|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:604595..611575+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13893.2.p2 ID=MSTRG.13893.2.p2|Name=MSTRG.13893.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6981bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604595..611575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agtaaaaaaaacaaagcaatgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAA
GATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTC
TCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTT
ATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGA
AAAGCCAGTAACAGTAAAGGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACA
GGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTT
GGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAA
TAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACT
CAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAAC
GTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTC
ATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACT
GGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGA
GATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAA
AATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAG
CTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTG
TTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCGTGAGTTTCTATTT
CTTCTAATAATAAAGATATTTTCTTGCCAAGGTATTTACAATCTCAAACT
ACGTTGCATGCTTTAATCGATTGTGATTATTtggaaacttttcttttttt
gtgagAAACAAATTGCGTTTTTGCCTTTACCTTTCAAGGacttttttact
attaaattttagaactcgattaaaattttacttttaaatttacttttgaa
tCCACAAAGCTACAAAATCTAGTTTTTTGAAGGTAGatgaatttttctgc
tttttgcaGTAATCCTAATATTCTAAAACAACGGTTTTGACTTTTCTTTC
GTTTTAGAATTCCGAACGATTTCTTAATATCCAAAGCAGCAATATGCAAC
GAGTTTTAGGAGATGGAAACACCCTAAATGTTATCTCTATTGCTCCTCTC
AAATCAAACACGGATATGTTGAAATTACACAAAACTATCGTTCAAGAACG
TTTAAAGGAAACTTTAAAAACTTCACGTAACTTACAAGCTTCGATCAAAG
AATTTCATGATAGAGTGCCAAACGGTTTGTTCATTTTATTTACGTATATC
TGAGTACCAATTAATGGCGATTTCAAGTACACAAATTTCCTATTAGTAGA
TTCATGTAAAAACGTCACGGaaaaaaaGTCGAgaaaagctctgattggct
gagagATACTTTGGACATTTTGAGATGCAATTTATGTGTGCAATTTACAA
CCCATCAGAGCTCTACTCGACGTTTTTGTGTGACTTTTGTATGTGAATCT
GCTTCTAAGGTGTGTGTTCGTTTTGACTTATGACGACAAACTGACGCTCT
ACACGACTGACCAGACAACAGACTACTCGGGACCATCTACAAACATCCAA
AACTCTCTGGAACTGAAGTGACAGTTGACTGCTTTAAAAACTACACACTC
GACTGGAAAATCCTACTCACAAAATATGACAGGTACATAATATTTGACAA
TTTATTAAATTGAATAAGCCTAGGAATTAGGCGAAATTATTCTTAATAAA
TTAGGAATTATCGACTTAAGAATATACGGTACGATGTTATTTTGTACTCA
ACAGCGTGATTTTCATTTGGTTCTAACTATAAAGTGTATTATCCTGCATA
AATTATCATTCCTATGAACTAAAATCGTAATAAGTATAAACCCAGTAGGA
CACACGGCGTCTATAAAACGTTAGATGAGATTCTTAAACAACAGTTTTTG
GCAACTCAGATGGTAGTAACCGAAGTGCAAAGGTAGGGCATTCGGGTGCT
GCGATGCGCAAGATACCGGGATCAATCCCCTATTGGGTTATACCAAAGAC
CTCGCGCTTAATACGAAATAGTATTTGATTTATCTCTCTGCTTAATGCAC
ATTTTGAATAGAAGAATATCTTAAAGAGAAGAATCGAGGGTAAATGGCGA
GCAATCCAGGAAGAAAGAGTGGCGTCTATCATCCCTACCTTAGGGAAGAC
AGTTATAGAGAGAGGACTCTTCGGGTCGCCTCAGACTGCGATGGTACAtt
tttttCCATACAAAACTAAATGACCTTCAAAAAAGCCTACGCCTTTAAAC
caattataaattttctttcaattcttaGATGTGTTGGAGAAGAAATTAAC
ATGGCCACTAGGCTATCCGCGACCATTCCGACCATCATCAAGATTTGAAG
