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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000128_pilon:450396..460367+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14943.2.p1 ID=MSTRG.14943.2.p1|Name=MSTRG.14943.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9972bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450396..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTAGAACTTCACTGGTGTTTTTACGTGATTGAAGTTTGATCTATTTAGC
TTATTTAAAGAAATATTCATTTTCCTAGAGGTTGAAGAAGAACCTTTAGA
TTCTTACGGGCGAACCGTATATCGTGAAGAATGCTTACGTCAGCAAATTA
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TTCGGTAAGAAAAAATCCTCACTTATATCTCTTATCAAAACTGTAAAAGA
ACATAACGTTTTGaaggcaaaaatgttaagaacgagtttaaagaacattt
taaggctttatggactgtaaaacacataattttttatattaggaaaattg
caaaagaaaaaactcaatcaaaaacatttaaacatttaagaaaatctgaa
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GAGTCGCGTTCGAAATCGTATGGATTGTATGTTTAATTATCAATTTATGA
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aaagaaaatacttttATCACACATCTTGTACGCTATCGTCACCGTCGTGC
GACTTTATTATCCACCGTTTTTGACGACATTTGACTTTATCGTACATTTT
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AGGCATTATATATACAATTGCCGATTTTGAAGGTGAATAGGATTTTCATC
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tattatcgaataatggagcttATCGAATGAATGTCGAATTACatataaaa
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ATTTGTCAAACTGTGTGATGTGGCTtcggaatttttcatttttcattttc
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aaggtattttagGTGATtttttggaatgaaaaaaaaagagaatttaaCGT
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AAGACCATTATAGTGACTCATACCAACACGAAATATAAGTAGACTTTACT
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ACCCATGATACTTAGTACGGTGGTGGTCCATtctcaaaattggaaaaaat
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ACCTGTGGAACAGACTACCGTTTTTCCATTAGACTACTTATATTCATGTT
GGTAAAAGTCACTTTAATTagtcacttttttagaaatcttagTGTTAATT
TAAAGCCGATCTGTGAAGTTGTTGTCAGGGGTGTTGTAGTTCTTTTAACT
ACCTTTACCCATTGAGGATTTTAATTAGTTTACTTAAGTTTCTGTACCCA
GCCTACTGAACTTGTGGAATTTCtgattaaaatttaaatatgtAAGATGG
AAAAGACATGgagatcccgggggggggggggtactacccttgacGACTGA
CGGGGGTgttccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtgggactcgaa
atttgcgaaaaaagtgaccctgaatgggactgaaattccaaaattttctc
aaattttctactttttccccaaattttccaaaaataggcaccctacgagg
gactgatttttctattttgctgtttttgtgaccctacctgggactcgtgg
aggttaaaaaaggtaccctgaccagcggagcatccccgtaacccatcttg
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ttaagaaaggattaagaggattttagaagaatattaattttaatttatta
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TTGGTTAAAATGTTTACTATAAcgtaagggagtggtcagaaagtatctac
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gggggggggttccaaatcttttgggcaactcaagagaaaatgtaggaagt
ctaatttcatagttttacgtttcaagatttcagaatttattttatttcat
atatgtacatgtcatactaacattatttgggcatcatcgccttgcccttt
tggtttgtagcattgagctaaatgagggaagtagattagtggcttTCACA
GCTtatcagagtggtttgaaaaagtactttttagaaagaaatttgtcaaa
acaaagtgtcttttagctaaaatggtggtcAAAAACATCGACATTTTCTC
CCGtctgcgcaaaccatggttgtgcctccttagtctctactaatatctta
taaattatatacacagagctttgacagacccttgaaaacctgaaaatata
ggtttatagggaaatttcaaactcagagaattttatttttcagactcctt
ttaacaacagaatagcttgtattttaggttctcgagtacctgatcttcaa
aattttctcccttcggGGCCAACCATGATGGCCCCTCAGGatattttgag
taattgagTAATGCTCTGTAATTAGGGAGATTATGTATCCGGGAAATAAG
CCGTCATTTTCTCCAAACTTTGGGAACTCAGAGAAAATAACTCgttgatt
cttattttaaccctgGACTATTCCtaggagatctaccattttgatgacgt
ttacacccacgggtttttttctttttttacttcagagaaattccgtcgta
accatggaaatcgacggaaaaaatcccgtggtgtaaacgtcaatcaaaat
