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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12878 ID=MSTRG.12878|Name=MSTRG.12878|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=12357bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gtttttttatataacaaTAGAAGGCTTCGTAGGCTCAgaaaatttcttag
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tcctaacttgaaatcatgtcatcttctctcttgagatactttgaaacaaa
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ttcttttttcttcatttacaaaaggagcatgcttttcacttgtgaattct
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aaaaaaattagaaaacgaaagtgcttgatacggtggacgaactcactaaa
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AGCTccacaattttgattttttctttattttcttataagcatatacttta
taagaatcaaatcaataactcttaatagacggtaatatacctttcggtaa
ttagttcttacaaagtaaacaagggatggcgcacaatatgagcttactta
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agacggtaatatacctttcggtaattagttcttacaaagtaaacaaggga
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agaatcaaatcaataactcttgatagacggtgatatacctttcggtattt
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AACCTTCTACTATGGTCCttagtaaaacctcaaagtattttagtgtaaca
attttccaaaattgagatatcaaaatttgaaatttttgaaaataggctct
tacacggttcttacgttgaaattctattgtttttattcaaaagccAAAAA
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tgagattttgctcaggacaatagtAGTATCCCACAGGtcaaatattacaa
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AAAAACCTTTTCAATGTACCATTAAGCTCATATCGAAGACGAACTTTCGC
TGCTTTACCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCAGCGGAACCAAGTAAG
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AAGGAGGCTGGAGAAACTTCAGTCcgaatttcatctcattttgagcatTC
CCACTTTTACGGTCGTTCCGCCAGGATAATTAtggcaatcaaaaaaatat
ccTCATAGAAACTTAAAGTATGATGTGCTCGAAATAAATAACTTTAAATT
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ATTTAACGCtcaaaacgtccatataacgttagatggatgttaaaacaacg
ttgtgtgccagctgggaaaacAAACTTATGTGTAACGTATACTATACTTA
TGAGGGAGGTTTGATAATTTGCGTGAATAGTTTTCTATAAATGGTGTGCG
GATAGAACCTCTGATAGCCAACCCTTTAGAAAGAGATTTAATTTCTGAGC
GAATGTGGGACTATTGTGAGTTTTCGTTGTTTTGTAACCTTTAGAAATAG
ACCCTTCCCTATAGGCATTCAACGTCTTATGGACATTAAATGGACGGTTT
AAAGACATTTGGACGTCGTCgaaacgtacattagacgtccaaaagatGTT
TGTGCCCATTGGGTTACTGTCTACACATAAACACTTATGCACTTATTTTT
GGCTTAAGTTCCTCCTTGGACTGGACTCCCTAAAACTTTATTGCATCGGT
GTTAAATGTACATTATGATGGCATAATTAAGAATggtggatttaagacaa
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ACAGTAAaaatacaattacaaatctCTTCTTCTGATAATTTTGTGGTCTA
AAACCACCTATTTGATAGGATAAGATCATAGGTGTTTGTCTATTGATGTT
GTTGTTGTTGATGATTAAGCTTTATAACATTTTTGTTTACTTATTTTTCA
