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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00022230 ID=TCONS_00022230|Name=TCONS_00022230|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3541bp
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aacaaaatcgaaATGCGCGAAGCTCGTGTTGCTTTTGTAAATCtgtgttt
gtttacttttttgacAGTAAATCTTGGTTGTTTATCTGCTGTTGAAGTAG
ATTTCCTAACAGTTTTTGAATCATCTGAAGGGGTAACAATTTCAAATGGA
ATCATAACTGTCATTACTGAAACGGATGCAAAACTCAAACTTCATGGAAA
GGACGTCAAAAACAAGTTAATTTCCTTCGCAGACACAGCCCCTGACAAAG
CCCAAGACCCTTGTGACAACAATAGGGTTACAGATATATTTAAATCAGAT
GATAATGGTCTTGTAAACTTAAATTTCAAGGCTCGAAATGTAGGGAAAGC
ATACCTTTGTACTAAAGATCTTTCACAAAATGGAACTACTACCACCTGGA
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AATTGAAATTGGTTTCTAAGAGTGGAACACCTCGACAAAAGAGATATGCC
AAAAAGATTGAACCTGTTCGTCGTCAAGGGAATTTCCTCCTGTGTACATT
GTTGCTAGGTAACACGTTAGTCAATTCATCCTTCACTATTTTGTTGGACA
GTTTGACCAGTGGTATCGTTGCAGTTGTTGGTTCAACAATGGCTATTGTC
ATCTTTGGTGAGATCGTACCACAAAGTATTTGTTCCCGTTATGGCTTAGC
AGTTGGTGCGTTCACCATCAACATGACCAAACTTTTCATGATCCTTACCT
TCCCGCTCTCTTTCCCAATCAGTAAACTTCTGGATTGCATCCTTGGCAAG
GAGATCGGAAATGTATATTCCAAGAAGCAATTATTGGAGTTGTTAAACat
tcagaatgaattcaatgattTGGAGCAAGACGAAGTTGGCATCATCTCTG
GTGCGTTGAAGTATAAAGACAAAACAGTATCTGAAGTGATGACAGCCATT
GACGATTGTTTCCTGTTAGACGAAGAAGCGATCTTGGATTTTAAAACAAT
GTCTTCGATTGTTAAAAGTGGTTACAGTCGAATCCCAGTATATTCTGGTG
AACGACACAATCTAGTTGCTGTCCTCTTCGTTAAAGATCTAGCGTTTGTT
GATCCTGATGATTGCATCCCATTGTTGAGTGTGTTGAAATTCTACAACCA
TCCAGTCCACAAAGTGTTCTATGATACCAGTTTGGATAAAGCTTTAGAGG
AGTTCAAACAAGGTCGTTCACACATGTCACTTGTATTGAAGATCAATGAT
GGAGGAGATGGTGATCCCTTCTATGAATGTATCGGAATCGTCACTTTGGA
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GATTTCTCCATCTTTTTACCGGACGCGCCCACCGTATCAAAGATCTCTCC
ACAGTTATCTTTTGCTATCTTCCAGTATTTATCAACTTCGGTGAGTATGT
TCAGCGATGAGCACGTGTCGAAGCATGTTTTGCGGAAATTGATCGAATTT
CCGAGTTCTGTTGAAGAAATGGAGATCGACGAAGAGGATGCcaaaaacaa
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GAAGATGGTCCTTTCTCTGTGTTTGGCGTGGGCGCACTTACTAGAGATTC
GAACCAACCTTTCAACCCTGATTACACCGTCAAATTGTTGAGTAATGTTC
AATATTTGAAGATCAGTCGCGTGATGTATCGATCAGCGCTGCGTGCAACC
AAATTGGAGCGTCAGAATAAAACGCCTGACACATACCAAGAATATGATGA
AATTTTCTTCGAGGAGGCGAAACGTAGTAAGCACGCAATTTCCCCGTTGC
CGGCTACCGATACTTTGAGTCATAACAGTTACGATAGCGAGCGTAGCGGA
ACGCCTACTAAACACGGCAATACAAAACGTCGTATGGATAGCTTGTTACG
TCGTCTGACGCCGAAATATGACCGCCGTAAAGATTCCCGCGATAAGGAAG
ACGCCGCCAAAACGCTTTCCGTAGGGAGTGGCCAAGAAAATCCGCTAATG
TCAAATGTTGAGGAGACGGATATCGAACGTCCGAACTCTTACGCTGAATT
AAATGGTAGTATAGATAGGACTTCAGATTCTCCCGTGTAACATGAGCCTT
