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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12878.1.p1 ID=MSTRG.12878.1.p1|Name=MSTRG.12878.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12357bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gtttttttatataacaaTAGAAGGCTTCGTAGGCTCAgaaaatttcttag
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tcctaacttgaaatcatgtcatcttctctcttgagatactttgaaacaaa
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CCAtttactgctagagatgctccgagcgtctctaagtcataaatttcacg
ttcttttttcttcatttacaaaaggagcatgcttttcacttgtgaattct
gatttcgtctattcagaaaactgtaacgaaatcgtaaaaacttttttttt
aaactagagggtgattcctttttaaactttggtttaactaatgaggagcg
tgccgttagatacaaaaggaatataaaagaaacatgtagacctaattgct
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AGTTGCAAGATGTggaaaaagaacaagaaaagctatcagcaaaagacgtg
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cgcatagcgaaagtattacgatagcctttcgcggcggcggtgtcctcgga
aaaaaaattagaaaacgaaagtgcttgatacggtggacgaactcactaaa
tttaatttacaaattacacgctcgtataaccacgcaccctcgcgagccag
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ggaatcgtttaatcttatatcccccgtcaacgcgtccatcagaatcatca
atagcgtaagggggttagataagccatgggGTCGAGGGAgttaaccacgg
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AGCTccacaattttgattttttctttattttcttataagcatatacttta
taagaatcaaatcaataactcttaatagacggtaatatacctttcggtaa
ttagttcttacaaagtaaacaagggatggcgcacaatatgagcttactta
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agacggtaatatacctttcggtaattagttcttacaaagtaaacaaggga
tggcgcacaatatgagcttacttatttttctcataagcatttactttata
agaatcaaatcaataactcttgatagacggtgatatacctttcggtattt
agttcttacaaagtaaacaagggatggcgcacaatatgagcatattcatt
tttcttataagcatttactttataagaattaaattaataactctcgatag
acggtgatatacctttcgttAATTAGTTATtacgaagtaaacaagggatg
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CTAGATTTTCTTGGAATTAGGCTCcattgttcttatttctttGACCTTTG
TTACCATACTccagggataatcagatggtttgagatatatAGATTACAGA
AACCTTCTACTATGGTCCttagtaaaacctcaaagtattttagtgtaaca
attttccaaaattgagatatcaaaatttgaaatttttgaaaataggctct
tacacggttcttacgttgaaattctattgtttttattcaaaagccAAAAA
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tgagattttgctcaggacaatagtAGTATCCCACAGGtcaaatattacaa
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TCCTGGCTGATTATACTTAAAATTCTCAATATTACATTATCAGAAGATGA
