MSTRG.15028 (gene) -

Overview
NameMSTRG.15028
Unique NameMSTRG.15028
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15028 ID=MSTRG.15028|Name=MSTRG.15028|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11495bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15028.1.p1MSTRG.15028.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
MSTRG.15028.1.p2MSTRG.15028.1.p2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:30812..42306 +