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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000057_pilon:1289550..1294465+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031670 ID=XLOC_031670|Name=XLOC_031670|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4916bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1289550..1294465+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCAAGAATGCAAGATTTATCCAAAAACATTGTCAAGGTTTGTATGG
AATCAAGAAAGCCAGAGTTCATTCGTTAAGTCCTTTAGCAAGTGCTTTCG
ACAAGCCTTATCTGAAAAGTGATTTTGATAGTGATGGCAATGTTGGGCTT
TTTGGTTTACCCGAGCTTCAATCTGCAGATGGTTTTCATGATCTAAAAGA
CAATGTTCTTTCTACTGCTAAACAGTTGGTCAACGAAGCTGTTTCTCAGT
CCCCTTCAGCTGAGGTCGTTAAAACATTCGATAATTTGTCCAACGAACTT
TGCAAAGTTGCTGACTTAGCAGAATTCACTAGACTTACTCATCCAGACCC
GAATTATGCACAGGCTGCTGAGCAAACATCATTTGAGATTGGAGGCTATG
TTGAGAAACTGAACACGAATTTTTCGCTTTATAAAGCATTAGATGTCTCG
TTGAGAATGGATAGTGGAGAAATGGACCCTGTCACAAGAAAAGTGGCGGA
ATTGCTCCTTTTCGATTTCGAACAAAGTGGGATTCACTTGgataaaaaac
gaaaagaaaTAGCCGTGGGCCTTCACGAGGCCGTTATTATCTTAGGCGCT
CGTTTCACTGAAGCTTCCCAAGCCGCCCGACGATACCCTTTAGGAACATG
GCCCAAAGACTTGGCTATTCCTTATAAAATTGATGGTAATCACCTGCTTG
CAGATGCAACTTATTGTGAAAGTAGTGCCGAGCGTACGAGAGAGCATTGT
CACAAGGCGTACTTTCATCCTTGTGATGATCAACAGTTTTTATTAGAGAA
TTTATTTCACGCTCGCTATCAACTGGCTTCTTTGTTAGGTTTCGAAAGTT
TCGCTCAGCGCACTTTGAAGGGTACTACAGCCACTTCCCCGGAAATTGTC
GATTCATTTTTAACCAAAACCCTTGACATGCTGACTGAACCAATGTCTAA
AGAAATCTCCCTTCTCTCTGAATACAAATCTAAACACGATGGACTTGGAA
CTGGTATAAAAGCCTGGGACCTAAGGTACTACACTAACCTCGTCACCACT
CAGATGTACAACCTAAGTTCCAGTTCCCTGAGAGAATACTTCAGTGTAGG
GTCATGTATGGAGGGACTAAATCTTGTCTTTTCATCCCTGTTTGGTGTGA
CTTTGAAAGTTGTTCAAGCAGCAACCGGAGAGGTTTGGGCACCACTTGTT
CAAAAGATCGAAGTGCATGACGGGAAGGAAATCCTTGGCTACCTTTATTG
TGATTTTTATCAACGTCCCGGAAAACTGGCTCAAGATTCGCATTTCACAA
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Gttttacagtggagtctctttaactcgatgctcaaaatttccttaactcg
aacaaatttgtgttctctCGAGTTATGGACAACGTACATGTACAAAGACC
TGAATTCTGACTGAACttagttttttcacattttgatgCTCCTGTACTTA
TCTGCGTTAATGAAGCCATAATTGGGCGGGCTCCAGACGATTGAAGTTTT
AGGAATGTCTCTTCATCctgatctttatttttcttttcttagaatTATTA
