XLOC_008579 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008579
Unique NameXLOC_008579
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000210:83626..109691-

Legend: gene
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>XLOC_008579 ID=XLOC_008579|Name=XLOC_008579|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=26066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000210:83626..109691- (Clytia hemisphaerica)
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TCACTGAGAGCCAGAGTTACTATTCCGTTATGAGAGAAAAATTTACTTAC ACCAGTGCTGATCTCCATGACAAATATTCCATGCTTCTCCTCCAATTCAA CCTTCATGTGATGGTAAAGCATGCTGTTCAGTGTTCCTCGTAAATATCCA TCTTCAATTAAATACATGACTTTCCCTTTGTATTGAGGTTTTTCGTTTAT CTGGATTGCTTTATGCTGGAGCAAAATTGTTTTTCCCGTTCCAAACGGCC CACAAATGATCAATTTGTTGTAGCGGGGATCGTTGCTATTCAGTGCTGCC ATTTGTTGATTGGAATAAAATAGGATATTGTCACTCGTTGAAACGTTTTC GATGGCGTTTCGGATGTACTCCACCCAGTTTGAGCTGGTTATTGGTGCTA CGAGGTCTTTCTTGGAAACGTGAATCGAAAACACGATAATCTTCAAAAGT TTTTGGACTTGATCGAGTGAAGTTGGTTTTTGAGCGATTTGAACGATTGG GTAATTANGAATCGAAAACACGATAATCTTCAAAAGTTTTTGGACTTGAT CGAGTGAAGTTGGTTTTTGAGTGATTTGAGCGATTGGGTAATTATCAAAG ATGCTTTCCAGCCATAGTTTTACGTCGGTTTCCATGGTGACAAAATGTTG GGTAGTGATAGAAATGGAACTGTTTCCAACACAAATAGCTGGAAAGAAAG TCCATCCAGACTCCAGGTTATCTCCCAGTCTTTCCTCAAACAATTGATGG TTCGAATCTAACTGTTCGAAAACTCGATCGTTTTTTAGTTCGCTTTTCAT CTCTACGGAAATGATGAGTTTTCTTTGCCATGAGATGATCAAAAAGTCTG CTTCTTTATGCATCTTGTTTCGAACATTTGTCAGAAAATTGACAGATGAA AGAACAACTGTGTCTTGGAGAATGTCATTTTTTAACGGTACGAGTTGATT ATAAAACCAGTGTTCAACATGCTCTCCGAGCTCTGACAACTCCAAATCGA AAAGCCATCGAAGATTCGAATCCTGTGTCTTGTTCTCCTCGATCTTCTGT TTCAACAGCTTTTTGAAATTCTTTTCGAAGAGATATTCGCGTAGAAAGGT TTTAAGCTCTGGCTCTGGTGATATCGAAGGAAGTTCGTTGATGCACCCTT GAACGAAGACTCCCAGGTCTGATGTGGTTGTTGGTAGAATGTTGTTGTCC GTTTTGAACTCGTCAATAACCAAATACAGGATTTTCAGGTTCACAATCCA TTTGTCAAACGCGTTCTTGTCAATACGTTCAGCAGCACCATTTTGTGTCT GCATGAAATGTTCTAATTCCATCGTCATCCAGTGTCCTCCTGGTGAATCC TTTTTCAAGTTGACCAAAAGTTTTTCAAGATCTTTCTTGACATCATAATC AAGAATAGCAACGGTTGATTTCTTCGTATATTGTTGTGAAACAAACGTTG GAGGTATGAAGACAGCTTCGTGTAAATCGTTCTTGAAAAGTGAAGATTCA CCGTATTCTCTTTGAAGGAGGAACATAGCAGCTTTGATTGGGTCGGTAAA CGTTTGGGTGTTCCCTAAATTAAATTGTCTGGCTTGACGCTTCGATACAG TTTGGTTGTTCTTGATAATCTGCCAGTATAACGATTTATTTGGATCACAT TTTAAAGGATTGATTGGTTTGGGTTGCAACATTAATAATTTCTGCGCGAT AGTTTGGACACCAATGATACTCGCCATCTTGTTTCAAATGAAACCACTGC TTTTCAACGATAACAAGCTGAATTTAACTCCAATTTATCCTTTGACAGAA