TCONS_00022636 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00022636
Unique NameTCONS_00022636
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1587

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00022636 ID=TCONS_00022636|Name=TCONS_00022636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1587bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00022636-protein

>TCONS_00022636-protein ID=TCONS_00022636-protein|Name=TCONS_00022636-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=430bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000429:27040..69947-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00022636 ID=TCONS_00022636|Name=TCONS_00022636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=42908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000429:27040..69947- (Clytia hemisphaerica)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000429:27040..69947-

>TCONS_00022636 ID=TCONS_00022636|Name=TCONS_00022636|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9030bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000429:27040..69947- (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR001828ANF_lig-bd_rcpt
IPR028082Peripla_BP_I
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00022636 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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