TTATTCAATGGAcattatttgataaaaacaaGATGTATGCTTTCACTGAT
CAAGAGCCAACCTCATCTTTCCCTGCTTCATATTATGGTGATTTTACAGA
GATTCTACAAACAGTAAAACAAGctatcaatcaaaaatatgGAAATCGTA
GATTGGAATTGTTAAATGGATATCACAGAGTTGATCCGAAAAGAGGTATT
TTTACTGccttttgaatcttttttcacTATTTCTTCGTTAAAAGTTTACA
TTTTGTCTCCATATTTCGAacttgaaaatagaaatttgtcTGTTCAAATT
AGATATACCCAGTTTGAATGACAGTTTGAATTAGCAAGTCTATTGTATCT
AAATTCTATGAAACGAAGCTTTTCTCTGATAGTACAAAATTTCTCTGACA
ACTTATCACCACAAAGTCTTCGGTATATATTATGATGTTGTAAGACAAGA
CAGACAGTGCAATTTTCCAATCGTTTCTCTCGGGTAGTAGTGAGTTTTAT
TTCGCAACACGAAATGTCTTCTGTTTCTTCTGTTTCAATGAtggttactc
ttaggtgccaaataacccccccccccaatttttttttaaattcccagcta
ccaaaaggaaagttccttgttttactctaaaaagcctaaatttagtctat
tttgaccctttttagggtttttaaaggtccattttccaacctccccccgg
taattaggccccccccgtttatttaatttggaaaacttttccaacccccc
ccccctttatttggcacctaagagtagtgGTTCATTTGTGTTTATCCTGA
CTGAATGAGGAAGATGGTAAATCAGACTTTGTTTGACTGTCCTCAATTTT
GAAGGTCTGATCAGCGGGTTGTTCTAACGTTTATATCTCTCTTGCTTCTT
GATTCCCTGGTCAGGATTCTTGACCCTTCCAAGATCTTAGTAAGATCTTG
acaagaattttgaccagggTACAGACACTATCGCTAAAGCTGTGAAATGA
CCGTTTCTTTAGGGGCAGAATATCTGATTGAAATGAAGGACAAATCGTCA
GATAAAGTGTATCGTTATCAGTTACTTCGACCTTTCTCCAGAGTTGAATC
ACTTTCAATGCCAGCTGCAACAGAACAGAAAGGAATACACATTGTACTAC
CGTTACTCAAGTAAGTAGAAAATAACTCTTTTCATTATATCAATTTGGgt
tttttagaaagttttgCTCTACCCAAAGTTGAAAAGATATACAATAGAGT
CTATTTAGCTCGAACCTTTAttataactcaaatgtctccttaactcgaac
aagttttcacctcccttcagttaacaattccTTATAGATACTTGCTCCAT
AACTCTTAATTACCTTAATTCAAACAAATTTGCGAATTCGCGTTTCTCGG
GTGAGTTCGAGCTATGGAGATTCCACTGTATTGGTATCACCTGGGACTAG
TAAAAGATCGTTAAAATATTGAACAGTCTTTGGATGATATtatgttatgt
tttattttcttccattgcttttttctatttttctaatGACGTTACAGCAT
ATCACCTAAACATATATTACTCAGTATGTATTGAAATAAATCATTGCTGA
CCTTGCTTCCTATTTCAAATACTTAATTtctttggtatttttcttttcGA
AGGGATGacatgaaatattttgaaaagttcatGCAAATGTACAAAAGACT
TTGTTTACAATCTGGAGAAAATGTTGTTCTTCTAACTGTCTTTGTCAATA
TTCGTGATGGGaagtttgaagaagaaaaagaaccgTTTCTAGAATTCAAA
AATCTGATTTCAAGGTGCGAATTACTTGTGTttaggcttttcctgaaaat
ttgatTCTAAAATTCTAGATCTCCCTGGAGGATTTCCTGTATACCCTTAA
GAGACTCCTTGATTTTTTCATGTACTGTGATACGTCTCATTTGGATTTTC
AccgaaatttttttgagagtACCTGGACCTGGAAAATCTAACCTCCTCAA
CATCTGGAATAGCCTAATAAAGTTTATATTGCGGAAAGAAAGGATGACTG
ATAGATTTGAAGAATTCCTTTCAAATTTcctatcaaaattaattttcaca
cAATTTCCACAGTccagaaattaaaatttcagtcaaatctttacttgtct
gtacacagacccgatatctacggctaatttcaaaaaacaatgatctCATT
CTTATCAACACTAAACAACCCCCAATGCAAACTTCTTATATTTTCAGATA
CAAGCAATCATACATGTGGGCTCAATTACCATGGTTACAAGTTGGTGTTA
AACACATTTCTGATGTCTTGGTGATGGACATTGTGTCAATGAAACTACCT
TCCAACGCTCTTATACTCTTGCTCTCACATCATAATCATTTCACTGtcaa
ttttttaaacagatGTCGTGTTAATGTAGTGACTGGATTGCAGGTACAGT
GGAACTTCTTTAACTggaatctctataactcgaatgtctccttaactcga
acaagttttctggcCCCTTCAACCTTATAAAGCTTAAAAATTCATaactc
cataattcgaacaattGCATTTCTTTAGTTTCATCACCGTAATTAGATTC
ACCTTCTAAATTCAACTAGAGTGCAGAAGGAGTGTATTGAAGCATGTAAT
TAGGCACAGGATATTGTCTTTAGAAGGTTCTATATCCAACGTTTCGAGAT
GTTTGAAAACAAGATAGATGTGTCATCGCCATGTATCGAAATCTTCCAAA
GATTTTTCTACGATTTTTCCTCAGAGACCAGTCAGACATATTTTTAACCA
TTCTGTCAGTATCTATTGCTTGATAATCACTTAAAATGAGAGCACACCAT
TGATTCTATTaacaattttaatgttttttacttttcaggtctttttCCCC
