGCTTTCAAAATG
TGTCATCTTCCTTGCCTCTTCCCTCTAAGCAGTTCTTTAGGTCAGATCAT
AGATAGTGTATCAATAACAGAAGTTATTAGTCTCCATTTTAAAATCCTTA
CCCTCCCTTTGAAAACCTTCCCCTCCCTTGTTGCTTACCCTACCCTTTAT
GGAGCACTTTTCGGGCTCTATCTCTCGTTGGTCCAGGTTGCTCATATATT
GGGGCTTTACTTCTGTATTATTACTAGAGCACTAACAGTAATCTGGTAAA
TTGTCAATAAAATGCATCTCCTTTTGTAAACAGGTCTGATGAAATTGATC
ACCACTGAAGATGATTATGACGTCAACGAGAAAGAAACAATAACAAAGAT
GGCGTCACAGATTGATCTCAGTCGTGTGGTGGAAGTGCTAACAAGACAAC
TTTCACATAAACAAATACATACTAGGATAGCTGTCTTGAGATGGGTTTTA
CAGTTACATATGAAGACTCCAAATAGGGTATCTATAAAAACTCTTTCCTT
ACTAACAAGAACGAGATGTTTTTAATATCATAATACCCATCTAGATAAGG
TTATTGGCAAATTTCACTAACATTTAACTGATTGGTAGTGTTAAAAGACC
TATGGGTTTGGTCACAGGTAATTCCAAGCAAAGTCTTCGGTGATATAGTC
TTTACTGGCTTTAAAGTGTTTTGTGCACTTCTATCTCATCTACTAATCTG
CTTTTGGTGATTAACTTTGACTCTTATGCTTATATCAAACTACTCAACTA
TTTTCAGCTCTTCCAACACATTGAGCAACTCTTTCCAGCTCTGGTGAAAA
CATTATCTGATCCATCTGATGAGGTATGTACAGTATGATTTTATTTCTAT
CTCAATAAGCATGCCCTTCTTGATCCATGCTCTTTGAACTGGTGTCTAAA
TGACACCAGGCTCTGGCTAGGGCCAGACCTAGGGTCTCGCTCTAGAATGG
AGAAGTGTGGCGCCTCCTTCCCTCCACTAGCCTGGGTGTTCGCCTTGAGC
AAGCGTTACTCCACCCACGCTCCCCTTGTCAGGGTCACGACACCAACTGG
CAATAATGTTCTGACAACTCGTCATCTTCATTGGCAACAGCAATGTGGCT
TGTCAACTCGGCATCCTCGTTGGTACCCTGGCGGATATCAGAATCAACTC
GGTCCTATATCTGGCATCTATTGCAACAGACTATCTTTATTCGGCTGTCC
TAGCTTGCTTTGCCGCCGTGTCCATGGAGTTTTCTGCCAAGGGAAGTTGC
TCTTGTCCCAAGCAGCTTCGACATACATTGGGACAGCCTTACAGAGCAAT
TAAGAACTGTACAACAACGTCATCTGCGAAACATTCTGCATATTAAATGG
GATGATTTTGTCAGTAATGAGGAGATATTAAGGAGATCCGATTCGGTAGA
TATCGAAGTTATGCTAGCCCAGAATCGACTCCGTTGGCTCGGTCACGTTG
CCCGTATGGACAACAATCGAACTGTTAAGCAACTTTTTTACGGTGAACTA
GTTCTAGGCAGCAGACCGATTGGGCGTCCACGCTTGAGGTACAAAGATAA
CATAAAAGCTCTACTTAAGACTGGTGACATCCTTCACTCGTGGAATGATT
CAGTTTCAGACCGATCCGGTTGGAGACGTAATGTGTCATCTGTCTGTGAA
AAATTGAATGTAAAACGTGTGGATATGTACGAAAGAAGAAAAGAAAGAAG
AAAAAGATAATATATATATTTTTTTTTTCTTAGTTCTCTTGTATTTTAAC
TGTATTTTACTCGAATATCGAGTTTTAGGCGTATTATTAAATGACAAGAT
AGTTTGTCACTTTTCATTTTAAACTAAATATTTTTATACTTCGAAAAAAA
ACATCAGAGCTACAGCACACAAATCATAAGAATACTTCTTCTAAGAGGCT
CCAGCCTGATTGAGAATTTAATGAGATTACTTTTCATTTTAGGTGGTGTT