GTATGGTAATATTTTAAAGTGGAAAACTCGCCTATGACGCGTCCTTGAAA
TGGCTGTTGCAGCTAGAGTTTTGATTCTTGCTTTGGTCTCTTTGTAATGG
TTGCAAAGCAACAGGAATTTGTTAGAAATATGATTAGTGAATGGACATTT
TACGGGGGAAACATTGTCTTCTGATATTCTTTAGATTTTTGAGATATTTA
TTGGTTCAAAATCAACACCTTCACACAGATGAAAGCGTATAAATTTTTGA
CTGGTTTGGAGGAAATTACGGCACTTTTCATCATATCAAACGCCTTGTAG
GTTGTTTTTTGAGGAACCATTTATTTTTAATAGGAaaggaaaaactaaaa
tttgtattttaccATAAAGTATATATCAACcgttttgttgtttgtttatt
ttatttgtggGCATTTTCAGTGGTGGTTTGACTTGCCGTCCgggtaattt
taaaattttacacatTTTATTCGCTTGCGTTAAACCACATTTATTTTATT
GACTTTCACATTCCCGTAAACATTTACTAAAATCAACACTTTTGAATTCT
ATCGAAAACCCTTTTCACAGAATTCAAGAGCAAGTCGTCATGTCTGGCAA
TTTGCCATTGTTTGTAATCTTTTTATAGTCCTACTATGATATAGTATCCC
TTGtacataatttttttgttacTGTTGGTATTATTTTTGTCTTACTTGCA
CTAAAGTATTTGTTTTTAccctaaaagatttttttactgTCTATCTTGAA
ACCCCCTTAAAATTGTTACGCCTGACATTTCGGAAGGATAGATTGATTTC
AGCCGTTCATTAATTGAAGCCGTTCTGTACTTCTTTTTTACGATGAGATC
GATACGAGAGACACCTTAAGTGCTAACAGAGAATGTGAGAAATTTTCTTA
CTCTCCGGCTCATAACATACAAACCCTGTACCTGGAGACCTATCGTAATA
CCTTCTTCTAGCTccgcatcaaattttaactGACCCAAATATCTTTTGCA
TTAACAATTCTAgctttggaaattttcttcgtATGTCAGGTTGTAAAATT
CTTGTTGTTCTAAACACAtctctttttgttaatttatatatttttttgtt
ttcttccctTCTGAAAATATACATCTGATATATACCACTTG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000408:38890..51413- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00022230 ID=TCONS_00022230|Name=TCONS_00022230|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12524bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000408:38890..51413- (Clytia hemisphaerica)
CCGTGTCCTGATATAAAAACATCGAGCAAGATGGAGGTCGGTCATTTGAA
AACAAAATCGAAATGCGCGAAGCTCGTGTTGCTTTTGTAAATCTGTGTTT
GTTTACTTTTTTGACAGTAAATCTTGGTTGTTTATCTGCTGTTGAAGTAG
ATTTCCTAACAGTTTTTGAATCATCTGAAGGGGTAACAATTTCAAATGGA
ATCATAACTGTCATTACTGAAACGGATGCAAAACTCAAACTTCATGGAAA
GGACGTCAAAAACAAGTTAATTTCCTTCGCAGACACAGCCCCTGACAAAG
CCCAAGACCCTTGTGACAACAATAGGGTTACAGATATATTTAAATCAGAT
GATAATGGTCTTGTAAACTTAAATTTCAAGGTTTGTATTCATTTTATTTT
GTACAACTTTAAAGTTTTGACTACTTTTGGCCCCTCAAAAACATTTTGTT
TTTGTTTGTTTATGGGTAATCTGATCTTTTGATGAATCATAGTTTTGACA
TAACATCTTGACAGCCCTAGAGTGCTTCATGCAAAATATGGGAATGGGGT
GTTGTTAGTTTGTATTATATATGCTGCTTGCACAGTCTGAGGCGGCGGAG
GAAATGGGGAATATAAAACATGAATAATAAGGAAAAACGTATATCATATT
TATTGTGAGCAAACCAAATTTTAGAAAGGCAGGGTAGCCTATACTAGAGA
TAAAAAGGAGTCTTTTATTGCTGTTTATTTTATTTTTTTCATAAAAAGGC
TGTTTTTACCTATTCTAGTGATTTTTCCTAATACTGTAGTAAAAGGGTCA
TTCGATGACCACAGAGCATGGTAGGGCATTAAAAATGTTCTGGTGACTTA
AAATTCTTTCAACAAATCTAGAGGAGGCAAAGTAATTTCTCAAAAAGCAG
GAAATTTTTTTAACATTATATATAAGAGTTAAAATTTAGAAAAGTCTGTA
