MSTRG.10975.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10975.1.p1
Unique NameMSTRG.10975.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10975.1.p1 ID=MSTRG.10975.1.p1|Name=MSTRG.10975.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTTTTCTTACTTCACTCGTAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAAC ACAGAAGTGTAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAA ACACCAGATACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACA ACCGAAAGAAACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAG AAATGAAACCGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAA AAACATGCTATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGA AAGTTTCAATTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCG TAAAGGCGAAGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATC GCTTTGAAAGAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGT GGAAAGTTACGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATT GTTGTAAAAGTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGAT CAAGACCATGTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTT TGAAAATTATACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTC CTTTCGTTGTACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCA CTAATTGATAATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAAT TAAGCCAATTAAACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTT GTAAAGGGAGAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGT TTATTGGATTGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACA ACGTATGCGATCTAATACTTTATGATACACGTTTTTTATAAGAACATCAC AAAATTTTTGAAGTCTTTGGTTATTCTTGATTTTTTGATTTAATAATATT CTTATTTTCACCATTTTGTAGTGAGTATTTTCCAAAGAAATCCAAAGAAA TCGGATGTTTCAGAGTCAGCAAAATCTTTACTCGTTCTTAACTTGTTCTT AATATTTTGGCCATCAAAGCCATATGTTCTTATATTGTTTGTTCTTATAA AAAAACGTGTAAGTTGTGATAATCCACCCATTTGGTGTCATATACTCTTA AAGGAGATTACCAGACAGATTTGTGAACAATTGAATGAAAGAAATGTGGA AATAGAGGGATGGAGGTGAGTAAGAGGTCAATTCTTACTTATCCAAAATC TTATATTAATTTTTTGGTATATCTTGAAAGGAGGCAGTTGCCTCTTTTTT GTGACTGAGAATTCAAGTCAACACTTGCTATGTTTGTTTGATAGGGGATA GTGATACAGTGATAACATTGGTAAAAGAATGACACTGTCATATCAAATTT GATATACGATTCAAGTCAATTTTGATAGAGAATTGGACAAAGGTTTGAAA GAATTACAATCAAATTATCCAATTGTCTAACCCCTTGCGATTTTTAATAT GATATTAGAGTAATATAACTAGATGAAAGTTTAAGCTATGTATGCTTTAC TTTTAATTTGATATGGATTTTTAGACTAGTTTTGACTGTAGGCTACTGGC ATCCACTAACGGATTCGTACTCCTTCTACTATACTATCTGTGGTTTCGTA GGGGTCTGTGATTCAGACAAGACTTGCTCCTTTTTCTTTTTTCAGAGATT GTTTGTTGAAACACATTTTTTTCTTCAAATCAACGGAATACTCAAGCATT GACCCATCTCAGTTCATGCAGTGTTTGAAGTATTGAAGTTTACAGAAACT GTTTACAAGTCACTATTTTCCGTTTTCCTTGCATTTCTATCAAGTCTTTT ACTCACTTAAGCGGTATCTTAATTTCCATTCCCAATATTTTCTTAATTTA AGACTTATAGATCGATCAAAGATGACTGACCAGAGCAAAGAGGGAGCTGA AAACTACAGATTGACAAGTTCTAAAATACAACAACACTATTTTGACATGC TTATCAATACTATTGATATCCAGCCTGGATGGAAAGTTTTAGATCTAGGT TGTGGAACTGGCAATGGAACAAAGAAGCTATGTGAACGAGTTGGTGCTTC TGGACATGTCATTGGCATAGATCCTATTGCAGAGAGAATCGTTCAGGCGA AAGAGTACTATGCAGCAGGTAATATTAAATATCACACAGCATACGGTCGA GATGCGTGCACTTTCGGTGAAGGCATTTTCGATCTTGTAGTCGCAGGTAC AGTCATGCATTGGCTGTCCCCTGAAGAGAAACAAAAAACATTGGAAAGTG TGTACAAAGCCTTAAAACCTGGTGGAATCTTTCTCTTCAATAACATGTTG AAATATGACAGTGCAAACACCTTGAAATTTCTCGATTTCTTTAAAGATCA AAGCGTCAAAGAAAAGCTCTTCGCTGCTGTTTTCTGCCCAGATAAAAGAA CTTTTTATGATCTGGCACAGAAAACAGGATTCAGCAGAACGACAATTGAT GAAGTTTCAGTCCAAGTTCCATTTGATTCACTTGAACATGCAATTCATTG GTTTTCAGCTTCTCTACATGCTATTGGATTTCATACAGCTCTGGACGAAT TACGTCAAGTTACCAGCGACGAAAATAATAATTTGGATTTTCTTTTCAAT GAAAAAGGAGAACCTTATTTTGATAATAAATATCATTTTGTAACTAGTCA CAAGTAATTTTTCGGCGATAAATAGTGAATCTATTATATGATTGATTTTA AATCATTTTCGTAATAGCAGAAAAGATATCTTTCAAATAATTAAGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215-

>MSTRG.10975.1.p1 ID=MSTRG.10975.1.p1|Name=MSTRG.10975.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7515bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:468218..487215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTTATAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAAGTGTAATTC
GCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCAGATACTCTT
ACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGAAACGAA
AATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAACCGAAAA
TGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACATGCTATCTTG
AGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTTCAATTCGTT
CCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGGCGAAGAGGA
GGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTGAAAGAATTG
AGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTACGACAA
CGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTAAAAGTGAAA
TTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCATGTTATG
GCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTATACTTT
AGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTGTACCAA
ACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGATAATGGA
ACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAATTAAACC
AAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAGGGAGAAGAA
AACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGTTTATTGGATTGGCCA
TATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACAACTAGTAAACTACAC
GTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGAATTCATACACAA
CACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTACTGGTT
GGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGCTGCATGTGG
GAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATCGAAACGTATCCA
CTCCATTTCACGGACCCTTAACAGTACAATGGTCATTAAATCCTTGTTGC
CAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTTAGTAGCTGATCT
TTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCTATCAATCTAATT
ATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATTGATACTTACAAT
GAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATACCAATGCTACAA
GAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGCAGATTCTTGGTG
AAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAAAAATCGATTGAC
CATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTTTACAAATAACAA
TCGACTTATAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAAGTGTAA
TTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCAGATACT
CTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGAAAC
GAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAACCGA
AAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACATGCTATC
TTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTTCAATTC
GTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGGCGAAGA
GGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTGAAAGAA
TTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTACGA
CAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTAAAAGTG
AAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCATGTT
ATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTATAC
TTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTGTAC
CAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGATAAT
GGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAATTAA
ACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAGGGAGAA
GAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGTTTATTGGATTGG
CCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACAACTAGTAAACTA
CACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGAATTCATACA
CAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTACTG
GTTGGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGCTGCATG
TGGGAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATCGAAACGTAT
CCACTCCATTTCACGGACCCTTAACAGTACAATGGTCATTAAATCCTTGT
TGCCAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTTAGTAGCTGA
TCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCTATCAATCTA
ATTATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATTGATACTTAC
AATGAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATACCAATGCTA
CAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGCAGATTCTTG
GTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAAAAATCGATT
GACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTTTACAAATAA
CAATCGACTTATAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAAGTG
TAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCAGAT
ACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAAAGA
AACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGAAAC
CGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACATGCT
ATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTTCAA
TTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGGCGA
AGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTGAAA
GAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAGTTA
CGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTAAAA
GTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGACCAT
GTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAATTA
TACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCGTTG
TACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATTGAT
AATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCCAAT
TAAACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAGGGA
GAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGTTTATTGGAT
TGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACAACTAGTAAA
CTACACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGAATTCAT
ACACAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATTCCTCTA
CTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGCTGC
ATGTGGGAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATCGAAACG
TATCCACTCCATTTCACGGACCCTTAACAGTACAATGGTCATTAAATCCT
TGTTGCCAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTTAGTAGC
TGATCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCTATCAAT
CTAATTATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATTGATACT
TACAATGAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATACCAATG
CTACAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGCAGATTC
TTGGTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAAAAATCG
ATTGACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTTTACAAA
TAACAATCGACTTATAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACAGAA
GTGTAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACACCA
GATACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACCGAA
AGAAACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAATGA
AACCGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAACAT
GCTATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAGTTT
CAATTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAAAGG
CGAAGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCTTTG
AAAGAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGAAAG
TTACGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTTGTA
AAAGTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAAGAC
CATGTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGAAAA
TTATACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTTTCG
TTGTACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTAATT
GATAATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAAGCC
AATTAAACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTAAAG
GGAGAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGTTTATTG
GATTGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACAACTAGT
AAACTACACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGAATT
CATACACAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATTCCT
CTACTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAAAGC
TGCATGTGGGAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATCGAA
ACGTATCCACTCCATTTCACGGACCCTTAACAGTACAATGGTCATTAAAT
CCTTGTTGCCAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTTAGT
AGCTGATCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCTATC
AATCTAATTATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATTGAT
ACTTACAATGAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATACCA
ATGCTACAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGCAGA
TTCTTGGTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAAAAA
TCGATTGACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTTTAC
AAATAACAATCGACTTATAGAGAAGCTTCGGCGCAATCGAAAAGAACACA
GAAGTGTAATTCGCAGAATGCAAAGCAGTCCTACTACATCTGAACAAACA
CCAGATACTCTTACCGTTCCGCATTTTACCTCATCCATCAAAAAACAACC
GAAAGAAACGAAAATTGAGATCGAATTAAACAAATTTGGAAATCAAGAAA
TGAAACCGAAAATGGGAAAACAAATGTTAACTGTCCCTTCAGATAAAAAA
CATGCTATCTTGAGTAGAACACCAAATCGTCGATTAACCTCTAGCGAAAG
TTTCAATTCGTTCCATTCATCTAGGAATACTAACCTTAGGGCGGCCGTAA
AGGCGAAGAGGAGGATTACCTACCCTCAGGTTATTTGTGAATCGATCGCT
TTGAAAGAATTGAGTAAATACGTCAATTTGGTGTGTACTCCTTTAGTGGA
AAGTTACGACAACGTAATAACAAAAAGTTCGGAATGTGAATTAGATTGTT
GTAAAAGTGAAATTAACCAGTCTTCAAAGCTTACTGGAACCTTTGATCAA
GACCATGTTATGGCGCAGGACTTATCAGTTGACCTTGACACCACCTTTGA
AAATTATACTTTAGAACATCGGGATATCATACAAGAAAACGATACTCCTT
TCGTTGTACCAAACTCTACTATTCCTAAAACTTGTGCAATTAAATCACTA
ATTGATAATGGAACCATGAGACTGTATAAACCAAATCAATTTCTAATTAA
GCCAATTAAACCAAATGAAGCTCGAGATATGGAATTTGGTTTTTTTTGTA
AAGGGAGAAGAAAACTAGACGAACGTCATTTCACTGATGTCGACGGTTTA
TTGGATTGGCCATATGTTGAATCTGGTGATGCTAAGATGACTTTACAACT
AGTAAACTACACGTCAGGAGATGGGAATACGACACTTGACTACACTGAGA
ATTCATACACAACACAAACGTACATCAGAATGTCCATATTCTTGCCCATT
CCTCTACTGGTTGGATTTTTGTCTCTTCTTATTCGATATCTGAGAAAGAA
AGCTGCATGTGGGAACAATCAATGTCTGCAATCACCCCTAAACCAACATC
GAAACGTATCCACTCCATTTCACGGACCCTTAACAGTACAATGGTCATTA
AATCCTTGTTGCCAAGTGTTACATTTCATGGTCTTACAACATGATAGCTT
AGTAGCTGATCTTTCCAATCCAGCAGGAAATGTAGCGTCCTTGATTCTCT
ATCAATCTAATTATACGCTCATCTTTGGAATGATTCCACATTTTACAATT
GATACTTACAATGAAAACCAGTTTCAAATCAATGCAATGTTTGATCCATA
CCAATGCTACAAGAGAAACTCATCTGAATTCACCAGTACGGATGATGAGC
AGATTCTTGGTGAAGAATATAATCTGAATGTGACTTTACTGTTCGATGAA
AAATCGATTGACCATACATCAAGTATTTGTGTGTATAATATGGATATTTT
TACAAATAACAATCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975MSTRG.10975Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.1.p1MSTRG.10975.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10975.1.p1.exon6MSTRG.10975.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p1.exon5MSTRG.10975.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p1.exon4MSTRG.10975.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p1.exon3MSTRG.10975.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p1.exon2MSTRG.10975.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10975.1.p1.exon1MSTRG.10975.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:468218..487215 -