TCONS_00023795 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00023795
Unique Name	TCONS_00023795
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2369

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000462:84863..99672+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000462:84863..99672+

Legend: exon

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>TCONS_00023795 ID=TCONS_00023795|Name=TCONS_00023795|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14810bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000462:84863..99672+ (Clytia hemisphaerica)
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ccttcgcgtcgcctccgactgcggtcgcagacttacttactcaTGGCTCA
AATGGTGCAATTTTATGTCAAAGAGTGTATTATCATGtgaatttttaaca
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ATGTATTTCTGAAAGCCCTTAAACCAGATTAGACTTTTCTACTCCcatag
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ATTTGCACAAGCCGATGAAAATGAACTAGAAATCGCAAAAAGTCACTTAA
AATTACTGTACTGGAGGAAAATTTACTTAGATATAGTTGAACTGAAAACC
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GCTTATTATTTTAACCTAAAATCTCACACActtaaaatttttcgattttt
cagatattttcgTGTGATTTTACacgaaattatttttaattatgGTTAAT
TAGAGAACTGATACCTGGCTGTTTTGGTATATCTGCTTCTTGGGCAGTCC
TGAACTTTTGCGATGCCTGATTTCTTATTCTGCCATTGTGAATAAGtttt
aatatttcataaaattaaagttttgtaatttttttttgtatttttgcaag
gttattatttttcaataacatttttaaatgaCACTCATTTCGTAATATAT
TGCTTTATATAATGTATTTGTTCGTTAAAATGAGAAAATCTGATATAAAC
tagatgaaaa

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_013370	XLOC_013370	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000462	supercontig	sc0000462:84863..99672 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.712369	0.00049784	0.268943	0	0	0	0	0	3.12992	2.75143	0.299212	0.156922	2.92584e-09	1.31982	0.326707	0.866328	4.67308	3.57735	3.86096	5.62321	10.7941	11.6571	3.48598	1.73621	7.24056e-10	6.58276e-07	0.460749	2.83858	0.402242	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00023795 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00023795 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00023795 (transcript) - C. hemisphaerica