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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1082955..1087754+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11020.2.p1 ID=MSTRG.11020.2.p1|Name=MSTRG.11020.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1082955..1087754+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaatgatgaaaaagttTATGACTGTAATACTGAAATGGGAAGTTTTATTC
CAACTAAGATTAAGTCCAAAATGGAGAAGGATATTTTAAATGATTCAGTT
CTTAAACCGGAAGCAATTGATGTTGGAAAAGAACCATTAAATGAGTTCAC
CACTGAGTATTTAGCTACATTAGCATTTCCAACACTATTTCCTGATGGAA
AAGGAGACCCCACTAGATTTAGCACGAAACGGTCAATAGCAAAAAGTGAT
ACAGAATCTTTCTCAGCAAAAATTAAACATTTGATTAAATTTGGTGAGTT
TATTGATGGTAAATGGATTTACAGATTTGCGGCCCATCCTCGTTTTGGAT
TTTGGGCCTATAATATGCTATATCGCAGACGACTTTTAGGACAAGGAAGC
TTTTACTTGAAGCAAAATCCAGGAGAAGCTAACTTGACTATTGATGAGTT
ACAAGAAATGATTAGAGCTGGTACTTATAGTAGtgttatgaaaaaacttt
tgagataTGCTAAGAACATTACAGGAACAAATGCTTATTGGAGTCAAGCT
AAAGAGCAGTTAAAAGCTACAATAAACCAAGTTGGCTCACCAacaatttt
ttggactttgtcttGTGCAGAGTTTCACTGGCCAGAGTATCATGCCTTAT
TTTCTACTGATGAGAAGGCTGATTCGAGCACTTTACATGAGAATATAATT
AACAATCCACATTTGATCGATTGGTTCTTTACAGTCagagttgaaaattt
tgttaagCATTGGCTTTATGAGACTCTTGAGGCTGAATGGCATTGGTACA
GATTTGAATACGCTGTTATGCGTGGTTCAATTCATTGCCATGGTGTCGCC
AAGCTTAAAAATGATCCAGGACTATGTAAACTTACACAAAAAGCCTTAGA
AGGTCATCTAGCTGAGAAAAAATTGTCTGAAACTGAtgatgatattgaaa
ataatagAGTACAATTACAGGTTATTGTTAATGAAGGTAAAGCTGCAGCA
CAGCAAGTTTGTGACTATGTTGATACTTTGGTAACTGCTTGTAATCCATG
CACACCTGAGGAAGGCTGGGTAAAACCAAAAGTTCATCCTTGTAAGAGAA
AGCTTGAAGACTtaaatgatgatgattttgataatGATTATGCTGATTTA
GTTAATTGTGTTCAGAGACATACTAAATGTAGCTCAGCTTACTGTTTACG
TAAGAAAAATGACGGTGAACAATATTGCCGGTTTAAATTTCCGTTTGAAG
ACTGTGATAAAACTTATATTGACTTTGAAGAAGTAACTTCTAAGAAATAC
GGTAAGCAATTTAGACCCAAGATTGTCTTGAAGAGAAATGATTCAAGAGT
TAATAGACATCAGCGGCTGCAATTGCAATCATGGAGAGCTAATTGTGATA
TACAGCCAATTATAGATTATAATGCATGtttagaatatctcgcaaagtAT
GCTTCGAAAGCTGAAAAGATTTCTGATGTTGCTAGAGATGCATTTGTCTC
GGTAGTTGAAAATCTGAAGGGAACGGAACAAATGAGATCAGTTATGCAAA
AATTGATTATAAAAGCTGTCGGTGAAAGAGATTTTAGTGTACAAGAGGTA
ATGCACCATATATTGTCACTGAAAAGTTCATCATTTCAAGTATTCAATGT
CTCTGTTGACGGTTCAAGAAAGATTGAAATTAGCAATGAAGAAATTGTCA
