XLOC_024393 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_024393
Unique NameXLOC_024393
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0002350:2..6572+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_024393 ID=XLOC_024393|Name=XLOC_024393|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6571bp|location=Sequence derived from alignment at sc0002350:2..6572+ (Clytia hemisphaerica)
TTGTACGGCAAGTCCAAGGTCACCAAAGATGGAAGATCAACAAAGACTCC AGTTTCAACAGTCGTTATATCATTACGAGCTAAGAATAATCGTCGTAGCT TAGCTAATCCGGTAAACGTACCCTTTCGCAGAGTCGTCAATTTATTACCT CCTGCGTACAGATATTCTAGTTGTGAAAGATTCTGAAAAACACGAGGTTC CAAATTTTCAATACCATTTCTTTGAAGAAATATAGTTATGATAGAATCGT ACCCTTCAAAGTCcttttgtttaattttattaatattattgtCTTCTAGC TCGAGAATGGTGATGCTTGGTATATAAAGTGATACGTTTGCAGGCAATCT GGTCAGTTGGTTTTCGTTCAACAAGATTCGATCAAGTTTagtgaaattaa caaaaagttcaGCTTGAAATTCGGTGATTAGGTTTCTGCTGAGATCTAAA TAttcagttttatttttatccAATTGTGATGTAATATCCAGAAGATCTTT ATTGGTGATATTTTGGTTTTCACAATGCACATCGACGGCACTATGATCCC AATAACACTTACATTTTGTTGGACAAGTTGTTGAACTTGATGCAAAACTG GAAACAATGCAAGCCAATAAAATGAGAAGATGGTGGAATAGCATATTCNT TGCAAAACTGGAAACAATGCAAGCCAATAAAATGAGAAGATGGTGGAATA GCATATTCATAATTTTGTTTGTCAGTTATTTTTCTTTAGGTTTTTCCTGA AAATGAGAATAAAGTGATTTTATAGTTTGTGTTATACACATATTAATTAT TAACAGCTTattttggcacgaaattcaaaccaaatataAGCAAATTCAAA CTAAGTCTTAAATACCCATGCTCTCACTGAGTAGCNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTAAAACACTACAAAAGAACACCAA CATTAACATAAAACATCCAGTTATTTGACTATAAAAGATTTAAAGTGTGT TCTAAAGATCTTTAGCTATAGCGTTATTGATTACATCgatatacagttga ctctctctaattcgatttttgaAGGGCAGATAATCTTCTTCGAATTTAAG Aagtattcgaattacagagagtattttatatcattgtccagttgagggga ccaatatttcaGTTCCAAATACGGAAAGATACGAATTgcagaagttcgaa ttagttAGTGAGAGATTTGACGGTATTTAACCTCCATGATTCAACTACAC AGGGACGCCTTCCAATTTCTCTGATCATTTGTTTTGAGACATGTTCACCT CCTCGCCATTATCTTTGTGTCCTCTTCGACGTCTCAAAAAGATAGCCAAC CCAACCAATCCAATCAAAACTAATATCGCCAACACCACCATTAAGATGAT GAAACCAGTATCTGGAGTTGATAATTGACATTGTTGACCATGATAACCTT CTTTGCATTGACATGTATATCCCATTGAAACGTTACTTATCTGACTGAAT TGGTCAACAACTTGACATGTTGCATTGTTTTGGCATTCATTGACAAAGCA GGAACTAcaatttaatttgttcttgCGGTAGAAATCTTCCAATCTTCCAA TACCATTGCACCAACCCCAAACTGTTCCATCATGGTAACTTTCAAAATAA GTAATTGTATAATGCATAACACAATCGCATATCAATGGGTTGTTCTCGAG TCTCAATAGTCTGAATATTTCAGGAACAGCTGAACCAAACCAATCTCTTC GTGCTGTTGTTATCTTattgaactgcaagtatatccAACTCAAAGACGGA AGATCACCAAAGACTCCAGTTTCAACAGTCGTTATATCATTACCAGCTAA