TCONS_00036968 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00036968
Unique Name	TCONS_00036968
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1011

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0001544:32405..44759-

transcript sequence

>TCONS_00036968 ID=TCONS_00036968|Name=TCONS_00036968|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1011bp
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ttttttgatttaacATACAATCTGGACAACGTCACCACAccatattttgg
actttttgtagATCActtcaagtttttgaaaaagGTTGAATTTAAACAGC
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GCCGAAGAAGGCAGAAGATCCTtcagtcttatttttttcactttttattt
ttcatgttaTT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0001544:32405..44759-

Legend: exon

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>TCONS_00036968 ID=TCONS_00036968|Name=TCONS_00036968|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001544:32405..44759- (Clytia hemisphaerica)
TTTTTCTCATAATGGTAATTTCTGTATCACCAATAACATCGAAACTTCAA
TTTGTTGATTTAACATACAATTTGGACAACGTCANTCTGTACCACCAATA
ACATCGAAACTTCAATTTTTTGATTTAACATACAATCTGGACAACGTCAC
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GCAAGGTCTTATAAGGTCTGAGAGGGGAACTCGCATCAGCCTCACAAGGG
TATTCTCTGGCGTCAATCAGTAACGTAAATAAAGCCTGTGATGCACGGGG
ACGAGGTTGCCTGAATTAAAGCTTTTTTAAAGTTTGAATGACGATGGATT
GAGAAGAATATTCATTTTTCTGTGCTCGTATTTTGGTTGGTTTAAAAATC
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AAAAGACAAAGATCTTTAGAGTTGAATAGGATAATATTTTTTTAATACAA
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GGCGTGTAGCTAACGTAAATAAAGCCTGAATGGGATACACGGGGACGAGA
TTGCCTGAATCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGTTTAATTAAATG
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ACCTGAAAATTGGAGTCGCTTATTAGAAAAATTGTATATGAAAGAAAATG
AAATTACCTCCTCCAGAACGTAACTGGATCGATCATTATTAATTTCATCA
AAAAATTTGATCTTTTTCTTCAACTTTTTTTTCGATTTGTTGCAGACATC
TTCTTCTTTCACTATATAGTTACTACATAGAAAGAGAGATATTAATCTGT
TATTGAATTGAAGAAAGATGATAAAAGAATTATATGGAACAGCATTGTAA
TGTTTTGGCGAAAACTGGAGTAACTTTAAAAAGAACTTGGCAAGGCCAAA
GGGAGAGGGTAAAATTTCTTTGTTTCTCTATTTCCTGTCGCTCTGCTGTT
TACAAAATATAGGTAAAATGATACAAGGTTCTACCTACCAGCTGCTGTAA
CCAAAATTTTGACAAGGAACTGTTTTCTTAAAGGAAAATGATTTATTCTT
CCTCTCGTGTTTCACTGAAAGTTTGATTCTCAAAGGTCCTTCAATGGCAT
AGCAATGTAACTCTGTATTCATAGTCAATGGTGAAAATCCCTTTTTTACG
TTTTTAATGTTCTTTTTGTATTGTTTCAAGATGTTTACCATGTCATCGTG
TAGTTCTGGAAAGTGTACCAATTTCCCTAAGAGAGATACATAAAATGAAG
CTATTAATTACGATCCCCAATAATACGAAAATAAATAAACCAATATCTAT
GGAAATTTCAAAATTCTTGTACAAAGTAATGACAACACTGATGTTTTTTA
AATTCTTTACAAAGCTTTATCCACCATCTTTGATCAGAGTCGGTCTTTTT
TTATATGTCCTGTTAAACCTTTTTAGAATTTAAAAATCGAAAAATTGAAA
TGAAAAAATTAAATGAAGAAGAAAACGAAGAGTTTTTCGAAGAAGAGTAT
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TTTTGGTTCAGGTGATGTATCTATTTAGTATCTAAAAATACAATTTCGGA
AAGTTTTTGTGTAAGTATCTTTCCTTTAAAATCTCCAAAAAACCTCATTT
TGGCGATTTTCCCCACTAAATTTGCATACGAAAACAGCTATAACTTGGGA