CATCCTACATGAACTAACCTTTATTACAAAACACAAAACACATTCCTATA GTGACTAATGAAGCTAATTAAAAACGTTGAAAGCTATTTTGATCAATAAT CATCACATACCTCTTAATGCTCTTAATTTACAAAAGGACTCTGAAATGGG GAAGCATTGTTTTATAGGAGCACATGTTTTAAGCACATGTTTTATTCAGG GTGCAATGGACCGAAAGGTAAGAATAAGAACGAATGCTCCTGTATGCCCA TATGTCAACGCCTCGAAAAAATGCAAATGATATTTCAGAATAGTTTTCCG TTCTAGTTAATCATATTTACGTATCAACCCCTGGCGGCGTGGTCAGGGAC GAATATACTAGGTAAATCTATTTCGACGACGGTATCGAAAACGCAAGCAC AGCTCATGTGGAAAATGTAAGATACCCTTGAAGCGATGAAGTAACATCAA TTTAGTTGAGCTATTCTAATACTAAAAACAGTTTCACTCCACCGCTGTCT AGTGAAATATCTCTTATACGGCATTAAGTTTTGGTGGGAATTTGCTTGGT TTGATTTAGAGGGAGTATACCGATTTAGCCGAGAACAATTCTTCCTTGTA AATTGACCACCAGTCCCCTAAGAAGCCGATCGCACCGTTAAGGGTTGATC GGTTTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCACGGACCCAACAAC TGATTGGTTGCAGTGGTTGTTTTTATGTCACTTACAACCAATCAGCTATT GGGTCTGGGATGTAATGTCAGAAGACAACGGTGCATATTATGAATTCATG ATGCGGTAAAAAACACTATTCTTATAAAAAAATGGGGAAATACCTCGCTG TTCCAACCTTATCATTACGTGAATAAATACGTGTGGATAGGATGTGGAAT GTTTTTTGTTTATTTTGGGTTATCTTAGCAACTAGTGCCAACTTTAAACC CTTATCTTTGATGAAATACTCGAGAGCTTTGCACTCCTTTTTTATAAGAG CAGTTTAAGAACAAAACTATTGAAAAATAAGAACGATTTAAGAAGATTTT GTGCCTGGAAATGCTGAATTTCAAGCAATTTATGACTTATAGAAAGCCTA TAATACATAGATAAATTATGAGGCTCCAAGTGTCAAAGCCTCAACAAATT GACGATTCTTGTTAAAGAAAGTGTATCTAAGCCGAAAAATATTGTGAGAA ACTAGTGAGAAAGGGATTAAAGCCTTCTTTATTCTAATGGTCTTCATTTC ATCAAGTGTATTGAGAAATCAATTCCTTGATTTTCCGCTGAGATCATCAG AAAACTAGGAGTAACTCAAGCTGCCTTCTTCTCTCTAGTAGAGAAAGAAG CGAGTGACAAATCAATCCCCGTCGTCGAGGAGGGGGCATGGCCCTAGACA TACTGTCAAGAAAAGTTACTTTGAATATTATAAGTATCTTTCAGCCCATT TACCCTTTCGTAAATCATAAAATAACTCGCAAACAAATCTTGCCTTATTT TGAAACAATTATAGCGTGAAACCTTCAACTGCGCCTTTCCATGGATAGCT CGCACAATTATTAGAATTACTTTTGATTATTCTAAATAAGTTTGAGTTTA TCGACCCAGTGATATTCATATTGGAAGTTTATCGTGGCTTGGATCACGAG ATTTACGTTTGGCTACGTTTCGAGAGGTTCTTCTCCCATCGTCGGGCAAG GCGGATAATAATTTTAAATTAAGCTATCATTATATGATTTTAAATTTGAA ACAAATGATTTGCTAGACATTTATGAAAAGACTTCTTGACTTGTATTCCC TTCTCTTTCTTCTTCTTTGTAGGTTTGGCTTTCGCAACCAGCCGGTAATT TTCATCAGCGCCACACCAAAAGTCGGTGAAAAACAAGTTCGCTTGACCTA TCTAACAAACTGGATCGAACGAAAACTTAAAGAGGAGTTTAAGGTATGTT TTTTTCCTTTGTCTTTGTCTTGTCTTTGTCTTTGTTTACTTCTGTCTGTC TATCTGTCTGTCTATTGATCTGCCTGTCTGTCTATTGATCTGCCTGTCTG TCTGTCTGTTTGTTTTCCCATTCAATGAAGAATTAAAGGTGGCCCTGTCT TTAGGACAGTACTGTTAGGTTCCAAATAAACGGGGGGTTCGAATAAACAG GGGGTTGAAAATTTTCGAACTTTTAATAAACTGGGGGGTCTTAATTGCCG GGGGGTTGAAAAGTGTACTTCTGAAAACCCAAAATTAAGGTAAATATAGG