TTTTTGAAGCATCTCAGCAGGGACTTCCCTATATAATTATATCTTTAGGC
AGCTTTAGGAAAATGGTATGCTCAAACTTTTTCAGGCCACTTGAAAAAGT
CCCAAAAAAGCCTGAAAATCTAATCTAATCAATTTTCTTTGTGGGAAAAC
GAAAGTGGTGGATTCTTTGAAAGGAAAAAGCCAGAAAAAATGTTAAGACA
AAAAATGTATATATTTTGAGGTTGAATTTTAATTCTATCAATTAAATCAA
ATACAGTCAACTGCCAGCGTCAGCTTGGAACCAAAAAGGGCACTATTTCT
TGTGATTTTCTAACAAAAAGGCAATTTTTGCTACTAATTTCAACATATTT
GTAACTTTTTGTTGGGGCAGCGTCCGTTAATCAGACCCTTAAAAGGCATA
AAAAATGGCCTGACTGCTCTAACTTGGGACTATCTGACAAAACATTGGAC
GGCGATTCGGCCACCAATTCACCGAACCTCCAAAGTCATTTGATTTGAGT
TAATGAACGGCGTATTAGAAAATAGACAATTTCTCTTTCGCACAGAGTAG
GCTTTTAAATTAAAATATAAAAAAAACCCGTAGTGGAACACACACGAATG
TCTGGAACGAAGAAGAGCAAATTAGCGTAATTTGCGCTGCAAGTTACATT
ATTTGTTATTTGTTAATCCCGTCTGGCGACAGGCGGTTAGGCAGCAGGCG
TTCTCTAATTCTCCGGTCATTTTTAATGAAAACAAAAAGTTAAAAAGGGT
GCGCTATCAGTTAAAGTTATCGTGACATGTTATGACAGAAAGTATGATTG
ATAAACTTGGTGGAGTTATCAAAACAAATTTGTTGTCAAAGAGATTTAAC
AGTAAATGAAAATACAGGCCAGATATCAACCATTCCCATGTTTCAACCAG
TCCCATGTTTCGACCAATCATCCCAAGTTGGAGCAGTTGAAGGTAATACG
CTAACGTACATTATCATGATATTGAAAATAAAAGTAATTAAAAATATCTA
ATAAAATGAAAAACAACTAAAACTAAAAGGCACTGCAATAAGAAGTAGCT
AATGCAGAGCTAAGAGTAGTAAGATATGACTGGAGCTGAAAGACCACCAC
ACGGATTTAGTAGTAGTGTATAGTAAAGTGAGAGAATAAGGTGATTTTAG
ACCTGAATGACCTTGAGAATTGACCCTGTGAAGATGAAAAAATTTTGGTG
ATGCAATTTTTTCGATGCTGAAAGACTATCATTTCAATCTTCCTTAAGGT
AAAAAGGTTGTGGGATTTAGGTTAGTGGAGCAAAAATGCTAAAAAACTGG
TAAATCATAGTCCTGGAATATCAAAGGTCCAGCTACACTGCCTTGTAAAA
TTTGACAATGCTTATCTTTTAACCAAGAATGCCCTTAGCTTTTTTTATTA
TAATTGATCTTCTGAAATGGCCAAATTCCTAGGCATCCAATTGCCATATA
TACATTCCATTGTTAGTTATAGTTGGTTCTAGACGATCAAGGCGGGTTAT
TGAATAAATGAGCTGGGATTTCTAAAAACTTCTGCATTGTGCTGTCTAAA
TTAGGCCTTTAAAATCAGATCTATGCAACTGTAAAAAAATTCACCCAAAT
TTGTCCATTTTAAGGCAAGAAAACAATCAGATTTTTCAAAGTTTTGTAAT
AAAGCTTGGTTGTTCTCACTTTTTACACCCTTAAGTTGGACTTTCTCGCA
CTTTCTCTCTTTTTGACCCTTAATGTGCACTTAATGTGCACGCATGGTAG
GTAGATTATTACAGGTTTCATCTTCTCACTCACCTGTCTGATATAATGAA
ACGCCTACTAACAAAATAATTTATCCCAATTGTACTTGCTTGTTGTAATT
TATCTTGTAGGGATTATTTATTTGATAGACCCTGATGATTGTATAAAGGA
AAAGAAATTTAAGCCCAGCCTTGGATCAAATTAAATGATTAAGAAAATAA
ACATATAATATGTCGTAGGGGTTGTAAGAATATTATCTTACTAGCATCCT
GTAAAAAGTAGTTTGGAAAAGTTTTTCAGGAGTAATAGTAATGAGTATTT
AAAAAGAGATTTTGCAATTTTTAAAAATTGTAATGTTTCAATGACAACTG
TTCACTCAGGAATTTTTTTACGTGATATTTAAGCAAAAACATCTGATCTT
AGATAGAAACAGATCTAGTTCAAATTTCATCACACAGATTCAGAGGAAAA
GAAAATTGATTTGCAGGATCATTGTTTTGCCAGGAGGAGAGCTGCTTATT
TGAAACTGATCTTTCCAATGACCTATTAATTTTAGAGGAATAAAGCCTGT
TTTTTTTTCAACCGTGATGATAGGAAAGTGGTAACCTTTCAACCGTGAGA
ATAGCCCAGTGGTAACCTTTCAACCGTGAGAATAGGCCAGTGGTGACCTT
TGGAAAAATCTTATACGAACAGAACTTCTGCAAAGATGATTGTATAAAAT
