XLOC_009576 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009576
Unique NameXLOC_009576
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000259:304140..329439-

Legend: gene
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>XLOC_009576 ID=XLOC_009576|Name=XLOC_009576|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25300bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000259:304140..329439- (Clytia hemisphaerica)
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AATTTTATACAACTTTTGTCTAGTTTAAATTTGCCACTACTGGCTAAAAC CGGGGTATTTTCGTAGAAAACATTACGTCATGAATATAATGAATTGTTCC AAGGTAAAAAATCCAGTAGGGATGGTTTTGGCGTGTAATTTTTAAACATT GAATTTTGAATGGGGATGAAATCAAAGTCAATCTACCAGTGGGACTGAAA TTCCCAAGTACTTTCCCCACCGATGACGAAATTTCCGCCAAATTTTCTTG TGCGTTATAAGAAAAGGGCTCAGTAACAAAACACCATGGTTATAAAATAA ACATGATTGCTATAAATTGGTTTCTTTTTCAGATGTATTGGAGGGTGAGT GATTTCACGTACAGTGGCTTGAAATTCGACAACAAATCTGTTGAACTCTT CCCAAACAGCAAAATCAAAGTGAACAGTGGTATGTACAATTATAGCGTTT TGCAGAATATAAATTTCGGGCGAGAATGACATTTTCAGGTTATTTCTTTA TATACTCGGGAGGGGTATAATGGCTTCCAAACATTCCAACCCTTAGTTAG GGCACTTAAAAACTACTTGCGGTTTTAAAATTTTTGCAGGGAAATTCGTT TTGTGCCTAATGTTATGGCCATAGTTGCAGTTGTTGAACTCATTGGACTA AATTTTTTTTGATAGGTAGTTCCNATTTTTTTCAGATACAGTTAGTAGTA TCAATAGATTTTGACAGACAAGACAGATTTTGATGTTTTGAACATTTTTG TGGAATTCGGTTTTTAAAATTTTGCTGGGAAATTCGTTTTGTGCCTAATG TTATGGCCATAGTTGCAGTTGTTGGACTCATTAGACAAATTTTTTTTGAA AGGCTTTTTGACCTTTTTTTCGCAAATTTCGTTATGTTGCCACTATTGAC ACATTCTGCTCTTCAGTAAAGACAATTTCCTGTAATTAAAGACCATTTCT CGTTCCTAATCCAATGCACCTATCAACTCTCAGCGGAACGGTCAGCTTTA GAGAAAACTGGTAACGTAAATACAAGGAAAACCCAAGTATGTATGTGTGT TTATAATGCGACGGAGATGGTGAGGTTCTAATTTGACTAGATCCTGACCC GTTGAGGACAACGGTAAATCAGCACTTTTACCGTCCTCGATTTTTGCGGG TCAGAAGTGTGGGTTATTCTAACCAAATCGCCTCAGTCACTCCGCCGTCC TCAAAAGTGCAAATACATAATCTCGTTAAAGTCTTTTCGACCTTGGAATA AAAGGGTTCTATTTGACATTTTCTTTGATTTTGTTAAAATCGTTTTGAAA AAATTGGATGAAAAATAACCTGGTTCCACATTGTTGTTAACCTAAAAACC ATGCTTTTCTGAAAGATCGTGTCCTACAACTACATAAAAATCAATTTGAA TGTTTTTACATTCATTTCCCCTGTTTTTATTAAGCAATGATTTTTCGGAT AGAACCTTTTTATTTTTAATTTTCCCTAAATTGCTAGAATAAAAAGGTTC TATTGTCAATTTTTCTTAATTTCTCAAGGGTAGTTCGTACCATACGTTTT ATATTCAATTATTTGGTCATTTCCACCAAGGACAAATCTAAAAAAATGCA TACAAGTGCATTAAAAGTGAAATTTGGGTGTTTTTCAATTATTCTGCTAA ATAGAACCTTTTTATCCAAATTAAATAGACTGTATCGAAAACAAAAGATA CCCTTGCATTGGAGTGACAAAGTAACGTCGATCTTAATTAACAGATTCGT TGCCGACTACGAACATACTTGCGGTAGAGGGCTCAAAATAGGCGCCGACC GCTCCACTAAGAGTTGATAAGTGTATGGTGACGAGGTCTACTTAGACTAC ACAATATATATTGCCGTACAATATTTGACAAAATCGTTTTCGGACCGTAA AGTAAGAAGTAAATAACATGTGCTCTATTATAAAAAGGAATTTTCTTTCT GTAAACAATCCCTCTGTATTGTTAGAAAATGGCAAATCAAGCTGACAATA TATTGTGTAGTGTATGTAGCCCTTATCTCTATACTCTAACTATTATATAA TGTCTTTTGACCATAACTTCGGAGATAAAATATCGAAAGATTGACGTTGA TTCCGATTTTTTTTATTTTCAGTAACCATGTTAAAGACGGTGGAATATAA AATATGGAATTCTCGTGGGCAAATTACCAGTACAGCTTTCGGTGTTAAGT AAAAATTATTTTTTCCAAAATGGTGAGCGGTTCGCTAGTGTTATGCAGTT TACTAAACACTGTACGATTCACCCATTGTACAACGAGTGGAAAATTTTAT AAAAGTGATTCAGCAAGGAAGTAATTTTGGCTGTTTGTGTCATTCTCTGA ATTGCTCCTGCTTCACCCAGATGAAGACCGGTCTCCACTTTCGCGCGACA TGAGCGAAAACTTTTTGACGTTTTTGTAAGGTCATTGGTCGGTTGAAAAA TGAAGCAATTCCATTGGTCGAAATTGACGTAACGGATGAAAAAAGTAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017123TCONS_00017123Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017123-proteinTCONS_00017123-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000259supercontigsc0000259:304140..329439 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
AP5M1PREDICTED: AP-5 complex subunit mu-1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.11 2.17 2.31 2.21 10.84 9.58 9.45 10.13 6.11 8.66 6.62 5.69 6.21 5.79 8.93 11.69 10.5 10.96 5.15 7.41 6.84 7.01 6.58 6.94 7.21 7.51 6.94 5.54 10.23 9.34