XLOC_024670 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_024670
Unique Name	XLOC_024670
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002463:2616..9294+

gene from alignment at sc0002463:2616..9294+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_024670 ID=XLOC_024670|Name=XLOC_024670|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6679bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002463:2616..9294+ (Clytia hemisphaerica)
tcatttcataaaatCTCCGCCCAATCTAATATTGGTTACCGCCCTCACTC
GGATAGTAAATCTAGGACATCGTCCTAAACTACCCCACTTAGCTTTCAAC
TcgcaaaacaagatggcggaacAAGAGTAAGTGTaattaaaattctttga
attccCCAAATATCCAAGTAATCTGACACATATTGAAAGTGATAAAAGGC
TCAGCCATCACTGAGAGGATAATGGGTCATAACTAAGTTACTCATTTCAC
TTCGAGATACAGGAACTAGCTGGTATAGCCATAGATTCTTGTTTTGCTCG
TTGTTTTGTCAGATCAGAATAGAAAGAAACAATAGGTTAAGCCCCCAGGG
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ttgaattccCCAAATATCCAAGTAATCTGACACATATTGAAAGTGATAAA
AGGCTCAGCCATCACTGAGAGGATAATGGGTCATAACTAAGTTACTCATT
TCACTTCGAGATACAGGAACTAGCTGGTATAGCCATAGATTCTTGTTTTG
CTCGTTGTTTTGTCAGATCAGAATAGAAAGAAACAATAGGTTAAGCCCCC
AGGGCTAACCGTTCCACAATACTTATTACCTGTGGTAATATGTTTTCTCT
TTTATGTCACAGGATTGCCAACAAAGAGAAACAGGCAGCTGGCTCAAGTA
AGAGAAGTGCTGACGTCCTGGGAGAAGATGAACTTGAAGGGCCAAGAGCT
AAAGTGTCTTGTCTAGAACTTTTTGAAGAGGACAATGCAATAAACTTAAG
ATCAGATCTAGCGGATCAAATAAACAACTACATTCGCAGACATGTCTCGG
ACAAAATTCTAAAAGAGAAGATTTTGGAAGACTATCCGATTCCATCTAAC
ATAGACAAACCTCAGAAATTGGATATGTTTATGAAGGACACTTTAacctc
ttacaaagcatttgCTATGGCGAGAGATAGCCAATTGTATAACATTCAGT
CTGGTATACATAAGATTTTTGGACCACTGGCCAATCTTTGGGAATTGGCT
GAGGAGGACAAGAAAGACCTGCTTTCTAAGGAGGATGTCCCAGACGAGGT
GAAGGAAAAGATGGAGGAAATGTGCCGTTCCTTTACCAATGTTATTGCAC
TTGTCGGACAGGCGTCGAACAAAGTTGCATATTATAGACGTTTAAACATG
GTTGAAAATATGACAGGCGACTCTAAGAGAGCCAAGTAACTTCtaagtga
aaatgaagaagttttcaatgaaaaatcttGCAACCTTTTTGGTGAAAAGT
TTGAGGATCTCATTGACAAGTTAGccaaatccaaaaagaaatcaaaagat
gcATTGTCTAATCTTGCATCACCCAAGCCGGTATCCAAGAAGCCCTTTCA
CAGGAGCTCTCTATCAAATGCAGATCAAGGAGGAGATAGGGGGCGTGGAA
ACCGAGGTGCCTTCAGTGGTTGGTTGGCCAGGAGTCAGTCATCCTTCAAC
AAAAGAGGTAAGCCATCCTCCTTCAAATCTTCTGGAAATTCTACCAATGG
GGAAATTTCCAAATGTTCTCCCAGCAATAAAGGGGCTTTTTCCAAAGGAG
ATCCCTCAAACACCATTAGCAGGAAGGACAAAGTTCTTCCTGGAAAACTG
GAAGAAACTAACAAGCGATCAGATTTTATTAGAGATGGTGAGCGGGTACA
GAATCCCTTTTCTAGAAAACCCTCCCCCAGTTTTGAGACAAAACCCTTAC
GTTTCTCAAGTAAGTCAGGACATGAGGGAATTAATCCAGGAAGAGGTGAA
AAGTATGTTGCTCAAAGGGGCAATCGTGACAGTGACACCATCACCAGAAC
AGTTTGTCAGCCCTCTATTTTTGGTGCCAAAGAAAGACCAGGGGCAAAGG
CCAGTGATAAACCTGAAAAACTTGAACAAATTTATTCCATACGAACACTT
CAAGATGGAGGGATTATTTTTAGTGAAGGAAATTCTGAAGCAGGGGGACT
GGATGTTAAAAATCGATCTCAAGGATGCATATTTCGCCATACCTTTAGAT
CAGCATTCTCAGAGGTTTGTGAGATTCGAATGGGACAAGACCCTATACCA
ATTCCAGTGTCTCTGTTTCGGTTTATCTCCAGCTCCAAgagtgttttcaa
aaattctgaagGTTCCAATTTCACTTCTGAGGAGATTAGGGAttcgttta
atcatatttctgGACGATATCCTGCTAATAGCCTCGACTCCAGAGGAGTT
GAGACAGATGAGGGACACAACTATTTTCCTTTTGCAAAGTCTTGGGTTTC
TAATAAATGTCAAGAAGTCAGTTTTCGAACCAACCCAAAAGATAGAATTC
TTGGGGATGATAATAGACTCAATCAAAATGACTCTAAGCCTTCCAGAAGA
GAAGGTGGTTGCCATAAAGAAGCAATGCTCAGAAATGTTAGAAAAGGAAA
AGGTTCCCCTGAGGGAGTTATCGAAACTAGTGGGCAGGTTGTCTGCCTCA
ATGCTAGCAATATTACCAGCACCCCTTCAATACAGGAGCCTTCAACGACA
ACAGATTTCAGAGTTGAAGGAACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCcgatttta
tgaataaaatcgAAGCCAACGGTCTAATATTGCCCGCCCACCATCTCCCT
TATTGGTGTTTCATTTCATaaaatatgttttattttttctctaCTTGTCA
GGTAATTCTGCTTTCAGAGGACGCGGACGTGGCCGAGGAAGATTTGGTGG
ATGATTGAAATATTATTTCAATGAAAGATACGATTCTTAAACTAAATATT
GAtattgtttctttctttctttatgtTTTATCCCGGACTTGTCCTAGATT
TACGATGCGAGTGAGGGCGGTAACCAATATTAGATCGTTGGCTTcgattt
tattcataaaatcgGGATTGCACTGCGGG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00040545	TCONS_00040545	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00040546	TCONS_00040546	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00040547	TCONS_00040547	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00040545-protein	TCONS_00040545-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0002463	supercontig	sc0002463:2616..9294 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.28	0.16	0.24	4.52	3.62	4.25	4.77	2.5	3.5	3.57	2.57	4.49	4.26	0.17	0.61	0.22	0.24	0.28	0.27	0.23	0.25	0.23	0.23	7.95	10.22	0.21	0.22	0.08	0.08

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