|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000128_pilon:449521..460367+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14943 ID=MSTRG.14943|Name=MSTRG.14943|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10847bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:449521..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGATCAGAGGCAGTTTGAAAGACCCCGTTCGTTTGTCTGTTTTCGTATTT
CGTTTGAAAATGCACAATATGTGCATAGTGGCTTTCCACAGTTCATCACG
TGACAATGATACTGTTGCCAGAACTTCGACTTTTGACcttaataacaata
ataacgaTGGACGAACTAGAATTATATCAAATGACATTCGAAAATCCGTT
CTACATCGAATCAGCGAAATTAGTGTGAACGAGGATTCAGAAtgtataaa
taaaaatcaattATCGTGTCAACAAAGTCCATCTAGACAAGCGTGGAAAG
AGACTGAAACAGACCAATCAGACAATGTTATTGACAACctaaaccaatca
gaatgcACAAATGACaatctaaaccaatcagaatgcACTATTGATGAGAT
GGATGATTTGATTGGCGGGGATATTGATGAGacgaaccaatcagaatata
GCATTCATTCAACTCATGATTTGATTGGTGCAAATAGTGATGATGAATTT
GATACTGATGTCGAAGAGGATTTCCCTGGTGATTATTATGCTTTTAAAGT
TTATTAGGgccatagtttctacccccttGGGGCTTGGATTTTGATGAGAC
GTGCACAAGAGGGTGCTGGAAGTTTCCAAGGGTGTTGCCAGTTAAAGGGG
GGTCTTCATAAAATTAAGTACAAAAATTATACATTTCTTTTGGAGAAAAA
GATTGCCTACGCGCTATACAATCTTCTATAGCATTTCCGAAGGTGAACTG
AACCTTCAAATGTATTTCCTAAGGGGGCCTACCACTTACGGGTCTTCCTA
CCTaaggggggggtcttgacccctctagaaactatgtaTTTTTGGATTAT
TTAAATGGAATTTAGCCTGTTTTCTTGTAGAACTTCACTGGTGTTTTTAC
GTGATTGAAGTTTGATCTATTTAGCTTATTTAAAGAAATATTCATTTTCC
TAGAGGTTGAAGAAGAACCTTTAGATTCTTACGGGCGAACCGTATATCGT
GAAGAATGCTTACGTCAGCAAATTATACCTATTACGTCATTTATCAAGCA
ATTACCtgaagaaaaaatgacattgaaATTTCGAGGATTTAATGAAAAAG
CTTCAAATGCACTCTCATCAGCTCTTTCGGTAAGAAAAAATCCTCACTTA
TATCTCTTATCAAAACTGTAAAAGAACATAACGTTTTGaaggcaaaaatg
ttaagaacgagtttaaagaacattttaaggctttatggactgtaaaacac
ataattttttatattaggaaaattgcaaaagaaaaaactcaatcaaaaac
atttaaacatttaagaaaatctgaagaattcaaatGTTTAGGTCTTTCGA
CTGACTAAAATGGGCAAATTAGTTTGAGTCGCGTTCGAAATCGTATGGAT
TGTATGTTTAATTATCAATTTATGACACCTATCTACTTATATAGGCGAAC
AGTCGAATCGAGATATGCGATTTATCCAACAACAATATGGGATACACAGC
TGGCCTAAGTTTGGTTGAAATGttgaaagaaaatacttttATCACACATC
TTGTACGCTATCGTCACCGTCGTGCGACTTTATTATCCACCGTTTTTGAC
GACATTTGACTTTATCGTACATTTTCAGTAGTTTAGATAATTCGCTCCAT
GATTCGAACGTACTTTCTTGCCCCTTTCGCTCACAAACCTTTATAAACGA
ATCGTTGTGTTGTGAGTTTTAGGGTAGGCATTATATATACAATTGCCGAT
TTTGAAGGTGAATAGGATTTTCATCAAGTAGTAgagtgtcgtttatgaga
gtttcttgttgacgatgacattcaatattatcgaataatggagcttATCG
AATGAATGTCGAATTACatataaaatgtgttttcagCTGGCTGCCCTTAA
GGGGAATGGGGATAGCTTTTTGATCATTTGTCAAACTGTGTGATGTGGCT