AGATTTAGTCATTCAACATGCACAACGAATAGCTTCTTTAGAGATGAAAA
AAGATCCATTATTCCTTGGCAATGTCATTAGGCGCCGTCGTGATGGCTGC
AAAAACCTTTTCAATGTACCATTAAGCTCATATCGAAGACGAACTTTCGC
TGCTTTACCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCAGCGGAACCAAGTAAG
TATATACTTTATAAGCCgaaattaaattttgctgaCAGGCCAGTGGAAGC
AAGGAGGCTGGAGAAACTTCAGTCcgaatttcatctcattttgagcatTC
CCACTTTTACGGTCGTTCCGCCAGGATAATTAtggcaatcaaaaaaatat
ccTCATAGAAACTTAAAGTATGATGTGCTCGAAATAAATAACTTTAAATT
CTTCCCTCTAGCAACCCACCCacctggcacacaacgttcttttaacGTAT
ATTTAACGCtcaaaacgtccatataacgttagatggatgttaaaacaacg
ttgtgtgccagctgggaaaacAAACTTATGTGTAACGTATACTATACTTA
TGAGGGAGGTTTGATAATTTGCGTGAATAGTTTTCTATAAATGGTGTGCG
GATAGAACCTCTGATAGCCAACCCTTTAGAAAGAGATTTAATTTCTGAGC
GAATGTGGGACTATTGTGAGTTTTCGTTGTTTTGTAACCTTTAGAAATAG
ACCCTTCCCTATAGGCATTCAACGTCTTATGGACATTAAATGGACGGTTT
AAAGACATTTGGACGTCGTCgaaacgtacattagacgtccaaaagatGTT
TGTGCCCATTGGGTTACTGTCTACACATAAACACTTATGCACTTATTTTT
GGCTTAAGTTCCTCCTTGGACTGGACTCCCTAAAACTTTATTGCATCGGT
GTTAAATGTACATTATGATGGCATAATTAAGAATggtggatttaagacaa
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ACAGTAAaaatacaattacaaatctCTTCTTCTGATAATTTTGTGGTCTA
AAACCACCTATTTGATAGGATAAGATCATAGGTGTTTGTCTATTGATGTT
GTTGTTGTTGATGATTAAGCTTTATAACATTTTTGTTTACTTATTTTTCA
GATTGTGCCGTCGCCGAGATGACAGCAGTCGTCGACGAAGAAGCTGCACA
AATGGAATCAGTGACAGCAAAAAATAATTTATCCCACAGAATCTACTACT
ATGGGTGCCTTCAATTATTTAGCTTTATGTTTTGATTTTTGTAACAATAT
ATAACTTGCTTTAGCAAcaaaaaaaattacgataatatttacttttgatt
tgttttcatgCCATCTCTATTCCTAGTACCCATTTCCATTCACCCCTACA
AAGAGATAAACCTTTAGAAGCTGTTCGTTATAAAAAATACCCAACAATTT
CTCAAAATGTGGATTTTAAAATGGGTTTCAAACTAAAATTTTGTACCGTT
GGAAAATCCATGCCCTCAGCTGTTTAAAACAACAAAtggaattttgactt
aaaaaggaCTTGTTCTGACCTTCTACGGCCAGTAGATATACTCCTTCATA
TCACTCAGGTACCAACTTTTTAAACGATaactttttgataacttttgaaa
tatttgtatGTCAAACATGAATTGACATCTTTGATGAGAATTTCAGCATC
ATTAATGATGTATTCACTTTTTGAGAGTACTGAAAATAGGACcccttcta
actttttttcactttaatttttttgctcaaattttgcgaGGGAGTTCCCC
GTTAACTGTATTTTTGGGGGAGAGGATCTTGCCACCTGTTggtatcttgt
attttacagataGATGGTACAGGCTTGCATTGCAGGCAGAATTTCAGCGA
AATCCGATGAGTAGTTATGCTGAAAGTAGTCATGTTAGGTAAAAAATGGA
CCGGtcaaatttcggattttttgatttatttgaccaatctattatttttt
ctacattttatattaGGAAATGTTATCAAAGAAATGAGACAAAGATCTCG
TACATGTTTTATACTAATTGTAGAATTAGCTACCGTTCTTTTGTATAAAA
TTCCCTTttctaagattcttgtcacttcTCTGGAATCTTTTCGCTATTTT
CTCCTGGATAACCGGCATCAGATTGGAAAGGGGTCGGTTACAGCACGAAA
AATCTTGTGCTCACTcacgaaactgcctaacttttTAAAGCTACCCGAAG
