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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1273048..1291342+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11027.1.p1 ID=MSTRG.11027.1.p1|Name=MSTRG.11027.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18295bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1273048..1291342+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tcgcttttttagaaaaatcaaaaactctgataaggtctatttCAGTTTCG
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GTTTTACTTTTTCTCCAATATGTACCTGAGCAGTCGAACTATCACTACTT
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ATTCTCTCTTGTTTAGCTTTGTCTTTTTCAGCTATTGCTTCGGCTAATTC
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AGTATTGCAGTTGCTAAAacgattttcagaaaatttacgTTGTTAAAGGT
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GCCATACCCGTTGTGTCGTGCCTGGACGTATCtccctaccatttgcttac
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TTTTGTACCGTTTCATACTTCGTTAGCTTCGTTCGTTTCTCAAAGTATCC
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cgaaccttagacggatgctctaccactgtacggTTGCTTATCTACCCGTC
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gtttgtttgtttgtaattgtaatttatcGTTGACATAAAAATAAATAGCT
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TGGTTTCTTTAATTCCTTAAGGTCATTAGGATGTCGAAATTCTTGGGGAA
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AACACTGTTCTGATGTTTCTAGgtttaaaaaacatttgatgTCGTGTGTT
CGTAGACTTTTCATTATATGAACAAATATTCCATCATTTAGCTTTGAAAT
GTTTGATTTGCATTTGAATAGCTCTGTTGCCAGAAGCTGAATATTACGAT
GGTGGAAGGTTACTGAATTGTCTTTCTCTAGAAGTTcttcaaaagtcaaa
ttttcttCAGGGAAGACTATTCTTAAGCATCGTTCATGCAGATGGTTTAT
CTTATTTTCTAGGCGGCGGCTATGAAACATCTAAACTAACGGACAATAGT
TAAactgacttttgaaaaatgcattCATTAGTTTTTGTCGTTTAGCTTGA
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TTTGCAGCGTTGTTCGATGTAATTTTCGAATGTGAGATGGTTGTCAAAAG
TCATTCCTAATATCTTAGATGTGTTGCTATTTGAAACCCGCTGATCTTGA
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ATCCTTGTGGAACCCCTACTGAAATGTTATGCCAAGTACTATAGCTGTCT
CCTATTCTAGTCCTTTGTTTTCTATTCGTAAGGTAATTTCCAATCAATTT
AAGAGCATTCGTGCTGAAGCCATAGGCTTCCATCTTTGCAGTAAAAGATC
GTGAGAAATGCAATCAAATGCTTTAGAAAGTAATGCTCCGAATTTCTGTC
TATCATCAATGGCTTTTTTCCAGATTTCAGTTAGCATCAGTAGCGGTGCT
TGCGTACCTAAACCTGCCCTATATCCACATTGTTTTTCGCTGTACATGTC
CTCGTAGAAATCTGAAATTTGATCATGTAttattctttcaaaaacttttg
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gtcaatttaatCATAAACAAATGGTCACAGTctattttaaagtaaaaata
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aGGGGATGAATTCATTGACTCCCGAAGGGCCTGTAAGGGCTAggctcgag
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atttttggttatttttcgccagggttattttttacgcaagggttaatttt
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taaattttggttatAAACATACTTGTTCTTGTTGCAACTTTTCGATGGTT
TCTTTCAATTTGGCGATTTGGTTGTTTTGGAAAACAGTCTCATTTTGCAA
TGTtttctataaaatgaaaaaatgtaaaatgattaaatgttgtttgagct
tcatgTTCATGTGACGCGATCGAGAGAGTCTGATCATATTTCTATGTTCA
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AATGGATCTTGGTTTACTAACAACAGACATTCAGTAAGTTATTGGTTGAA
TTATTGGTCGAGTTATTGGTTGAGTTATTGATCGAGTTAATGGTTACCAT
GGAATAAAGATCACGAATTGTATAATTATCCACTTTCGCTTAACTTAGAA
TaggttttaatttaatttttttttaatctcaaaTACTTTAAGGGAGGCTC