ATTTTGCATAAACCTTAATCCCCTCCTTGCCCCAAACCAGTACGAATAAG
GTCTCACCGAATGATCAAAATATAGGAAAATTCTAATGGCCTTAACATAC
ACGATTCCGTCTATACTAGTTTGACCCTTATTCATTCATTGTTAGGTGGA
AAAGAATTGGATGACGGTACATACCAGCTACCGATCATTGCATTGAATTG
TAACTTCCCAGCGCCACAAGGTGATCGTCCAGCATTGTTAAGCCAGGGAA
TGGTTGAAAATCTTTTCCATGAAATGGGTCATGCTATGCACTCCATGCTC
GCACGCACCAGGTATAATGTTTTTGTCCAATATGTAATTGAATACATTGG
CGAAACCCACTGATCTTTATTTActctggaccaagtttctcaatcctggc
caagtaaaatctttgatcggagtttttttagaaaagaggtaccctaatgg
tagcactactcaatgtaaatacatcgagagcgctagaacTACTTTTCCCT
ACTGGactacttttgatgatgtagcgccgttagacgttaatttttaacac
ttgaAGGTATCTAAAAAATCCTGGAGACTAACCTTCCTAAAATGACTCCA
AAGCATTTGGATGGAATAATTTTCTGGGGAAGCCCAATGGAAATTTTGCT
CAAGAAGCAAATTATCAAAACATTAAAGGAGTGATTCATTACTTTACATa
taggatatttttttcaaagaaccCTGAAATTTCAGTCGTATTAATTAATA
CTTTGAAGTTAATCTAATAAACAATAAGGTTGGAATTATAACAGGGGTTG
GAACATTTTTAAATCTCAATGAATCTGCTTGCTGGACGTGGTGTATTGGA
AATTGTCTATAAGATGAGAATCACTTATGCGATGACACAGGGTTGTGATA
ATATTTCGTTTCCGTTTCAACAGATACCAACACGTGACCGGGACACGCTG
CGCAACGGATTTCGCTGAAGTACCCTCAATACTTATGGAATATTTTGCAA
TGGATCCGCGTATCCTACCTTTGTATGCAAAACATTACAAAACAGGACAA
CCTCTACCTCAAGAAATCATTGATAGTAGGGTCATTTCTTTGTGCTCttt
ctaccttaaaggaagaaattttggcggagagaaaatttggcggatttggc
ggatttggctgaaatccgccaaattaagttcccgccaaattaaacatttt
gaaaatatgatctcttttaaggtgtttttgctattttttcgctgttttga
cgccatcttaaggttaaatttttaagcgaccgccaaattaaattcccgcc
aaatttagttttttcgtccatccgccaaattaaattccctctgaaaaaac
ttttttggccatccgccaaattaaattcccgccaaaatttcttcctttaa
ggtattctGTCCGTTAATTTCTAAATTGAGTTCTCTATGTGTCACTTTGA
TTCGAAGTCTGCTGAAATTAGGATGACAAGCAGACTTAGTAAGGAAGCAA
GCacatttatcaaatttgaataagtaGGTCTCCTGCTTTAGTTTTTATCG
AATTACTTATTGactaagtttttttataagaataacttccataaaaatat
cagggtgagatttcggagttggaacaataggcctattgtttagaacaata
gagaAGTAAGAATAATTCCCACTCTCAACcaaaaaaacactattcttatt
aaaaaaaatcgtgGATAGctataagaataaaatcaaaCTTTCGATCAATT
TTTCAACAGTGATTTCCAATTCGAAGAaattatttgcagccatggatTTG
CATACGCAAGCATTTTATTCAATTGTTGATCAGCGTTTCCATGGCAAATA
TCCGTTGGGCAAACCGAATAATGAAATATTGGATGATCTCCATAAAGAAT
ATTCTCCATTATCTCATGTCCAAGGTAAAaagaattacacgtttttttat
gagaatattatcttctataagaatatcaggataaaaattggccaaatcgt
aagaatacccgaAGAATACACTCTAGGGTGAGTTttacagaatttgataa