TTCTGATCTTCTTTCCACTataaaagtggcaaaggaattttagtgtggaa
atgggaaacttatacaaaacgacggtagaTATTAATAAAAAGCTGATATT
TGTATAATGTAGAATTGTGTGAGTAATGCTCAGTGAGAATCAGCATTCTT
CAAGCATTCACTGGAGGGACAAGTGGAGGTGCACCCACTTTACTACTGGT
CATATATGGGGTTTGGCGTTTGTAATCAAGAATTGTACAAAATTTTCGTG
GGCTTTCCAACAAAATGTTATGTTATTATGGATTAATGCATCAATACATC
AACATCAAAATAAATGGATTAGACGCttctttttctataagaacatccaa
aatttttaaacttcattgatgtttttaacattttaagtttaaatgctctt
attttcaccattttgtgaccatttttacccgttttcctaagaaattaggt
gttttccattttgaaaagttttaaaatgttcttaatttgttctgaACATT
TTTACCATCttaaccttatgttcttatagagaAGCTCATTAAAACCGTGA
TAGAAAAGCGGAACATTTTTTCTCTCCCTACGCATTTACATCATTCTTTT
ATAGGAACATTTACATTTTTTGTAGCTacactttggatgttcttaattgt
tcatatacacgtttttttttataagaacaaactatataagagcataaggc
ttcgaggcccaaaaatttaagaacattctaagaacatactaaggctttgt
agacttaaaaacatgcaatttcttaagaaattacatcaaaatgctcaaaa
aatgctgaaaataagaacatttcaagaacatttttaggcttcaaatccaa
aaaactaagaacatccgaaggctttgaaaatttttgacgttcttataata
aaaaaacgtgtaacaacaaacaataaaagaacataaggcttcgtggactc
agagaatttcttaggaaaaaaaaaatactcaccaaatagtgaaaataaga
acatgttgagaacgTTATTAGGCTTAatactcgaaaagttaagaacatcc
caaggcttcgaaattttagatgttcttataaaaaaagcatataATCACAA
AATGGTTTTGAAAAGCATTAGTTTGTTAATTGAGTCATTGAGTTAATTGA
AGTCATTGAGTGCTTAAAAAATATCTTCCTCTTACCGATATAAATCGATC
AAATTGGATCTGTGATCATTTGAAACTtccgaaccaatcaaacaattTCG
TTACTTCCTTTCGTTTTATTTTTTCGAGATGAGGAAAAATCTTCCGCTTT
ACTTTCTGtaggaaaaaaaaatctaaatcagCCAATAGGTATCAAGGTTT
TAGATCACGTGTTCagtttcaaccaatagaattcGTCAGAATAAACATAA
CACAAACCACTCTGGCATTCCCATTTAAGTCATTTTCTCTAACATATTCG
TTATTTCAAACCAGCATACATTCGAAGAAGGAAAAGTTCAACAGTACAAA
TTCTCCAAACGCCAAGCTCATCATGGAAATTTCCAGGAAAATATTCTTTC
TTGCATTAATTGTCACAGCCCTCGTTCATTGTCACGGTGAGTTAACCAAG
TTGTTGTTATCTTTTTAtacctttttaacttttataatAAGTCTTGCTGA
AAATACCAAAGCTACACTTTCTCAAATCACAAAATATTAGCAGTAAGCTT
TTAAACAAGGCAGAAAATTATGCCGTCTTTTCCCTAGAAACATATTTGAG
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cccggggggggggcactgggtttgcggactgacggtatgtgcgggccaaa
aattggcttttaaaattgcacccttacagtgcagcaaaaatcagtaaaaa
tcatacccttAGagggcattttcccccaaattttcgatcccttcgTGCaa
aaaaaTGTTAGCATTTttccaaaagagatttttcaaagaagttttctgaa
atttctacccttacagtgcatatctagtttttccgacccttacagtgcat
tttaaacatattggaaaaggtacccttaggacccgcacatacccgtcggt
ccttttgcccagctgcccccccggGCTGTCACCACTCTATTTAATGTACT
CTATGTAATGAACCAAATTACAGACTTCTGCTTTCAAGGTGGCTCGCACG
AGTTACTTTCTTTGTCTAAGTCTAGGGCTAGCTGGGTTGCCAAAAATAAT
