MSTRG.11018.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11018.1.p2
Unique NameMSTRG.11018.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:1038013..1054234-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11018.1.p2 ID=MSTRG.11018.1.p2|Name=MSTRG.11018.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1038013..1054234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTGCTGGTGAAGGGGTTCTACCACTTTGATTTTGGATACCAGAATACA TATTGCTAGGAAGTGTTTGACTTTTGTGTATTCCCGAACTACCCGGGATA TCAACAAAGTCAAAGGGCCCTTGTCTTCCTGAGGGCCCTTGAAAACACAA GTCCTGATGACTATTATTCTCAGGGTAAGAATCATAGTCCTCATAAAGCC GAGGTAACGGCATACTTGGTGTCTCAGGGAACGCAGCTTCAAATTGTGCA TCTAACTCACCAGTCATTGCCAGTCTCTTGGCATCTACACGAAAGAATTC TTCAGCAATCTGGTAACTTTCACTGGTATAAAATCGACCATGATTAGCTT TGACAATCTCCTTAACTTTCCTTAAAATATGTGTAGCATCTTTGTTAGTT GCTAAATCTTTAGTATTGTCAATACCGATATAACCTTGAGAATATTGATT GATAATTTTCTGGAGCATTGGAGGAGCATTCATCACAAGATCATCCAAAC TTTTCTTCTTTCGTTTTCGTTGGTCATCATGTGTAAAAACCACAAGCAAA TATTCCTTCAAATTCTCACCAAACAGTTTCATAAGAACTTCAAAAACAAA TGCATTCTCGTGTGTAAAACGACCCTCACCAATCACCAAAATCATTGCAT GAATCCCAGGGCTTGTAATTCGGATACACTTCAGAATCTCATTTGCAGTT TGCTTTAAATCTGCATCACCTCTTGTATCCAACAACCCTGGAGTATCGAC AACCAATATTGTACGTCCATCACGTATCGTTTTATCGAAAAGCGATTCTC TCGTTTCTGAGGTGAAACTACAACTTTCTGTGAAAACCTCACGACCCAGC AATGTATTACCAGTACTGCTTTTCCCAGATCCTGTTTTCCCGATCAAAAC AATACGTAATTCATCTTCGATTGTACCCATTACATTATTTTTTCTAAAAG TATTTAAAACAAACTTGATAAAATACATCCCTGTGTCACAGACCCGGTAG ACCCCTCACCCCGGTGGAAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:1038013..1054234-

>MSTRG.11018.1.p2 ID=MSTRG.11018.1.p2|Name=MSTRG.11018.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:1038013..1054234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACCGAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAGTTGGCT
GAGTTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGCAGTGCTGTAGAAAGGTTCTATAT
TGATTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGACATGTAACTAAAAACATCAGTCG
TGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCGAAGTGTTGAAATCCTTCG
TTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTGACGTTATTGGACAGTAAC
TGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACTCATCTCTTTATTGAAACAAAGCTGAA
CGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAACCTCTGTTATCTATTCAA
ACACAATCCGTACAGAGATCGACCCCAATGCGGTGATTATACGAAATAAA
GATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTTATTCAATAACCGGTAAAGG
GAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGCAAGTTTGGAGACCGTATTGAGGAAA
GATTACGCGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATTAAAAGTGATAATCAACGG
AAATACCGGTCAGCTCAAGAAATGAAAATTTCTTTGGACAAAGAATCCAA
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ATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACACCTGTCGATCGTAGCGATCGT
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GCCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATCGAAATCGT
GATAAGAAGACTGTCAGTGATTTGATTGGTCGATGCGAATATAATGTTAT
CGTTTAAATGGTGCTTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTTTGATACAC
AGCACAGAAGCAAAACTACATTGTAACTGTCAAGCGAAACGTTGTGTGAA
ACCAACAAATTGTAAAGCTGGGACACACAAAGACGCCTGTGGCTGCTGTG
ATATGTCCTACTGAGGAAAGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATCACCATA
CATCAAACTACTTATACCTGGTATCGAATTTGATAACGCCAAGCGTACTG
GATTCCTTGTCCGCTGCAAGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGATCCTAAC
AACAAAGCTATGTGTTTACCACAATGCAATTCGAATAAAAACAATAATGG
TGACCGAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAGTTGG
CTGAGTTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGCAGTGCTGTAGAAAGGTTCTAT
ATTGATTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGACATGTAACTAAAAACATCAGT
CGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCGAAGTGTTGAAATCCTT
CGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTGACGTTATTGGACAGTA
ACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACTCATCTCTTTATTGAAACAAAGCTG
AACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAACCTCTGTTATCTATTC
