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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13893 ID=MSTRG.13893|Name=MSTRG.13893|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7091bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caaatattttgaaactattttctcagatttaaatgtttttgtaaagaaTT
GGCTATGATAGATTGTGGACAATAATCCGACaatttcaataaattctttt
tcttttttctagtaaaaaaaacaaagcaatgAATCGAAGTATGAATAACA
AAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTG
GTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCA
CGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCA
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AATGACTACAGGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCT
AATGTTTGTTGGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTG
TGACCATTAATAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTC
ACACCGTACTCAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATT
AAACCTTAACGTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATT
TGGAATTTTCATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAAT
AAATATAACTGGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGT
TAATGCTGGAGATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATAC
TGGCAAATAAAATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATG
AGTCATACAGCTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCC
TTCTGGGTTGTTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCGTGA
GTTTCTATTTCTTCTAATAATAAAGATATTTTCTTGCCAAGGTATTTACA
ATCTCAAACTACGTTGCATGCTTTAATCGATTGTGATTATTtggaaactt
ttctttttttgtgagAAACAAATTGCGTTTTTGCCTTTACCTTTCAAGGa
cttttttactattaaattttagaactcgattaaaattttacttttaaatt
tacttttgaatCCACAAAGCTACAAAATCTAGTTTTTTGAAGGTAGatga
atttttctgctttttgcaGTAATCCTAATATTCTAAAACAACGGTTTTGA
CTTTTCTTTCGTTTTAGAATTCCGAACGATTTCTTAATATCCAAAGCAGC
AATATGCAACGAGTTTTAGGAGATGGAAACACCCTAAATGTTATCTCTAT
TGCTCCTCTCAAATCAAACACGGATATGTTGAAATTACACAAAACTATCG
TTCAAGAACGTTTAAAGGAAACTTTAAAAACTTCACGTAACTTACAAGCT
TCGATCAAAGAATTTCATGATAGAGTGCCAAACGGTTTGTTCATTTTATT
TACGTATATCTGAGTACCAATTAATGGCGATTTCAAGTACACAAATTTCC
TATTAGTAGATTCATGTAAAAACGTCACGGaaaaaaaGTCGAgaaaagct
ctgattggctgagagATACTTTGGACATTTTGAGATGCAATTTATGTGTG
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ATGTGAATCTGCTTCTAAGGTGTGTGTTCGTTTTGACTTATGACGACAAA
CTGACGCTCTACACGACTGACCAGACAACAGACTACTCGGGACCATCTAC
AAACATCCAAAACTCTCTGGAACTGAAGTGACAGTTGACTGCTTTAAAAA
CTACACACTCGACTGGAAAATCCTACTCACAAAATATGACAGGTACATAA
TATTTGACAATTTATTAAATTGAATAAGCCTAGGAATTAGGCGAAATTAT
TCTTAATAAATTAGGAATTATCGACTTAAGAATATACGGTACGATGTTAT
TTTGTACTCAACAGCGTGATTTTCATTTGGTTCTAACTATAAAGTGTATT
ATCCTGCATAAATTATCATTCCTATGAACTAAAATCGTAATAAGTATAAA
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CTTAATGCACATTTTGAATAGAAGAATATCTTAAAGAGAAGAATCGAGGG
TAAATGGCGAGCAATCCAGGAAGAAAGAGTGGCGTCTATCATCCCTACCT
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ATGGTACAtttttttCCATACAAAACTAAATGACCTTCAAAAAAGCCTAC
GCCTTTAAACcaattataaattttctttcaattcttaGATGTGTTGGAGA
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TTTCACTGATCAAGAGCCAACCTCATCTTTCCCTGCTTCATATTATGGTG
ATTTTACAGAGATTCTACAAACAGTAAAACAAGctatcaatcaaaaatat
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AAAGTTTACATTTTGTCTCCATATTTCGAacttgaaaatagaaatttgtc
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TATTGTATCTAAATTCTATGAAACGAAGCTTTTCTCTGATAGTACAAAAT
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TGAGTTTTATTTCGCAACACGAAATGTCTTCTGTTTCTTCTGTTTCAATG
Atggttactcttaggtgccaaataacccccccccccaatttttttttaaa
ttcccagctaccaaaaggaaagttccttgttttactctaaaaagcctaaa
tttagtctattttgaccctttttagggtttttaaaggtccattttccaac