CTGAAGCATCTACTGTAGACAATTATGCTAACAGAGAAAATCTTCAAGGT
TGTGATAGAACTATTTTGGAAAGtaattttgttcaatttgtaTCAGACTA
CACAGTGACAAAAGaagttataaaaaaaagaaAAAAGCCTGTAATTGTTA
GAGCATTCCCAAGTCCGCCAGCAAATCCAAAAGGACCTAATTATGGTGCT
TTTTGCAAATATCAATTGCTTAAATATAAGCCATGGAGGTCCAGGACAAG
TGACGCTTGGGATAATTTAGATGGCGAAGATTCTGAAATGTTTTGCCTGA
AATGGAATGAGTTTTTGCAAAGTGAACAAGGTCAAAAACTTGTTCCGAAC
TGGAGAAGAGAATTTCATAATGCAGAACTGTATTTTGAAAGATCAGAACA
TGATGATTATGAGGAAAATGTCGAAGGTGAACGAGAAGAGTGGATGCATT
TGGCTGACTTATGTGCTAATGATAATGATTCAGTTAATGAGTGTTAATAA
CATACAATATTGGCAGAATTTTAGACAAAATTATACTGAAGAACAAATTG
GCAATATGGTTTCTTGGCTTGATAAGAAAAAAGCAGAAGTGTctgaaagt
tttgatttatgcTTTGAACTTAATGTTGAATCACTCAATGAGGCTCAAAG
AAGGGCATTTGACATTGTACTTGATCATGAGAAAAATCCACATGAACAAT
TATTGATGATGATAACTGGATTAGCCGGAAGTGGAAAATCATTTCTAATT
AATAATATTAGGGCATTATTGAAAGAGAAATGTATAGTTTCAGCCTATTT
TGGAATAGCTGCATTCAATGTAAAAGGCAAAACTTTGCATTCATTGTTAA
AGTTACCAATACGAGGTAGAAATCTTAAAGATTTGAAGGGTCCTGCTCTT
TTACAATTACAGGAGAAATTAAATGGTGTTAAATATATCATTATTGATGA
ATACTCTGTTGTCGGCCAGAACTTACTAGGTTGGATTGATAAGCGGTGTC
GTCAAGGCACTGGTGATTCAGATAAACCATTTGGAGGAATCTCAATAATT
TTAGTTGGAGATATTGCTCAGCTACCACCTGTTGGGGATAAAgttctata
tcataaaaaaccTAATGGTGAAATAGGCACTATGGGGTTTTGTATGTATG
GAAAATTTACTAAAGTTGTTAAACTCACTGTTAATGAAAGATCAAAAGGT
GATAATATTGAACAAGAAAAGTTTAGATCTGCTTTATACAGATTAAGAAA
TGGAGATTCAACTGAGGAAGATTGGCAGATGTTTTTATCTAGAACACCTG
CCAACTTAACAGAAGAAGTTGACAAGAAAAGTTTTGTGAAATTgtcattt
tcaaatgaaaaagtagcTTGTGATAATCACGAGGCTTTGATGAGTTTAAA
TGTACCTGTAGCACAAATAAATGCAAGGCATAGTAATAAAGCTTCAGCTA
AGTTATCATCAGACGATATGGGTGGATTAGAACCAAAGATATTTTTGTGT
AAAGGCTCTAGAGTGATGCTTACTAGAAACCTATGGACTGAGAAAGGGCT
TTGCAATGGATCAATGGGTTATGTGAAAGATATAATTTATCAGGAAGGAG
ATTCAACTCCGAATCTACCAATAGCTGTTGTTGTTCAGTTTGATGATTTC
TATACAGGACCAAGTATTTGTGAAGACCAGCCTCGCTGTGTTCCCATTAT
ACCTTTAACTAATGCTTCAGATTTACATGGTTCTTCTCATGAGAGACAGC
AGTTACCTTTGAGATTGTCTTGGGCAATTACTATTCATAAATCGCAAGGA
CTCACCATTAATAAAGCATGGATTGATTTAGGAAATACTGAGAAATTTAT
TGGGTTAGCATATGTAGCAGTATCAAGGGTAAGAGAGCTAAAAGATATGA
TAATTGAGTCAATGACACTAGAACGTTTAAGAGATGTAAAGAATAGAAAG
GACTTTGAATATAGAAAAGCTGAAGAAGAAAAGATCACCGACTTAGCAAG
ATGTTTAAATGAAGGTTTATGAAGTTCAATAATAACCATTGAATAAGCCA
GAATAAGCCTTGAAAGGTAACCCTGtcataaaattacaaaatgtaaaTAT