ggtagatctcctaaaggactatactcactttacagggctaaactatctcc
cttacctaattttgacataaaaaaCtgtcatacaaacaaataatactttg
taccgcatctgtatgaattctttttttgcgtaaaattttctagtgggggg
ggtgcgaaaaatattgggccttatgaggggggttcgaaatttttttccag
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TATGAAGGtgcatataaaaataaaGaataaCTtttatgaGttAATCAAGA
TTATGTAGAAAggaataaatattttgtataagataaaacaataaattttt
tgtatatgattataaatacaagaaaaggaaaaataaaaggagaataaaag
agagtgtatgagataagaagaaaaagatatatatgaagTTAATCTTTCAA
ATAATGTTGGCTTTTCAGGGTTTTGTCTAGTCATAAAGTTATTTATATTT
AGAGGATGGTGGAGAACTCCACCACTTTTGGTTAGCCAGTGTTAATTTAA
AGCCATCACATGTTGTACAATGTATGTTACATTCTTACAGGTAATAAATT
CACCAACCCGGTAGCCAGAATATTTGCTgaggttttcaaaacaaatgata
cACTGGTCGAACTTGATTTGAGTTATAATGAATTTCATGAGAATGGTTCA
CTTTACTTGGGTGCTGGACTGGTAAgttatttttctcttattttacAGAC
TAGATACTAcccatgatatgcaccattgcaatgtcttccacggacccaac
agctgattggttgaaagtgacgtattgtaTTGACTAATTttaccaatcag
ctgttgggtccggtaatgtcagaagacattgcgaTGATACATATCATGGA
TAATTTCTAGTTTGTAAAATAAGAGAAAGTTTTTCATGTTTGTTAAGTTG
CGTgttttccgccattatggaagcaaacgttcgatttgcGTATGGGATCG
CCTCTACatattcgaacgtttgcttccatgaTGGCTGAtaaagttacgta
acttaacaataCATGTAAAAGCTCTAGATATTATGTTGCTGTTTTTGACC
CCATTTTCCGGCCCAAAGCTGAGGGGTCCGTTTAATATTTTGTAGCCATT
TTAATTTCTGTATTGGGAAGATTtcggagaagaaaaaaaaacagcttaAC
ATTAAAGttatagtttgatcaattatttTCCTGAACTAACATGATATGAG
ATAAATTTATTTATACTAGCAGGCACGACTCACAGAGTACGATTGTTAAA
GTATTTCCTTTTATTCTCCATATATCAGATTGAGTAATCCCCTTTCTCTA
TTCAGGCACTAAACGAAAGTATAGAAGTTTTGAGCTTGAAGTGGAATTCC
ATTCGTGGTAAAGGGGGTGTCGCAATTGCGGCCGCCCTCAGTGTAAGTGA
ATTTGATTCAAATGATAATTTATTGTCTTAAATAGCAGACCTCTACActc
tctacaaaaccgcagatAATCCAATCTTTAGAAGGGCCACGAATTCGTTA
GAGGATACCATAAGGGATTCTAAGTATTGTGATCCAAGCTATAGGGATTT
ATTTTTCCAGGATTCTATAAAAATGGACCCTGATTGGGGTGACATTCAGT
GAACATTTTATTTGTATTTGATTCTTCTCTTGTTTTATCCTAAGGAATAT
ATCCGATGTTTCTTTCTAGAAAAATTCAACATTGAGGAAACTCGATTTAT
CCTGGAACGGCTTGGCTTTCATTGGTTGTTTGGCGATAGGGCgccatttg
aagaaaaattcaacaCTTGAACACTTGGATATCAGGTAACAAATGATTTG
CGTTCCCCACTAGTCTACACGATAGACAGCTCCAAGCTTTtactcaggta
agttatggcatatctcaaaaacctgaaaattaccataatttttgaaggcc
attagccggcagaaaatgaggaaaccaatgatttgcaacgaaggatacca
tgatgaagtttcgctGTAGGGGTGTTACCTATTGTTACGCCCTTATTTCG
CGAAGACCGCAAAAACCAAGTGCTGCGTCAgcaaacttgttttttaatat
CTCCAGTTGGTAAGGTAGAAACATGAATTGGACCCATGTTGAATATCATT
TGGGgtcatttgcaaaaaaaaaattttcgaattttctatCGTCAGCAGAA
ACAGCAAATacgaattttgcaaaaaagtgctgatgtcagcaaaattcaaa
atttttttttgcaatccttTAAATGATTCTAATTCAGTCCAAATTCATGT
TTCTATCTTTGGCCCAAGGAGTtctcaaaaaacaagttttgctgacgtca
gctttttttagttttgcGGGTTTTCGCGAAATAAGGGCGTAAAAATTAGG
TACACCCCTACAGCGAACTCATCATGGATCCTTCGTTGCAAACATTGGTA
ACTTTGATAGagttcgaatcaagttgcgattaagtgcttttaaaatgata
ttcgtgagtggaatattatcaagtaaaaaaattgagaaaaaaaggaaaat
gaaaatgaaaaataaagagaaaaaatcaactttttgtaaaatgtggtata
attaccatttcacaggagtgattttCAATCTTAGGATCATCagtgtcaaa
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ttgctggttgctctaaaatagtaaaaactggaaaaaacacaaaaacagcc
ttttgtcgatcaccgcataaactttttttgatctctttattgaataaata
tttttaaaaattttttcacattgatgatgatctaagaaaGAGCATCCGTG
AAAATGGtaataccacatttctacaaaaagttgatttttttcttcttcat
ttttcattttcattttccttttttttctcaatttttttacttgataatgt
tccactcacgaatatctttttaacgagcacaaaatcgcaacttaattcga
attctatcaaaagttacagccatttttttctccagctgcaaattatttcg
agacagactttaattttcaggtttttgagacatgccataacttacctgag
taGGCTTTACTCTTAACATAGTAAgggttttacgctcgaaacgaaggaag
atatggcATGCCTTGTTCTCCACGTGTTGTTTTCACACTTTTGTAATTAA
TGTTGGTGCATTTTCTTATGTTGGAAATCATGACTTACggctaaatcttc
atgatgcacAGAGACTTAAAGAATTTTTTGAGACTTTTCAATACTTTACC
GTGGTTCGAACCTACATGTCTCCGATTATGAAACATGTAGTCTATTGCAC