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TGAGACCCATTTACTTACAAATACAGACGATTTCAATTATGAGTGTCCTG
GTGAGGGGTGGGTGTGTCTGTCCTTACAAAAGCTCGAAAATCGACCCtgt
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ATCAATGACCATCAACCAAAGTATAGACTGTCACGCTGACACTTCTGAGT
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cttgtagatcttcaacttctttatctttctcttGTACAAAAACCTAATAA
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AATTTTGTAACATTCTATGACTGTGTTGAAGTtcagaatttctttttctt
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GTCCATTTCTTATTACGCTTTTGTATGCCTTCTTTTTACACGATATACTA
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agaaccttgccgtctccgtcgcagaaaaacacacatacatatggagcgca
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ACTTCAATTCTCTCTTGTTTAGCTTTGTCTTTTTCAGCTATCGCTTCTGC
TAATTCATCTTTTACTGTCTTTGCTAATAAAGTTTGTGACTTTGCTTCAC
CTTTGTAGTATTGCAGTTGCTAAAacgattttcagaaaatttacgTTGTT
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CGTTTCTCATCGGAAATTTTgctcaatcaatagatattcaattttcgaaa
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agaaaaacgtttcttcgcttatatcagcataacataacaataggcagaca
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GTACTCTTAAACCCCGGggggagtacttaggcAaaaataggtgctgggta
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gttacAaaaatcaggaaatttcaaagtagtctctctaagggtgggaaaat
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gtctcactaagggtaggaaatttttgaaaatcagagaaaatttttcgaaa
aagtctttctaagggtcactttttcactaaaatttggtctctctaagggt
cggttttcggaggtcccgtccgcacatacccctcattcactaaccctagt
accccccccccgggtctttAACTTTGACTGTATCTAAAATGGTTTGATAT
CTCTGACAAGTTACGGTAACAAAGCCAAGAACAACAAAAACTTTATAGTA
AATTCATACCTCCTGTGTGTTTTCATAATCTTTAAGCACTTTTGAATATT
TGAGCTCGTAAGCATCACACAATGTTGAATGCTGACTTGTGGTAGCTGCA
TTACAATCACCATCACTGTCCTCTTGAACGGCTTTTTGCGCAGCTGCTTT
TTGAAGATCGATTGCGATAGTACTGTTAACTAGAACTGCAGCACTGTTTA
CTAGAACTGCTTTTGCTAAACTTCCTGGCGAGCCGACGCTTAATTGAACA
GTACTGGGTTGTTGACTGTCCATTATTCTATTTTATTTCGTTGTAAGTAT
AGTTTCTTGACTTGGATAACCGATTCTCCTACTGTGAAATCTTGAACTGA
CTTCTTCTCTTTTAACTGCGTTTTGAATGAAtgtctttttggaaaaatat
ttacttcgtactttgtatttttatttgacgtcagttcaTATcttatattt
gacgtcaattattaaagtatttcAACGTCATTCCCCGTGACACTGTTGAA
CCAGTCTGATAACTAATTAAAGTAGGTaaaaaaaTGGGTATCGTCGCCCA
TTTAATGTAACATGCGCAAGATATCTTTAATGATCCTAACGGATGTTTTT
GTAAAAGATGGAaaaatacagtagactctcCCTTATTCGAACCTTTCTCA
TTCGAATGAGCAAGAGTCAACAGTAGGAGGATGTTGCTCGAAAGGTTGAG
AACATCTGGATTCAATCTTGATTTCTTTCGTtgcatattttctttttata
gctCTCGGAGATGTCATTCAAAAATCACTATGTTTACAAATTCACTGTTA
AAGGGGGGACAAAATCAGGTAACTTTCTcgaacattttttgaaacaataa
ataTATTAGTCCAAATGTAACTCATGACGATTATGAAGACTCCTCAGTGG
TTTACATGAATACTCGAATGACCAGCCCGAGGGcaacttatagctttttg
atagtcTGGATGTCGCTTATAGGTGGGCCGATGTAATATTCTAGATTCCT
ATTTTTGTTCTTGAGCACGCAGCAATTCCATAAAGATAAGTCCCTTTTGC
GTCAATGCTTGAAATTATCCTTACAACAGTGGCTTTTCTTGATCTAGGCT
TATGTCTCTCGAATCTTTCAAAACTTAATGTGAATCTGAATAAAAAGAGA
GGATGTTCTACCCCTTAgttaagaaactttttgaacttgtatcatgaatt
ttattttatccattttctttttataggaGATTTCATAACGCtggttcaaa
atcaaaatcttatgAACATTCCACACTCAGCCGCTGAAGCACAAAGTCAC
CATCGAGTATCGCTCGTaaaaaaaGTATGTTCTTCGTCATACTTAACAcg
cttttttctttataagaatattcatgatgaaattggccaaaaaataaaga
atatgctaagaatactATCTATCGCCAATTATCCCCTAGCAATgccaaaa
gctttcaaaaaaggccaatacgctaagaatattttggatgcttttcccca
aaaagttaagaatatcaatGATGATTGGGAAAAAAGACCATTTAGAAGcg
