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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15028.1.p1 ID=MSTRG.15028.1.p1|Name=MSTRG.15028.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11495bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttttatagaagaatcatgctgatttgtgagtaaaataaatagaaacatt
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CACAATGAATGCAAGggaaaaaacaacaatgttCAAAAGGGCCATTCCAG
AGAAAGGATACGTAATGTCACTCTGATTTTTGACTAGATGCTAGTAGGGA
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TCATTCAAATCTTGCTTTAGCTAGGTGATAAATGTTCTTTTGCATCAGTT
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GGTTCGAGTGAAAAGGTTTTGTTTCAACAACATCACGAGTGTGGTAGTTT
GAATGAGATAATATCAATGAAGAACcacaaatttgaattttgaagaatta
TTATTGTAGTTGTAGATGTAATCTACATCAAGTATCATTTGCTGCTTGCA
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TTTCTAACAACTTTCAGGAGGCTTCCAATTATTACTTTCCAACCCACCCT
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TTTTTCGAGGGTGGGGTTGAAGACTTTTTTCGAGGGTGGGGTTGAAGact
ttttccttcaatttttaccaaaaaggatactaattttagatttaaagtAT
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ATGTCACACTCATTCGGAGTTAtgattataatttttatttctttcagaAT
TACTAGGTTTTAATAATGGTGttgcatttcaattttttatttcttttctg
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AAAATCGAGGACTCACCAACAAACTCGTACAGAGGGAATTCAATTCAATA
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ATTGAAAAAGCAGCAATCAAGCCGACAGATACAGTTCTTGAAGTTGGTCC
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CAAGGTACACCTGAAGCTAATAAATTACATCTTCTGGTTGGTGATGTTTT
GAAAGCTGATCTTCCATACTTTGATTGTTGTGTTGCTAATCTTCCATATC
AAATCTCATCTCCatttgttttcaaacttttactcCACAGACCAATTTTT
AGATGTGCAGTACTCATGTTTCAGCGTGAATTTGCACTCAGGTTGGTGGC
TAAACCAGGGGATAAATTATATTGTCGTCTATCAATTAATACGCAATTGT
TATCCAAAGTTGATCATTTAATGAAAGTGGGGAAAAATAATTTCCGACCT
CCGCCCAAAGTGGAATCTAGCGTCATCAGAATTGAACCCAAAAATCCTCC
ACCGCCAATCAACTTCCAGGAATGGGATGGCCTTGTTCGTATAGCATTTG
TCAGAAAAAATAAGACCTTGAGTGCATGTTTCAGCTCTAAGGCAGTCATC
GAAATGTtggataaaaattataaaattcatTGCTCTATGAACAGTATTAT
GGTAGATGAGgattttgatatcaaaacaaaagtccaagaaattttacaag
aaaatgAATTCAACAAGAAACGTGCAAGAACCATGGATATAGAcgatttt
cttcaacttttagACAAGTTTAATAAAAATGGAATAcattttgcatgaaa
atagaaattataaaaaaaaatgatttgaatgTGTCTCAAAAAGGATATAT
taattttatgtttcattttttttttggtgtttttaaaagtaacttgtcat
ggtgtcttttttaatatttttatcaatttctgcACTATGTATACTGTGTA
ACTACGTcatcttttttcaaagtttgaaaactcttgtatgtttaggaaaa
cacaatgcattgttttgttttagacAAATCAGCTGCATCTATTTGGACTC
AAAGtttttgtctccttattattatttctttattttactttattcttttt
tacagggtataaaataaataacaaaaaataagaaaaataagatcACATTT
TTTATAGAAGATGGCAATGGACCCTgcacttttgaaggaattcaatgcat