CGGTCTAGGGTGAAATTTACAAAACCGCTCTTTAAAGAGGCACTTGAATA
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CAATAGGTATTCCGATGGGCTCGGACCCAGCTCCCTTTATGgctaatttg
ttcttatatcaTTTTGAAAGTCAATGGGTGAAAAGcctcaagaaagaaaa
tttacaaaaagcaAGGCGCTTTTCAAACACTTTTCGATTCATCGACGATC
TTTTTAACCATCAATGATGACAATTTATTTATGGAAACTATAAGAAATCT
ACCCTCCTGAACTTCAGCTCAATCTTGAAAGTTCAGGTGATACTATTACT
TTTTTGGATCTCTCATTAACCAATGACAACGGTTACATAGATGCAAAACT
CTATGACAAAAGAGATAACTTTCCTTTTTCGATTGTTCGTCTTTTATTTG
CGTCGAGCAATATCCTCTCGGATGTTTTATAACTGTGTGGGAGCTGAAAT
TTTGAGGATTGGTAGGGTCTGTTCCAGTGTGAACAATTTCATTAGTGCAA
GTATGTCTCTCATTGATAGAGCAAAGAAGCAAGGAGCAAAGATTACACGG
TTGGAAAAAGTGGTTTGAGGAAAATGTATGGTCGCCATCAAGTTTTGAGA
ACCTTTTTCAGtaatgcgaaaaaattttcagattcattaCTCCACactaa
acaacaaaaaaattttggacttgTCACTGTTTCTTTTActatttactaat
tttcatttctttttaatcgatagagtcgttttatatttcaatgtgTTGTA
TCTTTTTCTCTGTCCAGTATATTTGTAGTTTATGTCTAAGTTTGTTGAGT
TTGTCTCATTTCCTAATTCGTTTCCAATGTGTACGGCCACTCGGTTACGG
GGTTCCGAACCGGGCTCTCGGTCaacctttcaactttttctctttctttc
tgctgtacttcactgtatggtcagaaattttaaacttttttgtttacaat
ttgttttattttaatccctttttttatgtacgaaatagtgtctgatcaac
actgtttcttctttggtaaagatgacgggtggctcgcgggcgccagagag
tgcttactcttggtaccacacctgactctaggctttgtcttcatcttgcc
attttcttattctttgtataattgtttggttgaatgttttgttgttttgt
atcatatttgttggtattgtcggtcgagcaattggggtgtgatggtgttt
cagcttttgctgagattatgttgagggtagtgttttgatccatgagagat
tttcaaacttttcttagattATAATCGCTAGATTGATTTATCAACACGTT
TTTACTTGTAAGCTAACTATTTGCTTGTGATCATGATACAAGAAGTATCG
AAACGTCAAGAATGAACATGaaacatgaaaatttgtttctcttctttact
tttttttaaaaaataatctggcccagaagaaaattttttcaagtaccACT
CTACTTGTCGGAAAATTGTGAGCGCAATAGGTTTTGCAGAGATTAATATT
CAATATTACTGACCGCGTAAAACGTCATAAAACGTCATAATGTGAATGTT
TTATGGAGCAAGTGTCATTTAAATAGTCCCCAATCATTGACGTATAAAAT
ATAACGTATAAATATCAactattcttaaaaaaaacaacggaagtCTAATT
TTTATTACTGTTATTGAGTCAGGTCAATTTCAACGTCACTTGGTTTAAGT
TTGTATTACTAAATACTACCTTTGCAGAAACCAAAAAAGACGAGCTAAAG
AAGGAAATCGAACGCGAGGTTCGAAAACAGTTGCAAGATGTGAAACAAGA
ACAAGACGGGCTATCAGCAAAAGACGTGAGCGAGAAGAAACACAAGCaaa
aagatgatgatgatgatgaagaagttcttgaagatgatgatgatgaaatt
gatgaatttgaagatgGTATACATATTCAGTTGctcttattattttattt
tcataacttTAATACATTTCTTCATTTTACACCCTTTTAACCAAGTAAAC
CCTAGATTTGCTTGGAATTAGGCTCCGTTGTTCTAATTTCTTTGACCTTT
TTTAGCATACTccagggataatcagatggtttgagatatttcgATTGCAA
AAACTTTCTAGTATGGTCCTTAGTAAAACTTCAAAGTATTAttgtgtaac
aattttccaaaattgagatatcaaaatttgaaatttttgaaaataagctc
