XLOC_011104 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011104
Unique NameXLOC_011104
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000335:169293..219722-

Legend: gene
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AAGTTACAACGAAAGAATGCATTACGTCATGGATACAGACCAGGTTGTCT TGGCAACAGGCTTTGTAAGCAAGTGGTTGACTTTGTGATTTCACCGATGA TCACATCCAGTTTATCCTTGGATAGTCTAGACACTGATGAATATAAAGAG GTGATTGACTTTTTATCCATGGAGGGCTCCCGATCTTAAAAAGTTACTCT TTATTTTGCAGTGTAGTTTCGACCAAAAATTGTGAATAATGATATGCACC ATTGCAATGTCTTCGACGGACCCAGCATCTCATTGGTTGAAGGTGACGTA TTGACTGATTTTACGTCACTTACAACCAATCAACTGTTGGGTCCCTGATA TAATGTCAGAAGACATTGCAATGGTGCATATCATATCACAAATTATACAC TTTCATGAATTTCAGAAAACTTACCCTTGTGGACCACAGAATCGGTTTAA TCCTTGGTTTCATTTACCGGGACTCATATTTGGGGTCTCGGGGGGTCTTT AAGATGTTGCTCTTGAGTCTGAAACTTTTGATATCGAGGTGTAAGATATT TAAACATTTAAGTTTATAGTTCCAAAAAAATAAAATTTTGTTTTCTGCAA GATGTTAAAAAAAGTCAAGATAATGCCTGTTTTCTACCAAGGGTTTACTC TATTTACCAAATATGGTAATAAAATAATGTCCATTGTCGTGACATCAAAT TGTGGTTCCTTTGACCTCGAAAGATATCTCTTGTCATCACATAGCTTGTT TCTTTGTTATACGTAAATTCGTGGTCCTGAGCGCTTGTTTGTTCAAGTGT TTTGCTAAAAAGATACCATAGGTTTTTTGAGGTATTTCACTCGATGCAGG AAAACAGATTAGATTAGGGCTGTATCTGCGGTTCTGTGTAAACACTTTAA AAATGCTGGTCTTAAGGAATTTGTACAATTTTTTTTGTGCCCAAAATTTA 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNCACTTAAATTATGTAAATAATGGCATTATCACAA AATATGAGGTGTATACACCAATTTACAACAAGATGTTTTCTCATGCTCAA TAGGATGCTGGCGGTGCAAAGGGATATAGATTGTCATGCAATGAAAACAT TAAATGCTCCAAGAGAGCTGTTTTAGAGATATGAAAATAGTAGTACTTTT ATTACTGTATTATTTTATTATTTTCATTTTTATGTGAACAGCATTATATA ACTTTAAAAGTTTTAAAGAAGATAAACTTGATTCTTCCACGCGAAAGGCA GTAGTCTACCTGGCATTTTCTTGACAAAGCAAAATCTCATTTTCGGCTTT ATATATAATATATGTTTAGATACTTAGCGTTATGCTTTTTTCTTTAGCAT ATTGTAATTTAAGCTGAGGCTGGACATATGCTTAATATGCTTAATTTTCT ATTGTTCTAAAACAATAAATCCATTGTATTCGAGCCAGAATCCCAGCTTT GTTATGCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTTTTGGACTTGGCTATTTTACAAACATGAGAAATAATCATATTGAGAGT TTTGGACTTTTGAGTTTCACCCTGATATTCTTATAGAAGATATTCTTATA TAAAAATGCGTTTATCATAAATGATCCAAACAACGTTAAACTACCTCCAG ATGTTATATCATTTTCAGTCGTTTTGAGCAGTTTGGAGTCTTGTACAGTA GAGTAAACAAGGATGAAGCAACATTGGCTTACTTTCAGGTACCTACCGGG GGTTGGAAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAATAAAAT TTTCGAAAAATTAATTATAGCGCCCAGGCTATTAGGTATCTGAGAGTAGA TTTAACGACATAGTAATGATGTTTTTATGTCACGAATAGGTAAGTGTTTT GTCGTTAAAATCTACTCTCATACGCAGATCTTTTTTCACCCCTGTCTACG CTACTGTTCTAAAGAATTGAAAAAGCTTTTCATTCTGAAACCTTTTGAAA AAGTTTTTTTCTGGAATTTTTTTTTTTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA CGCTGGCACGCCAAGACAGTTGGCACGAAGGCACGCATGGCACGCTGGCA CGCTTAAAAACCGATGGCACGCTGGCACGCGTGGCACGCGATTTAGCAGA CTCATATGTGAGTGATCGAAGGTTTGGTAATGCTGCTAGTGCCTTCAAAC 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TCACTTTGATCTATGAGTTTTTTTATGATGTTTATGATTTTTTGTCTTTA GGGTGAAACAGAAGAGGACGCAGAGATTCGTAAAAATGCAATTGCTATGC GATCACGTCGAAGGAGTTCTGTGGTTCAAATACCAACAGCCAGTATACAA ATGGATTTACACACTATCTACTTAGAAAGTATCAATGGAACCAAAAAGAA AGGTCAGATTTAAAATGTTTTAGAAAAATTTGATATTATATGTATTTCAT ATATATAGGGCAAGTAAAAAAAAATCCGAAAGTTACGTTACAAAGTTAAT TTGAAAAGTAGATGGTAATTATTTCAATGGGTGTGAATCATGTTAAATTT TCTCAAACCATTGGGCATTCTCTATCAGAGCATTCTCATTCCCTTCCTAG TGATGTGATATGGGGTTGTGGATCGGGTGTGGATACGTCTAAATATACAT GGCCCATCTTATACTAATACAATAATGACCGGTTAGTGAGGGCTGTACTG AGAAATATTGCCCGAGGTCAAATAACGACCGAGCTTGCGAGGTTGTTGCG TTGACCGAGGGCAATATTTTCAATACAGCCCGAAAAACCGGTCATTATTA TATTTGTTAATCGTTTCCTTCAGCTTCGATTGATTTTTTAGCGCTTTATC TAGGAAAAATAGCGAAATAAAGCGAAAAACAAGCGAAAAGAGATAAGAAA TTGTTATAATTTCTGACGTCAGAAATAAAAAATGAGAGAAATGATGTCAA CGCATTGTTCATTTTCCTTTGAAAAAAATGAATTTTCCTAACGACGGGCA ACTCTGGGCAGTGAAGGCCCGTCGTCATGCGAAAAGAACCAATTCCATTG CGCAAAAAGCCGTGTAGCCCGCTTTGAAAAAGTAGCCGGTTAACAACGTT CCATTTAATATGAAAGATTTTTTTACAGGGAAATCGTTTGAAGAACCGAA 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TTTCTTCCTGATAATAAACTATAGTTTTTGTCAAGATGTATATACTGCAA GAGTTTTGATGTGACCTTCATCTTTTTGTN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019751TCONS_00019751Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00019747TCONS_00019747Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019746TCONS_00019746Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019745TCONS_00019745Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019744TCONS_00019744Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019743TCONS_00019743Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019742TCONS_00019742Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019741TCONS_00019741Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019740TCONS_00019740Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019739TCONS_00019739Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019751-proteinTCONS_00019751-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000335supercontigsc0000335:169293..219722 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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2.18 1.21 0.85 1.07 12.74 9.69 7.88 8.84 7.85 8.72 7.17 8.61 12.91 12.78 6.45 11.55 10.35 10.81 9.64 10.17 14.12 12.78 7.96 10.15 23.07 23.53 3.53 1.63 4.61 3.83