MSTRG.13893.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13893.1.p1
Unique NameMSTRG.13893.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13893.1.p1 ID=MSTRG.13893.1.p1|Name=MSTRG.13893.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7091bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caaatattttgaaactattttctcagatttaaatgtttttgtaaagaaTT GGCTATGATAGATTGTGGACAATAATCCGACaatttcaataaattctttt tcttttttctagtaaaaaaaacaaagcaatgAATCGAAGTATGAATAACA AAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGATATCAGGCTTTCTTTTGGGGCTG GTTATACGTCTCAAATTTTCATCGTCATATCAAGCACTTTCGAAATGTCA CGATAAAGTTATTTTGGATCAAAAAGAACAATCTAAATCTGGTCGAAGCA TAAATATAGAAAAGCCAGTAACAGTAAAGGCAAAACCAAATCGATTTAAC AATGACTACAGGCCTTATTTTGTATACAGTGAGCTTGGTTTCAAAAATCT AATGTTTGTTGGTGTCAAAATAAGTGAACAACAACTTATGACCAATGGTG TGACCATTAATAACACGTGGTCTTCAGATGATCAGACTGTTGTTTTCTTC ACACCGTACTCAAGAGACAGTGAATTTCATAACCGATTTGTGAAGAAATT AAACCTTAACGTCATTCAATTACCAGATATTGTGGACACGTCGAGTGATT TGGAATTTTCATTGCGTATTGTACAATATATGAAAGATCACCATTTGAAT AAATATAACTGGTTTATTTTGAGTAATGATAATGTTTATTTGAATATGGT TAATGCTGGAGATCATTTAAAACGGTTGAATTCGACACAACCAATCATAC TGGCAAATAAAATTAAAGGAGAATGCTCTTCAAGCCATGGCGTTATAATG AGTCATACAGCTCTTTCAAACTATTACCAAACTGATGGAGCGGGTTTTCC TTCTGGGTTGTTATCAAAACTGGGAAATAAGGAAACACTTTTTTGCGTGA GTTTCTATTTCTTCTAATAATAAAGATATTTTCTTGCCAAGGTATTTACA 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tgatctCATTCTTATCAACACTAAACAACCCCCAATGCAAACTTCTTATA TTTTCAGATACAAGCAATCATACATGTGGGCTCAATTACCATGGTTACAA GTTGGTGTTAAACACATTTCTGATGTCTTGGTGATGGACATTGTGTCAAT GAAACTACCTTCCAACGCTCTTATACTCTTGCTCTCACATCATAATCATT TCACTGtcaattttttaaacagatGTCGTGTTAATGTAGTGACTGGATTG CAGGTACAGTGGAACTTCTTTAACTggaatctctataactcgaatgtctc cttaactcgaacaagttttctggcCCCTTCAACCTTATAAAGCTTAAAAA TTCATaactccataattcgaacaattGCATTTCTTTAGTTTCATCACCGT AATTAGATTCACCTTCTAAATTCAACTAGAGTGCAGAAGGAGTGTATTGA AGCATGTAATTAGGCACAGGATATTGTCTTTAGAAGGTTCTATATCCAAC GTTTCGAGATGTTTGAAAACAAGATAGATGTGTCATCGCCATGTATCGAA ATCTTCCAAAGATTTTTCTACGATTTTTCCTCAGAGACCAGTCAGACATA TTTTTAACCATTCTGTCAGTATCTATTGCTTGATAATCACTTAAAATGAG AGCACACCATTGATTCTATTaacaattttaatgttttttacttttcaggt ctttttCCCCATTCCTTTCTTGGAATACAATCCAGACATTGTTTACAATG GCAAGCAGAAACCAGCATTTTCAGAAGTACACACCACAACCGGGTTCTGG GGTCGAGACTCATATCAAGTTGGCTGTTTCAATAATAATGATTATAAAGC AGCTCGTATGTGGAAAAATGACTTCCTTGATGAAAACTTGCCTAACAATA AAACTATTCTTGGTGTTTTTGAAGGATCCAATCTTAATGTTTTCAGAGCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+

>MSTRG.13893.1.p1 ID=MSTRG.13893.1.p1|Name=MSTRG.13893.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=15183bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:604485..611575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgAATCGAAGTATGAATAACAAAAATCCAAAGATATTTGTCTATCTGAT
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13893MSTRG.13893Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13893.1.p1MSTRG.13893.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13893.1.p1.exon1MSTRG.13893.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon2MSTRG.13893.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon3MSTRG.13893.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon4MSTRG.13893.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon5MSTRG.13893.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon6MSTRG.13893.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13893.1.p1.exon7MSTRG.13893.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:604485..611575 +