MSTRG.10975.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10975.4.p1
Unique NameMSTRG.10975.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:470106..487215-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10975.4.p1 ID=MSTRG.10975.4.p1|Name=MSTRG.10975.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:470106..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:470106..487215-

>MSTRG.10975.4.p1 ID=MSTRG.10975.4.p1|Name=MSTRG.10975.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:470106..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAAGTGTAATTCGCAGAATG
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GCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGAAACGAAAATTGAGA
TCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAACCGAAAATGGGAAAA
CAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACATGCTATCTTGAGTAGAAC
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CGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTACGACAACGTAATAA
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CTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTATACTTTAGAACATC
GGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTGTACCAAACTCTACT
ATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGATAATGGAACCATGAG
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CTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAGGGAGAAGAAAACTAGAC
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GATAAACTACACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGA
ATTCATACACAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATT
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AGTAGCTGATCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCT
ATCAATCTAATTATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATT
GATACTTACAATGAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATA
CCAATGCTACAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGC
AGATTCTTGGTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAA
AAATCGATTGACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTT
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GTAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCAGA
TACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAG
AAACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAA
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TATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTTCA
ATTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGGCG
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TAATATGGATATTTTTACAAATAACAATCGAGAAGCTTCGGCGCAATCGA
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TTTTTTTGTAAAGGGAGAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGT
CGACGGTTTATTGGATTGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGA
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GTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGCTGCATGTGGGAACAATC
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TTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGAAACGAAAATTGAGATCGAA
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AAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCATGTTATGGCGCAGGACTTAT
CAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTATACTTTAGAACATCGGGAT
ATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTGTACCAAACTCTACTATTCC
TAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGATAATGGAACCATGAGACTGT
ATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAATTAAACCAAATGAAGCTCGA
GATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAGGGAGAAGAAAACTAGACGAACG
TCATTTCACTGATGTCGACGGTTTATTGGATTGGCCATATGTTGAATCTG
GTGATGCTAAGATGACTTTACAACGTATGCGATCTAATACTTTATGATAA
ACTACACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGAATTCA
TACACAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCT
ACTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGCTG
CATGTGGGAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATCGAAAC
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TTGTTGCCAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTTAGTAG
CTGATCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCTATCAA
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GCTACAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGCAGATT
CTTGGTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAAAAATC
GATTGACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTTTACAA
ATAACAATCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975MSTRG.10975Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.4.p1MSTRG.10975.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.4.p1.exon5MSTRG.10975.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.4.p1.exon4MSTRG.10975.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.4.p1.exon3MSTRG.10975.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.4.p1.exon2MSTRG.10975.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.4.p1.exon1MSTRG.10975.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:470106..487215 -