ATGTCTTTATTTTAAAGCCTTTGATAAACTCAACCCTGAATGGTTGTAAT
CACAGGTCCAAAGCTTCAGTAATCTGCAAATCTAAGGGGTACTTGACTTC
AGTTTTTATTTTTATTATACATTATTTTTCTTTGATGTTTACATTTGATC
TTTTGATGACATAAACTTTGGTGTTTCATTTCTCCGAACTTCATCTTTCA
AAATTAATGTCATGAGGGCTTTTTAAACAAACACTAGGCCTTAATTTTCT
TCTAGGGGTGATTCTTTATTGCAATATAGATTTCTAATATAAAAACTTTT
ACTTAGATGGAGAATATTATTGCAAGTTGTTTTCATTTTTACTTTGTTTG
AAAGAAAAAGATATTTTGAGAAACAATTGCTCTATAAGATTATATATTAC
ACCTTGGAAACTGTATAAATTTTTCATTACATATTCTCATTGAGAAATAA
AATAAGGAAAAATACAAAGATATCATGGGGTTTTTTGAATTGTTTAGAAT
AATAGCTTTCAAGAGAAAAAATTGTTTCCAAATACAATTATTTAAATGCT
GCTGACAAATCTTGTAAAAAAAGGTCATCAAACTTTTTTTAATATTCAAT
CTGATGAGAAATCTATTGAAAGATTGCAAAAAATCCGCTTTTCTTGAACA
AAACTAATAGATTGTGAAATGCTCATGTGGTATTGTAATTAAACTATTTT
GAGTTTCATTCAGTAAACTATCTGAATAGCATGTGGTAAACATAATCACT
CTAGAGTTGAAAATCTTTTATGTTTATCATTTAAAAAGCGCAGTGATTTT
GAACCTCTAATGATCGTCATTAAATATATCATTAACATAGTTTAAAATTT
GCAAACAAAATCATTTGTAAGTTTGATTTTGATTCTTATCTTGAAGTCTA
AGAAAAAATCACCAGCTTAAAAAATCTTGTTTATATACTATGTTGNATCA
CACAGATTCAGAGGAAAAGAAAATTGATTTGCAGGATCATTGTTTTGCCA
GGAGGAGAGCTGCTTATTTGAAACTGATCTTTCCAATGACCTATTAATTT
TAGAGGAATAAAGCCTGTTTTTTTTTCAACCGTGATGATAGGAAAGTGGT
AACCTTTCAACCGTGAGAATAGCCCAGTGGTAACCTTTCAACCGTGAGAA
TAGGCCAGTGGTGACCTTTGGAAAAATCTTATACGAACAGAACTTCTGCA
AAGATGATTGTATAAAATATGTCTTTATTTTAAAGCCTTTGATAAACTCA
ACCCTGAATGGTTGTTATCACAGGTCCAAAGCTTCAGTAATCTGCAAATC
TAAGGGGTACTTGACTTCAGTTTTTATTTTTATTATACATTATTTTTCTT
TGATGTTTAGCTTTGATCTTTTGATGACATAAATTTTGGTGTTTCATTTC
TCCGAACTTCATCTTTCAAAATTAATGTCATGAGGGCTTTTTAAACAAAC
ACTAGGCCTTAATTTTCTTCTAGGGGTGATTCTTTATTGCAATATAGATT
TCTAATATAAAAACTTTTACTTAGATGGAGAATATTATTGCAAGTTGTTT
TCATTTTTACTTTGTTTGAAAGAAAAAGATATTTTGAGAAACAATTGCTC
TATAAGATTATATATTACACCTTGGAAACTGTATAAATTTTTCATTACAT
ATTCTCATTGAGAAATAAAATAAGGAAAAATACAAAGATATCATGGGGTT
TTTTGAATTGTTTAGAATAATAGCTTTCAAGAGAAAAAATTGTTTCCAAA
TACAATGATTTAAATGCTGCTGAAAAATCTTGTAAAAAAAGGTCATCAAA
CTTTTTTTAATATTCAATCAGATGAGAAAGTCTATTGAAAGATTGCAAAA
AATCCGCTTTTCTTGAACAAAACTAATAAATTGTGAAATGCTCATGTGGT
ATTGTAATTAAACTATTTTGAGTTTCATTCAGTAAACTATCTGAATAGCA
TGTGGTCAACATAATCACTCTAGAGCTGAAAATCTTTTATGTTTATCATT
TAAAAAGCGCAGTGATTTTGAACCTCTAATGACCGTCATTAAATATATCA
TTAACATAGTTTAAAATTTGCAAACAAAATCATTTGTAAGTTTGATTTTG
ATTCTTATCTTGAAGTCTAAGAAAAAATCACCAGCTTAAAAAATCTTGTT
TATATACTATGTTGTGCTTAACCTTGACAACTTCCCGGTAAAAGGTCAAA
TGGGTGTCCTCACAACAACAAAGATCTCACGTTACATTTCCTGACCTTAA
GATCGTTTCTCTAAATATTACACCGAAGAGTTTAATTCGCATCATCATGC
CTGGTTGTCAATGACATTTTACTTTCTCTTGGATGCTTACATAATTCTTG
CAAAATGCTTTGCCTGTGTCCTGTAAAAGTATTTTAAGGGTCATTAAGTT