tCTTACATAGTTCTTGCGTTGAACTTCTATTGTTTTtatcctaaaagcca
aaaacttgtaAGTTAAATATcttgactttggaaaatagttagacaaaaat
attttgagatttttctcaGAATTatcccacatgccaaatattacaaacca
tctgattatccctttaaatagCCTTGCAAAATACATTAATAGCCTTTATG
GCAGATTATatctaaattttttaatattacaTTATCAGAAGATGAAGATT
TAGTCATTCAACATGCACAACGAAAAGCTTCTTCAGAGATGAAAAAAGAT
CCATTATTCCTTGGCAGTGTCATTCGGCGCCGTCGTGATGGGTGCTCaaa
ttttttccgtataccatTGAGCTCATTTCGAAGACGAATTCTAGCCCCTT
ATCCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCGCCGGAACCAAGTAAGTATAA
TCTTTATaagccaaaattaaattttgctgaGAGGCCAGCGGAAGCAAGGA
GGCTGACTGGGGAAACTTCagtccccacttttgagcaaataaGATTTCTT
TTCAAACTCCTTGcgaatttcatctcattttgagcctgcAGCCTTCCCAC
TTTTTACGGTTCTTCCACGGTTCTTGCTAAGCCTATCATTATGACAAGCG
AAATAGTCTTATGATCTTCATAGAAACTTAAGTATGATATGCTTGAAATA
AATAACTTTCGATCCCTTCCctatccaACTGGCACACACGTTCTTTTAAC
GTTTATCCGTATGATGTTAGATGAACGTTAAAACAACGTTGTGTGCCAGC
CGGGAAGACAAACTTCTGTAGTAACGTGTACTATACTTATGAGGGAGGTT
TGATAATTTGCGTGAATAGTTTTCTATAAATGGTGCGCAGATCGGACCTC
TGATAACCGACCCTTAGAAAAAGATTCAATTTCTGATCGACTGAGGGACT
ATTGtgagtttttgttgttttgtaaccTTTAGAAAGAGTCTTTGGGAGGC
CAAAAATAGACCCTTCCCTATAGGCATTCAACGTCTTATGGACATTAAAT
GGACGGCTTAAAGACATTTGGACGTCGTCgaaacgtacattagacgtcca
aaagacgtttgtgccCATTGGGTTACTGTCTACACATAAACACTCATGCA
CTTATTTTTGGCCTAAAGTTCCTTCTTGGGCTGGACTCCTTAAAACCTTA
TTGCAGCGGTGTTAAATGTACCTTATGATGGCATAATTAAAAATGgggga
tttaagacaatagagcaagtacgttggaaacatgcgaaggagtgcaacac
TTGTTAAAGGACAATGAACATACTTACACAATTAaaaatctcttcctctg
ataagtttgtGGTCTAAAACCACCTATTTGATAGGATAGGGTCATAGGTC
tattgatgttgttgttgttgttgttgatgattaagctttataacgttttt
gtttacttatttTTCAGATTGTGCCGTCGCAGAGATGACAGCAGTCGTCG
ACGAAGAAGCTGCACAGATGGAATCAGTAAcggcaaaaaataatttatcc
caCATAATCTACTTCTATGGGTGCCTTCAATTATTTAgctttatgttttg
atttttgtaacaATATATAACTTGCTTTAGCACaaaaaaaaTTACGATAA
TATTtacttttgatttgttttcataCCATCTCTATTCCTAGTACCCATTT
CTATTTACCCCTACAAAGAGATTAACCTTTAGAAGCTGTtcgttataaaa
aaaatcaatatttcccCAAAAGGTGGATTTTAAAATaggtttcaaacaaa
aattttg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ >MSTRG.12878.1.p1 ID=MSTRG.12878.1.p1|Name=MSTRG.12878.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2136bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000099_pilon:1000958..1013314+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggaaattttcaggaaaacaTTCTTTCTTGCATTAATTGTCACAACTCT
CGTTCATTGTAAAAAAACCAAAGAAGATAACGAGCTGAAGAAGGAAATCG