tcggaatttttcatttttcattttcttttttcaggatttaTCAGAAAATC
AACTTGGTAATGCAGTTGGAATCAAACTTGGAGAAATGTTGCTCACAAAC
ATATACATGAAAACACTcattttgaaaggtattttagGTGATtttttgga
atgaaaaaaaaagagaatttaaCGTTAACTAGAGAAAACAGGCATACTAT
GGATACCCTTATGTTTTCTGTCTGCAAGACCATTATAGTGACTCATACCA
ACACGAAATATAAGTAGACTTTACTAATGGAAAAAATGGTTTTAATAAag
tcttttccaaaaaaatgacagaccGCTTCAAGTAAGCATATATTTACAgg
gggggTCGAGCAGTTAGTACATGACACCCATGATACTTAGTACGGTGGTG
GTCCATtctcaaaattggaaaaaattcagTGTAAAAATAGGTGGTTATGC
TTAGTGATTAACAGCAAACTTAGTGTACAACATACAATACAGTATTCCTC
CAAGAGTGATGTATTAAAATGTGCGACCTGTGGAACAGACTACCGTTTTT
CCATTAGACTACTTATATTCATGTTGGTAAAAGTCACTTTAATTagtcac
ttttttagaaatcttagTGTTAATTTAAAGCCGATCTGTGAAGTTGTTGT
CAGGGGTGTTGTAGTTCTTTTAACTACCTTTACCCATTGAGGATTTTAAT
TAGTTTACTTAAGTTTCTGTACCCAGCCTACTGAACTTGTGGAATTTCtg
attaaaatttaaatatgtAAGATGGAAAAGACATGgagatcccggggggg
ggggggtactacccttgacGACTGACGGGGGTgttccgctgaggttcgaa
aaatggaccctacgtgggactcgaaatttgcgaaaaaagtgaccctgaat
gggactgaaattccaaaattttctcaaattttctactttttccccaaatt
ttccaaaaataggcaccctacgagggactgatttttctattttgctgttt
ttgtgaccctacctgggactcgtggaggttaaaaaaggtaccctgaccag
cggagcatccccgtaacccatcttgccctagtacccccccccccagatgG
AGATAGtaagagatttaatttaattttaagaaaggattaagaggatttta
gaagaatattaattttaatttattagtGGTTGAGAAGAAGCATGGATTTT
ATGGGAGATTTatttaataaaagaaaagaaaggtaTGTATATTATACATA
TATATGGTTTGTAATATTAACTTAATTGGTTAAAATGTTTACTATAAcgt
aagggagtggtcagaaagtatctactaggggggggggggtggaggattct
ttcttctaggggggggggttccaaaattttttcgagggtttagggggggg
gtttcaaattttttttgagggtttagggggggggttccaaatcttttggg
caactcaagagaaaatgtaggaagtctaatttcatagttttacgtttcaa
gatttcagaatttattttatttcatatatgtacatgtcatactaacatta
tttgggcatcatcgccttgcccttttggtttgtagcattgagctaaatga
gggaagtagattagtggcttTCACAGCTtatcagagtggtttgaaaaagt
actttttagaaagaaatttgtcaaaacaaagtgtcttttagctaaaatgg
tggtcAAAAACATCGACATTTTCTCCCGtctgcgcaaaccatggttgtgc
ctccttagtctctactaatatcttataaattatatacacagagctttgac
agacccttgaaaacctgaaaatataggtttatagggaaatttcaaactca
gagaattttatttttcagactccttttaacaacagaatagcttgtatttt
aggttctcgagtacctgatcttcaaaattttctcccttcggGGCCAACCA
TGATGGCCCCTCAGGatattttgagtaattgagTAATGCTCTGTAATTAG
GGAGATTATGTATCCGGGAAATAAGCCGTCATTTTCTCCAAACTTTGGGA
ACTCAGAGAAAATAACTCgttgattcttattttaaccctgGACTATTCCt
aggagatctaccattttgatgacgtttacacccacgggtttttttctttt
tttacttcagagaaattccgtcgtaaccatggaaatcgacggaaaaaatc
ccgtggtgtaaacgtcaatcaaaatggtagatctcctaaaggactatact
cactttacagggctaaactatctcccttacctaattttgacataaaaaaC