AAAAACAAGGAAACTTAAAAAAGTATATTAATTTTAAATTCTTTTAAAAC
ACGTATGGTCTAGTAGCTCTAACTGCCTCAGAACTTTTTGCAAATCTTTT
TTCAAAACTTTTGTGGTTCTTTTTGTGGAAATGTTTCTGTTCATATTTAA
ATCATATTTTCTTCTTTGTCGTGGTTGAAAGACCTCTCCTTTTCACTTTA
ATAAAAAGTGATTTGTGGGCTGACCTATTTTTTTCTCTTCTTCCTTCCAA
ACAAAAATCAAGCTCCTTTAAAATTCCCTTATTTAATTTATAAACTTTTT
TTCTGTTCTATTTCAATGGAAAGTTTGTCTAATCAAATTTTAAAGTGATA
TTGATTTAAGGCTTATCGCAAATATACCTCGCTAGAGAAATTTAATCATG
GTAGACTTATTATTGGGAAATCGTTTTAAATTCTGTTTTTATAATTTCTC
AATAGCAAGTCCTACTACCTACCAGACAAAATCAACAAATCTGTTTCAGT
TTCACAATTGCAACTCAATGTTGTAACCAATTAACGAAATTGTCATTGAG
TCATCAAATTTTCTTGTTCTATTGATAAAGTGTTGATGTGATGATTGATC
GATGGCCTCCTTATCATACAAAAAATGTCTCGTGGCATGTGGATCTGTTT
TAAGAGATGTGTTTTAAGATTATAATGAGCTCTATTTTTTGTATAAAACT
ATTAGATTTTTCTTTTTCTTAATCATAAGGTTTAATATGTATAACCTTTT
CCAAAAGATTTAGGAATAATAAAATTACATGTTCCACCTTTCCATATTGA
AAATCGACCTGACAATTTTTCTATGAACCTTGTATCTAGAAACAAATCTA
AAACATCGTGTTCTGTTTACTTTGTAGGCTCGAAATGTAGGGAAAGCATA
CCTTTGTACTAAAGATCTTTCACAAAATGGAACTACTACCACCTGGATTC
ACCAAGACAAAACAGTCATGTTGGTCATCGAGAAGAAGGAAACACTGATG
CCAATATGGGCAAAAATCATTTTGATTGGTGTCCTCATGGTTCTCTCTGG
AATGTTCTCTGGTTTGAATCTCGGGCTGATGGCTCTGGATGTCCAAGAAT
TGAAATTGGTTTCTAAGAGTGGAACACCTCGACAAAAGAGATATGCCAAA
AAGATTGAACCTGTTCGTCGTCAAGGGAATTTCCTCCTGTGTACATTGTT
GCTAGGTAACACGTTAGTCAATTCATCCTTCACTATTTTGTTGGACAGTT
TGACCAGTGGTATCGTTGCAGTTGTTGGTTCAACAATGGCTATTGTCATC
TTTGGTGAGATCGTACCACAAAGTATTTGTTCCCGTTATGGCTTAGCAGT
TGGTGCGTTCACCATCAACATGACCAAACTTTTCATGATCCTTACCTTCC
CGCTCTCTTTCCCAATCAGTAAACTTCTCGATTGCATCCTTGGCAAGGAG
ATCGGAAATGTATATTCCAAGAAGCAATTATTGGAGTTGTTAAACATTCA
GAATGAATTCAATGATTTGGAGCAAGACGAAGTTGGCATCATCTCTGGTG
CGTTGAAGTACAAAGACAAAACAGTATCTGAAGTGATGACAGCCATTGAC
GATTGTTTCCTGTTAGACGAAGAAGCCATCTTGGATTTTAAAACAATGTC
TTCGATCGTTAAAAGTGGTTACAGTCGAATCCCANTGATTTAAGGCTTAT
CGCAAATATACCTCGCTAGAGAAATTTAATCATGGTAGACTTATTATTGG
GAAATCGTTTTAAATTCTGTTTTTATAATTTCTCAATAGCAAGTCCTACT
ACCTACCAGACAAAATCAACAAATCTGTTTCAGTTTCACGATTGCAACTC
AATGTTGTAACCAATTAACGAAATTGTCATCGAGTCATCAAATTTTCTTG
TTCTATTGATAAAGTGTTGATGTGATGATTGATCGATGGCCTCCTTATCA
TACAAAAAATGTCTCGTGACATGTGGATCTGTTTTAAGAGATTTGTTTTA
AGATTATAATGAGCTCTATTTTTTGTATAAAACTATTAGATTTTTCTTTT
TCTTAATCATAAGGTTTAATATAACCTTTTCCAAAAGATTTAGGAATAAT
AAAATTACATGTTCCACCTTTCCATATTGAAAATCGACCTGACAATTTTT
CTATGAACCTTGTGTCTAGAAACGAATCTAAAACATCGTGTTCTGTTTAC
TTTGTAGGCTCGAAATGTAGGGAAAGCATACCTTTGTACTAAAGATCTTT
CACAAAATGGAACTACTACCACCTGGATTCACCAAGACAAAACAGTCATG
TTGGTCATCGAGAAGAAGGAAACACTGATGCCAATATGGGCAAAAATCAT
TTTGATTGGTGTCCTCATGGTTCTCTCTGGAATGTTCTCTGGTTTGAATC
TCGGGCTGATGGCTCTGGATGTCCAAGAATTGAAATTGGTTTCTAAGAGT
