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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:470303..475706- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033368 ID=XLOC_033368|Name=XLOC_033368|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:470303..475706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTACTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCT
TATTCGATATCTGAGAAAGAAAGGTATGTTCTTTCTTATATGAGACTTAA
AAGCCCTGAAATAGCAGACACCCCTGCCTCACAGGGACCTCTTCCATCAG
CCTAAATTTCGTCATTTTTGTCCCTGGTGAGATTACTCATAAATTTAATT
AATAAATTTGAACAAAAGAATTTGAAAAACCCAAGCATTACATATCCCAT
GGTTTTCATCATAATATCCTAAATTGCTCAGAAATGCCCGCCCGGCCACC
GAGACAGTGGTGTGTCAACAGAAAACTCACTAAATATTGTTTTTGAACGT
TAGATGATGGATGTTTCATTTTCTTAGCCATTTCTGAAACCTCAAGCTAG
GATAGTTCCCTATTGTTCTAAGGTTTTGTCAAATTGAGCTTCACGTTTTT
ATAAAATTATTCTAATTAGAAAAAAAAACGAGTCTATGAAAAGTGTTTTT
TTTTAATTTCGCATAGCGAAAGTATTACGATAGCCTTTCGCGGCGGCGGT
GTCCTCGGAAAAAAAATTAGAAAACGAAAGTGCTTGATACAGTGGACGAA
CTCACTAAATTTAATTCACAAATTACACGCTCGTATAACCACGGACGATT
TTCGCGGGTTTTCTTTGGATTACGTCATATATCTTTGTGTCTTTAGCTCC
ACAGTTTGATTTTTTCTTTATTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAAT
CAAATCAATGACTCTTGATAGACGGTAATATACCTTTCGGTAATTAGTTC
TTACAAAGTAAACAAGGAATGGTGCACAATATGAGCTTATTTAGTTTTCT
CATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGACGGT
GATATAGCTTTCGGTAATTAGTTGTTACAAAGTAAACAAGGAATGGCGCA
CAATATGAGCTCATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCA
AATCAATAACTCTTGAAAGACGGTGATATACCTTTTGGTAATTAGTTCTT
ACAAAGTAAACAAGCGATGGCGCACAATATGACCTTATTTAGTTTTCTTA
TAAGCATATACCTTATAAGAATCAAATCAGTAACTCTTGATAGACGTTGA
TATACCTTTCGGTAATTACTTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGCGCACA
ATATGACCTTATTTAGTTTTCTTATAAGTAGGGAGGGGACTTAAAAAAAG
AAAATTAGAAAGAATTTAGTGGCATATGTACAAAAGCTGCCAAATTATAT
AAAAATAAGGAAAAAATCAAAAATTTTGACCGGGGACCCTTTTCAGGGTC
CCCCCGGGCCCCATTTCTGCGGGGTACTCAGCGCGACCCCGGACCAAAAA
TAGCCTAACACCAACTTTCTTAAAACATAGTCATGTGGCATATCAAATTA
TCAGAAATTCTATGCTGATTCCAAAAAACATTAGTAGTAGGGGTCAGAAA
TAAAGCTAAACAAAGTTATGACCATATCTTGGACCAGATTTGGAGTAAAT
TGCATAATTCGCAAGAAATTCGAATAGAATCTTGATTATGACTAACATTT
TATGTTGTTAGTAGTTAAACTTTGACAAAATTCTGGTTTATTGATGTAAC
TGTTTTCATGATATGAAGACATTTTCAGGTTTATTTAAGTTTTCTTTAGA
GAGACGGATTATGGATGTGTGAAGCTGAGGTACCTTGAACAAGAGCAAAA
TATATTTTATCAAGCCAGAAATTGCAAAGTAAAAAATCAAGGAATAAAAA
GTTTTTCAATTGTAAAGAGCATCACGAACTGCCACATGAGTGGGCAGAAT
GAATGTAAAGATAACCTTTGGATGTTCTTTACCAAATGCCAAGAAAGCGT
TGGAATATCTATTCACCACTAAGATGGTCAATACAGGAAAGAATGAGAAT
TTTGAAAAAGCTGTTGAAAAGGGTGTTGTTGTAAAGGGTGTTGTATTGCA
ATGGATTTTTTGCAATGTTTATCCAAAGAACTATCGAACATCGGAGCACG
ATATTAAAACATTATTAAATAATTATGAATTATTGAAAAAAGAAGCACTT
CAAAAAAAACAGATGATAAAGATATTGTTTGACATTATTGATTATTGAAT
AGTTTATTGCTAGGGCAAATTCTCTCCTAGGACTGACAGTGATATCTAAT
TCAATTCTTTGTAATTTTCGTTTAGGTATACAAGTTGAGTTCAATCTATA
GACCATGATGGCACCTTTAAAGTTTACATTTCATTTGAAAAGGCATTGTA
GGGTACAGACATTGATTGGTGCTAAATTTAATTTAAAAGTTCAAAAGAGG
GTAAGGCTACAAGAAACAACCTGGGTGTAAAAATAAGGCAAAATGACTGG
ACATTTTACAATAACCAAAAACAAATCCCACTAGAAGGGTTTTGTACCAG
TTTCACTGATAGACTCTTTTTTAAACTTTCCAACTCACCGAGGATGCTCT
TAAGATCTGCCATTGAGATACTGGTAGCTGATCTGGCGCCTTCAAATATA
TTTTTAACCCATTTTGATAACCCCCCCTTGAACTCAACCTCTTGCCATTC
TGCCTCCTCATTCTGCATCCTGCAAATGTAAACTTTAAAGGTGCCATAAT
CATGGTCTATGGATTAAACTCAACTTGTATACCTAAACAAATATTGCAAA
GAATTGAATTGGATATCACTGTCAGTCCTAGGAGAGAATTTGCCCTAGCA
ATGGACTATTCAATAATCAAAGAGAAATCTTACCAATGTTAAACAATTAT
TTAACCTATCTGTATTTCTCAAACTTAGGCCAGTACTCTCGGGTACCTAA
TAGCTGGGGGTTTGGAATAAGAGGGGGCATAGTGCGGAAAGGGTCTGATC
CCCTTCTTGGCAACCCCCCCCTTAAAAATATCTATCCCCCAAGGGTTTTG
GGCTAAATTTTCGAAAATATATAGTGTATAGTGTGATCCGATAATCCCCT
CAGACTACTCAAACAGAAAAACTTCCTTTCATGCAGACCAAATTCATAAC
AACGCTGGAAAGAATATCTACAATATACGTAAGCCCCCCCTTCTTAACCG
ATCCCCCCTTTTTAATGAAAATTTCTTATCCCCCCTTCTTCACTTTTTTG
GAAGGTATCATCCCCCCTTAAGCCCCTGGCTATTAGGTACCCTAGAGTAA
TCATCTGGTTTCTTCGAAGTGCTTCTTTTTTTTAATGATTCATAATTATT
TATGTATTAATTTTAATTATTTATAAAATTGTAATAATAATCTTTTAAAA
TCGTGCTCCACTGTTCAATAGTTCTTTGGATAAACATTGCAAAAAATCCA
TTGCAATACAACTCTTTGCAACAGTTTTTCAAAATTCTTATTCTTTCCTG
TATTGACCATCTCAGTGGTGAATAGATATTCCAACGCTTTCTTGGCATTT