ACTGGATCTTGAAGTTTTAGCAGATATTTCAGCTTCATCAGCAGGCCCAC
CTCGTTCCCAGGGCTCCACCTTATACGAAGTCACAAATACACCTTCACAA
AAACACACATTGAATTCCTATTTTACCAAATTCATGAACAACCTTTTGAA
AATCTTTAGTACCGATAAAAATTTGTTAGAAGAACGTGGGCCCTTCATTA
TAAGGTAATTATTTCAAATTTTGCCATTTTGGCTGTGAATATATTTTGAA
TTGTTAAGGAAACACCTAGTTTGACATGCAGTAATTAACTTTATATTTTG
AGGTAAATCAGGATGTCGGAGGAGAAAGTCAGAAAAATAGCGTGATTTCT
TTTTTTCAACACTCAGCCTAAAAATAGATTACTGTGTTTTCAACCTACTT
CTGGGTTAGTTGAGTTGAAATGGGTTAAGGATTAATTATGATAAATGATT
TTATCTTTAATTTCCTTTAGACATTTATGTTTACTGCTGAACGCTCAAAA
CATTTATTGTGCATTAGCTGAAATTTTGACACAAGAAAAAGATGACTTGA
AATTTGCTTCCATCATGGTCAACAATCTGAATATGATTCTACTGACCTCC
AGTGAACTTTTCGAATTGAGGCTGAAACTGAAAGATCTAAATTCTGAGGT
ATTGTTCCATTGAATTATTTCCACGATTCAAGTCCAGATTTTTTCTCATT
CAAAAAAGTGATTGCTCCTTCTGATTCACAAACATGATAATTTCAATGTT
TTATAAATGAACTAAACTGATTTTCATTTCCAAACGTACCAGGTTAGGGA
TTTATTGATTCAGGCTTTTTCTTGATTTAGTCCCTATACACCTAAAACGT
TCTGCTAAATGATTGTCGTATGTAAAAAAAAATTGAAGTCGTTGTACAGA
AACAGACTTTTTGACGTCATTGACCCTCCTAGTATACTAAAGCCTATACT
GTAATACTTTTTTCACGTATACGGTGTCGTTCAAGACCACAAACTTTGGT
TTCGTATAATGACATCAAAAAATTGTTTTGACATTTTCACTAATTCTCAT
TTGAAGTTATTCTCTCCCTTTCAGGATTCTTGTCATTTATTTACCATCTT
GTATCGATGTTGGTGTCACAATCCGGTAGCTACAGTTTCATTATGTTTCT
TATCACAAACCTACAAGCACACGTGTGATTTACTTCTCAAATTGTATCCT
TTTCAACGAAGAAATGTACGGTGACATAGGCGTCCTTCATCAAAAGTTGA
TTAAAAATTAAAAGTAAAAGTTTCCCTACTTTAGAGAGCATAATTCTTCT
GGCAAAATTCGAGTTTTTTTTTCGTTTTTAGGCTCTAGCAATTAAATGAG
CTTAAATAAGTCTCGTCGTAGATATTATTCGTTACTCGGATCTTACTGTT
GAATTTTATTGCTAATGTATTATTTCCTTAACATATTCTCAAATTATGTA
ACCAGTGGTAATCTAGAGGTCAATGCTGAGTTTTTGACGCAAGTTGATAA
ATTGGTTCAAATGATCGAGTCCCCCATCTTTACT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000192_pilon:406249..413132- >XLOC_039029 ID=XLOC_039029|Name=XLOC_039029|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:406249..413132- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGAGAAGGACTATTCACCTCTTTCAATACAAGTTGTAAGAGGGTT GAATGACAAACTGTATGAAAAAAGAAAGACAGCAGCTTTGGAAATTGAAC GATGGCAGAGAAGGACTATTCACCTCTTTCAATACAAGTTGTAAGAGGGT TGAATGACAAACTGTATGAAAAAAGAAAGACAGCAGCTTTGGAAATTGAA CGAATGGTCAAAGAATTTCAAGCCAACAATGATGTAAAACAAATTCGAAA