XLOC_026258 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_026258
Unique NameXLOC_026258
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0003411:3570..7718+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_026258 ID=XLOC_026258|Name=XLOC_026258|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4149bp|location=Sequence derived from alignment at sc0003411:3570..7718+ (Clytia hemisphaerica)
TCTGATATATGTTtgtatatcagagtttagatgcaaatggtttgttttga
tatatatcCGGACTCTTGAGACAGCCTCACTCTCATGCCTATTTAAGGCC
TCAGTTCTTCCACATGgacctttttcagttcttcatttgCCTAGTGCTGA
CTGCTGTATTTTTGCTGTTTTATATCCTGTGCTGTGGTGCTGTGCTTCTA
ATCAAATCATGCTATCTCAAAGACTGTTTTTTACTATCCTGATGTTCCTG
ACCACCCCTCCTCTAACTCCTACCCCAGCTGCTGAGGATGACACCACCAA
TGCCACCAGGAAAAAGAAATGCCCTGGATGCCAGAGAAATCATGATATTC
ATACCTTTGGCCCACCAGGTAGGAATTGTCAAGGCCCTGTTTCACCAAGC
TCCTCCACTCATTCTCCGAACAGAACACGGTCTAGTCGTGTTGCTAGTCC
AATAGACTCTGGGAAAAACCCCAACGCTGGGGCCATGTCGGATGAACAGC
TGAACCAATACCGCCAACACTTacaacttttgaaaaatcaagagTCTGAA
CTTTTGGAATCGATTAGACTTGAACAGGAAAACTATTTAAGGGAAGAAAA
CACCCTTAAAGATGAAATCCAACGTCAAACTGAAAAGCTTGAACGTCTCA
AGGCTGCAAGAAATCGCCCATCTCGTCCCGCCACACCGCCTGCGAACCAA
AACAATATTTCACGCTCAGGGGAAACCCGTTCTACGgaatccgccatctt
taattcGTCTGATAACATGTCTACGTTACTTCATCGCCCGCTTCTTTCAC
ATCAACAAACTTCTGCTGGTACTTCGTTTGGTTTTGCTGCTACTGGTGCT
ACTGTTCCCTTGTTGAATTCTGGTTTGAATGGTCAAGATCCTTCCTTTGT
CAATCGCCGATTTACTCAAAATGAACTTTTCCTGCGCCCAACACGTACAA
ATGACATCACTAGAGGTAAAGCATTACGTATTGTAGACTTTGTTTCCAGA
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NNNNNNNNNNNNNNNNGGACTCGGCAGGAATGCCAAGCTGCTTTTGATAC
CCTTCACTCACTCCTGATATCCCTAGGTTTCACTATCAGTCCTTCTAAGC
TTGTTTCGCCTTGTCAGAAACTTGTGTTTCTTGGTGTTGAGATTGATACT
ACAATATTGACTCTCGCACTTCCTGCCAGAAAGCTAGGTGACCTGCGAGA
CGTCCTGATGTCTTTTCANATGTTGTTGCTGATCATGTCTCTCGATTGCA
TGAACACAAACATCTTGCGGCTTTTCTCCAGTATCTTTGTGACCACTTTT
ATCAGTTTGCTTTATCTGATGACATTGTCTGGCACATGTCTGAGAACTGT
TTCTTGTTTCTTCTTGGTTTGTATGGGTCTGGCTCATGCCTTCACTCTGC
CTTTTAGACTTTGCGTCTTCACTGCTGGCAGATGTGCAGTTCTATCGTGA
AGCCACCTATGCTGTCAATACCCGCAAGGCCTACCGTACGCACCGTAAGG
TCTATCTTCAGTTTTGTCATATGTTTGACATTCAACCAGCTCCGGCTGAC
TGCATTCACATCTGTATGTATGCTGCCTACCTTGCTAGGTTCCTGTTGCC
GCAGTCTGTTTGTgtttatttgaattttgttgGTCTGCTGCACCGTGAGA
TGGGTTTCCCGAACCCTCTTCTTGACAACTGGTTCCTTTCCTCTGTGCTC
AAGGGTATCAAGCGTTCCAAGGGTATCCCTCCCGTTCCCAAGCTCCCCAT
CACAGTGGATATCCTTTCCTTCATTCACTCCCAGCTCAACCTTCTGGATA
GCAAGCAGGCTTCTTTTTGGGCTTTGTGTCTTGTTTCCTTCTTTGGGCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00042417TCONS_00042417Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00042417-proteinTCONS_00042417-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0003411supercontigsc0003411:3570..7718 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.1	0.09	0.49	0.19	5.55	4.95	5.89	6.96	3.38	4.72	3.2	2.94	3.8	4.51	0.25	0.09	0.1	0.11	0.17	0	0.12	0.16	0.03	0	5.79	5.79	0	0.09	0.03	0.07