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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:824100..825512- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033415 ID=XLOC_033415|Name=XLOC_033415|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1413bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:824100..825512- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAATGAAGATACCAGCAGACGTAAAAACCTAAATTCGCCAATATT
GCGTGGAAGCGAAAAGAACAGTATTGAATCTAATACAGGTCTTGAGAAAT
GGAAAGTCCAGCGTCGGCGAACCTTCCTCGCCTTCTGTCTAATCATCAGT
ATAAATGGCTTAGAATGTGGTATCGCTCTACCAACACTGTTCACTTACTT
AAAAGAGAATCTCAAAACACCACATTTGAATATCTGGTATGGTTTGATTG
CCAGTTCGTACTTCATAACCTCCAATATAGGCTGCTTAACAGTCTCCAGG
TATGCTGATCAAACTAAAAATATCCGTTTAGTGCTTATTGCGACATGTCT
TTTTGTATCGCTCGGAAATCTCATTTACGCCACATCAAAATACGCTTTCG
TGCTACTTATCGGTCGTTTAATGCAAGGTTTCGGCGATTCTTTAGTATCT
ACCTTATCCGGAGAAACGATGCGCATTTACCGTAAAGAAGAAGTGGTTCC
TAAAATTTCAACATTCATGACAGCTTTCTTCGTATCTTATATTATCAGTC
CGATTTTAATCACCATCTGTGGTCCGGTGAATTTTGAATTGTACGCTGGT
GTACGTCTGGAAGATGATAATTTTCCCTTTATTATCGTTGGATTTTTATG
GCTTCTTGGAAGTGTGTTATCTTATTTCGTGGTATGTGATTTATCGAAAA
ATAATTCATTGGTTCAAAACGAATGTGATATCCAAGATGGTAGACGAAGA
GGTGAAACCGAATCAGAAATTCAATCAAATGTGGAACAAGCTAATGATAA
AATGCTACCACTAAGGAAACTTATATTCAATCGTGATTTAGCGTTTATAT
ATAGCATAACATTCGTGGTAAATTATTTTTCAGGTGTTTTTAACGCTATT
TATGTTCCCATCATTGCAAACCGATTTTATGAAATCGCACTCAAGTATGT
TGGTATGATTTATACAATGAATGCTGTATTCTTTTCACTGACAATGTATT
TAGTGACGAAATTAAATTATTTTAACAATGAGATTTATTTTATTGTGTTT
GGATCATCAGCCATGGTGATTGCCCTACAAGCCATGACTATGTCAGTGAT
AATGACTCAATTTCATTTATTTGGTATTTTAATGTTGATAACATTTGCTA
TCTGTACTGGTGTTGGCTGGTCAGTCGAGCAAGTGCTATTAACTGCATTA
TCGGGTAAATTCGTACCCCTAAATATGCAAAGCTATGCCGCGGGCGTACG
CCGTACTGTTGGTAACACGGCTCATATTATCGGCGAGTTTTTAGCACCAA
ATTTACAAGATTGCATGGCAGAACATTGCTTGGTGATTTCAGTGGTGTAT
TTTGGGTTCATTGGTTACGCTATAATTTACAGAAGAAGATTCACTACGGC
CAAAATGATAGGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:824100..825512- >XLOC_033415 ID=XLOC_033415|Name=XLOC_033415|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2826bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:824100..825512- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAATGAAGATACCAGCAGACGTAAAAACCTAAATTCGCCAATATT
GCGTGGAAGCGAAAAGAACAGTATTGAATCTAATACAGGTCTTGAGAAAT
GGAAAGTCCAGCGTCGGCGAACCTTCCTCGCCTTCTGTCTAATCATCAGT
ATAAATGGCTTAGAATGTGGTATCGCTCTACCAACACTGTTCACTTACTT
AAAAGAGAATCTCAAAACACCACATTTGAATATCTGGTATGGTTTGATTG
CCAGTTCGTACTTCATAACCTCCAATATAGGCTGCTTAACAGTCTCCAGG
TATGCTGATCAAACTAAAAATATCCGTTTAGTGCTTATTGCGACATGTCT
TTTTGTATCGCTCGGAAATCTCATTTACGCCACATCAAAATACGCTTTCG
TGCTACTTATCGGTCGTTTAATGCAAGGTTTCGGCGATTCTTTAGTATCT
ACCTTATCCGGAGAAACGATGCGCATTTACCGTAAAGAAGAAGTGGTTCC