tgtcatacaaacaaataatactttgtaccgcatctgtatgaattcttttt
ttgcgtaaaattttctagtggggggggtgcgaaaaatattgggccttatg
aggggggttcgaaatttttttccaggctagGGGAGGGGTGCGAAAGTTTT
tggggatttttcaaatatcCCACTCCCCCCAGTAAcatttctgaccactc
cctaataAAGTAATCTGAAAATGCATATGAAGGtgcatataaaaataaaG
aataaCTtttatgaGttAATCAAGATTATGTAGAAAggaataaatatttt
gtataagataaaacaataaattttttgtatatgattataaatacaagaaa
aggaaaaataaaaggagaataaaagagagtgtatgagataagaagaaaaa
gatatatatgaagTTAATCTTTCAAATAATGTTGGCTTTTCAGGGTTTTG
TCTAGTCATAAAGTTATTTATATTTAGAGGATGGTGGAGAACTCCACCAC
TTTTGGTTAGCCAGTGTTAATTTAAAGCCATCACATGTTGTACAATGTAT
GTTACATTCTTACAGGTAATAAATTCACCAACCCGGTAGCCAGAATATTT
GCTgaggttttcaaaacaaatgatacACTGGTCGAACTTGATTTGAGTTA
TAATGAATTTCATGAGAATGGTTCACTTTACTTGGGTGCTGGACTGGTAA
gttatttttctcttattttacAGACTAGATACTAcccatgatatgcacca
ttgcaatgtcttccacggacccaacagctgattggttgaaagtgacgtat
tgtaTTGACTAATTttaccaatcagctgttgggtccggtaatgtcagaag
acattgcgaTGATACATATCATGGATAATTTCTAGTTTGTAAAATAAGAG
AAAGTTTTTCATGTTTGTTAAGTTGCGTgttttccgccattatggaagca
aacgttcgatttgcGTATGGGATCGCCTCTACatattcgaacgtttgctt
ccatgaTGGCTGAtaaagttacgtaacttaacaataCATGTAAAAGCTCT
AGATATTATGTTGCTGTTTTTGACCCCATTTTCCGGCCCAAAGCTGAGGG
GTCCGTTTAATATTTTGTAGCCATTTTAATTTCTGTATTGGGAAGATTtc
ggagaagaaaaaaaaacagcttaACATTAAAGttatagtttgatcaatta
tttTCCTGAACTAACATGATATGAGATAAATTTATTTATACTAGCAGGCA
CGACTCACAGAGTACGATTGTTAAAGTATTTCCTTTTATTCTCCATATAT
CAGATTGAGTAATCCCCTTTCTCTATTCAGGCACTAAACGAAAGTATAGA
AGTTTTGAGCTTGAAGTGGAATTCCATTCGTGGTAAAGGGGGTGTCGCAA
TTGCGGCCGCCCTCAGTGTAAGTGAATTTGATTCAAATGATAATTTATTG
TCTTAAATAGCAGACCTCTACActctctacaaaaccgcagatAATCCAAT
CTTTAGAAGGGCCACGAATTCGTTAGAGGATACCATAAGGGATTCTAAGT
ATTGTGATCCAAGCTATAGGGATTTATTTTTCCAGGATTCTATAAAAATG
GACCCTGATTGGGGTGACATTCAGTGAACATTTTATTTGTATTTGATTCT
TCTCTTGTTTTATCCTAAGGAATATATCCGATGTTTCTTTCTAGAAAAAT
TCAACATTGAGGAAACTCGATTTATCCTGGAACGGCTTGGCTTTCATTGG
TTGTTTGGCGATAGGGCgccatttgaagaaaaattcaacaCTTGAACACT
TGGATATCAGGTAACAAATGATTTGCGTTCCCCACTAGTCTACACGATAG
ACAGCTCCAAGCTTTtactcaggtaagttatggcatatctcaaaaacctg
aaaattaccataatttttgaaggccattagccggcagaaaatgaggaaac
caatgatttgcaacgaaggataccatgatgaagtttcgctGTAGGGGTGT
TACCTATTGTTACGCCCTTATTTCGCGAAGACCGCAAAAACCAAGTGCTG
CGTCAgcaaacttgttttttaatatCTCCAGTTGGTAAGGTAGAAACATG
AATTGGACCCATGTTGAATATCATTTGGGgtcatttgcaaaaaaaaaatt
ttcgaattttctatCGTCAGCAGAAACAGCAAATacgaattttgcaaaaa
agtgctgatgtcagcaaaattcaaaatttttttttgcaatccttTAAATG
ATTCTAATTCAGTCCAAATTCATGTTTCTATCTTTGGCCCAAGGAGTtct