TGTAGCCAAATAGAAAATTTTTCCGAAAAAATCTAAATAAAGAAATTATT
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GGCTTTTTTGTGAAAAGTATACGAATAGCGTCGTTATGACGTTTTATTAA
GGTCCATGCCACACTTATTCCTCAATTACTCATTATGTAATTACTTAAAT
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CCTTTAATTTCGGGGAAATTCTTCCAGCTGGCAAATCAGAACAGGTATTT
GCAAATTTTAGGTCGGTGGCTGCTTCTGAAAGGTCATACAATTGATCATT
GGCATCATCATGATTATTTACGGGGAAGGTAGGTCTAGCGCTTTAGATTC
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TAGTGATATATTGTTATTGACTTTACAAAGTTGTTTGTACTTTCGGTTGA
ATGGCGAACGAAGACCTGAGAGGGCTTCACGTTTTTTATTATAATAACAT
CCAAAAGATTTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACCTTTTGAGTTTTAAGC
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CTGAGTATTTTTGACCATTTTACTATGAAATTGGATGTTTTAGAGTCCGC
AAAGCCTTAAAATGTTTTTAGGATTCTGGCCATCGAAGCCTTATTCTCTT
ATATAGTTTGTTCTTATTAAAAAAAACAGTGTACCTGATGTAAATGATTC
ATGATTTATAAAGCTGAAGTAGTTCTCCTCTAGATATCTTTTGCAATATT
TGATGAAAAAGGAATAAGGGTATTTACAAAATATATTTCTCACGGGTACT
AAAAAAGTGTCGAGACAATCTTTTCACCAATCTGGCACCCAGAACTACAC
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TCACCATTTTTTGAGTATTTTTGTCAATTTTCCTAAGAAATTGGGTATCT
TAGAGTCCCAAAAGCCTTAAAATGTTCTGAGCTTGTTCTTAAAATTTTGG
CCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTCATTCTTATAAAAAAATTAAT
GGATATGATATGATCGGGAGTGTTATCAGAATAATTAAGAAAGTAAAGTG
ACTGGGTTCGAGGTTGTTTGTTTGTGTTTACAAAGTACTTGGCGAAACAG
AAACTAAAATACAAGTGCAAACAAACTTTGCAACGTCATTAATTGACCAT
TTATCTTAAGCGTAACAAAGGGGAACCTAAAAAACCTAAAAAAACAACTT
TGAAAGACGCTGACGTATATTTCTATGTGCGGATATAAAAGTGTTTTTGA
ATTACGTGCAAGCATAGTATAAGAAAGTATAAGAAAGCCGCGGAGATTGC
ATTATTTTTTTCGTGCCCTTCGTGCCCTTCATGCCTTTCGAAAATAAGTT
CGTGCCTTTCGAAAAAAATTTCGTGCCTTTTGAAAAAAAGTTCGTGCCTT
TTGAAAAAAAGTTCGTGCCTTTTGAAAAAAAGTTCGTGCCTTTCGGGGAA
AAAATTTATAGCTCTTCTTTCACTTCTTCTTTACATCCGCGCTAATTTGT
ATGTGTTTGTTGACTTCTCTAACCCGACAATTCATGTTTATACCTTATCG
GCCAAAACTTAGTCGACGAAGGCACGCAAGGCACGAAAAAATCACACTCC
TTTTTTCATTGCCCATTGCGTTTCAATAACTGATCTATCAGGCAAATCCA
AAGACCCATTTTTCGTCCTTCCTATTCTTACTGTGTGAATTAAAGTAGGA
AGAGGTCATAAAGAGGTCATATAATCCAAAGGTCAAAGTTACCAAGCTCT
AGTTTAGATGGTCGAATTTTTGCTCTGCCTACAACCCCCACCGTAATATT
TGGCACAAAAGGGGAATCCCCTCAAATTTGAAAACTGCAAGTGCTTTTTA
AGTGCTCTAAAGTACGTTTGGAAAGTAGAGTTTTAACTCTTGAGTTTTAA
CATGAAACTTAACACTTAGGACCTTAGGATCTCAGAATCTTAAAGCTCAA
AATTGTTCCAATAAGGCTGACAATATAGCCTGGAAGCCACTTAACCCTCA
CAAATCGAAAAATCCAATGAAACAAAGTGAGAGAACTGAAATTGCAATTC
TCGCCCGATCTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATACGCAAAAAGTGCCA
ATATATTTCGACGTTGATTGTATTCTAATTGTTAAGAAGGAGCTAAAAAA
CATCATTTAATTAATAAAGATGTACACAATTTTCTCAAAAATCTAAAAAT
CCATAATCACATGATAGTTAAGTATTAAAACGCCTTTCTTATAACTGTGG
ATGTGACATGGATGGCTGACGAAACTAAAGAATTATTACAAAAGTCAAAA
TATCTTTGTTTTTGTTCTATATTTTTCATAGTCTAACAAAATTAAGCGAT
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CGAGCAAAAAAACATGGTTGGTTATAAATTTCGAGCTCGACTTTTTCGCA
TAGGGACCTATTTTGAGAATCTAATTGCTAGGTAGCAGCTACGAGAAAAA
