XLOC_022559 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_022559
Unique NameXLOC_022559
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001726:14218..24266-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_022559 ID=XLOC_022559|Name=XLOC_022559|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10049bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001726:14218..24266- (Clytia hemisphaerica)
ACCCGTCTATGTAAATAGTAGCGGATGGACATCGGTTTACGCTATTAAAA AAATACGGATCTTCATCGAAGTACGCTGTTGCTCTGAATCTCTAATGACT GGCGTAGCGGATGACCATCAGATAACGTTCTTTCAAATACCTACATGCAG TTACTGGATCCGGGTGCTTTTCATTTTAAGCGTAAACAACATGGCGACTG CACGCTTACAGAAAGATGTCTTCATGAGTGTTTATTTTCAAGGTTTGTAA CTCAGTTTCTTCTCTAATTTATTATAAAGTTTATGGATTTGAACAACCAT TTTCATATTTTATTTGCACTCATGCAAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTGCT GACAACACTTTTTTCCACATATTCACCCATGATGATAACCAAGTCAAATC AAATGTAATTGCGGTATTAAATTATCATATACCGGTATATATTAAGGACT TGGATTACCTAATAGCTGATTGATAAACCATCAATCGACTCTTGCAGACT TTCATAACATCGACCACTTGTTGCTTGTGATCTTTTCCCAATTAAAAATT ATACGAAACCAATCAAATATAGCTACTTGATGATATCCATTGATTGACGN CTTGTGATCTTTTCCCAATGAAAAATTATACGAAACCAATCAAATATAGC TACTTGATATCCATTGATTGACGTCCGTATAGATTTCAATAGAGGAGGGA ATATCCTATCAAAGGCATTTATGCATTAGTAGAGATGTGTATACTAGACC TTCTCTTGTCGATGTTTTCGAAGAAGTCAAACAGTCAAACCCTGGTCAAA CCAGGCTCTCCCCCCCACTCGATACAATACAATCAATACATTTTTTCAAC GAAAACAATGACCAATCGATAGATTAGATATTGATTGGTTCCGACAATGG ATAGGTAATCAAGCCTATTCCAAAATCTTGAGTATCCATTGATCATCGAT 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CGCCTTACTTTGAATAGCCTTGATAATGAACTAGCCTTGGTATCCGATCG GGGTCTATGTACTTTTCGGTCTCCAAGCCTATATTTAGTAAGACTGCGTA AGATTTCTCAACTGCGGTCGAATAGTGATGATGATAATTTCATTTTCCTT AAAAGTTAGTGAAGGAAATCAAGTTTAATCAATCCCTTTTTCTCTCAAGG ACTGGATCAGTAACCATAACAAGCCTCCAAAAGTGTCAAAGAGGGACAAA TTATATCTAACAAAGCCAAGGGCATATGATGTATTCAGAAAGAAATACTT CAAAGAGTTAGAAGGTTTGTTTTTACGTTAATTTATTACATGCCTAATAA TTCTTACAACGCTGAGTTCCTAGGAGTGAAGGATTGAGAAATATGTTTTT CGTTTTTTTTAAACTCATGCAAAAACTCAATTGTGTGATGATTGGGAAAA GTTACTTTTTACTTGCAATCTGGTGACACGTAAAAGCTTTTACTTCGACT GCGAGGGGACATGTTGTATTACAACAACATCAAAAATACTCGTAGTAAAT ATACTTTTTATTACATATGTGGTTTTTTTCGTAAGGTACTGTATACGACC CACAAATTGCTTTGGCGAAGGCAAATGAGAAATGGGGACAGATTTCGAAG ATTGAACGAAAGATTTACGAAGACGAGGCTGAAGCAGTAGTGGTTGCTGA TTTTCACGAATTGCCGATTGAGGATCAACGATCAAAAATTAATGATACCA GGAAAAAGATATCTAGAATGGTATGTAATTACTTAAGTTTGCCTTCGATT