MSTRG.10974.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10974.4.p1
Unique NameMSTRG.10974.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:403442..438963-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10974.4.p1 ID=MSTRG.10974.4.p1|Name=MSTRG.10974.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=35522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:403442..438963- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGATATGATGTGTTTGTTACAACAAATATTATATAGATTTCTATATATT TTTACATATTTTTTCTTCTTTCTCAGACTTGAAAATGAAACACAGTTTTC GAAATATATTGTCAAATCAAATTAAATTGTTGGCTACAGATTTATATAAA AAGAAGAAACCCGATTAAAGTTTCCTGGTCGCTCATGTTTAAAAGAAAAT CCGTTACGAAATCCAAATCTTCTTAATGAAAGTTTGTGACAAAACAGCCA TGGCGTATAGGCGTGTTCCTCTCACATGTCACAGCAGTCGCCACAGGCAA AGGTACATTAACTTGCCAAATGAATTGCGGCGCTAAGTTAAAATGGGAGT GGAGAACGACAACCACTACACTATCATACCACTCAATTATTCGATTTTTC TTTCATTATTATTTCTTTGTAGGTTAAATACCCTTACCTCTATTGTCAGT TGATGTTGAGTGGTGAAAAGTACAGCACACCGTTCCAGATACGCGCTCGA TACACGTTCCATGTACAATTCCAAGCCAATGATGATCCATATCTAGATAG ACGCTGGTCAAAATTCTCTAATAACCCGTTCGAAATGATAGTTCCGGAAA AATCAAGTGAGTGGGTTATTTACTACTTTTAAGGTCTACTTGGCTACACA ATATTTATCGCCGGTGAACAATATTTAACAATAGCGAGTTTATGTATCGG GGGATATCAAGGGCCACGGTAAGTGAATTCGACTCAAAACAAAGTCAATA CTTGGTGTAAGGCTCTATATCGCCTTTGCTCACCTACACAGAAGACGGTA TTTTGGTGTTTTTACCGTGGTCGAGCAACATATCAACTTTCCTTTATACC GTTTTCTTCGATTTATCTCGAATACATAAACTCGCTATTATAGTTTTTGG ACCGTAGAATGTGTGGTTTATCACGAGTAGGAATTTACTTTCTGAGAATT 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ACCTAGATTCGGCCAATTTTCAGCTTCGGCCTTATTTAATCGACAAAGTA CGCAAGCACTCTCTTTTGAGACCGAAATATAAATCGCTTAGGGATCGACC AGACGGTAAACCAGAAACATAAAAAATAAAACAACAATTTGCAGCCTCGA TATCCAGAGTCTACATATTTTATAAATTTTTTAAAAAATTTATTCGGATA GCTAAATGGTGATTATATCCATCTAAAGATGAAATTAAAATACATTCTGA GAAGTGGAATTAGGGGCTGAAGGATGTATTATTTATTCTACGGTTTATCC CCGTCGATTTATTACACCTTGGACGCGGGTACACGTTTTTTTATATAACA AACGTAGAACAAACTATATAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:403442..438963-

>MSTRG.10974.4.p1 ID=MSTRG.10974.4.p1|Name=MSTRG.10974.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2055bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:403442..438963- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTCACCTCGAGGTGCTGTTACTCAAGTATCCAATGAAACTCTCGACTC
AGTACCCTAAACGACGTCATATTGAAGAAGGTTTGGAGCAAAATGAAATG
CGTCTGATGGCCCAGATGATCAGACAGGGATGTATGTTGGAATACCAGTT
GGTGCCATTGCGTTTCTTGTCGTCGTTGCAATTATTGGTATCTATATTAG
GTTAAATACCCTTACCTCTATTGTCAGTTGATGTTGAGTGGTGAAAAGTA