TGGGCTACGACGGTTGCTGATTTTCCGAAATTCAAGGTTATTTTATAGAG
TGACATATATAGTATATACGGGTGAACAGACCtcacgagttaggctaact
gttatgatcgcCATTCCTCCAGGAAGACCCCACACACGGGTGCACCACCG
GGGGGTGCACAGTCGTCTGGGTGCATGTTAGGCATGAGCCACAGGCTGGC
TACGCTACGATATTTTGCTCGCTACTTGCAAGGCTGGTGAATCATCAAGA
TCTAGCCATAAGCATGACCAGATCTATTTTTCAATTCATGCTTAAAGGGA
TAAGCAGGAGACTAAGATGGAGTTTACCAGAAGGTTACGTGTTGAAATTC
TCAAGCTTTTGTATGGGAAAATCAATGTAACGACTAAATACTTTGGATGT
CAATTCTAAGAGTTGATACGATAGTTTGAGGTAATTTGTAGTAGCAAAAC
CTTCAATTATTCAAAAcgaaaattctcaatttcagTAACAATCGAATAGG
CTGTGATGGAGCAACAAAGCTTGTAGGCGCTCTTTCAGTACATCCCGTTT
TGGAGACGTTTAAAATCGGATTAAACCCGATCGGGGATGAAGgtgttcaa
aaaatcttgaaagcAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATT
TGAGGTGAGTTGAACAGTTACCAAATTGAGACTCAACCTTTGATGTTTCA
GTATGTTAAGAAGCAAAACACGATGGAAGAtttttttCTACGCATGATTA
TCAgacgtagaaaaaaataatttctaaaatAGGTCGTtgactttgatgaa
aaattctgGAGTACAAATAAAATTTAGGTTGAGCGACCTTAGTCTCTCTG
GCATCAAAGGCTGTAAAATTCTAACAAGTGTGAATTGTTCTTGACGTATT
TACATAGTGGTCTTtgattatttcatctatgaatttagaaaatcacaatt
tgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATAT
TGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGGTAAAGG
TCATTATTTCATTTATGATAATATGTCACTTGGCTCACGGGCTGTATACc
gtaaattaaactttttacgTGCAAATTACGTTGTGCTTCTTCTATTCTAA
AAAACGCACCCACCGCTTACTGCCCTTCTCTCTCCCCTCATTTGCTTTAT
CGTCAGTCCCTTGATCTTACTGAGTGAGGTGTTTTAGAGGTAATTTTAAG
CATTTATCTAAATCATCAgaggaaaacaaatttttttttgggaatATGCA
TGTAGTTAATTTCTAAGGATGGGCGGGCGTTGTCCGTATATCCTATAgac
tacaatcagtgacaaaatatgtAGCAATTTCTTGAAccccccccTAATAT
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CAACATTTATACTAGGGGGAGGGAATTCTTGCCACAACATCTAGTCACAA
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ctttaaaaatcacCCACAGTATTAAATATTCTTCGATTCTTATTTCATTT
TCCAGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGAC
AATCGGATGAGGTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAA
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TGAAAATGGATAAGGTAAGACTCAAGCTTTCGATATTGGTACATAAGTAT
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GTAGaaaagaagtttttcaaaaactctTTCGGAATTGTTCAGAAGAAAGC
CTAACTTAAGTTTTGTTGtgttactttttaattttacttcattggctTAA
AAGCTGTGTCCAGAAAACAAAAACGTCAATTTAATGTCAAAAAGGCGGAA
AACGAGGGTATCAatttatgaaaacaaaagtttcttttaCCAAATTATCG
CACCCGGTAACTAACCTGGTCTTCTTGTGGTGCCAAAAAGAATAAAACTC
TATTATCTATTATTCATCTAAGCATGATAAGATTTCGGATTTGAGCTAAA
AACATTAGAATCTTAAAATTCACCAGGTCTTAAAAGCGAAATATTTTTAT
GGTATAGAACAAAGAAACGCAATTACAAGCGTCAACCTCAGTGCAAACTA
CATATTCTCAAGAGCAGAGCGTGTAGTACGGAATATACATTgcctttcat
attttttttttcacttcagGGGCAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTG
ACACAAACAATGATGGAGACATAGAGTTTAGGTGAGAAGGGTTATTTTTA
GATCATCTGCTCAAATCGTTCGTTCATATTTCTCACGTCAATTcttactt
tttctgaaaaacacGTTACGTAATTCACTAAAATGACCAATGGGAAAGGC
TACTTTTCTAGGTACTCTATTTAGCCCGGGCACAGGGTATATCTGAAGAC
TTTCTAACATCGCTTCtcaatttcgaaaagaaaattacaTACTACAatgg
aatctccataactcgatcaCGCACATTGCtaaagggaccataaaacttgt
tggagttaaggagacattcaagtGATAGAGGTTCTAGCTATAGATTGtat
atgtttctttttttttttttctttcagtgagATTTTGAGTGGACAACAAT
TAGTGATGAACGAACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAA
CAGATGGAAAAAGACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAACA
TACAAAAAACTGGACACAAGCATGCATAGACATTACATTGTGGCATATTG
AAACATTTGAACTGTTTAAACATTAGCTCTATATAAACCAATAGAACTTT
TTCTAAACCCTaggcatttttttttaattttcgaaagCTCCAGGCTTAAA
TGTGATGGATATCTGCAATACCATATTattaagaaaattaattttggcga
gcagcagaaatctttgaaaatatgtaaactGGCGAGGAACTTACATTGGC
AGAGTAGCGAACTGGTAATTTTGTCGAGAACTGGCACCAATGTCGGTGTA
ACGAGATTCTATTTAGCCCAAAAATGAGTATTCTAGACAAACATTATGGA
ATTTTGAAtcgaaaaatatgtaaaaactcacttttagtgacttttagaaa