GGAACACCTCGACAAAAGAGATATGCCAAAAAGATTGAACCTGTTCGTCG
TCAAGGGAATTTCCTCCTGTGTACATTGTTGCTAGGTAACACGTTAGTCA
ATTCATCCTTCACTATTTTGTTGGACAGTTTGACCAGTGGTATCGTTGCA
GTTGTTGGTTCAACAATGGCTATTGTCATCTTTGGTGAGATCGTACCACA
AAGTATTTGTTCCCGTTATGGCTTAGCAGTTGGTGCGTTCACCATCAACA
TGACCAAACTTTTCATGATCCTTACCTTCCCGCTCTCTTTCCCAATCAGT
AAACTTCTGGATTGCATCCTTGGCAAGGAGATCGGAAATGTATATTCCAA
GAAGCAATTATTGGAGTTGTTAAACATTCAGAATGAATTCAATGATTTGG
AGCAAGACGAAGTTGGCATCATCTCTGGTGCGTTGAAGTATAAAGACAAA
ACAGTATCTGAAGTGATGACAGCCATTGACGATTGTTTCCTGTTAGACGA
AGAAGCGATCTTGGATTTTAAAACAATGTCTTCGATTGTTAAAAGTGGTT
ACAGTCGAATCCCAGTATATTCTGGTGAACGACACAATCTAGTTGCTGTC
CTCTTCGTTAAAGATCTAGCGTTTGTTGATCCTGATGATTGCATCCCATT
GTTGAGTGTGTTGAAATTCTACAACCATCCAGTCCACAAAGTGTTCTATG
ATACCAGTTTGGATAAAGCTTTAGAGGAGTTCAAACAAGGTCGTTCACAC
ATGTCACTTGTATTGAAGATCAATGATGGAGGAGATGGTGATCCCTTCTA
TGAATGTATCGGAATCGTCACTTTGGAAGATATCATTGAAGAAATCATCC
AAGATGAAATTGTTGACGAAACTGATGTTTATAGTAAGTTCTTGTGCACA
TCTATTCAGTTGGTTTTTTTCGCCAACGATTTAAGGAATGACGCCTGATT
TTTACTCCGGCACTTTTGGAAATACTGATTACCTAGCCTAGTCACCCTTG
CTTGAAATTGTTAATCTGATAATTCAGTTTTTCATACTTTTTAGCTTGCT
TTCATTCATAAGCGGATTCTTTTTTTTAGTTTTCAATTTTGGTTTTGAGA
TATTTTGTCTTTGGGGTGGATGGTTTACACTGCTTAAACTATATGGAAAC
CTTTGATTTCAATCGTGTATATTTCGAATTAAGCGCTTTTACAGACACAC
TTAAAGGGACATTAAAGTAGTAAAATATAAACATCGCGCGAACCATGTGT
CATTAAAGAGAACAATTAAAATCGCGTGTCCAAAACAAACTTGTAAAACA
ATTGAACATTCAAAATTAGCCGAATTNCGCGTGTCCAAAACAAACTTGTA
AAACAATTGAACAATCAAATTTAGCCGAATTTGGTTTGATTTTTTATTTT
GACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATCCGCTGCATACAGCTTGTTTT
CAAATTTCACAAGTACTGTTATGTCCCTTTAAAAGACTATTATTATAAAT
AAACTTACTGTTTAGCCATTCTCCAAAATAGAGAAGAAATAAAGGGACCA
AAAATAACGTCAAAGTTGTATAGAATATCGGAACGGCGTTTCTTAAAAAA
ATCTCCCAATTGATTTTCTAAACAGCGATAATTCTTATAATCAATATTTA
GACAACCGATCTATAGTTTTTATGGAACGTCAAGTTTAGAGTGGATTTCC
AAAATTATACTAATCATTAATTTCACGTTTCTTTTAATTTCCAGTTGACA
ATGTGTCCGGACAGAAGGTTAAGCGGAATAACCAGCAAGATTTCTCCATC
TTTTTACCGGACGCGCCCACCGTATCAAAGATCTCTCCACAGTTATCTTT
TGCTATCTTCCAGTATTTATCAACTTGTAAGTTCCCATCACCATTTATTA
TCTTTGTCTCCTTCTCTGATTGGTAAGGCTAATCGCATAGCTTATTCACT
GATTAAGACGTTTTGAACTTGATTGTATCTATTTTGTCTCTCGCCTTTTT
TGATAAAGATTTCGTATGGGCGAGTGCGACCTGAAGGTTTCCTCCTCTTT
AACTATCCAGCTGAAGGAAGGGAAGAACGCTACTCCTTTCCACTTAACCT
TGAACTTTCTCTTTAGATTCCGAGCATAAAGGAGAGGGGCATCGATTATG
GGATTGGACAACTTTGTGCATTGTATTTAAACCCAATACTCCACGGATCG
TTATTCACCTTTAAACTTACTGCTAGCACAATCCCGAAATAATTCCGAAT
TGTAGTTTTCTGTTAGGAATGTAATTTTTGTCTTATTCTCGAAAAGTAGA
CTTTGGCACAGGGTTGTACATTCATCCTGATTCATCATATTATTATTTGC
ATTTCTTACATTAATTTCTAGCGGTGAGTATGTTCAGCGATGAGCACGTG