ctccccccggtaattaggccccccccgtttatttaatttggaaaactttt
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TTTATCCTGACTGAATGAGGAAGATGGTAAATCAGACTTTGTTTGACTGT
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CTTGCTTCTTGATTCCCTGGTCAGGATTCTTGACCCTTCCAAGATCTTAG
TAAGATCTTGacaagaattttgaccagggTACAGACACTATCGCTAAAGC
TGTGAAATGACCGTTTCTTTAGGGGCAGAATATCTGATTGAAATGAAGGA
CAAATCGTCAGATAAAGTGTATCGTTATCAGTTACTTCGACCTTTCTCCA
GAGTTGAATCACTTTCAATGCCAGCTGCAACAGAACAGAAAGGAATACAC
ATTGTACTACCGTTACTCAAGTAAGTAGAAAATAACTCTTTTCATTATAT
CAATTTGGgttttttagaaagttttgCTCTACCCAAAGTTGAAAAGATAT
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taactcgaacaagttttcacctcccttcagttaacaattccTTATAGATA
CTTGCTCCATAACTCTTAATTACCTTAATTCAAACAAATTTGCGAATTCG
CGTTTCTCGGGTGAGTTCGAGCTATGGAGATTCCACTGTATTGGTATCAC
CTGGGACTAGTAAAAGATCGTTAAAATATTGAACAGTCTTTGGATGATAT
tatgttatgttttattttcttccattgcttttttctatttttctaatGAC
GTTACAGCATATCACCTAAACATATATTACTCAGTATGTATTGAAATAAA
TCATTGCTGACCTTGCTTCCTATTTCAAATACTTAATTtctttggtattt
ttcttttcGAAGGGATGacatgaaatattttgaaaagttcatGCAAATGT
ACAAAAGACTTTGTTTACAATCTGGAGAAAATGTTGTTCTTCTAACTGTC
TTTGTCAATATTCGTGATGGGaagtttgaagaagaaaaagaaccgTTTCT
AGAATTCAAAAATCTGATTTCAAGGTGCGAATTACTTGTGTttaggcttt
tcctgaaaatttgatTCTAAAATTCTAGATCTCCCTGGAGGATTTCCTGT
ATACCCTTAAGAGACTCCTTGATTTTTTCATGTACTGTGATACGTCTCAT
TTGGATTTTCAccgaaatttttttgagagtACCTGGACCTGGAAAATCTA
ACCTCCTCAACATCTGGAATAGCCTAATAAAGTTTATATTGCGGAAAGAA
AGGATGACTGATAGATTTGAAGAATTCCTTTCAAATTTcctatcaaaatt
aattttcacacAATTTCCACAGTccagaaattaaaatttcagtcaaatct
ttacttgtctgtacacagacccgatatctacggctaatttcaaaaaacaa
tgatctCATTCTTATCAACACTAAACAACCCCCAATGCAAACTTCTTATA
TTTTCAGATACAAGCAATCATACATGTGGGCTCAATTACCATGGTTACAA
GTTGGTGTTAAACACATTTCTGATGTCTTGGTGATGGACATTGTGTCAAT
GAAACTACCTTCCAACGCTCTTATACTCTTGCTCTCACATCATAATCATT
TCACTGtcaattttttaaacagatGTCGTGTTAATGTAGTGACTGGATTG
CAGGTACAGTGGAACTTCTTTAACTggaatctctataactcgaatgtctc
cttaactcgaacaagttttctggcCCCTTCAACCTTATAAAGCTTAAAAA
TTCATaactccataattcgaacaattGCATTTCTTTAGTTTCATCACCGT
AATTAGATTCACCTTCTAAATTCAACTAGAGTGCAGAAGGAGTGTATTGA
AGCATGTAATTAGGCACAGGATATTGTCTTTAGAAGGTTCTATATCCAAC
GTTTCGAGATGTTTGAAAACAAGATAGATGTGTCATCGCCATGTATCGAA
ATCTTCCAAAGATTTTTCTACGATTTTTCCTCAGAGACCAGTCAGACATA
TTTTTAACCATTCTGTCAGTATCTATTGCTTGATAATCACTTAAAATGAG
AGCACACCATTGATTCTATTaacaattttaatgttttttacttttcaggt
ctttttCCCCATTCCTTTCTTGGAATACAATCCAGACATTGTTTACAATG
GCAAGCAGAAACCAGCATTTTCAGAAGTACACACCACAACCGGGTTCTGG
GGTCGAGACTCATATCAAGTTGGCTGTTTCAATAATAATGATTATAAAGC
AGCTCGTATGTGGAAAAATGACTTCCTTGATGAAAACTTGCCTAACAATA
AAACTATTCTTGGTGTTTTTGAAGGATCCAATCTTAATGTTTTCAGAGCT
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tgtcaaaacaaataaaaccgAATGTCATTTTAAGAATTCACAAAGACTTG
GTAATAGAGCTCAGTTAGCTCaagttttctttgattttaataaTTCGAAA
AAACCATAGACATATTATCAGCATTAGAAATATGTATTttaggcccggcg
gaagcggggagactggggagacttccccacttttgagcaaatgagatttt
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caccaaattacccccggacagagcaaatttacaccccggacaaggcaaat
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AAcagtaattttcattttcgacATCGAAATACAATTCTTTTTTATGTATA
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TACTTTTTGATGCGACAGGGTTGATCTTACGGTGCTGTTAGCATTAcatt
ttgtttagaattttTCTCCTCGGGATTatcaaaaattctttgttttatcT
TCATTAAACTAAGATAACAAAGgattttggaaaattaactGTGGATATCA
TCTGCCGAAAGTATCTGCTTGCATAATTCTAATCCTTTTATGCAATTTGT
TTATCCCAACAGAGGTGTTATGCTATTACAGTGTGTATCCCaaaaaaaGC
Ggacatatttttatataaagtaaaatcttcatgatttatgagaaatttta
tgaCCCTTATGTACCtataggtcgtgttcagaccaaggtttaaatcAATT
AGGTCTACAAGTTTCTTTTagattccttttgtatttaacgg
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:604485..611575 + |
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