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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00029231 ID=TCONS_00029231|Name=TCONS_00029231|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2211bp TCAATNgcatgatttcaaaaaatggctTGGAATTAACGCAGAAGACATGC TGTACAAACACGAGGATGTTTATTGGAAACAAACATTATCACTTGTTCAA AAATATTGGCAAGCGACTGTAATGTCTCAAGTTCAATTGTGGGAGCAATT CGCAGTCGACGCTCAAAAAGAGCTCCTTTCAATCGCAGGTCCGCCAAATC TCGCTTTGGGTCGACGGACTTCTCAATCAGGCCAAAAAAGCGGTAGCAAT CTTGCCGTCGATGGAAAACATGACAAATGCTTTCCTCAGGGTCACCAGAG TACGAACACAGGTCTGCAACAGAATCCATCTTGGACTGTCACACTGGACA AAGCTTACGATGTCAGATACATCATTCTTTATGTTGGTAATTACAACCCT TACGCCCATGCAAACTCACTTTCACATACTGATATTTACGTTTATGATAA AGACAACAAACCACATTTTTGTGCAAATACCGGAGACATAAGCGTATCTC GTAAAATGATACGAGTTACGTGCAATTTTGGTGCAATAGGAAATAAAGTC AAGCTTGAAAAGCAAGTCCACGGACAGCTGAATTTATGTGAAGTTATGGT TTATGGACAAAAAGtcGAATCTTATGGTAGGAACCTTGCATTAAACGGTT TAACAAGGCAATCCTCTACCCTATCCAATTTCCCAAGTTCCAAAGCTGTA GATGGTAACAAAGCTGATTGTTCAAACAACACGGTATGCTCAAGCACAAT GGTTTCACAATCTCCTGACGGAAAAATCTGGTGGCAAGTGCAGCTATCAA CATCGTATcatgttgaaaatgtttttatatacgGATGCGGTGACAGTTCG TTATCACATTTTGATATTACAGTCATCAATTCGGACGGAAAGATTTCCTT GTGTAGACATGTGTACGATTTAGCCCgcgaattccctttcaacaatgTCA AGTGTGGAGAGGAGGCATATGGCGAGGTTGTTCGTATTGATATGAAATAT TTAGATCAACCGTTGAGATTATGCGAAGTTGAAGTTTATGGGCACCAATt tGATGTTCAAAACAGAGAAAATTTGGCTTTACATGGTAAAACAAAAGCAT CAAGCAGCCGTCTCAGCTCACATGCAGTTGATGGAGACAACCTGAACTGT GACATGGGCAACTTGCAAGGGCTAATATCCGTATCTTTTTCTGACGGACA CCGGCCTTATCCCAGGCCTGTGTATGAAAAAGGCCGTCGTTATCTTAAGC ATGTGTATGAAAAAGGCCGTGGTCATCCCAGGCCCGTCTATGAAAAAGTC CGGATACCGTCAGACCGTATGCTGCCAAGGCCAGGAATGCAAATTCCAGG TAATAGTTTAATAGATGTTAGTCGTGATCCAAAAAGCTTTTGGCAAGTTC AATTGATCTCAATTGCAAAAATCGAATCCGTTATCATATACAACCGTGTC GACTGCTGTACAAATGATTTATCGAATGTAACAATAACTGTTTTAAGCTC AATAGAGCTAGTTTCTGTTTCGAAAGATGGTACACCCATCAATGGTAAAC CATATGAAGTACCATTTGGTGATACAGGAATCATGCATGATGTAATCGCC AAAGAAATTAAAACCAAGAAAGATGTTTTTGGTGATATTGTGAGGCTTGA TCAAACAAGACCATACGTGCCTATAGCTTTGTGCGAAGTTGAAGTTTATG GAAGAagagCCACGGAAGAAGAGTTAAGGATTGCTCCATTGCGGGCGcat tgtgaaaatgaaaaatatgaaaatgtcaACGAATCTCGACTATGCCAGAT GGTGATGGGAGGATCAAATTTTTACATTGGTTAAAGTTCTAATCATTAAA AATGGAACGTTACggacgttaaatggacgttgaaacaacgttgtgtgccc