ACTGATCACCATTCTTACAGATGAATTTGCAGTTTCCCACAACCCACATA GTAGAAAAGGAGGTCTCATCGGTCTTGCAGCAACTGCTATTGCTCTCGGA AAGAATGGTCAAAGAATTTCAAGCCAACAATGATGTAAAACAAATTCGAA AACTGATCACCATTCTTACAGATGAATTTGCAGTTTCCCACAACCCACAT AGTAGAAAAGGAGGTCTCATCGGTCTTGCAGCAACTGCTATTGCTCTCGG AAAGGATGCAACATTCTATCTCTCAAGTCTTGTACCACCTGTCTTATCAT GCTTCTCAGACCAAGACAGTCGTGTTCGCTACTATGGATGTGAAGCTCTC TACAACATTGCAAAAGTAGCAAGAGGTTCTATTCTTCCCTACTTCAATGA AATTTTTGATGGTCTCAGCAAGGATGCAACATTCTATCTCTCAAGTCTTG TACCACCTGTCTTATCATGCTTCTCAGACCAAGACAGTCGTGTTCGCTAC TATGGATGTGAAGCTCTCTACAACATTGCAAAAGTAGCAAGAGGTTCTAT TCTTCCCTACTTCAATGAAATTTTTGATGGTCTCAGCAAGTTAGCTGCTG ATCCAGACCCTAATGTAAAAAACGGAGCCGAGTTGCTAGATCGTCTCATA AAGTTAGCTGCTGATCCAGACCCTAATGTAAAAAACGGAGCCGAGTTGCT AGATCGTCTCATAAAGGATGTTGTTACTGAAAGCTCGAATTTTGACTTGC ATTCTTTTGTACCCATTCTTCGTGAGCGAATATACACTACAAATCCTCAT GCTAAGCAGTTTATTGTGTCTTGGGATGTTGTTACTGAAAGCTCGAATTT TGACTTGCATTCTTTTGTACCCATTCTTCGTGAGCGAATATACACTACAA ATCCTCATGCTAAGCAGTTTATTGTGTCTTGGCTGTCTGCCCTTGATGCA GTTCCAGAATTGGATCTATTGGTATACTTGCCAGAGTTTCTTGATGGACT TTTCAATATTTTTCGCGATAAAAGTGGTGAAATCAGGAAAATCTGTCTGC CCTTGATGCAGTTCCAGAATTGGATCTATTGGTATACTTGCCAGAGTTTC TTGATGGACTTTTCAATATTTTTCGCGATAAAAGTGGTGAAATCAGGAAA ATGTGTGAATTCATTCTTGGCGAGTTTCTTAAAGATATCAAGAAGAATCA TTCCACTGTCAACTTTGCAGCTATGGTTAACAATTTAGTACATCACTCGC AATCTGAAGGTGTGAATTCATTCTTGGCGAGTTTCTTAAAGATATCAAGA AGAATCATTCCACTGTCAACTTTGCAGCTATGGTTAACAATTTAGTACAT CACTCGCAATCTGAAGATGAAATAATTCAGTTCACAGCAGTAACATGGCT CAAAGAATTCGTCTCACTATCAGGAAGAACAATGTTACCATTTTGTGCTT TGATACTCTCTTCTATTCTTCCTTGTGTTTCATATGATCAACCCAAACAA CACATCAGAGAAGTTGCAAAACTTGTCAATAATGATGAAATAATTCAGTT CACAGCAGTAACATGGCTCAAAGAATTCGTCTCACTATCAGGAAGAACAA TGTTACCATTTTGTGCTTTGATACTCTCTTCTATTCTTCCTTGTGTTTCA TATGATCAACCCAAACAACACATCAGAGAAGTTGCAAAACTTGTCAATAA TGGTCTGATGAAATTGATCACCACTGAAGATGATTATGACGTCAACGAGA AAGAAACAATAACAAAGATGGCGTCACAGATTGATCTCAGTCGTGTGGTG GAAGTGCTAACAAGACAACTTTCACATAAACAAATACATACTAGGATAGC TGTCTTGAGATGGGTTTTACAGTTACATATGAAGACTCCAAATAGGGTCT GATGAAATTGATCACCACTGAAGATGATTATGACGTCAACGAGAAAGAAA