AGAATAATTTGTACTATTATTTTGTTTCTCTTTTTATAATTTAGGAGATT
TATCTCAATTCAAACACAATTCAACAAAGTAACTAAAGCCAAAAACAAAG
GTaagtttaaaattattttttaatgtttcaatAGTTCTCGAATCACTTTT
ATTCTATACTGAAATTGTATAGGATAATATAATGTCGTCTTTCTACGAAA
ATTACAAATAATCAATTTCGAGAGATTATACATCTATAGTTTTAGAGTGT
TTAAAGCTCAAAATAAAATCTCTCTTAGGCATATACTATTAATACGGTAA
CCCAAttttaaatatgtttttttttctcattcagGTTATTTTCACAACAT
TCAAATCGATCTGAAACAATAATGTATCCATGCAATATTTCAAACCATAT
TTCAAAAACGTTTGGTTGATGTTAAATCCTGTAATTAATGTTGTCCATAA
TATGATCTTGTAAAGGATATGTACTTTTAGAAGTAAATTAAAGTTCGTTA
TTGGCACCTTGCTTCTGATTAAACCTTTCATTGAATATAGTATTGCAGTC
ACGTATGAAATTTATTAACACCCGTTGTCATGTTTTCCTGTTAACGTTCT
GGATCCTGTGTCACCTACGCATGTTATTGAAATAGAGTTTAACAACAATA
TGCATTTGCTGATGTCCAAGATATATTTTCTCAATCTTCCAGTTAAAAAT
TGTGGCTGAATAAAGTATATACATTCTGGCTTAAACATGGATATTATTGC
ATTCCCTGGTTAACatcaaaaatacttacaaattgCTGCTGTTcataaat
ttttgttatttgcTGTTATCATTATATGACGTTGGTTTTTGATTGCAAAT
GGAAGTTGAATTGTGTTAATGGACAATTTTTACTAGTATTTTTGAATCAA
TtgcaattttcatttgttgaATTTGCTAAATATTGCTTACTgtaatttgt
caaaaaaattttaatagataaaatcataaagattttctttttgcaaACTC
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1082955..1087754+ >MSTRG.11020.2.p1 ID=MSTRG.11020.2.p1|Name=MSTRG.11020.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2676bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1082955..1087754+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aatgatgaaaaagttTATGACTGTAATACTGAAATGGGAAGTTTTATTCC
AACTAAGATTAAGTCCAAAATGGAGAAGGATATTTTAAATGATTCAGTTC
TTAAACCGGAAGCAATTGATGTTGGAAAAGAACCATTAAATGAGTTCACC
ACTGAGTATTTAGCTACATTAGCATTTCCAACACTATTTCCTGATGGAAA
AGGAGACCCCACTAGATTTAGCACGAAACGGTCAATAGCAAAAAGTGATA
CAGAATCTTTCTCAGCAAAAATTAAACATTTGATTAAATTTGGTGAGTTT
ATTGATGGTAAATGGATTTACAGATTTGCGGCCCATCCTCGTTTTGGATT
TTGGGCCTATAATATGCTATATCGCAGACGACTTTTAGGACAAGGAAGCT
TTTACTTGAAGCAAAATCCAGGAGAAGCTAACTTGACTATTGATGAGTTA
CAAGAAATGATTAGAGCTGGTACTTATAGTAGtgttatgaaaaaactttt
gagataTGCTAAGAACATTACAGGAACAAATGCTTATTGGAGTCAAGCTA
AAGAGCAGTTAAAAGCTACAATAAACCAAGTTGGCTCACCAacaattttt
tggactttgtcttGTGCAGAGTTTCACTGGCCAGAGTATCATGCCTTATT
TTCTACTGATGAGAAGGCTGATTCGAGCACTTTACATGAGAATATAATTA
ACAATCCACATTTGATCGATTGGTTCTTTACAGTCagagttgaaaatttt