tgtatgtgtgttttttcttGTTGACTGTCAATTGTCAATCGATAGAGAGA
AGTCGATGTTTGTGTAGCTATTGAGCAAAGCACCAGTGATTTCCAAACCC
CAGCCAAAATATCCAATCAAAGATTGATGAAACGATTACCGAATTTGTCT
AAGGCGCCAGCGTAACAATCCCCGGTTCGATTTCCTGCTctttccaatgt
tccgttcagttcctACATTCCCAAGCCAGCTGACCGTGgtcccgtgaaaa
caatcgaaagactgccgaaagttctagattactgggctaaaAGTTCCACG
TATTCTGCGTTTTCGACATCGAGTGtgttttaataataataactagccgg
tacccagcgtcgcacgccggttaagatgtagctgaacgcactaaaagtcc
tttggatgttgaagctggcttgaaaaacgatcaaatgaataaaaagatat
cttcaaagtttgactaaactttcttggtaccgttggaagcAGGATTTTAT
GTAGATGATCATACTCAGAGCCTCTTGATGAGGCtcttggggaaaacttt
tggtaaaatcaagtCTGAAGTGTACTTCTTTGCCCCAAAATAGATACGTT
TTTGAGCAGTGCACTGGTCATCAGCTACACTAAAAACCTATCAAAGCCTT
TGAAAGTCAGCGCTATCCCCATGGGCTTTCGCCTTGCACTTGACCCATTT
CATATCATGGATGACACTGTTTAATTGCTTGTGGTCTACAGAAATGTTGT
TGGGAAatccccccccaaaaaaaaaattctttaagaGTCTTTTAAAAGGT
ACCTACCATTGCAAGGATAGCACTTTTCAAGGCACTTTATATCGAAAATG
GgtctttattgttttatttcaccaatttttttccCCCAAGGGCCTCAacg
tgaggctctgagtatgttaGAACTTGTAAAATTCCgcttccaacgatacc
aagaaagtttccgcggaatttttttcaaggtcaacctttatttctgccag
actattaaatttcaaaacaaaggctgaataaagtctaaaccaggctttat
ttgatctgtcaatcaaaagaaacttattgagaacaaaacattgcttgcga
aatcgaaagtgacacacagacagaaaacagaaaacagaaaaaagacatac
agactacgactattaatatatagatgctatacaagttcgcaggccaccgt
gtgagcacatgggcctctatgaaccgctctATGTTCGGCTTACAATTTTC
TTGAAGTTTTTATTACTTCTGAGAACACAAAAGTAATCTGccctaaattt
ttttaatcaaattttctcTCTTCATAGCACTCAGAAACGTCCAATCATCT
TTTCACGTCATTACGATTTATATTACACCAGCCATCACCTCGATGGCAAA
CATTTCGGTTGGACGATATCAAATTCTACAAAATAGTCAAATCAGACAGT
GAAACCGTAAgagattcattttttttaattgattttgatttaacGCCTGA
ATTCCGGTTCACCATTTAATTCGGCGCTTACAGGGCCCAGATAATgtcat
tttggaaaattattagCTATGTGAGAAGTGAAATCCCTACGATGGTCAAT
TTGCATTAGGCTTTCCGATTAGGAGTTCAGGTGTTCTACACACTCGACAA
GCGCTTCCTACTAAATTTCATGTTATAAAGATGCAGTCCTCATTGCTATC
AAGTCATCCCAGTTTGGAAATATTCAGGCCTGAGTCAAAGCCAGAATCTT
TAGACCGGCTGAGTTACTAGTCCAACCACGCCCAACTCATCGaaaaaata
caacatttttATTATAGAAAGATGATGAAGATCATGTGGACaaggaagaa
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ACAActgattttgttttaattttccttgaacgttcacaaaattaaattta
agcTTACCAAGAGTTTATTGTAAAGCCCATGTGCGTTTTTGCATACATTA
TAGTTGTTtaacatttgaatttcagtattcaacaAAGCTTAAAAGATTGG
AGAGTGGTTTGAAATCAGCAAGGGAGGTTCTGAACCAATGTGACTGGATG
AGCGAAGAAAATGTTGTCAAGCCGTTTGAGGTAAATACGCAAACTATTTT
ACAgttggcgctctctaattcgacgttctactattcgatgcactctatta
ttcgataatattgaaattccCTGTCGACAAAAAACTCTACTATTCGCTAC
GCTCCctttttcgatgaaaatcagATTCCCCCTGAAAATCGAATAAGACA
GCGTCAACTTTACTACGCtttttttttGGTTGGACTGGTTGCATAAttga
atataacttttatgaCAATGGAAGAGGATTCGACTTATTCCTTCAATAGA
TGATACTTTCGTCTGTTAGGTTGATAGTAAACGCAGGAAAGTATAATATG
CGCAAAGTTTACAGCAATCACAGCGGTTTAGTATAGTATAGTTTGGGACA
CTGTAAGCCCCTCCGCCACTGGTAACTCCGCCCTGGGCTTAactccgttt
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TACCCTTAGTGGGACAAAGTCGGTGAAAGAGGGACCCTTTGagag Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1273048..1291342+ >MSTRG.11027.1.p1 ID=MSTRG.11027.1.p1|Name=MSTRG.11027.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5166bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1273048..1291342+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAGGTTGACGGAAGTTATGatatcaatttgctttcttaTTCGTCACCCGC
AACTACTCATTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:1273048..1291342 + |
|