CTAAAATCAGGCTTTTTAGAGCAAAATAAGGGCCTTCTTTTTGCCAGCTG AAAATGTTCTTAAAAATTAATAATAAACAGGGGGGGTCCTAATAAGGTCC AGGGGGTTGGAAAATTTTTGAAAAATTAACAAGTGGATGGGGGCGTTTAT TTTGAACCTAAGAGTACACTGCTGGTTAACCGTCATCTTAAGTCAATCAG GATATAAAAAGTGTGTGCTTATACATTCGCGTTTATTTTACTTGTAATTA CAAATGATCTGTTTGTATTCAAATTGGTTGAATAGGATTCAACCATGACA AACGACTACAAGAAACTAAAACCTATACACGTTTTTTATAAGAATATGAG GCTTCGATGGTTTTCAAAATATAAATACCTAGGCCTTTAATATGAATACT ACTCGTCAAAACGATTATATCGAGTTCTCTTTCAACGTAAGTATTTGCTT GATCAAAGTACTTTTCTTAAAGCAACAAAATTTTGACATATACGATTTGA GAGATTAAGAAGCATTACGTGTAGCCTGTATACCGCCTACTGTTTTAATC ATTTAACCCGGATGTTTTTCTCACTCCAATGTTGTCATCGGAAAAAAAGG ATTCAACGACATCTATGATGGAATGCAGTTTTTCCATATAAGGAATGTAA ACGAACACTCTCCATCATTTACCTTGAATTCTACTTCTTTCTCCTAATCC TTTAGATTGCGTAATCTTAAATTGGTATTTGAATTACGTCATCTGAAACC AATAGATTTCCATTTTAGTTTCGGTTTATAGTGTGATAGCAGGGATATGT AATAGCAAAGCTGGATGAAGGACGAGATTTCCGTAGCGGATTGCTTCTTT GTCTTTTCTATTGTATTGAACAGGATGTGACCAACAATTTTGTATTTCTC TTATATTAATGATATATTTCGAGATTTGATTCTCATCTTCAGATTAATAT CTAAAAAGAAAAATATAAAAACAGTTTTAAAAACAGTAAAAAATCCAAAA CATGTACATCTTCGTAAAAAAACCTCCTCATACAACACTCGTCTCATAAT AAATTCTACTGTAAAAAATAAAATCGGAAAAATCAAAAATTGAAAAAAAA TCAGTAAAGCGTAACGAAATAATTAAAAACATTTTATTAGAAAAAGGACC ATTAAATTTTTATAACTAGTGCTCGGCTTTTGTATTCATCCTTTTTGTTT AGTTCAGGTTTGAGATCTTTAATGAATAATGCCTCAAGAGTCATTAAATG TTGTTCATTTTTTGTCGACATGCCAATGATAGAGAAATCATCGATTGAAA TATCTCTATTACAACTAAGAAAATGTTTTCCCACTGGACTTCTGGAATGC TCTTTTGAACGCGTAATTAGATGCCGAACGGTTTGGCCGACATAGCGCGA GTTACATCGCGGACATTTAACAAGGTACACTACGCTGCTTCTAAGAGGCT TTTCAATTTGTGGCTTTAATGATTGTAAAACAGTTTTTAATTTTCTCGTC GTAAAAACAACCTTACACGGGGCATCGATTCGTTTCAGTGTGTTTTCAAA TTTATCCGAAACTTTACCACGATACTGTATGAAGAATTTCTTTTTATCCG ATTCGTCTTCTTCTTTTTCTGGCTTTTCGACAATTTTAGTTAAAGTTTTC TCAATGATGGGATTGAAAAAAGAAGGAGGATATTGATTGTTAATCAGGAT CACTTTCGCTTTCGCTTTCTCTAAACTTTCTTTCTATTGTAAACTGTTCA TAATAGAAATCCATCTCTGTACCCCTGACTGTTCTGTTTTTATAAGAAAA ATGAAGCAGACAAAGTATTTATGCAGTACGTCTGCATGTCCCCGCTATTC ATCAAAATAATATTTGCAGAAGCTACCCCAAAATCTTCCTTGTAAATGAA ATGTAATTTTATCAGCGTGTGTTATGAATTTGAGAAGTTTTCATGATTCC TCTTTAAAAATCTCGGATGTAAATATTTTGACAAATATTGTTTCAATTGA CTGGAATTTTTTTCCATAATCTGAAAATATCAGTTAGAAAGTGAGGCACC CCGCGGTGTAGCGCGGTTTTTCAAATGAAAAAGAGCTATTTATAATCTTG CAAAAGAAACTTCTTTTAACTTTACTAATGAAAACAATGTTTTTCATTCT TTTAAATTGTCATTCACCAATGTTTTACAGACCCTGGCTAAGAGGAAATC CAAATTTCACGAGTTTGTAATTAAAAAGTTAAATTTCATATCAAATTTTA ATGTCAGGGTACTGAGATAGAACAAGGCTTTTTCAAATGTGCATTATCCA