TCGAAGCATGTTTTGCGGAAATTGATCGAATTTCCGAGTTCTGTTGAAGA
AATGGAGATCGACGAAGAGGATGCCAAAAACAAAGAGATTTATCTTTACA
AGAAAGGCTTCAATTGCGATTATTTCGCTCTTATCATACAAGGTCGTGTC
GAGGTTACAGTCGGTAGTGAGAATATTTTATTCGAAGATGGTCCTTTCTC
TGTGTTTGGCGTGGGCGCACTTACTAGAGATTCGAACCAACCTTTCAACC
CTGATTACACCGTCAAATTGTTGAGTAATGTTCAATATTTGAAGATCAGT
CGCGTGATGTATCGATCAGCGCTGCGTGCAACCAAATTGGAGCGTCAGAA
TAAAACGCCTGACACATACCAAGAATATGATGAAATTTTCTTCGAGGAGG
CGAAACGTAGTAAGCACGCAATTTCCCCGTTGCCGGCTACCGATACTTTG
AGTCATAACAGTTACGATAGCGAGCGTAGCGGAACGCCTACTAAACACGG
CAATACAAAACGTCGTATGGATAGCTTGTTACGTCGTCTGACGCCGAAAT
ATGACCGCCGTAAAGATTCCCGCGATAAGGAAGACGCCGCCAAAACGCTT
TCCGTAGGGAGTGGCCAAGAAAATCCGCTAATGTCAAATGTTGAGGAGAC
GGATATCGAACGTCCGAACTCTTACGCTGAATTAAATGGTAGTATAGATA
GGACTTCAGATTCTCCCGTGTAACATGAGCCTTGTATGGTAATATTTTAA
AGTGGAAAACTCGCCTATGACGCGTCCTTGAAATGGCTGTTGCAGCTAGA
GTTTTGATTCTTGCTTTGGTCTCTTTGTAATGGTTGCAAAGCAACAGGAA
TTTGTTAGAAATATGATTAGTGAATGGACATTTTACGGGGGAAACATTGT
CTTCTGATATTCTTTAGATTTTTGAGATATTTATTGGTTCAAAATCAACA
CCTTCACACAGATGAAAGCGTATAAATTTTTGACTGGTTTGGAGGAAATT
ACGGCACTTTTCATCATATCAAACGCCTTGTAGGTTGTTTTTTGAGGAAC
CATTTATTTTTAATAGGAAAGGAAAAACTAAAATTTGTATTTTACCATAA
AGTATATATCAACCGTTTTGTTGTTTGTTTATTTTATTTGTGGGCATTTT
CAGTGGTGGTTTGACTTGCCGTCCGGGTAATTTTAAAATTTTACACATTT
TATTCGCTTGCGTTAAACCACATTTATTTTATTGACTTTCACATTCCCGT
AAACATTTACTAAAATCAACACTTTTGAATTCTATCGAAAACCCTTTTCA
CAGAATTCAAGAGCAAGTCGTCATGTCTGGCAATTTGCCATTGTTTGTAA
TCTTTTTATAGTCCTACTATGATATAGTATCCCTTGTACATAATTTTTTT
GTTACTGTTGGTATTATTTTTGTCTTACTTGCACTAAAGTATTTGTTTTT
ACCCTAAAAGATTTTTTTACTGTCTATCTTGAAACCCCCTTAAAATTGTT
ACGCCTGACATTTCGGAAGGATAGATTGATTTCAGCCGTTCATTAATTGA
AGCCGTTCTGTACTTCTTTTTTACGATGAGATCGATACGAGAGACACCTT
AAGTGCTAACAGAGAATGTGAGAAATTTTCTTACTCTCCGGCTCATAACA
TACAAACCCTGTACCTGGAGACCTATCGTAATACCTTCTTCTAGCTCCGC
ATCAAATTTTAACTGACCCAAATATCTTTTGCATTAACAATTCTAGCTTT
GGAAATTTTCTTCGTATGTCAGGTTGTAAAATTCTTGTTGTTCTAAACAC
ATCTCTTTTTGTTAATTTATATATTTTTTTGTTTTCTTCCCTTCTGAAAA
TATACATCTGATATATACCACTTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:51034..51413 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:51034..51413 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:42281..43406 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:42281..43406 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:41288..41419 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:41288..41419 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:38890..40792 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1575043694:38890..40792 