CAATAACAAAGATGGCGTCACAGATTGATCTCAGTCGTGTGGTGGAAGTG CTAACAAGACAACTTTCACATAAACAAATACATACTAGGATAGCTGTCTT GAGATGGGTTTTACAGTTACATATGAAGACTCCAAATAGGCTCTTCCAAC ACATTGAGCAACTCTTTCCAGCTCTGGTGAAAACATTATCTGATCCATCT GATGAGCTCTTCCAACACATTGAGCAACTCTTTCCAGCTCTGGTGAAAAC ATTATCTGATCCATCTGATGAGGTGGTGTTACTGGATCTTGAAGTTTTAG CAGATATTTCAGCTTCATCAGCAGGCCCACCTCGTTCCCAGGGCTCCACC TTATACGAAGTCACAAATACACCTTCACAAAAACACACATTGAATTCCTA TTTTACCAAATTCATGAACAACCTTTTGAAAATCTTTAGTACCGATAAAA ATTTGTTAGAAGAACGTGGGCCCTTCATTATAAGGTGGTGTTACTGGATC TTGAAGTTTTAGCAGATATTTCAGCTTCATCAGCAGGCCCACCTCGTTCC CAGGGCTCCACCTTATACGAAGTCACAAATACACCTTCACAAAAACACAC ATTGAATTCCTATTTTACCAAATTCATGAACAACCTTTTGAAAATCTTTA GTACCGATAAAAATTTGTTAGAAGAACGTGGGCCCTTCATTATAAGACAT TTATGTTTACTGCTGAACGCTCAAAACATTTATTGTGCATTAGCTGAAAT TTTGACACAAGAAAAAGATGACTTGAAATTTGCTTCCATCATGGTCAACA ATCTGAATATGATTCTACTGACCTCCAGTGAACTTTTCGAATTGAGGCTG AAACTGAAAGATCTAAATTCTGAGACATTTATGTTTACTGCTGAACGCTC AAAACATTTATTGTGCATTAGCTGAAATTTTGACACAAGAAAAAGATGAC TTGAAATTTGCTTCCATCATGGTCAACAATCTGAATATGATTCTACTGAC CTCCAGTGAACTTTTCGAATTGAGGCTGAAACTGAAAGATCTAAATTCTG AGGATTCTTGTCATTTATTTACCATCTTGTATCGATGTTGGTGTCACAAT CCGGTAGCTACAGTTTCATTATGTTTCTTATCACAAACCTACAAGCACAC GTGTGATTTACTTCTCAAATTGATTCTTGTCATTTATTTACCATCTTGTA TCGATGTTGGTGTCACAATCCGGTAGCTACAGTTTCATTATGTTTCTTAT CACAAACCTACAAGCACACGTGTGATTTACTTCTCAAATTTGGTAATCTA GAGGTCAATGCTGAGTTTTTGACGCAAGTTGATAAATTGGTTCAAATGAT CGAGTCCCCCATCTTTACTTGGTAATCTAGAGGTCAATGCTGAGTTTTTG ACGCAAGTTGATAAATTGGTTCAAATGATCGAGTCCCCCATCTTTACT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000192_pilon | genome | sc0000192_pilon:406249..413132 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1747-1824:79 |
| Aaloc | 1627-1743:461 |
| Aaloc | 1450-1626:1064 |
| Aaloc | 1237-1446:1543 |
| Aaloc | 1171-1236:2728 |
| Aaloc | 979-1170:3200 |
| Aaloc | 811-975:3750 |
| Aaloc | 703-807:4113 |
| Aaloc | 592-699:4401 |
| Aaloc | 484-591:5241 |
| Aaloc | 421-483:5641 |
| Aaloc | 253-420:6063 |
| Aaloc | 103-252:6542 |
| Aaloc | 1-99:6885 |
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