GCTTCGCTATTACATATCCCTGGTGATAGCCAAACCTCAGATGTCTCCAT TTCTCGTACAATCTTTTTGGTCCCTTGAAATGTTTTCTATATAACTCGAA CCTTCTAACTTCTAACTCAAACTCGAACTTTGATACTAATCCTTTGCGGC ACGAGTTAAGAATATTGTAATGCCAATCGCAAGGAGTTTTATCTCACTGA AAATTTGACCCCTTTTATTAATTTACGTTTAGAGGGGTGCTCTGGCCCTT ATTTTTCACTAACAGAGGATACGTGTTTTTTTTAATAAGCTAGTGTCTAC CCTTATGTTAGGCTAGCATTATGCTTGGCATTTTATTGTTCTTGAATGAT GAAGCCATTGTTTAGGTACCAAAAACTGAGCCTGCATATGCTTATAAACG TTATACCTGTAGAAAAATGTAATTGTTAGAAATTTAGTTGTTCTGATGTG CATTTATCTCGAAGCTGACAGGCTATCGACCCTAACATACGAAGCAAAGT GGATTGGAGTTAATTTTTCTAGCATCAAATGACGTCAAAAGTCGTTCTCT TTTATTGCAAAATATTTCTCACCGCCGATCAGATTTCGGAAATAGATCCC TACAAAGCATCAAATTTAATACGGTCCTCATAAAGTCGAGCTCATTCATC TTTTCAGGATTATAAAGTGATACAACGTTTATCTAATGTTCACAATGTCC ACATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAATATTGTGTGTCAGCTGGTTAGC CCTTTCCGTGCCCATGTCGGAGCATTTTTTATTTCCTTGCCATCGTTGGG ATTTGCCGACATGCGAAATTTCGACCAATTTGCCCGAAATTTATCATTTT TTACAAGATTTTTGTATTAGGTGGTTTGAAATGAAAGAAATGAATAGTTA CACACTTTTCTATGTTGAAAAATAACTATTCTACAATGTTCAACTCAAAA TTATAGTCCTTGGCTAATACTTCATATATTATTCAGAAAATGAAGTGAAA ATCGCTATATTTTGCCCATGTCGGCGTTTGCCGACATCGCCAAATAGTTC GAACCTTTATTTTTTACTTCAGCAAATAAATCGAACCTAAAAAAAGCGAC GGGCAGTTAAAGGGTTAGAAAGAGTCGAAGTGGTTGTTTGTAGATGATCG TTCGATGCAACAGATGGGCAGAAAGTCGACTTAGTAAAATCTGTATTTTT GCTTGAAAACCACTGCAATAACTATGGACTTTAATCGGGATATCGGTAAA AAGGAGGGAGGCAAGGCAGAAGATGTCACAGGTCTGGACGACTCACGGTT AAATGTTTTTGAACACACACAATACTCCTAGAAATAGCATAAGGACGTCT CATGAGAAATCTTAGTTCAAATTCACCCTAACGAATAAGAGAACATCGGG TATCATCTTTATCATCCTAAGGTCTTTTCATGCGCAAACTAAACCGGCGT TTGGGACGACGGGAACCCTAAGAGACATATATTTAAACTTAACTGTTCAT TGTTCACCATTCTCGTTCATTTTAGAAATATTTGGTGTTGCCAAGTATGC AAGATATCTCAATTAAACTGATGGATTCGCAGCTGAAAGATTTGTGTCCT GAAAGACCTATGTCATAAAATTGTGAAGGAGGTTTCGATTGGTTGAACAA AACACCGAATTCAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015345TCONS_00015345Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015344TCONS_00015344Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015343TCONS_00015343Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015343-proteinTCONS_00015343-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000210supercontigsc0000210:83626..109691 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.84 6.41 71.55 86.65 16.46 12.32 16.65 18.78 11.44 14.4 15.25 10.85 7.83 8.41 6.75 7.27 8.04 9.38 7.83 8.54 7.94 9.52 8.13 9.83 15.91 15.88 6.04 4.87 10.8 10.96