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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14943.4.p1 ID=MSTRG.14943.4.p1|Name=MSTRG.14943.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9928bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGAAGAACC
TTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCTTACGTCAGC
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GACTGACGGGGGTgttccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtggga
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ttaattttaagaaaggattaagaggattttagaagaatattaattttaat
ttattagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTTATGGGAGATTTatttaata
aaagaaaagaaaggtaTGTATATTATACATATATATGGTTTGTAATATTA
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tttcatatatgtacatgtcatactaacattatttgggcatcatcgccttg
cccttttggtttgtagcattgagctaaatgagggaagtagattagtggct
tTCACAGCTtatcagagtggtttgaaaaagtactttttagaaagaaattt
gtcaaaacaaagtgtcttttagctaaaatggtggtcAAAAACATCGACAT
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atcttataaattatatacacagagctttgacagacccttgaaaacctgaa
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atctcccttacctaattttgacataaaaaaCtgtcatacaaacaaataat
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ggggggggtgcgaaaaatattgggccttatgaggggggttcgaaattttt
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ATATTTAGAGGATGGTGGAGAACTCCACCACTTTTGGTTAGCCAGTGTTA
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acAGACTAGATACTAcccatgatatgcaccattgcaatgtcttccacgga
cccaacagctgattggttgaaagtgacgtattgtaTTGACTAATTttacc
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CATGGATAATTTCTAGTTTGTAAAATAAGAGAAAGTTTTTCATGTTTGTT
AAGTTGCGTgttttccgccattatggaagcaaacgttcgatttgcGTATG
GGATCGCCTCTACatattcgaacgtttgcttccatgaTGGCTGAtaaagt
tacgtaacttaacaataCATGTAAAAGCTCTAGATATTATGTTGCTGTTT
TTGACCCCATTTTCCGGCCCAAAGCTGAGGGGTCCGTTTAATATTTTGTA
GCCATTTTAATTTCTGTATTGGGAAGATTtcggagaagaaaaaaaaacag
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TATGAGATAAATTTATTTATACTAGCAGGCACGACTCACAGAGTACGATT
GTTAAAGTATTTCCTTTTATTCTCCATATATCAGATTGAGTAATCCCCTT
TCTCTATTCAGGCACTAAACGAAAGTATAGAAGTTTTGAGCTTGAAGTGG
AATTCCATTCGTGGTAAAGGGGGTGTCGCAATTGCGGCCGCCCTCAGTGT
AAGTGAATTTGATTCAAATGATAATTTATTGTCTTAAATAGCAGACCTCT
ACActctctacaaaaccgcagatAATCCAATCTTTAGAAGGGCCACGAAT
TCGTTAGAGGATACCATAAGGGATTCTAAGTATTGTGATCCAAGCTATAG
GGATTTATTTTTCCAGGATTCTATAAAAATGGACCCTGATTGGGGTGACA
TTCAGTGAACATTTTATTTGTATTTGATTCTTCTCTTGTTTTATCCTAAG
GAATATATCCGATGTTTCTTTCTAGAAAAATTCAACATTGAGGAAACTCG
ATTTATCCTGGAACGGCTTGGCTTTCATTGGTTGTTTGGCGATAGGGCgc
catttgaagaaaaattcaacaCTTGAACACTTGGATATCAGGTAACAAAT
GATTTGCGTTCCCCACTAGTCTACACGATAGACAGCTCCAAGCTTTtact
caggtaagttatggcatatctcaaaaacctgaaaattaccataatttttg
aaggccattagccggcagaaaatgaggaaaccaatgatttgcaacgaagg
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ATTTCGCGAAGACCGCAAAAACCAAGTGCTGCGTCAgcaaacttgttttt
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ATCATTTGGGgtcatttgcaaaaaaaaaattttcgaattttctatCGTCA
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cttcatttttcattttcattttccttttttttctcaatttttttacttga
taatgttccactcacgaatatctttttaacgagcacaaaatcgcaactta
attcgaattctatcaaaagttacagccatttttttctccagctgcaaatt
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AATTAATGTTGGTGCATTTTCTTATGTTGGAAATCATGACTTACggctaa
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TTTACCGTGGTTCGAACCTACATGTCTCCGATTATGAAACATGTAGTCTA
TTGCACTGGGCTACGACGGTTGCTGATTTTCCGAAATTCAAGGTTATTTT
ATAGAGTGACATATATAGTATATACGGGTGAACAGACCtcacgagttagg
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AAATTCTCAAGCTTTTGTATGGGAAAATCAATGTAACGACTAAATACTTT
GGATGTCAATTCTAAGAGTTGATACGATAGTTTGAGGTAATTTGTAGTAG
CAAAACCTTCAATTATTCAAAAcgaaaattctcaatttcagTAACAATCG
AATAGGCTGTGATGGAGCAACAAAGCTTGTAGGCGCTCTTTCAGTACATC
CCGTTTTGGAGACGTTTAAAATCGGATTAAACCCGATCGGGGATGAAGgt
gttcaaaaaatcttgaaagcAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATT
GTCATTTGAGGTGAGTTGAACAGTTACCAAATTGAGACTCAACCTTTGAT
GTTTCAGTATGTTAAGAAGCAAAACACGATGGAAGAtttttttCTACGCA
TGATTATCAgacgtagaaaaaaataatttctaaaatAGGTCGTtgacttt
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TCTCTGGCATCAAAGGCTGTAAAATTCTAACAAGTGTGAATTGTTCTTGA
CGTATTTACATAGTGGTCTTtgattatttcatctatgaatttagaaaatc
acaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCG
AGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGG
TAAAGGTCATTATTTCATTTATGATAATATGTCACTTGGCTCACGGGCTG
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TTCTAAAAAACGCACCCACCGCTTACTGCCCTTCTCTCTCCCCTCATTTG
CTTTATCGTCAGTCCCTTGATCTTACTGAGTGAGGTGTTTTAGAGGTAAT
TTTAAGCATTTATCTAAATCATCAgaggaaaacaaatttttttttgggaa
tATGCATGTAGTTAATTTCTAAGGATGGGCGGGCGTTGTCCGTATATCCT
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TAATATCAGTGCTGATGTGAGCTTTTTCTGAACATGGTAGCAGTCTTTCC
