XLOC_021837 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_021837
Unique NameXLOC_021837
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001544:32405..44759-

Legend: gene
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>XLOC_021837 ID=XLOC_021837|Name=XLOC_021837|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001544:32405..44759- (Clytia hemisphaerica)
TTTTTCTCATAATGGTAATTTCTGTATCACCAATAACATCGAAACTTCAA TTTGTTGATTTAACATACAATTTGGACAACGTCANTCTGTACCACCAATA ACATCGAAACTTCAATTTTTTGATTTAACATACAATCTGGACAACGTCAC CACACCATATTTTGGACTTTTTGTAGATCACTTCAAGTTTTTGAAAAAGG TATGCTCTTAATTTATATTCGTCTGCTTATCATGATTATAAATTATTTGT ATGATAACTAAAGGATTTTATTTGGATTCTTTATTTGTGCTTTTCGGAGA AAGGCTCTTAACCTAGGCTAGCCTGACGGAAAAAGTTTCTAACCTTTATG ATTGGTAAAGCTCAGAGATTTTCTAAATGCGAAAGATTACGTAATTCAAA TATAAAACGTCAGGTTTCATTTGCTCTATGATTTGAAACCATTGCATTGC GTTGTTTATCTTTGTAAAGTTAGATTTCCTTATGACGTATTGTTTTTAGC GGTCCCCCCTCTGAGACCACGTTCACACGCTACGTTTCGTTTTGCTCCGG TTCCGGAACATTGTGTGAACATTAAAATTGGAAACGTCAAAAAAAGAAGA CGCTACAAGGCAAAAAATAAACGGTTTCGCTCCACTATGAGGCAAATTGT TTCGCTTACACTTTTGCCACTTTTGCCCTAGTTCCCACTTCTGCCACTAT CATGTTGAAACATTTTTAAAAAGTGTGAAGAGTGGCTCATTCAGCTAACA ATTTGCCCCTATTTTCATTGGAACGGAACTGCTCCGTTTTCTTGCTTCGA AACGTTCCGAAATGAGTATGAACACTTCCTATTCGTAACAAATCCACACC GGAGCGATACGAAACCGTAACGTCTGAGCATGGTCTAATTTAAAGTTCTT CAATTCGATAGTCTAATTAGCTAATATTGAAAAGAGTTCCCTAAGCACTC 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ATTATTTTTTTCGTGCCCTTCGTGCCCTTCATGCCTTTCGAAAATAAGTT CGTGCCTTTCGAAAAAAATTTCGTGCCTTTTGAAAAAAAGTTCGTGCCTT TTGAAAAAAAGTTCGTGCCTTTTGAAAAAAAGTTCGTGCCTTTCGGGGAA AAAATTTATAGCTCTTCTTTCACTTCTTCTTTACATCCGCGCTAATTTGT ATGTGTTTGTTGACTTCTCTAACCCGACAATTCATGTTTATACCTTATCG GCCAAAACTTAGTCGACGAAGGCACGCAAGGCACGAAAAAATCACACTCC TTTTTTCATTGCCCATTGCGTTTCAATAACTGATCTATCAGGCAAATCCA AAGACCCATTTTTCGTCCTTCCTATTCTTACTGTGTGAATTAAAGTAGGA AGAGGTCATAAAGAGGTCATATAATCCAAAGGTCAAAGTTACCAAGCTCT AGTTTAGATGGTCGAATTTTTGCTCTGCCTACAACCCCCACCGTAATATT TGGCACAAAAGGGGAATCCCCTCAAATTTGAAAACTGCAAGTGCTTTTTA AGTGCTCTAAAGTACGTTTGGAAAGTAGAGTTTTAACTCTTGAGTTTTAA CATGAAACTTAACACTTAGGACCTTAGGATCTCAGAATCTTAAAGCTCAA AATTGTTCCAATAAGGCTGACAATATAGCCTGGAAGCCACTTAACCCTCA CAAATCGAAAAATCCAATGAAACAAAGTGAGAGAACTGAAATTGCAATTC TCGCCCGATCTTTAAATTCTGAAAAACGTTAAAATACGCAAAAAGTGCCA ATATATTTCGACGTTGATTGTATTCTAATTGTTAAGAAGGAGCTAAAAAA CATCATTTAATTAATAAAGATGTACACAATTTTCTCAAAAATCTAAAAAT