gttaagCATTGGCTTTATGAGACTCTTGAGGCTGAATGGCATTGGTACAG
ATTTGAATACGCTGTTATGCGTGGTTCAATTCATTGCCATGGTGTCGCCA
AGCTTAAAAATGATCCAGGACTATGTAAACTTACACAAAAAGCCTTAGAA
GGTCATCTAGCTGAGAAAAAATTGTCTGAAACTGAtgatgatattgaaaa
taatagAGTACAATTACAGGTTATTGTTAATGAAGGTAAAGCTGCAGCAC
AGCAAGTTTGTGACTATGTTGATACTTTGGTAACTGCTTGTAATCCATGC
ACACCTGAGGAAGGCTGGGTAAAACCAAAAGTTCATCCTTGTAAGAGAAA
GCTTGAAGACTtaaatgatgatgattttgataatGATTATGCTGATTTAG
TTAATTGTGTTCAGAGACATACTAAATGTAGCTCAGCTTACTGTTTACGT
AAGAAAAATGACGGTGAACAATATTGCCGGTTTAAATTTCCGTTTGAAGA
CTGTGATAAAACTTATATTGACTTTGAAGAAGTAACTTCTAAGAAATACG
GAGATTTATCTCAATTCAAACACAATTCAACAAAGTAAaatgatgaaaaa
gttTATGACTGTAATACTGAAATGGGAAGTTTTATTCCAACTAAGATTAA
GTCCAAAATGGAGAAGGATATTTTAAATGATTCAGTTCTTAAACCGGAAG
CAATTGATGTTGGAAAAGAACCATTAAATGAGTTCACCACTGAGTATTTA
GCTACATTAGCATTTCCAACACTATTTCCTGATGGAAAAGGAGACCCCAC
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CAGCAAAAATTAAACATTTGATTAAATTTGGTGAGTTTATTGATGGTAAA
TGGATTTACAGATTTGCGGCCCATCCTCGTTTTGGATTTTGGGCCTATAA
TATGCTATATCGCAGACGACTTTTAGGACAAGGAAGCTTTTACTTGAAGC
AAAATCCAGGAGAAGCTAACTTGACTATTGATGAGTTACAAGAAATGATT
AGAGCTGGTACTTATAGTAGtgttatgaaaaaacttttgagataTGCTAA
GAACATTACAGGAACAAATGCTTATTGGAGTCAAGCTAAAGAGCAGTTAA
AAGCTACAATAAACCAAGTTGGCTCACCAacaattttttggactttgtct
tGTGCAGAGTTTCACTGGCCAGAGTATCATGCCTTATTTTCTACTGATGA
GAAGGCTGATTCGAGCACTTTACATGAGAATATAATTAACAATCCACATT
TGATCGATTGGTTCTTTACAGTCagagttgaaaattttgttaagCATTGG
CTTTATGAGACTCTTGAGGCTGAATGGCATTGGTACAGATTTGAATACGC
TGTTATGCGTGGTTCAATTCATTGCCATGGTGTCGCCAAGCTTAAAAATG
ATCCAGGACTATGTAAACTTACACAAAAAGCCTTAGAAGGTCATCTAGCT
GAGAAAAAATTGTCTGAAACTGAtgatgatattgaaaataatagAGTACA
ATTACAGGTTATTGTTAATGAAGGTAAAGCTGCAGCACAGCAAGTTTGTG
ACTATGTTGATACTTTGGTAACTGCTTGTAATCCATGCACACCTGAGGAA
GGCTGGGTAAAACCAAAAGTTCATCCTTGTAAGAGAAAGCTTGAAGACTt
aaatgatgatgattttgataatGATTATGCTGATTTAGTTAATTGTGTTC
AGAGACATACTAAATGTAGCTCAGCTTACTGTTTACGTAAGAAAAATGAC
GGTGAACAATATTGCCGGTTTAAATTTCCGTTTGAAGACTGTGATAAAAC
TTATATTGACTTTGAAGAAGTAACTTCTAAGAAATACGGAGATTTATCTC
AATTCAAACACAATTCAACAAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:1082955..1087754 + |
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