XLOC_011038 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011038
Unique NameXLOC_011038
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000332:6171..17511-

Legend: gene
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>XLOC_011038 ID=XLOC_011038|Name=XLOC_011038|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11341bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000332:6171..17511- (Clytia hemisphaerica)
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CCCTTTTACATGATTTTACTATAGACGTGATCAAACAATAGCCTGCCTCC CAGTGTTAAACTACATTCTACAATACTGGGTGTGTTTTAAAAAACACTCT TTTTTTAATTTTCTCTGTTTATTTATTATGAATTTTGAATTTTCTGAACA GCCGTTATTCATGGAACTGATTTTAAAAATTGTTTTATACATGAATTACT GTCGATCAGGAATCTAACAATCTCAACACAACGAGTTTGAAATGTTATTT CTAAATCAACATCAGCTTTATGTTATTATTTTTAGGTCATTTGCATGCTG GAAATGTTGTAGTTGATGGAAATAATTGCAGGTGATTTTTCGTTCGAACC AATAGTTTAAAGCAATTTTCACATTATAAGCAAATAGGTTGCCAAAGCTT TAAATTAGCCAATTAAGCCTTTGATCCAATAAGCGTAAATATGGTATAAT ATTAGGGATGTTCAAAGCTAATTTTTCAAAAAACTACCCCTGACCCGAAA GTTGGAGTTGCTTATAAAACAAATGCTTAATGATGATAGATGATAGATAC TTCTTTTAGCTCTTGAATTGATTTCATTTTAAAGTAATGAATGAAAATAC CAGGTCCTATTAAATTTGTAGGAAATGCAGCTAGCCACTATTGACAATTA TGAAAACTGCGAAAGCCAGTTTTTGATTTTTTTTGCTGGTGAAATTCCAT GTTCAAAATTCAAATAACACAGGGATCCCACTCCTCCTAAAATTCCTAAA ATAAGTCAAAACTCCTAAAATCCTCCTAAAATGCAGCAAATTCTCCTAAA TTCCTAAAATCTGAAAACTTTATCAAGCACGGTAGCTGATTTTGTTTGTA TATTTGTATAATCAGACAAGAAACTAAGATTTTTCCTCAATAAAGTCAAA ACAAACTAGGAGCAAGCTACCTGACCTTGAAACAACATGTTTAAAATATA TTTTTGCACTGAAATATTTGAAACAAAATAATGTCAAATTTGTACCGTGG TTTCGTAAGCAAGGCAAACTGTATTCAAAGTACCATAGAAGTGGATGTGT TAGGTATTAGAGCTTAAGTTTTTGTGGATTTGGTACTGTGGCAGAAGGTA TCAGTCAGAGCTAAGTCACTTTTTGATATTTTATTTTGTCTTTGAAATAT TAGTTCAAATCTGTGATGGACGGAACGTCCCGTTATAGCAGGGGGGGTGA AGCAGTTAGTACAAGACATCATGCCTACTAACTGCTTTCTCGGAAGAAGT TAGTAACACCACCACCTTGGTACACTTAGTACAGTTAGTANNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNCAGTTAGTACTAACTGAATTTAGCCTTGAAAAAGGC TTTTGACCTTCATAAATTCAATAAAATCAAATAAAATCAAATTTAATATC TTAAAAATGATTCAATATCCATAGCTTTCAATAGGAAAAAACAACATTTT AGAAAATCAAATTTCTTTTGCAACCAGCAAATTGTTTTTAAGATTTAAAA AAAAAATTTCGAAAATTTGAAAAAAAAATGTACTTCCCAAAAAAATTTTT TGGTAAAATATGGTCTTTTTTTTTTAATTTTCTCACAAAATCCTATTTTT TACACAATTAGTACCAAAATTTGGCAAATTTTTAGCAGGGGACCACCCTT TTTTGCAGTTAGTACATCTGAGTACTAATTGATTTTATCCAATTCATATG GCACACCACCACGGTACTAACCGGCATGATGTCTTGTACTAACTGCTTCA CCCCCCCCTGGTTATAGTTATAACTGAAAATATGTGACGGACAGGACACA ATTTTGTTGTTTTCGAAGCAAAATTTAGTATTCAAAGCTTCTTACAGGAA