ATTCCTTTCTTGGAATACAATCCAGACATTGTTTACAATGGCAAGCAGAA
ACCAGCATTTTCAGAAGTACACACCACAACCGGGTTCTGGGGTCGAGACT
CATATCAAGTTGGCTGTTTCAATAATAATGATTATAAAGCAGCTCGTATG
TGGAAAAATGACTTCCTTGATGAAAACTTGCCTAACAATAAAACTATTCT
TGGTGTTTTTGAAGGATCCAATCTTAATGTTTTCAGAGCTTTGGATAGTG
AACTTCATACTTGGTATGAGTTTGAGAATTGTGTTTCAGatgtcaaaaca
aataaaaccgAATGTCATTTTAAGAATTCACAAAGACTTGGTAATAGAGC
TCAGTTAGCTCaagttttctttgattttaataaTTCGAAAAAACCATAGA
CATATTATCAGCATTAGAAATATGTATTttaggcccggcggaagcgggga
gactggggagacttccccacttttgagcaaatgagatttttttctcaaat
tcctagcaaattttatctcattttgagccttcagcctccccactttaagG
TCGTTCCCCGGAtctgtattttgaatatttagcATATTTTCTTAAGTAGA
TATGAGTTTTCAATTATCATTGTATTCCTCAGggaaattaatgcgtgtcc
aaatttcaAACATGTTATTAGGCcacttatgatgacgtcataaaacaaGA
GAATTAAATATCTTGAGAACTACTCagtaaaactttatgaaatttttacc
aATGATATCAAAAGGAGTATTGGGCTCtccagaaaaaagttttacatggg
ggttggaggatataacaaattttagtgatttaccccccggacagggtgac
ttttggccccccggacaggcatctgctgaccccccggacacaccaaatta
cccccggacagagcaaatttacaccccggacaaggcaaattttgatgatt
ttttgctacccccggacaatatatcctgaacccccatgtaaaattttttt
tggaagagcccattctatgattgtaaatattttgatgacgtcagcagaaa
tagCAGAACATCTCAAAAGTGGCAGAAATTAAATTTAAGTAAcagtaatt
ttcattttcgacATCGAAATACAATTCTTTTTTATGTATAATGGGTGCGa
aagaattattgaaaatttagacAATATGCATTCTTATTGAAACAGATTTC
ACGGGTTCTGAATAAAATGATTTGTCATTTGGAAAAATACTACTTTTTGA
TGCGACAGGGTTGATCTTACGGTGCTGTTAGCATTAcattttgtttagaa
ttttTCTCCTCGGGATTatcaaaaattctttgttttatcTTCATTAAACT
AAGATAACAAAGgattttggaaaattaactGTGGATATCATCTGCCGAAA
GTATCTGCTTGCATAATTCTAATCCTTTTATGCAATTTGTTTATCCCAAC
AGAGGTGTTATGCTATTACAGTGTGTATCCCaaaaaaaGCGgacatattt
ttatataaagtaaaatcttcatgatttatgagaaattttatgaCCCTTAT
GTACCtataggtcgtgttcagaccaaggtttaaatcAATTAGGTCTACAA
GTTTCTTTTagattccttttgtatttaacgg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:604595..611575+ >MSTRG.13893.2.p2 ID=MSTRG.13893.2.p2|Name=MSTRG.13893.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604595..611575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agtaaaaaaaacaaagcaatgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAA
GATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTC
TCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTT
ATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGA
AAAGCCAGTAACAGTAAAGGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACA
GGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTT
GGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAA
TAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACT
CAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAAC
GTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTC
ATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACT
GGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGA
GATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAA
AATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAG
CTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTG
TTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCAATTCCGAACGATT
TCTTAATATCCAAAGCAGCAATATGCAACGAGTTTTAGGAGATGGAAACA
CCCTAAATGTTATCTCTATTGCTCCTCTCAAATCAAACACGGATATGTTG