TGAAGTTTTTGTAAGGTGTAGTATATTTCAGGTAGATATTAGTAAGTTTC GGATGTGATTATACTAGAAATTTTAATATCAGTTTAATACTTTCCTGCAA TTCTGTTCCAAAATTAGTGTCAAGAGCTGGATGGTTATGGGGTAGAAGTT CTTGTTATGGACTATGACACCAATGACGAGAGAGCCACAAAAGAAGGAGT CAACAGCTGCGGAAGTTTAAGATCTGCTAGTTTTCTTGAGGCAGAAAACC GCCTGGAGTGGAGGTTTGCTCAATTCATGGACGGTGAGTATAGCTTAATT GTTGGATTGAAATACATAATCCGATTCCACAGTGCACCTCTGGGTTTGGA CTGACATACCTAAATCGACTTGGGTAGTTTTTTTGGTACAGTTTCTGGAG AAACACGAAATTGACCTAGGAGGCAAATGGAGGCGTTCCATCCTTATTAT ACCTTTTAAATTTCGGGGAAATTTTGCTAAAGCTGTCAAGCCTCTCTGTC GCGGTTTTGTGTGCACTCGAAATTAAAGTTCTCTTTTTACATTTAGGGAT ATTGGGTAAAGTTGCGGAGGAAAATCAAGAACCTCGTCAAGCTGCAAGAA AAGAAGTTGTCGACCTTCTTAATAATAAAATTCGTATGTTGTATTTTATT TTGTCTTTCGTTATTTTAACTATATGGACGGAACAAGGTAATTTCTTTAC CGTAGAAAAATGTTTTTAGTGAACATGCTTCATATTTCAAATTCTCTCTT CGTTATTAATTGATTATTAATAAAACTCGCTTTGAGGCTATCGTAGAGTA TTTGGGGGGGGGGTATAAATGAATGCCATAAATGACATTTACAAACACAT CGTTATTGATATATTCGACAATATTTCCTTTTTATTCAAATGGGTTTAGG CGCGTTACAAATAGGAAGAACCACAGTGCCGTATAAAGCAATCGTGGAAG GGTCTGTTGAAGTAATTGGGCTACCAGAAGGCTTTCATTTTCGAAACCCA GCATTGATGACAAAGAAAGAATTGATACTTATAAAGGAAAACATCGACAA TATATCCTTCCTTTGTACGAGTTAAATTTATATTTTCACCTTTTATATCT CTATAAATTAGACTTGTCACCGTTTATTTATTTCTCGAGCTATTATTAAG GAGAATTTGTGGTTGTCTAAAATTTAAATGTTAAAAACAATTCTCAGTTA CGATGCATTAGTTAAAGACCGTTTTATACTAATTTTGCTTTCTTGCAACT TTGAAAAAATTCTTTGTTTTTCCACAGGTCCGAAACCAAGATCGAATGAG TCAGAACTGGAAGAAAATGAGGGTGAAAGCGACGATTTCTTTGACATCAG AATGGAAGACTTTTGTGAGTGGTTAAAACCTGACGATTACGTCCCAAACT CATTAAAGTTGAGAGTCACTCTCAGACAGGTGGTCGAGAAAGACAAGAAA GGAGAGGGATATATAGAGAAGATTCTCGACCATTACGAGAGTACAGATGG GTATATGTTTTCTGTGAAATGGGTCGCATACAAAGAACCAACTTGGACAA AAGGCGATGGTATACCGGAAGAGGACTTGCAACCTTATAAGAAACGTTAC AACCTACTTTAAGTGGATAAATTTTGACACAATTCATTCGAGCCACTCN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00037850TCONS_00037850Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00037849TCONS_00037849Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00037848TCONS_00037848Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00037848-proteinTCONS_00037848-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001726supercontigsc0001726:14218..24266 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.11 1.79 0.87 0.86 52.02 52.2 32.11 43.57 17.9 19.45 16.82 11.64 14.27 11.47 19.13 19.65 21.31 16.3 12.27 13.1 12.81 11.32 6.62 9.36 1.09 6.32 5.75 2.95 6.68 2.94