GAATAATCGTCGTAACTTAGCTAATCCGGTAAACGTACCCTTTCGTAAAG TCGTCAATTTATTACCTCCTGCGTACAGATATTCTAGTTTTGAAAGATTC TGAAAAACACGAGGTTCCAAATTTTCAATACCATTTCTTTGAAGGAATAT AGATATGATAGAATCGTACCCTTCAAAGTCcttttgtttaattttattaa tattattgtCTTCTACATCGAGAATGGTGATGCTTGGTATATAAAGTGAT ATGTTTGCAGGCAATCTGGTCAGTTGGTTTTTGTTCAATGTGATTCGATC AAGTTTagtgaaattaacaaaaagttcaGCTTGAAATTCGGTGATCAGAT TACTGCTGAGACTTAAATGCACAGTTTTTTTTGTATCCAATTGGGATGCA ATATCTAGAATATCTTTGTTGGtgatattttggtttgtacaaaACACATC GACGGCACTATGACCACGTTCCCAATAACACTTACATTTTGTTGGACAAG TTGTTGAACTTGATGCAAAACTGGAAACAATGCAAGCCAATAAAATGAGA AGATGGTGGAATAGcatattcataattttgattgtcagttatttttcttt aggtttttcctgaaaatgaaaataaagtcgTTTTTATACACATTATTAAT TATTCACAGCTTattttggcacgaaattcaaaccaaatataAGCAAATTC AAACTAAGTCTTAAATACCCATGCTCTCACTGAGTAGCATCTGATGGGAT TTTTCTtttatgtggtgtaagttttGGTTAGAGAGAATGGATCTTAAGAC TAGGTTGCGNTCTtttatgtggtgtaagttttGGTTAGAGAGAATGGATC TTAAGACTAGGTTGCGTCAACTTTGACTAAACTTGTTGTCATTTCAAGTA TTGTTTTctaaaagcaaaataaaaacccCTGTAAAAACCAGGCAAAAACT CAACACAACTTCTTCATCTACCAAAGaactttcgaaaataaaaaataagg aaataaaCATCCAAACTTTCCACATGTCCACTTAAAATCACATGACTGAA TACTCGCATTTGATTGGCTAGTGATATTTGTGGTATTGTATAAattaaat catcaaaatttacatTAACACTACAGAATGTTAGTGAGACTCAATGGACT AGACTCAATGGacgcaatggactgtgttcgaacCCAAGCACTANNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCATTAGTTGGCACTGCAAAACACTCA GGCCATCCACTGAAATGATCAACGAATGAGACAATGTATCTGTTACCAGC GTGCGTTTCCACGTAAGGTCCAAGAACGTCACCGGAAATGTCTCTCCATG GTGCTGTAGCTTCCGAAGGGTACAATTCAGatattttctttcttccttTG TATAAAAATGTAAAGAAAGATTCTGAAAAACATGAGGTTCCAAATTTTCA ATACCATTTCTCGGAAGGAATATAGCTATGATAGAATCATACCCTTCGAA GTCCTTTTGTTCGAAGttattattataattattgTCATCTAGATCGAGGA TGGTGATGCTTGATATATAAAGTGATATGTTTGCAGGTAATCTGGTCAGT TGGTTTTTGTTCAACGTGATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00040195TCONS_00040195Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00040196TCONS_00040196Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00040197TCONS_00040197Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00040198TCONS_00040198Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0002350supercontigsc0002350:2..6572 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
13.81 14.77 7.45 5.65 8.35 6.61 9.38 8.69 9.44 8.22 5.8 3.43 6.31 10.69 17.98 27.25 1.45 7.16 0.07 1.1 0.42 0.75 8.96 5.83 0.8 1.82 8.42 2.9 1.38 2.66