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AATGGAATCAGTGACAGCAAAAAATAATTTATCCCACAGAATCTACTACT
ATGGGTGCCTTCAATTATTTAGCTTTATGTTTTGATTTTTGTAACAATAT
ATAACTTGCTTTAGCAAcaaaaaaaattacgataatatttacttttgatt
tgttttcatgCCATCTCTATTCCTAGTACCCATTTCCATTCACCCCTACA
AAGAGATAAACCTTTAGAAGCTGTTCGTTATAAAAAATACCCAACAATTT
CTCAAAATGTGGATTTTAAAATGGGTTTCAAACTAAAATTTTGTACCGTT
GGAAAATCCATGCCCTCAGCTGTTTAAAACAACAAAtggaattttgactt
aaaaaggaCTTGTTCTGACCTTCTACGGCCAGTAGATATACTCCTTCATA
TCACTCAGGTACCAACTTTTTAAACGATaactttttgataacttttgaaa
tatttgtatGTCAAACATGAATTGACATCTTTGATGAGAATTTCAGCATC
ATTAATGATGTATTCACTTTTTGAGAGTACTGAAAATAGGACcccttcta
actttttttcactttaatttttttgctcaaattttgcgaGGGAGTTCCCC
GTTAACTGTATTTTTGGGGGAGAGGATCTTGCCACCTGTTggtatcttgt
attttacagataGATGGTACAGGCTTGCATTGCAGGCAGAATTTCAGCGA
AATCCGATGAGTAGTTATGCTGAAAGTAGTCATGTTAGGTAAAAAATGGA
CCGGtcaaatttcggattttttgatttatttgaccaatctattatttttt
ctacattttatattaGGAAATGTTATCAAAGAAATGAGACAAAGATCTCG
TACATGTTTTATACTAATTGTAGAATTAGCTACCGTTCTTTTGTATAAAA
TTCCCTTttctaagattcttgtcacttcTCTGGAATCTTTTCGCTATTTT
CTCCTGGATAACCGGCATCAGATTGGAAAGGGGTCGGTTACAGCACGAAA
AATCTTGTGCTCACTcacgaaactgcctaacttttTAAAGCTACCCGAAG
TTCTGATCTTCTTTCCACTataaaagtggcaaaggaattttagtgtggaa
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TGTATAATGTAGAATTGTGTGAGTAATGCTCAGTGAGAATCAGCATTCTT
CAAGCATTCACTGGAGGGACAAGTGGAGGTGCACCCACTTTACTACTGGT
CATATATGGGGTTTGGCGTTTGTAATCAAGAATTGTACAAAATTTTCGTG
GGCTTTCCAACAAAATGTTATGTTATTATGGATTAATGCATCAATACATC
AACATCAAAATAAATGGATTAGACGCttctttttctataagaacatccaa
aatttttaaacttcattgatgtttttaacattttaagtttaaatgctctt
attttcaccattttgtgaccatttttacccgttttcctaagaaattaggt
gttttccattttgaaaagttttaaaatgttcttaatttgttctgaACATT
TTTACCATCttaaccttatgttcttatagagaAGCTCATTAAAACCGTGA
TAGAAAAGCGGAACATTTTTTCTCTCCCTACGCATTTACATCATTCTTTT
ATAGGAACATTTACATTTTTTGTAGCTacactttggatgttcttaattgt
tcatatacacgtttttttttataagaacaaactatataagagcataaggc
ttcgaggcccaaaaatttaagaacattctaagaacatactaaggctttgt
agacttaaaaacatgcaatttcttaagaaattacatcaaaatgctcaaaa
aatgctgaaaataagaacatttcaagaacatttttaggcttcaaatccaa
aaaactaagaacatccgaaggctttgaaaatttttgacgttcttataata
aaaaaacgtgtaacaacaaacaataaaagaacataaggcttcgtggactc
agagaatttcttaggaaaaaaaaaatactcaccaaatagtgaaaataaga
acatgttgagaacgTTATTAGGCTTAatactcgaaaagttaagaacatcc
caaggcttcgaaattttagatgttcttataaaaaaagcatataATCACAA
AATGGTTTTGAAAAGCATTAGTTTGTTAATTGAGTCATTGAGTTAATTGA
AGTCATTGAGTGCTTAAAAAATATCTTCCTCTTACCGATATAAATCGATC
AAATTGGATCTGTGATCATTTGAAACTtccgaaccaatcaaacaattTCG
TTACTTCCTTTCGTTTTATTTTTTCGAGATGAGGAAAAATCTTCCGCTTT
ACTTTCTGtaggaaaaaaaaatctaaatcagCCAATAGGTATCAAGGTTT
TAGATCACGTGTTCagtttcaaccaatagaattcGTCAGAATAAACATAA