AAATTAATCAAAATCTTTACAGTTTTCTCCACTATTTGGTCACATCTTGA TGGGAGAGTACTCAAAATACAAAAATACATCCTCAGAACATACAATTTCT TAAATAAATAAGCATCTTGTGCCGAATTCACCTTTGAAAACAAAAAATTA TGTCCCGTCCGTCACACATTTTCAGTTATAACTCAAATTTGGCTCAAGAA AACAGCCTGAAATTTTCAAATCATATACTTACATTATAGAGTAATACTTT TAAATAAAATTGACTAAAATTTAGAAAGCCAAATTTAAAATTGAGTGGAT AAAAGACAAGCATATGAGTGACGGATGGGACGTCCCGTCCGTCACAGATT TTTGCTAATATTTCAAAGACGAAACAAGTATCAAAAATGACTTAGTCCTG ACTGATACCTTCTGCCACAGTACCAAATCCACAAACACTCAAGTTCTAAT ACCTAACACATCTACTTCTATGGCAATTTGAAGACAGTTCAAAACCACGG TACAGATTTGGTGCAATTTACCCCTATGTTTATTGAAGGAGTGCAGACTT TATTCAACAAAGAGAACTCAAATGTTTTAAGGTTTGATGGTTTGCGCCCT CATCTTTGAATTTTTTACTTGAGCATAAGCTTTGTTACAACACAATGCCT TTCCCTGTTAATGAAAAGAAATATGAACGCTGACAACTATTTTCTAACTG CATTACAAAATGTTCTAAATAATCTGCTTTAATGTTTTGCCATTCTATTT CATCCGCTTTAATTCATTTTGCTCTTTTTTAGTAAACAGAATATAAAAGC AGTAAATGTGCCTGATTATTTATATTCAAAATAAGTTGATAGTGTGCTTT AGTTTGTTTTTGAGGCTCAACTATTATGACTAGTTTTATTGTGTTTGTGG ATGGCTTAATTTGCTTAGTACTCATTGGTTTCCAAGTCTATTTTTTTTTG TATCTATTCAATTTTTGGAAGATCTCAAGATGAGTTTTTTGGTAACTAGC CTTCTGTTGAAATATCTATTGTTACTTTGAATAAAATCAGTCTATATTGC TCAGATTACATCTCAAATTTGTCCCTAGTTTTTCTAATTCAAGTTGCCTT TTGTTAATATTTTTGATCTTGTAAGTTAGCAGTAAGTATGACTGGTAATT TAGCCATATTGAGAGAATTTCTTTTAGAACGAACAATACTTTACGTAAAG TAATTTTATTTTTGTTACATTATTTTAGTCTTCCTGTGGGTGATTTTTTC TGATTGCTGACTTCAGGTCGATTTTAGAAATTTATTTCTTAAATTTTCCT AAAATCCTCCTAAAAAATTGAAAATTCTCCTAAAAATCTCCTAAAATTTG GCCAAAGTCCTCCTAAAATTTGTCCTAAAATTAAGATATTCAGGCGTGGG ATCCCTGAATAACATATTTGAGTCAAAAATTTATTTTATTTTTTTCTGCT TGAAGATTGCTGGATGTAGAAAATGGAATACTGGGCCTGCCCACACTTTA TCGATCTTTTATTATGGAGCTCAAAGCTGTCAAGGTAACTCTTTAGCTCT AGTAGTTGAGATGGTTGACTTTATTCATTACTATCCCTTAGTCTTGATGT CAGCAAATTTACTATAATGTTTATGTCAATGTGATTTCTCCATTTGATGC TAATGCAATGACCTCTTTCAATCTTTCAGGCATAATCTGAAACCATTCAC TTTCACATTGTTACAGTCTCCTTGATTTCTTAAAGCCAAGTTTTGTGCTT GGACAAATTTAGCAAATCAATCTGTCAAGCCATGTCCGATCTGTTCTTGC AATTTTATAATCCAAAACTTGGTGATACTCGAACTTATCTCTTTTATTTG TCACGATAAGTGAAAAATTATTCCTTCGTTCATTGACTTATATAATTTTA TCCATTCGTGTCATATATAGGATCTGGAAGCAGTTGATGTTTACTGTTTC GGTCACTTTCTGTACGAAATCACATTCGGTAACCCATTGAACATGGCACA CGTAGGTAACCTTCCTGAAGACTGTCCTCCCATGATACAACCAATACTAC ATTCAATATTGAGTACCTCAGCTGTCAAAAGTGGATTACCCTCTATAGAA GATCTACTGGCAAATCCGTAAGAGATAAACATGATTTTGTTTTCTTTCCT TTTGATTGAAAATCCTTTCCTTTCAAGCAGGGTTCTCACTGGTCAGGGAA CCTGGAAAACCTAGAAAACCTGGAAATTGTACTAATTGTACGTTTTTGTC AGGGAGAAATACCCTTTTTTAGTAAAAAAATCAGGAGAAATAATTGGTAA TAACTAGTGGGAACCCTGTACAAAGTATTATCGCCTTTTCCTTTTTTATA TAGTTTCATTGATCTATCCGATGTACATAATGTGAAAATCGATTGGGTTA