XLOC_021448 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_021448
Unique NameXLOC_021448
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001454:50787..58460-

Legend: gene
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>XLOC_021448 ID=XLOC_021448|Name=XLOC_021448|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7674bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001454:50787..58460- (Clytia hemisphaerica)
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TTCGATTTCACCCGTTCAAACCGATAGCGGTGGCATTTTATTGTGGTAAA TCAAAGCCCCCATTTAATGAGTTTGTTCGAGATTTTGTTATTGAAACAAA CCGTTTAATAACCAATGGTTTTGTTTTTAACGGCGTCCATAGATCAGTGT CTTTGTTTTGCTTCACTTGTGACGCTCCAGCACGTTCAGGGCTTAGAGGC ACCATTCAACATACAGGCTATTATGCCTGCGAAAGGTGCTCTCTAAAGGG TAAAAGTGTTAGAAATCGGATTGTTTATGACAGGTGGGATCCTCAATCTG ATCCTCCGATTGAAGAGCGTACAGATGAAGTTTTTCGTCAAAATGGATAC GCCTTGCCCGATGACGATGGCAAGCGCCATCAGTTGGATGAGTCTGAACT TGTTGGCTTGGCAATTGACATTATCAGAGATTTTACACTGGACCCTATGC ACTTGGTTTACCTTGGAGTGACTCGCCGTCTACTTTATTATCTAAAAGGT TCTTACAAGAAGATAAAAGCTGGAAAGCTATCTACTGCCTATCTGAATGC GATATCTAGAAATCTTGATGATCTCAAATTACCATCTGATTTTGCCCGAC AACCTCGAAGTATTTCGGATTTAGACAGATGGAAAGCCACTGAATTCAAA TCGCTCCTCCTGTACACTGGTTTGGTTGTACTGCGGCCATATCTTTCCTC AGACGCTTGGAAACACTTTTTGAGCTTCTCTCTTGCAATCAGGTTACTAA GTGAAGAAGTTGATGCAATTCGTAATGCAAATTTGGATGTTGCAAAAGAA CTTTTGAAATATTTTGTTCTTAATGCTCATATGTATTATGGTGAAACGTT TTGCGTCTTCAACGTGCATAATCTACTGCACCTTTCAAGCGATGTGTATT ATTTCCAGCTACCATTGATTGCATTTTCCTGTTTTCCTTTCGAGAATCAT TTACAAAAATTGAAACGCCTCGTCAGAGGAAAATCAAATATACTTAGCCA GATTGTGAAACGATCAGAAGAATTAGATGCTAGTTACTATCTCGATAAAC CCGTGGCGATGAAAATCAAACCTGATGGAAAAAATTCATGCTTTTTAACT TCGCATCGTTTAGTTTTTGTGAAAAGGCAAGAAAATGGTGGTGCCTTCTT ATGCAACACTTATACGTTATCAAATCTTTCCTCGTATTTCAATCTAATGG GTATCGACTCTAAATCAGTTGGTATATTTCTTTTGAAAGGAACTTTGCAA GCAGAGGAGCGACACTATAGTAAAGAAAGTTTCCTGAAAAAGTGTGTATG TTTACCGTATCGAAATGACTTTGTTGTAATTTCATTGATTTAGATGTCTT CCTGCAATAACGAGTCAAATTTTGAAACAGATTTAAATTTTTCTTTGAAA TTGTTAGTACACGTTTTTTTTTTTATATAAGGAACACGTTTATAAGGAAC TCGAGGCTGAAAATGGTCCAAAAAATAAGGAATTGTTTAGGAACTGCTCA GGCTGAGAATAAGAAAACGAGTTTTAAGGAACAGTAAGAGATGGTTATTC AAACTTAGCAGCTATGTAAATAAGGAACTCGATAAGGAACTTTGAGGCTG AAATTATTTGTAAAATTAAGGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTT CCTTATAAAAAATAAAACGTGTAGTTTTTTCCAGAGTTATCATGGTTTAC GGTCGTAGTGCTTGTACAAGTGTATACTCGTTAAAACCTACAAAGTTGGA TTTTGGACTTTTTTAACTTCCAAACTTAATTATCGATATAAATTGTATAA TTCACTTTTTTACAACCTCTTATAAAATGTTCATAAAATATCTAATTTCA GAATTTTATCCCAAAGTGTCGTAAAATTCGAAGTTATTCAAAACTCTATC AAAAATACCTTTAAGAAATCAAGTTTTTCGGACCTAGAGATTACACAATT ATATTTTTAAGGTCGTGTATGCAAATTTTGTATCCACTGGTATAGACCTA TTGTTACTTTGAATTCTTTGCAGTATTTTATTATTGTATTATTTATGTAT TTCTTCTGCCTAAAAGTACCAAGCTTTATTTATTTGTAATTACTATATGA AGAAAAAAAGTGTTTCTTTGAGCATTTTATTATTTTAGAGAGTTTCATAG ACGTTTGAGACTTTTCAGGTTACGAACTATCGTGGTTTTCGTGAATCTTG ACTTTTTTTATGAATGTTAATCTCTCTCCAAATGCTACAGACGATAATGA ACGTTTATGAAAGTAAGGCTTCCTAAAAAGTTGTCAGCAGTGTTTATCCT TTTAATTATCTTAAAATTAATTGTCGTAAAATTCAGTAAATCTCACGACC TACCGAAATCCTAATCTAATATTCTTAAACGAGTGCAATAAGAAAATGTT ATCAATCATTTTTTTTTTCAGAATGGCATACGTATTAGTTAAATGTTTTG AAAATAACAAAATCGTCGAGGCCACCATTCCAAAGCATTGGATGGAAGGA CATACAATGTGGTGGCCAGCACACAAAGCCAGACAATTGGCCATCAGTCT CGCTCCGCTAGACAAAAATTGGAAATCGTTTCCAGTCTTAGAAGTCAAGA GATCTAGTGGTTAGTAAATGTATTTAGAAAATAATGCTTACATCATTGGT CGTTGATTTTAGTATGAGCTTTTCTTTTTCCATTCAAACCTTGTTATTTC TCATTGAATTTTTATGGCTTTACACTTATGAAATATAAAAGTAGAATTCC CGTTTTCGTGTAGTGGATCGATGTCTTGAGCAAATGGCCAAATATTTAAA TCTGGGCTAAAGCTTGTATAATTTCCCATCTTAAGATAAAGTTTAATATT CTATTTAAGACAACTTTGAAGAATTGGAAACTGGATCATACACAACTACG GAAGCTGAAGACAGTCCCGTTAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00036406TCONS_00036406Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00036405TCONS_00036405Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001454supercontigsc0001454:50787..58460 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.92 0.46 1.87 3.72 3.63 3.14 0.2 1.23 1.47 0.96 0 0.6 1.72 1.08 4 2.26 3.32 3.79 4.97 3.98 0.91 1.95 0 1.7 1.62 0.68 1.66 2.89 2.43 2.49