CACAAACCACTCTGGCATTCCCATTTAAGTCATTTTCTCTAACATATTCG
TTATTTCAAACCAGCATACATTCGAAGAAGGAAAAGTTCAACAGTACAAA
TTCTCCAAACGCCAAGCTCATCATGGAAATTTCCAGGAAAATATTCTTTC
TTGCATTAATTGTCACAGCCCTCGTTCATTGTCACGGTGAGTTAACCAAG
TTGTTGTTATCTTTTTAtacctttttaacttttataatAAGTCTTGCTGA
AAATACCAAAGCTACACTTTCTCAAATCACAAAATATTAGCAGTAAGCTT
TTAAACAAGGCAGAAAATTATGCCGTCTTTTCCCTAGAAACATATTTGAG
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aattggcttttaaaattgcacccttacagtgcagcaaaaatcagtaaaaa
tcatacccttAGagggcattttcccccaaattttcgatcccttcgTGCaa
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atttctacccttacagtgcatatctagtttttccgacccttacagtgcat
tttaaacatattggaaaaggtacccttaggacccgcacatacccgtcggt
ccttttgcccagctgcccccccggGCTGTCACCACTCTATTTAATGTACT
CTATGTAATGAACCAAATTACAGACTTCTGCTTTCAAGGTGGCTCGCACG
AGTTACTTTCTTTGTCTAAGTCTAGGGCTAGCTGGGTTGCCAAAAATAAT
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CAATAGGTATTCCGATGGGCTCGGACCCAGCTCCCTTTATGgctaatttg
ttcttatatcaTTTTGAAAGTCAATGGGTGAAAAGcctcaagaaagaaaa
tttacaaaaagcaAGGCGCTTTTCAAACACTTTTCGATTCATCGACGATC
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ACCCTCCTGAACTTCAGCTCAATCTTGAAAGTTCAGGTGATACTATTACT
TTTTTGGATCTCTCATTAACCAATGACAACGGTTACATAGATGCAAAACT
CTATGACAAAAGAGATAACTTTCCTTTTTCGATTGTTCGTCTTTTATTTG
CGTCGAGCAATATCCTCTCGGATGTTTTATAACTGTGTGGGAGCTGAAAT
TTTGAGGATTGGTAGGGTCTGTTCCAGTGTGAACAATTTCATTAGTGCAA
GTATGTCTCTCATTGATAGAGCAAAGAAGCAAGGAGCAAAGATTACACGG
TTGGAAAAAGTGGTTTGAGGAAAATGTATGGTCGCCATCAAGTTTTGAGA
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acaacaaaaaaattttggacttgTCACTGTTTCTTTTActatttactaat
tttcatttctttttaatcgatagagtcgttttatatttcaatgtgTTGTA
TCTTTTTCTCTGTCCAGTATATTTGTAGTTTATGTCTAAGTTTGTTGAGT
TTGTCTCATTTCCTAATTCGTTTCCAATGTGTACGGCCACTCGGTTACGG
GGTTCCGAACCGGGCTCTCGGTCaacctttcaactttttctctttctttc
tgctgtacttcactgtatggtcagaaattttaaacttttttgtttacaat
ttgttttattttaatccctttttttatgtacgaaatagtgtctgatcaac
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tgcttactcttggtaccacacctgactctaggctttgtcttcatcttgcc
attttcttattctttgtataattgtttggttgaatgttttgttgttttgt
atcatatttgttggtattgtcggtcgagcaattggggtgtgatggtgttt
cagcttttgctgagattatgttgagggtagtgttttgatccatgagagat
tttcaaacttttcttagattATAATCGCTAGATTGATTTATCAACACGTT
TTTACTTGTAAGCTAACTATTTGCTTGTGATCATGATACAAGAAGTATCG
AAACGTCAAGAATGAACATGaaacatgaaaatttgtttctcttctttact
tttttttaaaaaataatctggcccagaagaaaattttttcaagtaccACT
CTACTTGTCGGAAAATTGTGAGCGCAATAGGTTTTGCAGAGATTAATATT
CAATATTACTGACCGCGTAAAACGTCATAAAACGTCATAATGTGAATGTT
TTATGGAGCAAGTGTCATTTAAATAGTCCCCAATCATTGACGTATAAAAT
ATAACGTATAAATATCAactattcttaaaaaaaacaacggaagtCTAATT