gaatacagtcatttcgTATTTGATTAAAAGAATACGTtaaaatatttcac
cctcaattttggcactttcttaagaatacttgaccctcatccgaAGTGCa
ctattcttaaaaaaaagcgtgtattatttTACTTCAACAACAAGAAATGA
TGGCGGAAtaaagtggattaattttcgcgtggattgaATTTTGTTCGGAA
ATTCCAAATCAGTATCCACAACCTCAAATTAACTAAAAGAGATTTTCGAT
GTGTGTGATAAATTTgacggaaaaatcttttttgcgacgtagaaattaaa
attttcacatgaaaaaatggcttagagggacaaatacttcttggactggc
ttgaaacttttttcttttgacttattagtcttttaacAAGCTAAAAAGTG
TAACAaatgttacattttattcaaagtttacagattttctattttgtcat
gaatttttcacgagcataaactttcgtgaATGGTAGTAGgggaaaatttg
taaaatcgctcgatttttttagtcaaagcacttgttatacatttttggaa
agctaaggggaaggggaatcaaaatatatcactaatcttaattttttgag
agctttccaaaaatatacaactcaggtctccgttttctcaagctacaatt
ttcattaatttttcaccctatgatttttgcctgagaccgtcgtatttgtc
cgaaaatcacaccagaGTGTCCGAacaaaaattggcacccaagttatttt
gattcccctatcccttagctttccaaaaatgtataacaagtgctttgact
aaaaaaattgagcgacctcaaaaaaacgaacaaatttccccctactatgg
cccttccaaaaattttcaaagacatttactttcgcgaaagggccaaaatt
cgtgAAACCCGcgaaaagtttctgctcgcgaaagtttgtacgcctaaagt
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CTGATTGGCATTTGCGTTTCAATCATTTCCACAGTTATGGTGCAAAATAT
TATTCATATGTTTGGTCCAAAGCCGTTGCATCGCAAATCTGGTACGAATT
CTTTGATCAGGATCCGTTATCTTTCAGTTCTGGATCAAAATACCGGTACT
CGATGCTTCAGCATGGTGGAGGTGTTTCACCCCAGACTCTGATTGAAGAT
ATGTTGGGTCGTCCTTTAACTACAGATGGACTTGTCTCAGCTTTaaaaga
agatttgaaaaaatga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000057_pilon:1289550..1294465+ >XLOC_031670 ID=XLOC_031670|Name=XLOC_031670|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4116bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1289550..1294465+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCAAGAATGCAAGATTTATCCAAAAACATTGTCAAGGTTTGTATGG
AATCAAGAAAGCCAGAGTTCATTCGTTAAGTCCTTTAGCAAGTGCTTTCG
ACAAGCCTTATCTGAAAAGTGATTTTGATAGTGATGGCAATGTTGGGCTT
TTTGGTTTACCCGAGCTTCAATCTGCAGATGGTTTTCATGATCTAAAAGA
CAATGTTCTTTCTACTGCTAAACAGTTGGTCAACGAAGCTGTTTCTCAGT
CCCCTTCAGCTGAGGTCGTTAAAACATTCGATAATTTGTCCAACGAACTT
TGCAAAGTTGCTGACTTAGCAGAATTCACTAGACTTACTCATCCAGACCC
GAATTATGCACAGGCTGCTGAGCAAACATCATTTGAGATTGGAGGCTATG