caaaaaacaagttttgctgacgtcagctttttttagttttgcGGGTTTTC
GCGAAATAAGGGCGTAAAAATTAGGTACACCCCTACAGCGAACTCATCAT
GGATCCTTCGTTGCAAACATTGGTAACTTTGATAGagttcgaatcaagtt
gcgattaagtgcttttaaaatgatattcgtgagtggaatattatcaagta
aaaaaattgagaaaaaaaggaaaatgaaaatgaaaaataaagagaaaaaa
tcaactttttgtaaaatgtggtataattaccatttcacaggagtgatttt
CAATCTTAGGATCATCagtgtcaaaaatttcaaaatataaatattcattc
aatcaaaagattcaaagaaagtttattgctggttgctctaaaatagtaaa
aactggaaaaaacacaaaaacagccttttgtcgatcaccgcataaacttt
ttttgatctctttattgaataaatatttttaaaaattttttcacattgat
gatgatctaagaaaGAGCATCCGTGAAAATGGtaataccacatttctaca
aaaagttgatttttttcttcttcatttttcattttcattttccttttttt
tctcaatttttttacttgataatgttccactcacgaatatctttttaacg
agcacaaaatcgcaacttaattcgaattctatcaaaagttacagccattt
ttttctccagctgcaaattatttcgagacagactttaattttcaggtttt
tgagacatgccataacttacctgagtaGGCTTTACTCTTAACATAGTAAg
ggttttacgctcgaaacgaaggaagatatggcATGCCTTGTTCTCCACGT
GTTGTTTTCACACTTTTGTAATTAATGTTGGTGCATTTTCTTATGTTGGA
AATCATGACTTACggctaaatcttcatgatgcacAGAGACTTAAAGAATT
TTTTGAGACTTTTCAATACTTTACCGTGGTTCGAACCTACATGTCTCCGA
TTATGAAACATGTAGTCTATTGCACTGGGCTACGACGGTTGCTGATTTTC
CGAAATTCAAGGTTATTTTATAGAGTGACATATATAGTATATACGGGTGA
ACAGACCtcacgagttaggctaactgttatgatcgcCATTCCTCCAGGAA
GACCCCACACACGGGTGCACCACCGGGGGGTGCACAGTCGTCTGGGTGCA
TGTTAGGCATGAGCCACAGGCTGGCTACGCTACGATATTTTGCTCGCTAC
TTGCAAGGCTGGTGAATCATCAAGATCTAGCCATAAGCATGACCAGATCT
ATTTTTCAATTCATGCTTAAAGGGATAAGCAGGAGACTAAGATGGAGTTT
ACCAGAAGGTTACGTGTTGAAATTCTCAAGCTTTTGTATGGGAAAATCAA
TGTAACGACTAAATACTTTGGATGTCAATTCTAAGAGTTGATACGATAGT
TTGAGGTAATTTGTAGTAGCAAAACCTTCAATTATTCAAAAcgaaaattc
tcaatttcagTAACAATCGAATAGGCTGTGATGGAGCAACAAAGCTTGTA
GGCGCTCTTTCAGTACATCCCGTTTTGGAGACGTTTAAAATCGGATTAAA
CCCGATCGGGGATGAAGgtgttcaaaaaatcttgaaagcAATGGAAAAGA
ACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGGTGAGTTGAACAGTTACCAAA
TTGAGACTCAACCTTTGATGTTTCAGTATGTTAAGAAGCAAAACACGATG
GAAGAtttttttCTACGCATGATTATCAgacgtagaaaaaaataatttct
aaaatAGGTCGTtgactttgatgaaaaattctgGAGTACAAATAAAATTT
AGGTTGAGCGACCTTAGTCTCTCTGGCATCAAAGGCTGTAAAATTCTAAC
AAGTGTGAATTGTTCTTGACGTATTTACATAGTGGTCTTtgattatttca
tctatgaatttagaaaatcacaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCG
AAAACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGA
GGATTCTCAAAAGGAAAGGTAAAGGTCATTATTTCATTTATGATAATATG
TCACTTGGCTCACGGGCTGTATACcgtaaattaaactttttacgTGCAAA
TTACGTTGTGCTTCTTCTATTCTAAAAAACGCACCCACCGCTTACTGCCC