CCATAATCACATGATAGTTAAGTATTAAAACGCCTTTCTTATAACTGTGG ATGTGACATGGATGGCTGACGAAACTAAAGAATTATTACAAAAGTCAAAA TATCTTTGTTTTTGTTCTATATTTTTCATAGTCTAACAAAATTAAGCGAT GTTTTTTGAAATAACAAGCTTAGTTTATGAAAATGAATCAGACAACAGAC CGAGCAAAAAAACATGGTTGGTTATAAATTTCGAGCTCGACTTTTTCGCA TAGGGACCTATTTTGAGAATCTAATTGCTAGGTAGCAGCTACGAGAAAAA CAACACCTTCGATATTTCTTTTCAGCTCTTTTAGCTTGGATATTCTGCAA TATTTTGGACTTGTTCAACTCCGGTTTAACCCCAATCTCGTACAAAGAGC ATGGATTTATAAAGCCTGAAGGGGTAGATGTCGTGCTTTGGCTGAAAAGT GTGTCGAGGTTAGGTAGGAAATCCTACCTAGGTCACGTGACATTACGATA GAATTTCAGCGCTTGACCAATCAGAAGCTTCGCAGGTCTTCGAAAACAAT AGCAATATTATTTTTTGCGATATTATATATTTTTTTTGCTTGAAAGAGCT TAAAGCGCGACATCTATAAAATATGTGACCAAGAGCCGGTTGAGTACTTT TAGATTTTAGTGCTGGACATGATACAAATCCTTTTGTGAGCACTATTGAA TTAATAGAAACGAACCAAGGACTGTGTTCCAGTTTTGGGTATGAATCTCA TTGCAACACCGTTATTATCTTCTAATAGGTTGAATTTAAACAGCCAGAAG ATTTTTACATCTCATGGAATGTTTTCAGTACGAACGAGCACATGGGAACA CATATCGATGCACCAGTGCATTTCGTGAAAGGTAGTCAAACTGTGGACGA AATCCCTTTACAAAGACTTGTAAGTTGAATATAAAAACTTTTGAAATCAT AGGAATACAAAGAAATTGATTGTTACTGTCTGCTCAAACTACAATTTACT ATACAGCGGAGTCTCTTTAACTCGAACCTCTATAACTCGAATGTCTCCTC CATTTTATGGTTTCTTCACTAAACAATGCCTTATAAACCTTACTCTATAA CTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAACAAATTTTTATAGTCCCTTCTCTATA TAATTCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGA ACAAATTTTTATAGTCCCTTCTCTATATAATTCCTCATAAACCTTACTCT ATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAAAAGGTTTTAGAGTCCCTTCTCT ATATAATGCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACT CGAACAAATTTTCAGGTCCCTTCTCTATATAATGCCTCATAAACCTTACT CTATAACTCGAAATGTTTCCTTAACTCGAAAAGGTTTTAGAGTCCCTTCT CTATATAATGCCTCATAAACCTTACTCTATAACTCGAAATGTTTCCTTAA CTCGAAAAGGTTTTATAGTCCCTTTTCTATATAATGCCTCATAAACCTTA CTCTATAACTCGAAAAACTTCCGTAACTCGAGCAAATTTGTGTTCCCCAT GCGTGTTTGAGTTATGGTCAGCTGTAAAACATTTTTTATAAACTCTTCAG GTCGGAAAGCTGTTCATACTTGATGTTGAGGAGGAAACATTGAAAGACAG ATTTCTATATATCACAACACAACATATCTTAGATGCAGAGAAAAAACAAG GAAAGATTGAAGATGGCTCCATCCTTCTCGTTAATACAGGTATAAATACC TCCTTTTTTCAACAGCATGCGGTCGGGCGGACGGGCGGACGGGCGAAAAA ATCAACCCGAATCAATAATACTATGCGTTTTAATTTTTTTCAAATTTATA ACCTTTTTGCAACTTTTCGAACGATTCGAACGTTCTACGGTAAAACTCAC TAAGTTAACTTCACAAATACGAATTTGTTTTTTTTACAATTTTAACATGG TTGGTGCAACCATAGGAAATCGGGAAATAGGTGGCAAAGTCAGTAATCGG CAAATCGGGATTCTCTCCGACATTAAGAAAGTAAACAAAACATTTTGTCA ACAAAACCAGAAACCTGAAAACTTTTTAATCTCGCAACTAGAGCCACTTG