XLOC_012460 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012460
Unique NameXLOC_012460
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000408:38890..51413-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012460 ID=XLOC_012460|Name=XLOC_012460|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12524bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000408:38890..51413- (Clytia hemisphaerica)
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CTGGTTGTCAATGACATTTTACTTTCTCTTGGATGCTTACATAATTCTTG CAAAATGCTTTGCCTGTGTCCTGTAAAAGTATTTTAAGGGTCATTAAGTT AAAAACAAGGAAACTTAAAAAAGTATATTAATTTTAAATTCTTTTAAAAC ACGTATGGTCTAGTAGCTCTAACTGCCTCAGAACTTTTTGCAAATCTTTT TTCAAAACTTTTGTGGTTCTTTTTGTGGAAATGTTTCTGTTCATATTTAA ATCATATTTTCTTCTTTGTCGTGGTTGAAAGACCTCTCCTTTTCACTTTA ATAAAAAGTGATTTGTGGGCTGACCTATTTTTTTCTCTTCTTCCTTCCAA ACAAAAATCAAGCTCCTTTAAAATTCCCTTATTTAATTTATAAACTTTTT TTCTGTTCTATTTCAATGGAAAGTTTGTCTAATCAAATTTTAAAGTGATA TTGATTTAAGGCTTATCGCAAATATACCTCGCTAGAGAAATTTAATCATG GTAGACTTATTATTGGGAAATCGTTTTAAATTCTGTTTTTATAATTTCTC AATAGCAAGTCCTACTACCTACCAGACAAAATCAACAAATCTGTTTCAGT TTCACAATTGCAACTCAATGTTGTAACCAATTAACGAAATTGTCATTGAG TCATCAAATTTTCTTGTTCTATTGATAAAGTGTTGATGTGATGATTGATC GATGGCCTCCTTATCATACAAAAAATGTCTCGTGGCATGTGGATCTGTTT TAAGAGATGTGTTTTAAGATTATAATGAGCTCTATTTTTTGTATAAAACT ATTAGATTTTTCTTTTTCTTAATCATAAGGTTTAATATGTATAACCTTTT CCAAAAGATTTAGGAATAATAAAATTACATGTTCCACCTTTCCATATTGA AAATCGACCTGACAATTTTTCTATGAACCTTGTATCTAGAAACAAATCTA 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ACCTACCAGACAAAATCAACAAATCTGTTTCAGTTTCACGATTGCAACTC AATGTTGTAACCAATTAACGAAATTGTCATCGAGTCATCAAATTTTCTTG TTCTATTGATAAAGTGTTGATGTGATGATTGATCGATGGCCTCCTTATCA TACAAAAAATGTCTCGTGACATGTGGATCTGTTTTAAGAGATTTGTTTTA AGATTATAATGAGCTCTATTTTTTGTATAAAACTATTAGATTTTTCTTTT TCTTAATCATAAGGTTTAATATAACCTTTTCCAAAAGATTTAGGAATAAT AAAATTACATGTTCCACCTTTCCATATTGAAAATCGACCTGACAATTTTT CTATGAACCTTGTGTCTAGAAACGAATCTAAAACATCGTGTTCTGTTTAC TTTGTAGGCTCGAAATGTAGGGAAAGCATACCTTTGTACTAAAGATCTTT CACAAAATGGAACTACTACCACCTGGATTCACCAAGACAAAACAGTCATG TTGGTCATCGAGAAGAAGGAAACACTGATGCCAATATGGGCAAAAATCAT TTTGATTGGTGTCCTCATGGTTCTCTCTGGAATGTTCTCTGGTTTGAATC TCGGGCTGATGGCTCTGGATGTCCAAGAATTGAAATTGGTTTCTAAGAGT GGAACACCTCGACAAAAGAGATATGCCAAAAAGATTGAACCTGTTCGTCG TCAAGGGAATTTCCTCCTGTGTACATTGTTGCTAGGTAACACGTTAGTCA ATTCATCCTTCACTATTTTGTTGGACAGTTTGACCAGTGGTATCGTTGCA GTTGTTGGTTCAACAATGGCTATTGTCATCTTTGGTGAGATCGTACCACA AAGTATTTGTTCCCGTTATGGCTTAGCAGTTGGTGCGTTCACCATCAACA TGACCAAACTTTTCATGATCCTTACCTTCCCGCTCTCTTTCCCAATCAGT 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CATTAAAGAGAACAATTAAAATCGCGTGTCCAAAACAAACTTGTAAAACA ATTGAACATTCAAAATTAGCCGAATTNCGCGTGTCCAAAACAAACTTGTA