CAGCACACCGTTCCAGATACGCGCTCGATACACGTTCCATGTACAATTCC
AAGCCAATGATGATCCATATCTAGATAGACGCTGGTCAAAATTCTCTAAT
AACCCGTTCGAAATGATAGTTCCGGAAAAATCAAATGTCACAGCAGTCGC
CACAGGCAAAGGTGTCACCTCGAGGTGCTGTTACTCAAGTATCCAATGAA
ACTCTCGACTCAGTACCCTAAACGACGTCATATTGAAGAAGGTTTGGAGC
AAAATGAAATGCGTCTGATGGCCCAGATGATCAGACAGGGATGTATGTTG
GAATACCAGTTGGTGCCATTGCGTTTCTTGTCGTCGTTGCAATTATTGGT
ATCTATATTAGGTTAAATACCCTTACCTCTATTGTCAGTTGATGTTGAGT
GGTGAAAAGTACAGCACACCGTTCCAGATACGCGCTCGATACACGTTCCA
TGTACAATTCCAAGCCAATGATGATCCATATCTAGATAGACGCTGGTCAA
AATTCTCTAATAACCCGTTCGAAATGATAGTTCCGGAAAAATCAAATGTC
ACAGCAGTCGCCACAGGCAAAGGTGTCACCTCGAGGTGCTGTTACTCAAG
TATCCAATGAAACTCTCGACTCAGTACCCTAAACGACGTCATATTGAAGA
AGGTTTGGAGCAAAATGAAATGCGTCTGATGGCCCAGATGATCAGACAGG
GATGTATGTTGGAATACCAGTTGGTGCCATTGCGTTTCTTGTCGTCGTTG
CAATTATTGGTATCTATATTAGGTTAAATACCCTTACCTCTATTGTCAGT
TGATGTTGAGTGGTGAAAAGTACAGCACACCGTTCCAGATACGCGCTCGA
TACACGTTCCATGTACAATTCCAAGCCAATGATGATCCATATCTAGATAG
ACGCTGGTCAAAATTCTCTAATAACCCGTTCGAAATGATAGTTCCGGAAA
AATCAAATGTCACAGCAGTCGCCACAGGCAAAGGTGTCACCTCGAGGTGC
TGTTACTCAAGTATCCAATGAAACTCTCGACTCAGTACCCTAAACGACGT
CATATTGAAGAAGGTTTGGAGCAAAATGAAATGCGTCTGATGGCCCAGAT
GATCAGACAGGGATGTATGTTGGAATACCAGTTGGTGCCATTGCGTTTCT
TGTCGTCGTTGCAATTATTGGTATCTATATTAGGTTAAATACCCTTACCT
CTATTGTCAGTTGATGTTGAGTGGTGAAAAGTACAGCACACCGTTCCAGA
TACGCGCTCGATACACGTTCCATGTACAATTCCAAGCCAATGATGATCCA
TATCTAGATAGACGCTGGTCAAAATTCTCTAATAACCCGTTCGAAATGAT
AGTTCCGGAAAAATCAAATGTCACAGCAGTCGCCACAGGCAAAGGTGTCA
CCTCGAGGTGCTGTTACTCAAGTATCCAATGAAACTCTCGACTCAGTACC
CTAAACGACGTCATATTGAAGAAGGTTTGGAGCAAAATGAAATGCGTCTG
ATGGCCCAGATGATCAGACAGGGATGTATGTTGGAATACCAGTTGGTGCC
ATTGCGTTTCTTGTCGTCGTTGCAATTATTGGTATCTATATTAGGTTAAA
TACCCTTACCTCTATTGTCAGTTGATGTTGAGTGGTGAAAAGTACAGCAC
ACCGTTCCAGATACGCGCTCGATACACGTTCCATGTACAATTCCAAGCCA
ATGATGATCCATATCTAGATAGACGCTGGTCAAAATTCTCTAATAACCCG
TTCGAAATGATAGTTCCGGAAAAATCAAATGTCACAGCAGTCGCCACAGG
CAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974MSTRG.10974Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974.4.p1MSTRG.10974.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10974.4.p1.exon5MSTRG.10974.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.4.p1.exon4MSTRG.10974.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.4.p1.exon3MSTRG.10974.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.4.p1.exon2MSTRG.10974.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10974.4.p1.exon1MSTRG.10974.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:403442..438963 -