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1510915933:51034..51413 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1510915933:51034..51413 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1510915933:42281..43406 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1510915933:42281..43406 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00022230-exon-sc0000408-1491911889:38890..40792 | TCONS_00022230-exon-sc0000408-1491911889:38890..40792 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000408 | supercontig | sc0000408:38890..51413 - |
Blast
BLAST of TCONS_00022230 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CNNM2 (Metal transporter CNNM2 OS=Homo sapiens GN=CNNM2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 525.013 bits (1351), Expect = 1.851e-168 Identity = 283/489 (57.87%), Postives = 380/489 (77.71%), Query Frame = 3
Query: 441 TTWIHQD--KTVMLVIEKKETLMPIWAKIILIGVLMVLSGMFSGLNLGLMALDVQELKLVSKSGTPRQKRYAKKIEPVRRQXXXXXXXXXXXXXXVNSSFTILLDSLT-SGIVAVVGSTMAIVIFGEIVPQSICSRYGLAVGAFTINMTKLFMILTFPLSFPISKLLDCILGKEIGNVYSKKQLLELLNIQNEFNDLEQDEVGIISGALKYKDKTVSEVMTAIDDCFLLDEEAILDFKTMSSIVKSGYSRIPVYSGERHNLVAVLFVKDLAFVDPDDCIPLLSVLKFYNHPVHKVFYDTSLDKALEEFKQGRSHMSLVLKINDGGDGDPFYECIGIVTLXXXXXXXXXXXXXXXXXVYIDNVSGQKV-KRNNQQDFSIF-LPDAPTVSKISPQLSFAIFQYLSTSVSMFSDEHVSKHVLRKLIEFPSSVEEMEIDEEDAKNKEIYLYKKGFNCDYFALIIQGRVEVTVGSENILFEDGPFSVFGVGALT 1892
TTWI+ D T M+V E+K+ L+P W ++I I +L+ LSGMFSGLNLGLMALD EL++V GT ++K YAK+IEPVRRQGN+LLC+LLLGN LVN++ TILLD + SG+VAVV ST+ IVIFGEIVPQ+ICSR+GLAVGA TI +TK FM++TFP S+P+SKLLDC+LG+EIG VY++++LLE+L + + +NDL ++E+ II GAL+ + KTV +VMT + DCF++ EAILDF TMS I++SGY+RIPV+ GER N+V +LFVKDLAFVDPDDC PL ++ KFYNHP+H VF DT LD LEEFK+G+SH+++V ++N+ G+GDPFYE +GIVTLED+IEEII+ EI+DETD+Y DN + +KV R +QDFS F D+ KISPQL A+ ++L+T V FS +S+ +L +L++ P+ ++E++ DE++ K E YLY++ DYF LI+QG+VEV G E + FE FS +GV ALT
Sbjct: 231 TTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLLPFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGNYLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGANTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELNIIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVDLLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQRVNNEGEGDPFYEVLGIVTLEDVIEEIIKSEILDETDLYTDNRTKKKVAHRERKQDFSAFKQTDSEMKVKISPQLLLAMHRFLATEVEAFSPSQMSEKILLRLLKHPNVIQELKYDEKNKKAPEYYLYQRNKPVDYFVLILQGKVEVEAGKEGMKFEASAFSYYGVMALT 719
The following BLAST results are available for this feature:
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