GGTAGAACATCCAAAGGTTATTTTTCCAACATCTCAAACTTAACACAGGT
ATTACAATCTTTACATTCATCTGTCCACTCATGTGGCAGTTGGTAATGCT
CTTTGCAATTGAAAAACTTTTTATTTCTGTGTTTGTTTTGATTTTTTACT
TTGCAATTTCTGGCTTGATAAAATATCTTTGCTCTTGTTCGAAGTACCTC
AGCTTCACCATCCTTGTCTAACTTAAATAAACCTGAAAATGTCTTCATAT
CATGAAAACAGTTACATTCAATTAACCAGAATTATGCCAAAGTTGAACTA
CTAACTACATGAAATATTAGTCATAATCAAGATTCTATTCGAACTTCTTG
CGAATTATGCAATTTACTCAAAATCTGGTCCAATATATGGCTATAACTTT
TTTTAGCTTTATTTCTGACCCCTACTACTAATGTTTTTTGGAATCAGCAT
AAAATTTCTGATAATTTGATATGCCACATGACTATGTTTTAAGAAAGTTG
GTGTTAGGCTATTTTTGGTCCGGGGTCGCGCTGAGTACCCCGCAGAAATG
GGGCCCGGGGGGACCCTGAAAAGGATCCCCGGTCAAAATTTTTGATTTTT
TTCTTCTTTTTATATAATTTGGCAGCTTTTGTACATATGCCACTAATTGT
TTTTTTCTAAGTCCCCTCCCTATTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAA
ATCAATAACTCTTGATAGACGGTGATATAGCTTTCGGTAATTAGTTGTTA
CAAAGTAAACAAGGAATGGCGCACAATATGAGCTTATTTATTTTTCTTAT
AAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAGCTCTTGATAGACGATGAT
ATACCTTTCGGTAATTAGCTCTTACAAAGTAAACAAGCAATGGCACACAA
TATGAGCATTTTTATTTTTCTTATAAGAATTTACTTTATAAGAATCAAAT
CAATAACTTTTGATAGACGGTGATATTACCTTTGTTTACTAGTTATTAGA
AATTAAACAACAATTGTTCTTAAATTGGTAGCGATTTTAAGCCTCGTTGT
TCTTGTAAAATTGTTTCATCAAGGCTCGATGTAAAGTAGATTTCAAATTG
GCTTCAATCTCTACTTCTTGTTTTTCCTATGTAGTTTAAATTCTAGGCGA
AATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTTTAAGCTTACAATTATCTTTTTCT
TACTTCACTCGTAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAAGTG
TAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCAGAT
ACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGA
AACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAAC
CGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACATGCT
ATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTTCAA
TTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGGCGA
AGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTGAAA
GAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTA
CGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTAAAA
GTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCAT
GTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTA
TACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTG
TACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGAT
AATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAAT
TAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:470303..475706- >XLOC_033368 ID=XLOC_033368|Name=XLOC_033368|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:470303..475706- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTACTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCT
TATTCGATATATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTACTGGTTGGATTTT
TGTCTCTTCTTATTCGATATCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTG
AAAGAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAG
TTACGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTA
AAAGTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGAC
CATGTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAA
TTATACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCG
TTGTACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATT
GATAATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCC
AATTAAACCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTGAAAGAATTGAGTA
AATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTACGACAACGTA
ATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTAAAAGTGAAATTAA
CCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCATGTTATGGCGC
AGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTATACTTTAGAA
CATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTGTACCAAACTC
TACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGATAATGGAACCA
TGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAATTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:470303..475706 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 286-459:175 |
| Aaloc | 211-276:241 |
| Aaloc | 61-207:388 |
| Aaloc | 1-60:5405 |
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