aCTGGGACCATCGCTTGtgtgaaaatattatcaaagaacaaggaaattat tttattaGCAAATAAATACCGACATTATAGTTTGCGAAACtggaaaattt catcaaacaGTTAGAGATTTAAGATAACGATTCGGTtactttgatgtttt ttattcataattttaCTAGAGATTTTAGTTATCTATATAAAAGTTTTAAA CCTTCGGGATTGTTTTAAGGGAAGAATGACTAAGGCGTGGTGTTTCAAGT CAAATTTGTTAACGGAAGGGGTGTTAATAAATAGAAATGGATGTTCTTTT CGCGACAATTT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00029231-protein >TCONS_00029231-protein ID=TCONS_00029231-protein|Name=TCONS_00029231-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=610bp
QXHDFKKWLGINAEDMLYKHEDVYWKQTLSLVQKYWQATVMSQVQLWEQF AVDAQKELLSIAGPPNLALGRRTSQSGQKSGSNLAVDGKHDKCFPQGHQS TNTGLQQNPSWTVTLDKAYDVRYIILYVGNYNPYAHANSLSHTDIYVYDK DNKPHFCANTGDISVSRKMIRVTCNFGAIGNKVKLEKQVHGQLNLCEVMV YGQKVESYGRNLALNGLTRQSSTLSNFPSSKAVDGNKADCSNNTVCSSTM VSQSPDGKIWWQVQLSTSYHVENVFIYGCGDSSLSHFDITVINSDGKISL CRHVYDLAREFPFNNVKCGEEAYGEVVRIDMKYLDQPLRLCEVEVYGHQF DVQNRENLALHGKTKASSSRLSSHAVDGDNLNCDMGNLQGLISVSFSDGH RPYPRPVYEKGRRYLKHVYEKGRGHPRPVYEKVRIPSDRMLPRPGMQIPG NSLIDVSRDPKSFWQVQLISIAKIESVIIYNRVDCCTNDLSNVTITVLSS IELVSVSKDGTPINGKPYEVPFGDTGIMHDVIAKEIKTKKDVFGDIVRLD QTRPYVPIALCEVEVYGRRATEEELRIAPLRAHCENEKYENVNESRLCQM VMGGSNFYIG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000730:128210..141539- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00029231 ID=TCONS_00029231|Name=TCONS_00029231|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000730:128210..141539- (Clytia hemisphaerica) TCAATNGCATGATTTCAAAAAATGGCTTGGAATTAACGCAGAAGACATGC
TGTACAAACACGAGGATGTTTATTGGAAACAAACATTATCACTTGTTCAA
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GAAATGTTAGCGTTGTATCAGTGTTTTTTATCGTTTTTTAAAGTTCGTTG
GAACTTGTTGTGGTATTGTCGGAACTTATTTTCAATGTCTAAAGAGCTAG
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AAAAAGGAATTCTAACCTACTAAAGATAATCAAAATCATCTTCTTACGAC
TAATCTATAGGTCAGAATTCTCATGTTGGAGACCACCTACATTCTGGGGG
CCATATACTAAACCTCAAAAATGGTATGTCTTGACGAGGAATGGACCGAT
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ACAAAAATTATTTATAAAATCCTCCGTCATCTCTACCCTTAATTTGACTA
TTTCACTAGAAATTTAGGGTTCGAAGGCTTAAAAACGCAATTGCAGTTAT
ACAACCCTTAGGGGGGGGTTAAAACGACTGGAATTTGTAATTTTTACGCC