TTCTCTCTCCCCTCATTTGCTTTATCGTCAGTCCCTTGATCTTACTGAGT
GAGGTGTTTTAGAGGTAATTTTAAGCATTTATCTAAATCATCAgaggaaa
acaaatttttttttgggaatATGCATGTAGTTAATTTCTAAGGATGGGCG
GGCGTTGTCCGTATATCCTATAgactacaatcagtgacaaaatatgtAGC
AATTTCTTGAAccccccccTAATATCAGTGCTGATGTGAGCTTTTTCTGA
ACATGGTAGCAGTCTTTCCACGCATCAACATTTATACTAGGGGGAGGGAA
TTCTTGCCACAACATCTAGTCACAACATCTAGTCACAGATTGTAGATTAA
GAAAGCCAAAATGTGTcgttaatttctttaaaaatcacCCACAGTATTAA
ATATTCTTCGATTCTTATTTCATTTTCCAGCCACCACCAGGGAATATGGA
AGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGACCGACATCT
TTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAGGCGAGTTT
GTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGTAAGACTCAA
GCTTTCGATATTGGTACATAAGTATACAGGGTGTGCTAGAAATAAGTTat
cctctttgatttgatatcgCAGGTAGTAGaaaagaagtttttcaaaaact
ctTTCGGAATTGTTCAGAAGAAAGCCTAACTTAAGTTTTGTTGtgttact
ttttaattttacttcattggctTAAAAGCTGTGTCCAGAAAACAAAAACG
TCAATTTAATGTCAAAAAGGCGGAAAACGAGGGTATCAatttatgaaaac
aaaagtttcttttaCCAAATTATCGCACCCGGTAACTAACCTGGTCTTCT
TGTGGTGCCAAAAAGAATAAAACTCTATTATCTATTATTCATCTAAGCAT
GATAAGATTTCGGATTTGAGCTAAAAACATTAGAATCTTAAAATTCACCA
GGTCTTAAAAGCGAAATATTTTTATGGTATAGAACAAAGAAACGCAATTA
CAAGCGTCAACCTCAGTGCAAACTACATATTCTCAAGAGCAGAGCGTGTA
GTACGGAATATACATTgcctttcatattttttttttcacttcagGGGCAG
ATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGGAGACATAGA
GTTTAGGTGAGAAGGGTTATTTTTAGATCATCTGCTCAAATCGTTCGTTC
ATATTTCTCACGTCAATTcttactttttctgaaaaacacGTTACGTAATT
CACTAAAATGACCAATGGGAAAGGCTACTTTTCTAGGTACTCTATTTAGC
CCGGGCACAGGGTATATCTGAAGACTTTCTAACATCGCTTCtcaatttcg
aaaagaaaattacaTACTACAatggaatctccataactcgatcaCGCACA
TTGCtaaagggaccataaaacttgttggagttaaggagacattcaagtGA
TAGAGGTTCTAGCTATAGATTGtatatgtttctttttttttttttctttc
agtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAAGATTTCA
AAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGTATACGTT
TACCTAAAATTCATGGCTTCTAACATACAAAAAACTGGACACAAGCATGC
ATAGACATTACATTGTGGCATATTGAAACATTTGAACTGTTTAAACATTA
GCTCTATATAAACCAATAGAACTTTTTCTAAACCCTaggcattttttttt
aattttcgaaagCTCCAGGCTTAAATGTGATGGATATCTGCAATACCATA
TTattaagaaaattaattttggcgagcagcagaaatctttgaaaatatgt
aaactGGCGAGGAACTTACATTGGCAGAGTAGCGAACTGGTAATTTTGTC
GAGAACTGGCACCAATGTCGGTGTAACGAGATTCTATTTAGCCCAAAAAT
GAGTATTCTAGACAAACATTATGGAATTTTGAAtcgaaaaatatgtaaaa
actcacttttagtgacttttagaaaaattcgccaaatttggTGCACA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000128_pilon | genome | sc0000128_pilon:449521..460367 + |
|