TTGAGAAACTGAACACGAATTTTTCGCTTTATAAAGCATTAGATGTCTCG
TTGAGAATGGATAGTGGAGAAATGGACCCTGTCACAAGAAAAGTGGCGGA
ATTGCTCCTTTTCGATTTCGAACAAAGTGGGATTCACTTGgataaaaaac
gaaaagaaaTAGCCGTGGGCCTTCACGAGGCCGTTATTATCTTAGGCGCT
CGTTTCACTGAAGCTTCCCAAGCCGCCCGACGATACCCTTTAGGAACATG
GCCCAAAGACTTGGCTATTCCTTATAAAATTGATGGTAATCACCTGCTTG
CAGATGCAACTTATTGTGAAAGTAGTGCCGAGCGTACGAGAGAGCATTGT
CACAAGGCGTACTTTCATCCTTGTGATGATCAACAGTTTTTATTAGAGAA
TTTATTTCACGCTCGCTATCAACTGGCTTCTTTGTTAGGTTTCGAAAGTT
TCGCTCAGCGCACTTTGAAGGGTACTACAGCCACTTCCCCGGAAATTGTC
GATTCATTTTTAACCAAAACCCTTGACATGCTGACTGAACCAATGTCTAA
AGAAATCTCCCTTCTCTCTGAATACAAATCTAAACACGATGGACTTGGAA
CTGGTATAAAAGCCTGGGACCTAAGGTACTACACTAACCTCGTCACCACT
CAGATGTACAACCTAAGTTCCAGTTCCCTGAGAGAATACTTCAGTGTAGG
GTCATGTATGGAGGGACTAAATCTTGTCTTTTCATCCCTGTTTGGTGTGA
CTTTGAAAGTTGTTCAAGCAGCAACCGGAGAGGTTTGGGCACCACTTGTT
CAAAAGATCGAAGTGCATGACGGGAAGGAAATCCTTGGCTACCTTTATTG
TGATTTTTATCAACGTCCCGGAAAACTGGCTCAAGATTCGCATTTCACAA
TCAGAGATGATCAAGAATGCAAGATTTATCCAAAAACATTGTCAAGGTTT
GTATGGAATCAAGAAAGCCAGAGTTCATTCGTTAAGTCCTTTAGCAAGTG
CTTTCGACAAGCCTTATCTGAAAAGTGATTTTGATAGTGATGGCAATGTT
GGGCTTTTTGGTTTACCCGAGCTTCAATCTGCAGATGGTTTTCATGATCT
AAAAGACAATGTTCTTTCTACTGCTAAACAGTTGGTCAACGAAGCTGTTT
CTCAGTCCCCTTCAGCTGAGGTCGTTAAAACATTCGATAATTTGTCCAAC
GAACTTTGCAAAGTTGCTGACTTAGCAGAATTCACTAGACTTACTCATCC
AGACCCGAATTATGCACAGGCTGCTGAGCAAACATCATTTGAGATTGGAG
GCTATGTTGAGAAACTGAACACGAATTTTTCGCTTTATAAAGCATTAGAT
GTCTCGTTGAGAATGGATAGTGGAGAAATGGACCCTGTCACAAGAAAAGT
GGCGGAATTGCTCCTTTTCGATTTCGAACAAAGTGGGATTCACTTGgata
aaaaacgaaaagaaaTAGCCGTGGGCCTTCACGAGGCCGTTATTATCTTA
GGCGCTCGTTTCACTGAAGCTTCCCAAGCCGCCCGACGATACCCTTTAGG
AACATGGCCCAAAGACTTGGCTATTCCTTATAAAATTGATGGTAATCACC
TGCTTGCAGATGCAACTTATTGTGAAAGTAGTGCCGAGCGTACGAGAGAG
CATTGTCACAAGGCGTACTTTCATCCTTGTGATGATCAACAGTTTTTATT
AGAGAATTTATTTCACGCTCGCTATCAACTGGCTTCTTTGTTAGGTTTCG
AAAGTTTCGCTCAGCGCACTTTGAAGGGTACTACAGCCACTTCCCCGGAA
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GTCTAAAGAAATCTCCCTTCTCTCTGAATACAAATCTAAACACGATGGAC
TTGGAACTGGTATAAAAGCCTGGGACCTAAGGTACTACACTAACCTCGTC
ACCACTCAGATGTACAACCTAAGTTCCAGTTCCCTGAGAGAATACTTCAG
TGTAGGGTCATGTATGGAGGGACTAAATCTTGTCTTTTCATCCCTGTTTG