CTTTAGTGGGATTTTGACGATCCAAAAAGGGCACCATTACATAAGGGCAG
CACATCCCCTTACTCTCCTTTTTCATAGCTACCCCGCGCCCAAGAAATGA
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TAAACTATCTGTATTCTAATCATTGATCAATTCATATTTTTCCAAACAAC
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GGCTTTACATGGTAAAACAAAAGCATCAAGCAGCCGTCTCAGCTCACATG
CAGTTGATGGAGACAACCTGAACTGTGACATGGGCAACTTGCAAGGGCTA
ATATCCGTATCTTTTTCTGACGGACACCGGCCTTATCCCAGGCCTGTGTA
TGAAAAAGGCCGTCGTTATCTTAAGCATGTGTATGAAAAAGGCCGTGGTC
ATCCCAGGCCCGTCTATGAAAAAGTCCGGATACCGTCAGACCGTATGCTG
CCAAGGCCAGGAATGCAAATTCCAGGTAATAGTTTAATAGATGTTAGTCG
TGATCCAAAAAGCTTTTGGCAAGTTCAATTGATCTCAATTGCAAAAATCG
AATCCGTTATCATATACAACCGTGTCGACTGCTGTACAAATGATTTATCG
AATGTAACAATAACTGTTTTAAGCTCAATAGAGCTAGTTTCTGTTTCGAA
AGATGGTACACCCATCAATGGTAAACCATATGAAGTACCATTTGGTGATA
CAGGAATCATGCATGATGTAATCGCCAAAGAAATTAAAACCAAGAAAGAT
GTTTTTGGTGATATTGTGAGGCTTGATCAAACAAGACCATACGTGCCTAT
AGCTTTGTGCGAAGTTGAAGTTTATGGAAGAAGAGGTACACGCTTTTTTT
TATAAGAATGGTCTTTTTCCATTCTAGCATGAAAATTCTTAACTTTTTCG
GAAAAATCATCTTAAAATATTCTTAAGGCTTTCTTATATTCGTCAATTTT
AAAGCCATACTTTAATAATACAATACCAAAGAGGATTTATTGCAATTTCT
AGAAATAATACTATTTCAAGGTGGCAAAACCTTGAAATTACTGAAATTTT
TTGTGTAAATTAAGAAAGTTACGGTCACAAGAAGATCAAAATAGAAATTT
CATGATGGCAATTCTTAGGACATTCTTAATTTTTCGCCCAATTTCATCAT
GAATATTCTTATAAAGTATATTCTTATAAAAAACGTGTAAAACAAACGCA
TGCGCATTTTTTTCTTTGTTTCTCCACCATCTTGACACTTGTTTTACCTG
CACCAGGTAACAACATCTTTTGGGAAATATTTTCCAATTCTACCTGATTT
GTGAGAGAGCGGCATGCGGATTGTTGAAAAATATGTTCCGATAATCGGTA
ATATTGATTGACTATTTTTTACTTTCAGCCACGGAAGAAGAGTTAAGGAT
TGCTCCATTGCGGGCGCATTGTGAAAATGAAAAATATGAAAATGTCAACG
AATCTCGACTATGCCAGATGGTGATGGGAGGATCAAATTTTTACATTGGT
TAAAGTTCTAATCATTAAAAATGGAACGTTACGGACGTTAAATGGACGTT
GAAACAACGTTGTGTGCCCACTGGGACCATCGCTTGTGTGAAAATATTAT
CAAAGAACAAGGAAATTATTTTATTAGCAAATAAATACCGACATTATAGT
TTGCGAAACTGGAAAATTTCATCAAACAGTTAGAGATTTAAGATAACGAT
TCGGTTACTTTGATGTTTTTTATTCATAATTTTACTAGAGATTTTAGTTA
TCTATATAAAAGTTTTAAACCTTCGGGATTGTTTTAAGGGAAGAATGACT
AAGGCGTGGTGTTTCAAGTCAAATTTGTTAACGGAAGGGGTGTTAATAAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000730 | supercontig | sc0000730:128210..141539 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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