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taatttctttaaaaatcacCCACAGTATTAAATATTCTTCGATTCTTATT
TCATTTTCCAGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATA
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CAGGTCTGAAAATGGATAAGGTAAGACTCAAGCTTTCGATATTGGTACAT
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CAGGTAGTAGaaaagaagtttttcaaaaactctTTCGGAATTGTTCAGAA
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TTATCGCACCCGGTAACTAACCTGGTCTTCTTGTGGTGCCAAAAAGAATA
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GCTAAAAACATTAGAATCTTAAAATTCACCAGGTCTTAAAAGCGAAATAT
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tttcatattttttttttcacttcagGGGCAGATAACAAATCTGATCGATC
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ttactttttctgaaaaacacGTTACGTAATTCACTAAAATGACCAATGGG
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GAAGACTTTCTAACATCGCTTCtcaatttcgaaaagaaaattacaTACTA
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TTGtatatgtttctttttttttttttctttcagtgagATTTTGAGTGGAC
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CTAACATACAAAAAACTGGACACAAGCATGCATAGACATTACATTGTGGC
ATATTGAAACATTTGAACTGTTTAAACATTAGCTCTATATAAACCAATAG
AACTTTTTCTAAACCCTaggcatttttttttaattttcgaaagCTCCAGG
CTTAAATGTGATGGATATCTGCAATACCATATTattaagaaaattaattt
tggcgagcagcagaaatctttgaaaatatgtaaactGGCGAGGAACTTAC
ATTGGCAGAGTAGCGAACTGGTAATTTTGTCGAGAACTGGCACCAATGTC
GGTGTAACGAGATTCTATTTAGCCCAAAAATGAGTATTCTAGACAAACAT
TATGGAATTTTGAAtcgaaaaatatgtaaaaactcacttttagtgacttt
tagaaaaattcgccaaatttggTGCACA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ >MSTRG.14943.4.p1 ID=MSTRG.14943.4.p1|Name=MSTRG.14943.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450440..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaat
ttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATA
TTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCA
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GTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAA
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AAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGG
AGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACG
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GACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAAAAGAACAG
TTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtcaaaaaacac
tGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAATTATCACA
GGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGGAATATGGA
AGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGACCGACATCT
TTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAGGCGAGTTT
GTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGGCAGATAAC
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GtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAAGATTTCAA
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ACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTAT
TGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAA
AACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGG
ATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGT
TTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGAT
AAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAGGCGAGTTTGTCAAAGGTTTGAT
GAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATC
AACTTGACACAAACAATGATGGAGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGT
GGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAA
GAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATG
GCTTCTAAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaa
atcacaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATC
TCGAGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAA
AGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAAT
CGGATGAGGTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGA
TAAAATAACAAAAGGCGAGTTTGTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGA
AAATGGATAAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAAC
AATGATGGAGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGT
GATGAACGAACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGA
TGGAAAAAGACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAA
AAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtca
aaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAA
TTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGG
AATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGAC
CGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAG
GCGAGTTTGTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGG
CAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGGAGACAT
AGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAA
GATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGT
ATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000128_pilon | genome | sc0000128_pilon:450440..460367 + |
|