CAACACCTTCGATATTTCTTTTCAGCTCTTTTAGCTTGGATATTCTGCAA
TATTTTGGACTTGTTCAACTCCGGTTTAACCCCAATCTCGTACAAAGAGC
ATGGATTTATAAAGCCTGAAGGGGTAGATGTCGTGCTTTGGCTGAAAAGT
GTGTCGAGGTTAGGTAGGAAATCCTACCTAGGTCACGTGACATTACGATA
GAATTTCAGCGCTTGACCAATCAGAAGCTTCGCAGGTCTTCGAAAACAAT
AGCAATATTATTTTTTGCGATATTATATATTTTTTTTGCTTGAAAGAGCT
TAAAGCGCGACATCTATAAAATATGTGACCAAGAGCCGGTTGAGTACTTT
TAGATTTTAGTGCTGGACATGATACAAATCCTTTTGTGAGCACTATTGAA
TTAATAGAAACGAACCAAGGACTGTGTTCCAGTTTTGGGTATGAATCTCA
TTGCAACACCGTTATTATCTTCTAATAGGTTGAATTTAAACAGCCAGAAG
ATTTTTACATCTCATGGAATGTTTTCAGTACGAACGAGCACATGGGAACA
CATATCGATGCACCAGTGCATTTCGTGAAAGGTAGTCAAACTGTGGACGA
AATCCCTTTACAAAGACTTGTAAGTTGAATATAAAAACTTTTGAAATCAT
AGGAATACAAAGAAATTGATTGTTACTGTCTGCTCAAACTACAATTTACT
ATACAGCGGAGTCTCTTTAACTCGAACCTCTATAACTCGAATGTCTCCTC
CATTTTATGGTTTCTTCACTAAACAATGCCTTATAAACCTTACTCTATAA
CTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAACAAATTTTTATAGTCCCTTCTCTATA
TAATTCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGA
ACAAATTTTTATAGTCCCTTCTCTATATAATTCCTCATAAACCTTACTCT
ATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAAAAGGTTTTAGAGTCCCTTCTCT
ATATAATGCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACT
CGAACAAATTTTCAGGTCCCTTCTCTATATAATGCCTCATAAACCTTACT
CTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAAAAGGTTTTAGAGTCCCTTCT
CTATATAATGCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAA
CTCGAAAAGGTTTTATAGTCCCTTTTCTATATAATGCCTCATAAACCTTA
CTCTATAACTCGAAAAACTTCCGTAACTCGAGCAAATTTGTGTTCCCCAT
GCGTGTTTGAGTTATGGTCAGCTGTAAAACATTTTTTATAAACTCTTCAG
GTCGGAAAGCTGTTCATACTTGATGTTGAGGAGGAAACATTGAAAGACAG
ATTTCTATATATCACAACACAACATATCTTAGATGCAGAGAAAAAACAAG
GAAAGATTGAAGATGGCTCCATCCTTCTCGTTAATACAGGTATAAATACC
TCCTTTTTTCAACAGCATGCGGTCGGGCGGACGGGCGGACGGGCGAAAAA
ATCAACCCGAATCAATAATACTATGCGTTTTAATTTTTTTCAAATTTATA
ACCTTTTTGCAACTTTTCGAACGATTCGAACGTTCTACGGTAAAACTCAC
TAAGTTAACTTCACAAATACGAATTTGTTTTTTTTACAATTTTAACATGG
TTGGTGCAACCATAGGAAATCGGGAAATAGGTGGCAAAGTCAGTAATCGG
CAAATCGGGATTCTCTCCGACATTAAGAAAGTAAACAAAACATTTTGTCA
ACAAAACCAGAAACCTGAAAACTTTTTAATCTCGCAACTAGAGCCACTTG
CACCACTCTTCGATTTTACTGTGTTCGAGTATGGTGTTTGCGCAACTTCA
AGTAAATACTTACCTTCCCATATAAAGAACACCTTACCTGCTAAATTTAG
TAGTCGGCTAATGACGAAATTTTTAACCCCCGAATCATTACCTAAAAAGA
CTTAAACTTCTAAACTTCTTAAAGGATAATTTCTCCCACACACCCCTGTC
TCACAGCCCCGGTGGAACTTTTTTCCTCAGTAGGGATAAAAATTCCTATT
GAAATGCAAATGGGAAAAGAAATTCTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATCCA
TTGGGGTTTTTTGAGTGCAATTTTGAAACATTGAATGTTTAGTTGGGATG
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TTGAAGGCTGAATAGCATCTTTTCGAAAAATGTTCTTGGTGGAAATCTTA
ATGAAAGATAACTTTAAGGTCTTTGTCTTAGCATTAAATATAATTTCCCA
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GGTGGTGATCCCAAAGATATATCTTTTATCAGCATCCTGGGTTAACCAAG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAACGGGGGGGTCCTAATA
AGGTCCGGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAACAAGCGGGGGGGAC
CGTTTATTTGGCACCTAAGAGTACAGATAATTAACAAGAAGGAAAATAGA
AATAAACCGGGTCGCAAAATTTCAAGAAAAATTGAGAAGTAGGTTGAAGG
CTGAATAGCATCTTTTCAAAAAATGTTCTTGGTGGAAATCTTAATGAAAG
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ATCCCAAAGATATATCATCTTATCAGCATCCTGGGTTAACCAAGGAAGCG
GCACAATGGCTCGTCGATAACAGAAATGTAAGGAGAAAATATCTACTTGG
AATGATACAAAATAGGGTGTTTTATACCTTCTTGTATAATTCTTAAAGCA
TTTTATTTATTCGTGCACAACTCTTCGTACTATCAATCTGTAGGATCGTT
GCACTTTTTAAAAACGAGTTCAGAATTTTCAAAGCGGCACCTTGTTTAAA
TGACGCACTAGGGGGGGGCGGGAGCGGCGGGAGCTATTTATATCTAGATT
GTGTATTTTTTTTCCCGGTAAAAGCTAAGACAAGGAAACCTTTTTGTTTT
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CAGAGCCACTAACAACGAATCGTCTTTGAGTCTATAACTAAAACAAAGGC
AAAAGCTTCAGGATTAAGCTTCTTATTCGTGTTCTTTGAGCATGCCGTTG
AAACTAAGAAAACAATTTATCATATGATTTTCCCTTAGATTGCATCCTTT
GGTATTGACACACCCTCGCTTGATCATGCAAAAACAACAAATTTTCCAGT
TCACAGAATATTCTTAGGTCAGAAAATACCTGGTTATGAAAATGTTGATC
TGTCGAAAATTGATCAGTTCAGAAACAAAACCAACGTAAGTTCAAAAGCT
TTTTTTTTTTAATGGTTATCATTTTTTCTAATACAGGGTGTCCCTAATAA
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CGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACATAGTCTCATTACAAAAGGTA
GTTACAACGTATAAATTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCT
TAAAATACAATTTTGTGAATACACACTTAAAACTTTCTACTCAATCGCAT
GTTCAAACTCGATACTTTTATTAGGGACACCCTGTATAGTGCCCCTGTAT
CACAGACCCGGTGGGACCTCATACCAGTTGGAAAAATCACACATGTTACA
AAAAATACCAAAAGAGTTTACACCTTTAATAATGAAGTGTATAGATGGGA
TAGACGCAATATAATTTTGAAAATCCCTCAACTAGATATTCGAAGGGTGT
TTGAGATTATTCATTTTAACCAAGAGATCCATCGTCATTAACAAATGTTT
TTAATTTTTTCCCGAGTGAAAGAAAGGCTCCTACCAGATTACTGAGCGAC
AACAGTATTGGGCTTCTGTGTCATATGATATAAAACAACTGACCTTTTCA
TAAATTACGTCACTTGTCTCGTATTCAAACAATTAACATGGCAATTGTGT
CCCTTGAGACATTTTTTTATGAATAGGAAGTAGTTTTAATAAAATCCACT
TCATTGAAGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACATGACAAGTGATG
TTGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTACTTCTAGTAGGTTTTGTCTTTTG
AAAAAAGTATTTTTTCTTCAAATTGTGACAAAGATGTTGGAAATGATGGA
ATAGTTTTTTGGCGTCGGGATCCTAAGAATGATGTAAGATAAATTGAATA
AATTAATAAATGCTCTTTCTTTAAAGGTATTGATCATTGCCATGCCAATG
AAAATTCGAGATGGTACAGGAGCCCCGACCCGAATGGTTGCCATGTATGA
CGACTCAGTGACGTCATCAGCTCAAAGCTCATTTGTTGCCATGCTTTATA
CAACGTTGGTATTGCCAATTGTAACAATGACGTCATTGATGTTGCAATAG
AAAGTACAACAGACCAAGAAGCCAAGCAGCCAAGCTAGACAACAATGCCC
CGCCCAAAAATCCCCCGGTCAGAACTATGACCTAGCCCCTGAAAGCCGAA
GAAGGCAGAAGATCCTTCAGTCTTATTTTTTTCACTTTTTATTTTTCATG
TTATT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_021837	XLOC_021837	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0001544	supercontig	sc0001544:32405..44759 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	1.85528	0.842438	0	0.320098	0	0	0.00849667	0	0	0.450672	0.314515	0	0	0.332007	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00036968 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00036968 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00036968 (transcript) - C. hemisphaerica