TAAAATTTCAACATTCATGACAGCTTTCTTCGTATCTTATATTATCAGTC
CGATTTTAATCACCATCTGTGGTCCGGTGAATTTTGAATTGTACGCTGGT
GTACGTCTGGAAGATGATAATTTTCCCTTTATTATCGTTGGATTTTTATG
GCTTCTTGGAAGTGTGTTATCTTATTTCGTGGTATGTGATTTATCGAAAA
ATAATTCATTGGTTCAAAACGAATGTGATATCCAAGATGGTAGACGAAGA
GGTGAAACCGAATCAGAAATTCAATCAAATGTGGAACAAGCTAATGATAA
AATGCTACCACTAAGGAAACTTATATTCAATCGTGATTTAGCGTTTATAT
ATAGCATAACATTCGTGGTAAATTATTTTTCAGGTGTTTTTAACGCTATT
TATGTTCCCATCATTGCAAACCGATTTTATGAAATCGCACTCAAGTATGT
TGGTATGATTTATACAATGAATGCTGTATTCTTTTCACTGACAATGTATT
TAGTGACGAAATTAAATTATTTTAACAATGAGATTTATTTTATTGTGTTT
GGATCATCAGCCATGGTGATTGCCCTACAAGCCATGACTATGTCAGTGAT
AATGACTCAATTTCATTTATTTGGTATTTTAATGTTGATAACATTTGCTA
TCTGTACTGGTGTTGGCTGGTCAGTCGAGCAAGTGCTATTAACTGCATTA
TCGGGTAAATTCGTACCCCTAAATATGCAAAGCTATGCCGCGGGCGTACG
CCGTACTGTTGGTAACACGGCTCATATTATCGGCGAGTTTTTAGCACCAA
ATTTACAAGATTGCATGGCAGAACATTGCTTGGTGATTTCAGTGGTGTAT
TTTGGGTTCATTGGTTACGCTATAATTTACAGAAGAAGATTCACTACGGC
CAAAATGATAGGAATGGCCAATGAAGATACCAGCAGACGTAAAAACCTAA
ATTCGCCAATATTGCGTGGAAGCGAAAAGAACAGTATTGAATCTAATACA
GGTCTTGAGAAATGGAAAGTCCAGCGTCGGCGAACCTTCCTCGCCTTCTG
TCTAATCATCAGTATAAATGGCTTAGAATGTGGTATCGCTCTACCAACAC
TGTTCACTTACTTAAAAGAGAATCTCAAAACACCACATTTGAATATCTGG
TATGGTTTGATTGCCAGTTCGTACTTCATAACCTCCAATATAGGCTGCTT
AACAGTCTCCAGGTATGCTGATCAAACTAAAAATATCCGTTTAGTGCTTA
TTGCGACATGTCTTTTTGTATCGCTCGGAAATCTCATTTACGCCACATCA
AAATACGCTTTCGTGCTACTTATCGGTCGTTTAATGCAAGGTTTCGGCGA
TTCTTTAGTATCTACCTTATCCGGAGAAACGATGCGCATTTACCGTAAAG
AAGAAGTGGTTCCTAAAATTTCAACATTCATGACAGCTTTCTTCGTATCT
TATATTATCAGTCCGATTTTAATCACCATCTGTGGTCCGGTGAATTTTGA
ATTGTACGCTGGTGTACGTCTGGAAGATGATAATTTTCCCTTTATTATCG
TTGGATTTTTATGGCTTCTTGGAAGTGTGTTATCTTATTTCGTGGTATGT
GATTTATCGAAAAATAATTCATTGGTTCAAAACGAATGTGATATCCAAGA
TGGTAGACGAAGAGGTGAAACCGAATCAGAAATTCAATCAAATGTGGAAC
AAGCTAATGATAAAATGCTACCACTAAGGAAACTTATATTCAATCGTGAT
TTAGCGTTTATATATAGCATAACATTCGTGGTAAATTATTTTTCAGGTGT
TTTTAACGCTATTTATGTTCCCATCATTGCAAACCGATTTTATGAAATCG
CACTCAAGTATGTTGGTATGATTTATACAATGAATGCTGTATTCTTTTCA
CTGACAATGTATTTAGTGACGAAATTAAATTATTTTAACAATGAGATTTA
TTTTATTGTGTTTGGATCATCAGCCATGGTGATTGCCCTACAAGCCATGA
CTATGTCAGTGATAATGACTCAATTTCATTTATTTGGTATTTTAATGTTG
ATAACATTTGCTATCTGTACTGGTGTTGGCTGGTCAGTCGAGCAAGTGCT
ATTAACTGCATTATCGGGTAAATTCGTACCCCTAAATATGCAAAGCTATG
CCGCGGGCGTACGCCGTACTGTTGGTAACACGGCTCATATTATCGGCGAG
TTTTTAGCACCAAATTTACAAGATTGCATGGCAGAACATTGCTTGGTGAT
TTCAGTGGTGTATTTTGGGTTCATTGGTTACGCTATAATTTACAGAAGAA
GATTCACTACGGCCAAAATGATAGGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:824100..825512 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 790-1416:628 |
| Aaloc | 1-786:1414 |
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