AAACAATTGAACAATCAAATTTAGCCGAATTTGGTTTGATTTTTTATTTT GACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATCCGCTGCATACAGCTTGTTTT CAAATTTCACAAGTACTGTTATGTCCCTTTAAAAGACTATTATTATAAAT AAACTTACTGTTTAGCCATTCTCCAAAATAGAGAAGAAATAAAGGGACCA AAAATAACGTCAAAGTTGTATAGAATATCGGAACGGCGTTTCTTAAAAAA ATCTCCCAATTGATTTTCTAAACAGCGATAATTCTTATAATCAATATTTA GACAACCGATCTATAGTTTTTATGGAACGTCAAGTTTAGAGTGGATTTCC AAAATTATACTAATCATTAATTTCACGTTTCTTTTAATTTCCAGTTGACA ATGTGTCCGGACAGAAGGTTAAGCGGAATAACCAGCAAGATTTCTCCATC TTTTTACCGGACGCGCCCACCGTATCAAAGATCTCTCCACAGTTATCTTT TGCTATCTTCCAGTATTTATCAACTTGTAAGTTCCCATCACCATTTATTA TCTTTGTCTCCTTCTCTGATTGGTAAGGCTAATCGCATAGCTTATTCACT GATTAAGACGTTTTGAACTTGATTGTATCTATTTTGTCTCTCGCCTTTTT TGATAAAGATTTCGTATGGGCGAGTGCGACCTGAAGGTTTCCTCCTCTTT AACTATCCAGCTGAAGGAAGGGAAGAACGCTACTCCTTTCCACTTAACCT TGAACTTTCTCTTTAGATTCCGAGCATAAAGGAGAGGGGCATCGATTATG GGATTGGACAACTTTGTGCATTGTATTTAAACCCAATACTCCACGGATCG TTATTCACCTTTAAACTTACTGCTAGCACAATCCCGAAATAATTCCGAAT TGTAGTTTTCTGTTAGGAATGTAATTTTTGTCTTATTCTCGAAAAGTAGA CTTTGGCACAGGGTTGTACATTCATCCTGATTCATCATATTATTATTTGC ATTTCTTACATTAATTTCTAGCGGTGAGTATGTTCAGCGATGAGCACGTG TCGAAGCATGTTTTGCGGAAATTGATCGAATTTCCGAGTTCTGTTGAAGA AATGGAGATCGACGAAGAGGATGCCAAAAACAAAGAGATTTATCTTTACA AGAAAGGCTTCAATTGCGATTATTTCGCTCTTATCATACAAGGTCGTGTC GAGGTTACAGTCGGTAGTGAGAATATTTTATTCGAAGATGGTCCTTTCTC TGTGTTTGGCGTGGGCGCACTTACTAGAGATTCGAACCAACCTTTCAACC CTGATTACACCGTCAAATTGTTGAGTAATGTTCAATATTTGAAGATCAGT CGCGTGATGTATCGATCAGCGCTGCGTGCAACCAAATTGGAGCGTCAGAA TAAAACGCCTGACACATACCAAGAATATGATGAAATTTTCTTCGAGGAGG CGAAACGTAGTAAGCACGCAATTTCCCCGTTGCCGGCTACCGATACTTTG AGTCATAACAGTTACGATAGCGAGCGTAGCGGAACGCCTACTAAACACGG CAATACAAAACGTCGTATGGATAGCTTGTTACGTCGTCTGACGCCGAAAT ATGACCGCCGTAAAGATTCCCGCGATAAGGAAGACGCCGCCAAAACGCTT TCCGTAGGGAGTGGCCAAGAAAATCCGCTAATGTCAAATGTTGAGGAGAC GGATATCGAACGTCCGAACTCTTACGCTGAATTAAATGGTAGTATAGATA GGACTTCAGATTCTCCCGTGTAACATGAGCCTTGTATGGTAATATTTTAA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022231TCONS_00022231Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022230TCONS_00022230Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022229TCONS_00022229Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022229-proteinTCONS_00022229-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000408supercontigsc0000408:38890..51413 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CNNM3metal transporter CNNM3 isoform 1 precursor Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
15.83 14.08 4.66 3.05 22.26 15.79 39.72 42.09 47.25 52.38 41.48 44.59 62.83 60.91 30.1 36.53 44.34 48.95 43.07 57.15 69.9 73.15 45.05 52.08 42.46 47.99 68.32 75.21 27.15 27.36