GGTTGGCAAGATTTCCCAAGTATCTTGTTAACATGCCAGAACATTTAGTA TTTTCTTAAAAAAATACCTCAAGGAGGGAAACGCTTTAGTTTTCGTCATA GTAAGCCAGTCTCTTTAGTTCTGGCAGATTTCAAATTAGTGTAATAGCAA CTTTATGTTTCAATTCGATCTAACATTTTTGAATTTCAGTCTGTTTGCAG ACGTACCATGCATACTGAACGAAAAACCAGTTTTTAAAGTGAATAAAGTG AAAGATGCACTTCGGCAATCCAAAGAAGCAATCGAAGGACGACTGAAGGA AGACCAAAAAAGGGTTTGTTTTGATATAAGGTCCTACTTTTTCATCATGT GTGTGTGTTTTCTGCTTTATTACCTAAACAGTATGAAGCTTGACTTTAAA TTTTTAACCACAGTGATTCATTTTTTATAGCCTTATTAATTTATGTGATG CTGTTATATATAGTACCAAACCTACCAATCCCATAATATTGTTTCATATG TGATTAAATTTCAAAAGAGATATGCCTCATATCATTTCATGTAGATTGCT ACTGGCAGCGCTAAATTTCAGAGCTCTTTTGTAATCTTAAAAATAACAGG TTTACCATTCAAAATGTAACTGCAGTTAACTATCGCCAACTCGAACGGGG AATCTCATGTGTTCGAATTACTTTACTTTACTTACGAATTAATTGTTCGA GATATTGGTACTATAGAAAGTATTTTAAGAAGGTTTCTCCTTGACGGGAA CTGGAGAAAAGTTTCTAATTATAGAAATATTCGAAAAATAGAAGTTCGAA TAATAATAGAGATAGCTGTATTATTGTTTTGAATTATTTTGCAGCTACGG CAGTTCAACCGCCTTTCCAAAGCACGTTCTGAACTAATGTCTGAAGAAGA GAAAAAGAAAAGGAAAAAGACCAATAAGAAGGTACCATTCAATTGACTCT ACCTTAATCAAATTCTTGCATGAAAATATAATTTGTTCAGATTACAAAAA GATATAGAAGTTCAAGCTGGTCTTAGTCTTCTCTATTAGACCTTACTTAA TCTACATTGAGTTTAATCCTTTAGCTGTAGCTTTTTAAATGGTCTTTATT CTGTCAAATTATGATATAACGAAATGCTAGTATTTTCGGCAATTCACTAC CAAGGTATTAAATGTTTGGTTTTCCAGGTTTCTCACTCGTTTATTTTTTA TGTTTTTAGAAAGCATCAACTGCAAAAGCCAGTACAATACCTGAAGGTGT CTAAATTTTTAATTTTTTTTCAATGAAATGATGATCCAAGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019623TCONS_00019623Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019622TCONS_00019622Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019621TCONS_00019621Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019620TCONS_00019620Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019619TCONS_00019619Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019618TCONS_00019618Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019617TCONS_00019617Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019616TCONS_00019616Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019618-proteinTCONS_00019618-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000332supercontigsc0000332:6171..17511 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PXKPREDICTED: PX domain-containing protein kinase-like protein isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
17.78 15.57 3.88 2.74 27.06 19.14 20.83 24.78 18.02 23.83 25.64 12.83 24.27 22.8 20.56 25.17 21.78 23.67 20.96 31.05 17.77 17.96 19.59 22.11 24.06 32.32 42.19 28.53 31.96 34.12