AAACACAATCCGTACAGAGATCGACCCCAATGCGGTGATTATACGAAATA
AAGATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTTATTCAATAACCGGTAAA
GGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGCAAGTTTGGAGACCGTATTGAGGA
AAGATTACGCGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATTAAAAGTGATAATCAAC
GGAAATACCGGTCAGCTCAAGAAATGAAAATTTCTTTGGACAAAGAATCC
AAATACATTGTTGAATTGAAAGCGAAAGCCTTAAAAGTACCTGCTCAAGC
ACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACACCTGTCGATCGTAGCGATC
GTTGGATGAGATACACGTTGATTAGAGATGGTTCCATGTCATTACCAATC
TTGTCCATTCGGACAGCTATGTACTATGGTTAAAAATCTCCCGACATGCA
CTTGTCCGAAATGCAAAGACATGATTATGTCACCGGTATGTGGCGAGTTG
AACGGTGTTACATATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAAGCTGAATGTTT
ACAAGGCAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAAAGGTATGTGCC
AAAGAAGAGGGTGAATTATGTGGTGGTGAAGAATATAACCAAGGAGAGTG
TGGCCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATCGAAATC
GTGATAAGAAGACTGTCAGTGATTTGATTGGTCGATGCGAATATAATGTT
ATCGTTTAAATGGTGCTTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTTTGATAC
ACAGCACAGAAGCAAAACTACATTGTAACTGTCAAGCGAAACGTTGTGTG
AAACCAACAAATTGTAAAGCTGGGACACACAAAGACGCCTGTGGCTGCTG
TGATATGTCCTACTGAGGAAAGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATCACCA
TACATCAAACTACTTATACCTGGTATCGAATTTGATAACGCCAAGCGTAC
TGGATTCCTTGTCCGCTGCAAGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGATCCTA
ACAACAAAGCTATGTGTTTACCACAATGCAATTCGAATAAAAACAATAAT
GGTGACCGAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAGTT
GGCTGAGTTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGCAGTGCTGTAGAAAGGTTCT
ATATTGATTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGACATGTAACTAAAAACATCA
GTCGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCGAAGTGTTGAAATCC
TTCGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTGACGTTATTGGACAG
TAACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACTCATCTCTTTATTGAAACAAAGC
TGAACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAACCTCTGTTATCTAT
TCAAACACAATCCGTACAGAGATCGACCCCAATGCGGTGATTATACGAAA
TAAAGATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTTATTCAATAACCGGTA
AAGGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGCAAGTTTGGAGACCGTATTGAG
GAAAGATTACGCGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATTAAAAGTGATAATCA
ACGGAAATACCGGTCAGCTCAAGAAATGAAAATTTCTTTGGACAAAGAAT
CCAAATACATTGTTGAATTGAAAGCGAAAGCCTTAAAAGTACCTGCTCAA
GCACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACACCTGTCGATCGTAGCGA
TCGTTGGATGAGATACACGTTGATTAGAGATGGTTCCATGTCATTACCAA
TCTTGTCCATTCGGACAGCTATGTACTATGGTTAAAAATCTCCCGACATG
CACTTGTCCGAAATGCAAAGACATGATTATGTCACCGGTATGTGGCGAGT
TGAACGGTGTTACATATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAAGCTGAATGT
TTACAAGGCAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAAAGGTATGTG
CCAAAGAAGAGGGTGAATTATGTGGTGGTGAAGAATATAACCAAGGAGAG
TGTGGCCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATCGAAA
TCGTGATAAGAAGACTGTCAGTGATTTGATTGGTCGATGCGAATATAATG
TTATCGTTTAAATGGTGCTTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTTTGAT
ACACAGCACAGAAGCAAAACTACATTGTAACTGTCAAGCGAAACGTTGTG
TGAAACCAACAAATTGTAAAGCTGGGACACACAAAGACGCCTGTGGCTGC
TGTGATATGTCCTACTGAGGAAAGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATCAC
CATACATCAAACTACTTATACCTGGTATCGAATTTGATAACGCCAAGCGT
ACTGGATTCCTTGTCCGCTGCAAGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGATCC
TAACAACAAAGCTATGTGTTTACCACAATGCAATTCGAATAAAAACAATA
ATGGTGACCGAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAG
TTGGCTGAGTTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGCAGTGCTGTAGAAAGGTT
CTATATTGATTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGACATGTAACTAAAAACAT
CAGTCGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCGAAGTGTTGAAAT
CCTTCGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTGACGTTATTGGAC
AGTAACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACTCATCTCTTTATTGAAACAAA
GCTGAACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAACCTCTGTTATCT
ATTCAAACACAATCCGTACAGAGATCGACCCCAATGCGGTGATTATACGA
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TAAAGGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGCAAGTTTGGAGACCGTATTG
AGGAAAGATTACGCGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATTAAAAGTGATAAT
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ATCCAAATACATTGTTGAATTGAAAGCGAAAGCCTTAAAAGTACCTGCTC
AAGCACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACACCTGTCGATCGTAGC
GATCGTTGGATGAGATACACGTTGATTAGAGATGGTTCCATGTCATTACC
AATCTTGTCCATTCGGACAGCTATGTACTATGGTTAAAAATCTCCCGACA
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GTTGAACGGTGTTACATATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAAGCTGAAT
GTTTACAAGGCAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAAAGGTATG
TGCCAAAGAAGAGGGTGAATTATGTGGTGGTGAAGAATATAACCAAGGAG
AGTGTGGCCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATCGA
AATCGTGATAAGAAGACTGTCAGTGATTTGATTGGTCGATGCGAATATAA
TGTTATCGTTTAAATGGTGCTTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTTTG
ATACACAGCACAGAAGCAAAACTACATTGTAACTGTCAAGCGAAACGTTG
TGTGAAACCAACAAATTGTAAAGCTGGGACACACAAAGACGCCTGTGGCT
GCTGTGATATGTCCTACTGAGGAAAGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATC
ACCATACATCAAACTACTTATACCTGGTATCGAATTTGATAACGCCAAGC
GTACTGGATTCCTTGTCCGCTGCAAGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGAT
CCTAACAACAAAGCTATGTGTTTACCACAATGCAATTCGAATAAAAACAA
TAATGGTGACCGAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTG
AGTTGGCTGAGTTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGCAGTGCTGTAGAAAGG
TTCTATATTGATTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGACATGTAACTAAAAAC
ATCAGTCGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCGAAGTGTTGAA
ATCCTTCGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTGACGTTATTGG
ACAGTAACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACTCATCTCTTTATTGAAACA
AAGCTGAACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAACCTCTGTTAT
CTATTCAAACACAATCCGTACAGAGATCGACCCCAATGCGGTGATTATAC
GAAATAAAGATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTTATTCAATAACC
GGTAAAGGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGCAAGTTTGGAGACCGTAT
TGAGGAAAGATTACGCGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATTAAAAGTGATA
ATCAACGGAAATACCGGTCAGCTCAAGAAATGAAAATTTCTTTGGACAAA
GAATCCAAATACATTGTTGAATTGAAAGCGAAAGCCTTAAAAGTACCTGC
TCAAGCACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACACCTGTCGATCGTA
GCGATCGTTGGATGAGATACACGTTGATTAGAGATGGTTCCATGTCATTA
CCAATCTTGTCCATTCGGACAGCTATGTACTATGGTTAAAAATCTCCCGA
CATGCACTTGTCCGAAATGCAAAGACATGATTATGTCACCGGTATGTGGC
GAGTTGAACGGTGTTACATATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAAGCTGA
ATGTTTACAAGGCAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAAAGGTA
TGTGCCAAAGAAGAGGGTGAATTATGTGGTGGTGAAGAATATAACCAAGG
AGAGTGTGGCCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATC
GAAATCGTGATAAGAAGACTGTCAGTGATTTGATTGGTCGATGCGAATAT
AATGTTATCGTTTAAATGGTGCTTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTT
TGATACACAGCACAGAAGCAAAACTACATTGTAACTGTCAAGCGAAACGT
TGTGTGAAACCAACAAATTGTAAAGCTGGGACACACAAAGACGCCTGTGG
CTGCTGTGAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11018MSTRG.11018Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11018.1.p2MSTRG.11018.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11018.1.p2.exon6MSTRG.11018.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11018.1.p2.exon5MSTRG.11018.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11018.1.p2.exon4MSTRG.11018.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11018.1.p2.exon3MSTRG.11018.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11018.1.p2.exon2MSTRG.11018.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11018.1.p2.exon1MSTRG.11018.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:1038013..1054234 -