GTGTGACTTTGAAAGTTGTTCAAGCAGCAACCGGAGAGGTTTGGGCACCA
CTTGTTCAAAAGATCGAAGTGCATGACGGGAAGGAAATCCTTGGCTACCT
TTATTGTGATTTTTATCAACGTCCCGGAAAACTGGCTCAAGATTCGCATT
TCACAATCAGAGGTGGAAAAGAATTGGATGACGGTACATACCAGCTACCG
ATCATTGCATTGAATTGTAACTTCCCAGCGCCACAAGGTGATCGTCCAGC
ATTGTTAAGCCAGGGAATGGTTGAAAATCTTTTCCATGAAATGGGTCATG
CTATGCACTCCATGCTCGCACGCACCAGGTGGAAAAGAATTGGATGACGG
TACATACCAGCTACCGATCATTGCATTGAATTGTAACTTCCCAGCGCCAC
AAGGTGATCGTCCAGCATTGTTAAGCCAGGGAATGGTTGAAAATCTTTTC
CATGAAATGGGTCATGCTATGCACTCCATGCTCGCACGCACCAGATACCA
ACACGTGACCGGGACACGCTGCGCAACGGATTTCGCTGAAGTACCCTCAA
TACTTATGGAATATTTTGCAATGGATCCGCGTATCCTACCTTTGTATGCA
AAACATTACAAAACAGGACAACCTCTACCTCAAGAAATCATTGATAATAC
CAACACGTGACCGGGACACGCTGCGCAACGGATTTCGCTGAAGTACCCTC
AATACTTATGGAATATTTTGCAATGGATCCGCGTATCCTACCTTTGTATG
CAAAACATTACAAAACAGGACAACCTCTACCTCAAGAAATCATTGATATG
ATTTCCAATTCGAAGAaattatttgcagccatggatTTGCATACGCAAGC
ATTTTATTCAATTGTTGATCAGCGTTTCCATGGCAAATATCCGTTGGGCA
AACCGAATAATGAAATATTGGATGATCTCCATAAAGAATATTCTCCATTA
TCTCATGTCCAAGTGATTTCCAATTCGAAGAaattatttgcagccatgga
tTTGCATACGCAAGCATTTTATTCAATTGTTGATCAGCGTTTCCATGGCA
AATATCCGTTGGGCAAACCGAATAATGAAATATTGGATGATCTCCATAAA
GAATATTCTCCATTATCTCATGTCCAAGGGGCTGATTGGCATTTGCGTTT
CAATCATTTCCACAGTTATGGTGCAAAATATTATTCATATGTTTGGTCCA
AAGCCGTTGCATCGCAAATCTGGTACGAATTCTTTGATCAGGATCCGTTA
TCTTTCAGTTCTGGATCAAAATACCGGTACTCGATGCTTCAGCATGGTGG
AGGTGTTTCACCCCAGACTCTGATTGAAGATATGTTGGGTCGTCCTTTAA
CTACAGATGGACTTGTCTCAGCTTTaaaagaagatttgaaaaaatgaGGG
CTGATTGGCATTTGCGTTTCAATCATTTCCACAGTTATGGTGCAAAATAT
TATTCATATGTTTGGTCCAAAGCCGTTGCATCGCAAATCTGGTACGAATT
CTTTGATCAGGATCCGTTATCTTTCAGTTCTGGATCAAAATACCGGTACT
CGATGCTTCAGCATGGTGGAGGTGTTTCACCCCAGACTCTGATTGAAGAT
ATGTTGGGTCGTCCTTTAACTACAGATGGACTTGTCTCAGCTTTaaaaga
agatttgaaaaaatga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000057_pilon | genome | sc0000057_pilon:1289550..1294465 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1792-2058:4650 |
| Aaloc | 1627-1788:3362 |
| Aaloc | 1474-1623:2525 |
| Aaloc | 1309-1470:1748 |
| Aaloc | 1-1305:1 |
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