tcaaaaagaaaagtttggCAACACCTAGTGTCGAGGCTAAAAAGACTCCA
AGCTCTACTGTTTCTAAACCTTCATCATCTAAAAGAAAAGTCAAGAGAAA
GAATGAACTACCTGCCCAGCTTTTACAGCAAGCTAAGAAACAAGCACAGC
AATcacaatttaattacaaaacaCATGCTCCTTTGAAATCCAAAAGTAGA
TTTGCTATTTTGTCATCGTGTGTTGACCATTTGAAAGGAAACTATCAAAA
AAGAATATTCGAAGGCTACACGCTAGATGAATTGTTAGATATCACAAAGA
ATACAGACATTAAACCCCACGATAAAGAATGGTTATTTGTTGCACTGAGA
GAAAACCCTAAAATTGGTATTGATGATGGAAAGTATATTTTCAAGCCTAA
ATACACGTTGAAAGACAAGAAATCATTAGTGAAGCTTCTAGACAAGCATG
ATCAAAAGGGACACGGTGGCATTCTACTTGATGATATTAGAGAGGGTCTA
CCTAATGCTGATGATATCATAAAAGCAATCGCTGACAAAGTTACATTTGT
CACACGCTCAAATGACAAGAAAGCTGTTTTGTTTCATTATGATCCCAGTA
TGGCGGTCAGTGTTGATgaggaatttcaaaaacattggCGTAGTGTTGCC
GTTGAAGGGTTAGCAGAGCCTGATATAGAGAAATATTTGAGTAGCAGTGG
TATCACAACTATGCAAGGTGTAGCACCCAAAGCGCAGAAAGCTCAAAAGC
GTAGAGGTGGAAAACGTAAAAGGACAGGCAAACTACACAATGACCATTTA
CAAAGCCATGTTTTGAAAGATTACTCTGAAGTTCCTAAGAAAGGTACTCA
CTAgattaaaactaaaaagtaCAATGAAAGGCTGGTCATAACATTGATGA
GTGCAATTTGTTCGGGTTTGGTACGGTGGAATTAGAAAATCAGATTCCCA
GTTTATTATTTAAGAATTCACGAGTTTTTGATataatatacttttttttt
aagtaatgagattgtattgttgtaaccttcttaaacttttttaattttaa
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ttttaaaacctcttttGGAACTTGAATATCTTCTTACCAAGGTTTCTTAT
CAATCACTGTTGATTAGACAAATGATCGTCATATTATATGTTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+ >MSTRG.15028.1.p1 ID=MSTRG.15028.1.p1|Name=MSTRG.15028.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=921bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:30812..42306+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTAAGGAAAGAGTTGCCAAAAAATCGAGGACTCACCAACAAACTCG
TACAGAGGGAATTCAATTCAATACAGGACTTGGTCagcatattttaaaaa
atccTTTGATAGTCAATGCTATCATTGAAAAAGCAGCAATCAAGCCGACA
GATACAGTTCTTGAAGTTGGTCCTGGAACAGGTAATATGAGTGTTAAGAT
CATGgaaaagggtaaaaaattaaTTGCTTGTGAAGTTGACCCAAGGATGG
CTGCAGAACTTCAAAAGAGGGTCCAAGGTACACCTGAAGCTAATAAATTA
CATCTTCTGGTTGGTGATGTTTTGAAAGCTGATCTTCCATACTTTGATTG
TTGTGTTGCTAATCTTCCATATCAAATCTCATCTCCatttgttttcaaac
ttttactcCACAGACCAATTTTTAGATGTGCAGTACTCATGTTTCAGCGT
GAATTTGCACTCAGGTTGGTGGCTAAACCAGGGGATAAATTATATTGTCG
TCTATCAATTAATACGCAATTGTTATCCAAAGTTGATCATTTAATGAAAG
TGGGGAAAAATAATTTCCGACCTCCGCCCAAAGTGGAATCTAGCGTCATC
AGAATTGAACCCAAAAATCCTCCACCGCCAATCAACTTCCAGGAATGGGA
TGGCCTTGTTCGTATAGCATTTGTCAGAAAAAATAAGACCTTGAGTGCAT
GTTTCAGCTCTAAGGCAGTCATCGAAATGTtggataaaaattataaaatt
catTGCTCTATGAACAGTATTATGGTAGATGAGgattttgatatcaaaac
aaaagtccaagaaattttacaagaaaatgAATTCAACAAGAAACGTGCAA
GAACCATGGATATAGAcgattttcttcaacttttagACAAGTTTAATAAA
AATGGAATAcattttgcatga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:30812..42306 + |
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