TTTATTACTGTTATTGAGTCAGGTCAATTTCAACGTCACTTGGTTTAAGT
TTGTATTACTAAATACTACCTTTGCAGAAACCAAAAAAGACGAGCTAAAG
AAGGAAATCGAACGCGAGGTTCGAAAACAGTTGCAAGATGTGAAACAAGA
ACAAGACGGGCTATCAGCAAAAGACGTGAGCGAGAAGAAACACAAGCaaa
aagatgatgatgatgatgaagaagttcttgaagatgatgatgatgaaatt
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tcataacttTAATACATTTCTTCATTTTACACCCTTTTAACCAAGTAAAC
CCTAGATTTGCTTGGAATTAGGCTCCGTTGTTCTAATTTCTTTGACCTTT
TTTAGCATACTccagggataatcagatggtttgagatatttcgATTGCAA
AAACTTTCTAGTATGGTCCTTAGTAAAACTTCAAAGTATTAttgtgtaac
aattttccaaaattgagatatcaaaatttgaaatttttgaaaataagctc
tCTTACATAGTTCTTGCGTTGAACTTCTATTGTTTTtatcctaaaagcca
aaaacttgtaAGTTAAATATcttgactttggaaaatagttagacaaaaat
attttgagatttttctcaGAATTatcccacatgccaaatattacaaacca
tctgattatccctttaaatagCCTTGCAAAATACATTAATAGCCTTTATG
GCAGATTATatctaaattttttaatattacaTTATCAGAAGATGAAGATT
TAGTCATTCAACATGCACAACGAAAAGCTTCTTCAGAGATGAAAAAAGAT
CCATTATTCCTTGGCAGTGTCATTCGGCGCCGTCGTGATGGGTGCTCaaa
ttttttccgtataccatTGAGCTCATTTCGAAGACGAATTCTAGCCCCTT
ATCCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCGCCGGAACCAAGTAAGTATAA
TCTTTATaagccaaaattaaattttgctgaGAGGCCAGCGGAAGCAAGGA
GGCTGACTGGGGAAACTTCagtccccacttttgagcaaataaGATTTCTT
TTCAAACTCCTTGcgaatttcatctcattttgagcctgcAGCCTTCCCAC
TTTTTACGGTTCTTCCACGGTTCTTGCTAAGCCTATCATTATGACAAGCG
AAATAGTCTTATGATCTTCATAGAAACTTAAGTATGATATGCTTGAAATA
AATAACTTTCGATCCCTTCCctatccaACTGGCACACACGTTCTTTTAAC
GTTTATCCGTATGATGTTAGATGAACGTTAAAACAACGTTGTGTGCCAGC
CGGGAAGACAAACTTCTGTAGTAACGTGTACTATACTTATGAGGGAGGTT
TGATAATTTGCGTGAATAGTTTTCTATAAATGGTGCGCAGATCGGACCTC
TGATAACCGACCCTTAGAAAAAGATTCAATTTCTGATCGACTGAGGGACT
ATTGtgagtttttgttgttttgtaaccTTTAGAAAGAGTCTTTGGGAGGC
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GGACGGCTTAAAGACATTTGGACGTCGTCgaaacgtacattagacgtcca
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CTTATTTTTGGCCTAAAGTTCCTTCTTGGGCTGGACTCCTTAAAACCTTA
TTGCAGCGGTGTTAAATGTACCTTATGATGGCATAATTAAAAATGgggga
tttaagacaatagagcaagtacgttggaaacatgcgaaggagtgcaacac
TTGTTAAAGGACAATGAACATACTTACACAATTAaaaatctcttcctctg
ataagtttgtGGTCTAAAACCACCTATTTGATAGGATAGGGTCATAGGTC
tattgatgttgttgttgttgttgttgatgattaagctttataacgttttt
gtttacttatttTTCAGATTGTGCCGTCGCAGAGATGACAGCAGTCGTCG
ACGAAGAAGCTGCACAGATGGAATCAGTAAcggcaaaaaataatttatcc
caCATAATCTACTTCTATGGGTGCCTTCAATTATTTAgctttatgttttg
atttttgtaacaATATATAACTTGCTTTAGCACaaaaaaaaTTACGATAA
TATTtacttttgatttgttttcataCCATCTCTATTCCTAGTACCCATTT
CTATTTACCCCTACAAAGAGATTAACCTTTAGAAGCTGTtcgttataaaa
aaaatcaatatttcccCAAAAGGTGGATTTTAAAATaggtttcaaacaaa
aattttg
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000099_pilon | genome | sc0000099_pilon:1000958..1013314 + |
|