AAATTACACAAAACTATCGTTCAAGAACGTTTAAAGGAAACTTTAAAAAC
TTCACGTAACTTACAAGCTTCGATCAAAGAATTTCATGATAGAGTGCCAA
ACGGTGTGTGTTCGTTTTGAagtaaaaaaaacaaagcaatgAATCGAAGT
ATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCT
TTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTT
CGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCT
GGTCGAAGCATAAATATAGAAAAGCCAGTAACAGTAAAGGCAAAACCAAA
TCGATTTAACAATGACTACAGGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTT
TCAAAAATCTAATGTTTGTTGGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATG
ACCAATGGTGTGACCATTAATAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGT
TGTTTTCTTCACACCGTACTCAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTG
TGAAGAAATTAAACCTTAACGTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACG
TCGAGTGATTTGGAATTTTCATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCA
CCATTTGAATAAATATAACTGGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATT
TGAATATGGTTAATGCTGGAGATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAA
CCAATCATACTGGCAAATAAAATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGG
CGTTATAATGAGTCATACAGCTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAG
CGGGTTTTCCTTCTGGGTTGTTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTT
TTTTGCAATTCCGAACGATTTCTTAATATCCAAAGCAGCAATATGCAACG
AGTTTTAGGAGATGGAAACACCCTAAATGTTATCTCTATTGCTCCTCTCA
AATCAAACACGGATATGTTGAAATTACACAAAACTATCGTTCAAGAACGT
TTAAAGGAAACTTTAAAAACTTCACGTAACTTACAAGCTTCGATCAAAGA
ATTTCATGATAGAGTGCCAAACGGTGTGTGTTCGTTTTGAagtaaaaaaa
acaaagcaatgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTC
TATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTGGTTATACGTCTCAAATTTTC
ATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCACGATAAAGTTATTTTGGATC
AAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCATAAATATAGAAAAGCCAGTA
ACAGTAAAGGCAAAACCAAATCGATTTAACAATGACTACAGGCCTTATTT
TGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCTAATGTTTGTTGGTGTCAAAA
TAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTGTGACCATTAATAACACGTGG
TCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTCACACCGTACTCAAGAGACAG
TGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATTAAACCTTAACGTCATTCAAT
TACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATTTGGAATTTTCATTGCGTATT
GTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAATAAATATAACTGGTTTATTTT
GAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGTTAATGCTGGAGATCATTTAA
AACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATACTGGCAAATAAAATTAAAGGA
GAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATGAGTCATACAGCTCTTTCAAA
CTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCCTTCTGGGTTGTTATCAAAAC
TGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCAATTCCGAACGATTTCTTAATATC
CAAAGCAGCAATATGCAACGAGTTTTAGGAGATGGAAACACCCTAAATGT
TATCTCTATTGCTCCTCTCAAATCAAACACGGATATGTTGAAATTACACA
AAACTATCGTTCAAGAACGTTTAAAGGAAACTTTAAAAACTTCACGTAAC
TTACAAGCTTCGATCAAAGAATTTCATGATAGAGTGCCAAACGGTGTGTG
TTCGTTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:604595..611575 + |
|