CACCACTCTTCGATTTTACTGTGTTCGAGTATGGTGTTTGCGCAACTTCA AGTAAATACTTACCTTCCCATATAAAGAACACCTTACCTGCTAAATTTAG TAGTCGGCTAATGACGAAATTTTTAACCCCCGAATCATTACCTAAAAAGA CTTAAACTTCTAAACTTCTTAAAGGATAATTTCTCCCACACACCCCTGTC TCACAGCCCCGGTGGAACTTTTTTCCTCAGTAGGGATAAAAATTCCTATT GAAATGCAAATGGGAAAAGAAATTCTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATCCA TTGGGGTTTTTTGAGTGCAATTTTGAAACATTGAATGTTTAGTTGGGATG AAATCAAAGTCAATTTTTCAGTGGGGTGAAATTCCAGGGTATTTTCCCGA CGGGGACGAAATTTTTCCAAATCTTACAGTTGGTCCCAGTAGGTCTTTGA CACAGGGGTCGTTTCTACGCCATATCCCATACAATTGGAGATTACTCCCC TCCCTTGTCTCTTTCTCAGTGAGGTTTTATCTTATACAAACTTATCTTAT ACAGCAGGTCTTTGACACCCCTGGTGTTTCTACGGCATTACCCATACAAT TGAAATTACTCCCCTCCCTTGTCCCTCTCTCGGTGAGGTTTTATCTTATA CAAACTTATCTTATACAGCAGGTCTTTGACACAGAAGTGTTTCTACGCCA TTATCCATACAATTGAAATTACTCCCCTCCCTTGTCTCTCTCTCGGTGAG GTTTTATCTTATACAAACTTCAACCACTTACAGATAATTAATAAGAAGGA AAATAGAAATAAACCGGGTCGCAAAATTTTAAGAAAAATTGAGAAGTAGG TTGAAGGCTGAATAGCATCTTTTCGAAAAATGTTCTTGGTGGAAATCTTA ATGAAAGATAACTTTAAGGTCTTTGTCTTAGCATTAAATATAATTTCCCA TTCTTGACTTAGGTTTAAGCAAATTCGTATCAAACCATACAAAATACTTT GGTGGTGATCCCAAAGATATATCTTTTATCAGCATCCTGGGTTAACCAAG GAAGCGGCACAATGGCTCGTCGATAACAGAAATGTAAGGAGAAAATATCT ACTTGGAATGATACAAAATAGGGTGTTTTATACCTTCTTGTATAATTCTT AAAGCATTTTATTTATTCGTGCACAACTCTTCGTACTATCAATCTGTAGG ATCGTTGCACTTTTTAAAAACGAGTTCAGAATTTTCAAAGCGGCACCTTG TTTAAATGACGCACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAACGGGGGGGTCCTAATA AGGTCCGGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAACAAGCGGGGGGGAC CGTTTATTTGGCACCTAAGAGTACAGATAATTAACAAGAAGGAAAATAGA AATAAACCGGGTCGCAAAATTTCAAGAAAAATTGAGAAGTAGGTTGAAGG CTGAATAGCATCTTTTCAAAAAATGTTCTTGGTGGAAATCTTAATGAAAG ATAACTTTAAGGTCTTTGTCTTAGCCTTAATTATAATTTCCTATTCTTGA TTCAGGTTTAAGCAAATTCGTATCAAACCTTACAAAATACTTTGGTGGTG ATCCCAAAGATATATCATCTTATCAGCATCCTGGGTTAACCAAGGAAGCG GCACAATGGCTCGTCGATAACAGAAATGTAAGGAGAAAATATCTACTTGG AATGATACAAAATAGGGTGTTTTATACCTTCTTGTATAATTCTTAAAGCA TTTTATTTATTCGTGCACAACTCTTCGTACTATCAATCTGTAGGATCGTT GCACTTTTTAAAAACGAGTTCAGAATTTTCAAAGCGGCACCTTGTTTAAA TGACGCACTAGGGGGGGGCGGGAGCGGCGGGAGCTATTTATATCTAGATT GTGTATTTTTTTTCCCGGTAAAAGCTAAGACAAGGAAACCTTTTTGTTTT AAAGATATGACCTGTTAAAGATGAAGAGACTGTTAAGGTTCCAAAATGAG CAGAGCCACTAACAACGAATCGTCTTTGAGTCTATAACTAAAACAAAGGC AAAAGCTTCAGGATTAAGCTTCTTATTCGTGTTCTTTGAGCATGCCGTTG AAACTAAGAAAACAATTTATCATATGATTTTCCCTTAGATTGCATCCTTT