AACGCGAGGTTCGAAAACAGTTGCAAGATGTggaaaaagaacaagaaaag
ctatcagcaaaagacgtgagcgagaagaaacacaagcaaaaagatgatga
tgatgcggaagaagttcttgaagatgatgatgatgaaattgatgaattcg
aagatgAAGATGAAGATTTAGTCATTCAACATGCACAACGAATAGCTTCT
TTAGAGATGAAAAAAGATCCATTATTCCTTGGCAATGTCATTAGGCGCCG
TCGTGATGGCTGCAAAAACCTTTTCAATGTACCATTAAGCTCATATCGAA
GACGAACTTTCGCTGCTTTACCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCAGC
GGAACCAAATTGTGCCGTCGCAGAGATGACAGCAGTCGTCGACGAAGAAG
CTGCACAGATGGAATCAGTAAcggcaaaaaataaatggaaattttcagga
aaacaTTCTTTCTTGCATTAATTGTCACAACTCTCGTTCATTGTAAAAAA
ACCAAAGAAGATAACGAGCTGAAGAAGGAAATCGAACGCGAGGTTCGAAA
ACAGTTGCAAGATGTggaaaaagaacaagaaaagctatcagcaaaagacg
tgagcgagaagaaacacaagcaaaaagatgatgatgatgcggaagaagtt
cttgaagatgatgatgatgaaattgatgaattcgaagatgAAGATGAAGA
TTTAGTCATTCAACATGCACAACGAATAGCTTCTTTAGAGATGAAAAAAG
ATCCATTATTCCTTGGCAATGTCATTAGGCGCCGTCGTGATGGCTGCAAA
AACCTTTTCAATGTACCATTAAGCTCATATCGAAGACGAACTTTCGCTGC
TTTACCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCAGCGGAACCAAATTGTGCC
GTCGCAGAGATGACAGCAGTCGTCGACGAAGAAGCTGCACAGATGGAATC
AGTAAcggcaaaaaataaatggaaattttcaggaaaacaTTCTTTCTTGC
ATTAATTGTCACAACTCTCGTTCATTGTAAAAAAACCAAAGAAGATAACG
AGCTGAAGAAGGAAATCGAACGCGAGGTTCGAAAACAGTTGCAAGATGTg
gaaaaagaacaagaaaagctatcagcaaaagacgtgagcgagaagaaaca
caagcaaaaagatgatgatgatgcggaagaagttcttgaagatgatgatg
atgaaattgatgaattcgaagatgAAGATGAAGATTTAGTCATTCAACAT
GCACAACGAATAGCTTCTTTAGAGATGAAAAAAGATCCATTATTCCTTGG
CAATGTCATTAGGCGCCGTCGTGATGGCTGCAAAAACCTTTTCAATGTAC
CATTAAGCTCATATCGAAGACGAACTTTCGCTGCTTTACCCTCTAATTGT
TTTCGTTGCTGCAGCAGCGGAACCAAATTGTGCCGTCGCAGAGATGACAG
CAGTCGTCGACGAAGAAGCTGCACAGATGGAATCAGTAAcggcaaaaaat
aaatggaaattttcaggaaaacaTTCTTTCTTGCATTAATTGTCACAACT
CTCGTTCATTGTAAAAAAACCAAAGAAGATAACGAGCTGAAGAAGGAAAT
CGAACGCGAGGTTCGAAAACAGTTGCAAGATGTggaaaaagaacaagaaa
agctatcagcaaaagacgtgagcgagaagaaacacaagcaaaaagatgat
gatgatgcggaagaagttcttgaagatgatgatgatgaaattgatgaatt
cgaagatgAAGATGAAGATTTAGTCATTCAACATGCACAACGAATAGCTT
CTTTAGAGATGAAAAAAGATCCATTATTCCTTGGCAATGTCATTAGGCGC
CGTCGTGATGGCTGCAAAAACCTTTTCAATGTACCATTAAGCTCATATCG
AAGACGAACTTTCGCTGCTTTACCCTCTAATTGTTTTCGTTGCTGCAGCA
GCGGAACCAAATTGTGCCGTCGCAGAGATGACAGCAGTCGTCGACGAAGA
AGCTGCACAGATGGAATCAGTAAcggcaaaaaataa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000099_pilon | genome | sc0000099_pilon:1000958..1013314 + |
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