TCONS_00029231 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00029231
Unique NameTCONS_00029231
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2211

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00029231 ID=TCONS_00029231|Name=TCONS_00029231|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2211bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00029231-protein

>TCONS_00029231-protein ID=TCONS_00029231-protein|Name=TCONS_00029231-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=610bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000730:128210..141539-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00029231 ID=TCONS_00029231|Name=TCONS_00029231|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000730:128210..141539- (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNNATAATTTTTCGTAAATTTTTTTATTGCATTTTTCATCAAA ACACAGCTATACAATTCCCAAATGAGACTTAAAGATCTCTCAAGAGAGTC AAATGCATCAAACTCATTGCTAATGATATGTCGTTATGACGTTTCATGCT GCGAGAAAGATGCGACAAACATGCTATGTATAAGAAATTGAATGTTGACA CCAGAAAATTTCAAACTTCCACCTCGCCAAAACCACCGTGCCACCGCGTG CCTCCAAAAGATTTCCATATCACTATGAAGCCAAGATACTCTAGTCTAAC ATATGTCAATCCTAGCTCTTCCCGGGAAAAAATTGGACAGATATTGCCAA CTTTATTTTCAGCGTCATTCTAGGCTTTTCACTCAATTTTTCTTGTTTGA TGAAGTTTTTTTCACATTTAATTTCATAAATGTATTCGTTAAGCTTTTTT GCTTTCATTTTCAAAGTTGCATCCGGTAAATATACAAAAACAAGAAGTTA CAGGACTTTTTAGAAATGGGATTATTAATCATTTTTCAAAATCAGGGACC TTCGAGCTGCCATGACAGTTGTCCTTTGCGGACAAAGCTAGAACATTGAT TGTTTTCTGAAACAATGGAAATACAATGGTCGCTCTACACTGTTTTATTT GATGTTTATCCAGAGTTCTATGATAAATCCATGGTTTCACTTAATTTATG CTGTAGGTAGATTCCAACTAGCTCACAAACTTCAGCGCCGTCGAACGCAC CCATGGTTACGTCAAACAGGTTACCATTTTTTTTCATCCAAGCGGAGTCG TCGCTGAAACAAGGAGATTTTCGTGCGTGGTTGATAATTCTAACGTCTTT TGCTGACAGAGTAGTGATGGTTTTAGCGAATTCGATAGCGCTGGATACAA GATCTTTAGAGATTGACGGATAAGTCTTTTATGTCAAACACTATGAATTT 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GAAAAATCATCTTAAAATATTCTTAAGGCTTTCTTATATTCGTCAATTTT AAAGCCATACTTTAATAATACAATACCAAAGAGGATTTATTGCAATTTCT AGAAATAATACTATTTCAAGGTGGCAAAACCTTGAAATTACTGAAATTTT TTGTGTAAATTAAGAAAGTTACGGTCACAAGAAGATCAAAATAGAAATTT CATGATGGCAATTCTTAGGACATTCTTAATTTTTCGCCCAATTTCATCAT GAATATTCTTATAAAGTATATTCTTATAAAAAACGTGTAAAACAAACGCA TGCGCATTTTTTTCTTTGTTTCTCCACCATCTTGACACTTGTTTTACCTG CACCAGGTAACAACATCTTTTGGGAAATATTTTCCAATTCTACCTGATTT GTGAGAGAGCGGCATGCGGATTGTTGAAAAATATGTTCCGATAATCGGTA ATATTGATTGACTATTTTTTACTTTCAGCCACGGAAGAAGAGTTAAGGAT TGCTCCATTGCGGGCGCATTGTGAAAATGAAAAATATGAAAATGTCAACG AATCTCGACTATGCCAGATGGTGATGGGAGGATCAAATTTTTACATTGGT TAAAGTTCTAATCATTAAAAATGGAACGTTACGGACGTTAAATGGACGTT GAAACAACGTTGTGTGCCCACTGGGACCATCGCTTGTGTGAAAATATTAT CAAAGAACAAGGAAATTATTTTATTAGCAAATAAATACCGACATTATAGT TTGCGAAACTGGAAAATTTCATCAAACAGTTAGAGATTTAAGATAACGAT TCGGTTACTTTGATGTTTTTTATTCATAATTTTACTAGAGATTTTAGTTA TCTATATAAAAGTTTTAAACCTTCGGGATTGTTTTAAGGGAAGAATGACT AAGGCGTGGTGTTTCAAGTCAAATTTGTTAACGGAAGGGGTGTTAATAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000730:128210..141539-

>TCONS_00029231 ID=TCONS_00029231|Name=TCONS_00029231|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9165bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000730:128210..141539- (Clytia hemisphaerica)
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CAGTTGATGGAGACAACCTGAACTGTGACATGGGCAACTTGCAAGGGCTA
ATATCCGTATCTTTTTCTGACGGACACCGGCCTTATCCCAGGCCTGTGTA
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CCAAGGCCAGGAATGCAAATTCCAGGTAATAGTTTAATAGATGTTAGTCG
TGATCCAAAAAGCTTTTGGCAAGTTCAATTGATCTCAATTGCAAAAATCG
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CAGGAATCATGCATGATGTAATCGCCAAAGAAATTAAAACCAAGAAAGAT
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GGAACCTTGCATTAAACGGTTTAACAAGGCAATCCTCTACCCTATCCAAT
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CACGGTATGCTCAAGCACAATGGTTTCACAATCTCCTGACGGAAAAATCT
GGTGGCAAGTGCAGCTATCAACATCGTATCATGTTGAAAATGTTTTTATA
TACGGATGCGGTGACAGTTCGTTATCACATTTTGATATTACAGTCATCAA
TTCGGACGGAAAGATTTCCTTGTGTAGACATGTGTACGATTTAGCCCGCG
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GTTCGTATTGATATGAAATATTTAGATCAACCGTTGAGATTATGCGAAGT
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CTTTCACATACTGATATTTACGTTTATGATAAAGACAACAAACCACATTT
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NGCATGATTTCAAAAAATGGCTTGGAATTAACGCAGAAGACATGCTGTAC
AAACACGAGGATGTTTATTGGAAACAAACATTATCACTTGTTCAAAAATA
TTGGCAAGCGACTGTAATGTCTCAAGTTCAATTGTGGGAGCAATTCGCAG
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CAAAAGCATCAAGCAGCCGTCTCAGCTCACATGCAGTTGATGGAGACAAC
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AATTCCAGGTAATAGTTTAATAGATGTTAGTCGTGATCCAAAAAGCTTTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
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Expression

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Values :
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR006585FTP1
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00029231 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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