GGTATTGACACACCCTCGCTTGATCATGCAAAAACAACAAATTTTCCAGT TCACAGAATATTCTTAGGTCAGAAAATACCTGGTTATGAAAATGTTGATC TGTCGAAAATTGATCAGTTCAGAAACAAAACCAACGTAAGTTCAAAAGCT TTTTTTTTTTAATGGTTATCATTTTTTCTAATACAGGGTGTCCCTAATAA AAGTATCGAGTTTGAACATGCGATTGAGTAAAAAAGTTTGTGTGTGTTAT CGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACATAGTCTCATTACAAAAGGTA GTTACAACGTATAAATTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCT TAAAATACAATTTTGTGAATACACACTTAAAACTTTCTACTCAATCGCAT GTTCAAACTCGATACTTTTATTAGGGACACCCTGTATAGTGCCCCTGTAT CACAGACCCGGTGGGACCTCATACCAGTTGGAAAAATCACACATGTTACA AAAAATACCAAAAGAGTTTACACCTTTAATAATGAAGTGTATAGATGGGA TAGACGCAATATAATTTTGAAAATCCCTCAACTAGATATTCGAAGGGTGT TTGAGATTATTCATTTTAACCAAGAGATCCATCGTCATTAACAAATGTTT TTAATTTTTTCCCGAGTGAAAGAAAGGCTCCTACCAGATTACTGAGCGAC AACAGTATTGGGCTTCTGTGTCATATGATATAAAACAACTGACCTTTTCA TAAATTACGTCACTTGTCTCGTATTCAAACAATTAACATGGCAATTGTGT CCCTTGAGACATTTTTTTATGAATAGGAAGTAGTTTTAATAAAATCCACT TCATTGAAGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACATGACAAGTGATG TTGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTACTTCTAGTAGGTTTTGTCTTTTG AAAAAAGTATTTTTTCTTCAAATTGTGACAAAGATGTTGGAAATGATGGA ATAGTTTTTTGGCGTCGGGATCCTAAGAATGATGTAAGATAAATTGAATA AATTAATAAATGCTCTTTCTTTAAAGGTATTGATCATTGCCATGCCAATG AAAATTCGAGATGGTACAGGAGCCCCGACCCGAATGGTTGCCATGTATGA CGACTCAGTGACGTCATCAGCTCAAAGCTCATTTGTTGCCATGCTTTATA CAACGTTGGTATTGCCAATTGTAACAATGACGTCATTGATGTTGCAATAG AAAGTACAACAGACCAAGAAGCCAAGCAGCCAAGCTAGACAACAATGCCC CGCCCAAAAATCCCCCGGTCAGAACTATGACCTAGCCCCTGAAAGCCGAA GAAGGCAGAAGATCCTTCAGTCTTATTTTTTTCACTTTTTATTTTTCATG TTATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036968TCONS_00036968Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00036967TCONS_00036967Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00036966TCONS_00036966Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00036965TCONS_00036965Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00036964TCONS_00036964Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Putative secreted antibiotic proteinTCONS_00036967-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001544supercontigsc0001544:32405..44759 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.64 0.8 0.4 0.32 12.45 7 2.35 3.06 1.13 2.62 25.06 0.54 3.16 3.43 1.26 2.48 1 1.53 2.96 2.03 0.97 1.32 0.21 0.06 0 0.17 0 0 0.06 0.26