aattcgccaaatttggTGCACA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000128_pilon:450396..460367+ >MSTRG.14943.2.p1 ID=MSTRG.14943.2.p1|Name=MSTRG.14943.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:450396..460367+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaat
ttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATA
TTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCA
CCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAG
GTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAA
CAAAAGGCGAGTTTGTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGAT
AAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGG
AGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACG
AACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGATGGAAAAA
GACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAAAAGAACAG
TTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtcaaaaaacac
tGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAATTATCACA
GGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGGAATATGGA
AGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGACCGACATCT
TTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAGGCGAGTTT
GTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGGCAGATAAC
AAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGGAGACATAGAGTTTA
GtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAAGATTTCAA
AAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGTATACGTTT
ACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTAT
TGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAA
AACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGG
ATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGT
TTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGAT
AAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAGGCGAGTTTGTCAAAGGTTTGAT
GAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATC
AACTTGACACAAACAATGATGGAGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGT
GGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAA
GAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATG
GCTTCTAAATGGAAAAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaa
atcacaatttgtcaaaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATC
TCGAGATATTGAAATTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAA
AGCCACCACCAGGGAATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAAT
CGGATGAGGTTGACCGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGA
TAAAATAACAAAAGGCGAGTTTGTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGA
AAATGGATAAGGGGCAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAAC
AATGATGGAGACATAGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGT
GATGAACGAACGAAGATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGA
TGGAAAAAGACAGTATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAAATGGAA
AAGAACAGTTCTATTTATTTATTGTCATTTGAGaaaatcacaatttgtca
aaaaacactGTGGATGATCGAAAACCTCCAGAAATCTCGAGATATTGAAA
TTATCACAGGTGGGATGGGAGGATTCTCAAAAGGAAAGCCACCACCAGGG
AATATGGAAGTTTTAGTACAGTTTATACAGGACAATCGGATGAGGTTGAC
CGACATCTTTTTCCGATTGGATAAAGACAGAAACGATAAAATAACAAAAG
GCGAGTTTGTCAAAGGTTTGATGAATGCAGGTCTGAAAATGGATAAGGGG
CAGATAACAAATCTGATCGATCAACTTGACACAAACAATGATGGAGACAT
AGAGTTTAGtgagATTTTGAGTGGACAACAATTAGTGATGAACGAACGAA
GATTTCAAAAGAAGATAACAAAGAAAACCGAACAGATGGAAAAAGACAGT
ATACGTTTACCTAAAATTCATGGCTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000128_pilon | genome | sc0000128_pilon:450396..460367 + |
|
