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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00016970 ID=TCONS_00016970|Name=TCONS_00016970|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=227bp
ATGGAAGGTAATGTTAATAATATGGATTTATCATCTGTGGTAATGATGAC
TGTCCAGTCACTCAGTTACAAATACACGCAAGACTAAAATGCATACTGGT
AAAACCATTCAATGGCTGTGGacgtagactggagtcgtttataatgcgtg
taatactaataataccaatactaataataataataataataataataata
cgggatttagtttgtataaacgactgg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000255:108609..118212- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00016970 ID=TCONS_00016970|Name=TCONS_00016970|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9604bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:108609..118212- (Clytia hemisphaerica)
ATGGAAGGTAATGTTAATAATATGGATTTATCATCTGTGGTAATGATGAC
TGTCCAGTCACTCAGTTACAAATACACGCAAGACTAAAATGCATACTGGT
AAGAATTTCTTCTCTTCTCCTTGATATTCTCTATTTGTTTAAACTTCAAA
TTTCAAGCTTTTCAAGTTTTGTTGTCACGAAAAATATTTTTTTTTCTAGG
TACTATGGCATTTTTCATGCTCTGACTATCAAAAAGATATTTAATTTAGT
TCGAGTTCTATGGATTTTGAACTGCTGTTGAAAGGTCGGGGGTATCTTTG
GCGGGAGAAATCTTGGTTACTTCCTCGGGAGGGAGCACACGATTTCTAAA
CGACGGCATAAACCACCAAAATATGCCTTTTAAAATCGAACCCTTAAAGT
GCAGTCCTTGAGCAGTGAAAAGGTGCCCTCACAGCGCATTTTACCGAACG
TTTCTGACCCTTCCAGTGTAGTTCGAATTTATATCTTATTTTGCTGAAGC
CACCTGAAAATGATCCAGAGATTTCGACACAATGTGCAAAACGAATCAAA
ATGGGTGGGAGTCAAAACTATAACGATACATCAGATTTTCAGTAATTCAG
TAATCTCCAAACAAACCCTTACAGTGTATCTAGCTAAGAAAAGACCCTTG
TATTGTATAAGTCACGACAAATATCATTTATTCATGGTTTTTGCAGTTCA
TTCAACTGCTTGATCTTTTTCACTTTAACGGTTTAGTGGAATTTCGTCGG
GAATGGAAGTTTAAAACAATTATGCTTGAGTTTTTAGTTCCCTCTGGATC
CGTAAGTGTAACGATATGTATGAAATCAGATTTGTCCAGTTTATTAAAAA
GTTAAATCTAAAAAGATTTAAAATCAAAAGTCTCGGTAGTCTGGAAAAAA
CTGGAATTTTAAGAAATTTTTAAGAAATGACCAGAGGGGAAGTCGGATTG
GTCTAAAATGCAGGCTACCCCAATTGGGCTAGGTTGGTGGGTAAACCTTT
TTTGCCCAAATATTTGAAGCTTAGTGTTTTAATTTGTGTAATTCCCCAAC
AATTTAATCCCCAACATTCTAACAGAGACTCAAAATGAAAATCAGAACGA
TGGAATAACTCATAACATTAAAAGACAATTTACCTTACACCTAGGGTAAC
TTACACCTTGTAAAGAAATTGCATTAAAAGACAGTTGACAGGACTGTAAC
GCTCGATGGTTTATAATAATACACGGCTACCCCACAACCTAGCCCAATGG
GGTATTGGCTACCCTGTTTTTTAGACCAACCCGGGAAAGTCAGGAAATTT
TGTAAAGCTCTTTTTAAAAGTGAGAGAAAGTCAAGACTTCCCGCAAGGCC
TTGAATTAGGTGCTTCTTATGACATCCCTTTCCAAGACATTCTCGTCTGA
GCCAACCATGGCAGGTCCTGCAAATACTCTCAATACACCCTCTTCTCACG
GTCCCGGTAGGATTTCAGCCAGTGGCTGCAAAAATTTATTGTAAATTTTC
TTGTAAAAAAAAATCGAAATCTCAAACAAGTATTAACAAGAGCTTCAAAA
ATGCGGATAATGAAATCAGGAGAAGGATTACGGAATATAACTGTTGTCTT
TCTCTGATGAAGAATATATTTAACTCTACAATGCCGTGCTTGGTCTATGT
AGTGCCGCCCTGCAATGAGCGTTGCTGCCTATTTAAGCAAACAAGGCAAT
ATCCGTTCATTATTTANATGTAGTGCCGCCCTGCAATGAGCGTTGCTGCC
TATTTAAGTAAACAACGCAATATCCGTCCATTATTTGTTTCATTTACAGT
AGATGATGATTTTTACAACCAAGCAATGGTTTCATTTGAGTTTCGTTAAC
GAGCCATTTATCCGTCAGATGGTATCGGTCGAACGTTAATTCTATTAATA
CCAGTAGTAAAAACGTCAATTTTTAACAAATTCAAATGTTCTTCTTTCAG
GTAAAACCATTCAATGGCTGTGGACTTCAATTGAACGTTGAATATACGTC
AAATGGACCTCGTGAACGTTAGATGGGCGTCGAAACGACATTTGTGTCAC
CGGAGATATACGCATCGTTCATCCCTCCATTGCATACACATACAGGCACT
ATGGTCTTTGTCCCGTCACTCTAAAAAAATACCGCATGCAAATTAAAGAT
TTAAAATATCAGCATATATTAACAGTAAGAATTTTATTTTCCTAACTCGG
GCAATCAGTAAATTCTTTATCAACTATAGACATTGCCAAAAAAGAAATTT
AAATTTTTTTGGATTTTTACTTCATATTGAGAAATCGTATCTATAATTGG
GAATTTGTACGTTACAGTGCACTAGATTAATGTTTTGAAATAACCGTTAA
AAGAAGTAGAAAAAAGTTGTGGTAAAATTTGGTCGGGTGAAATAAGTATT
GAAGTTGATAATACACACTTTACACTTTTTATTGATAGCCATAACTCTTA
TAAGCATATCCAGGCTCAAATCTTAAAAAAAAATTAAGCATTGCCTAAGC
ATATGTATGCTGTCCTTCATTTTACGAAATTTCAAAATATTTTTAATTAT
CTGAAGTACAAAAAAAAGCATGCTTAAAATGTTAAGTACATTATCACATC
ATAGGCATAACATTTAAGCTTATTCGAGGCTCAAAAAATGTATTTTCTTG
CAAAATGAGTCCTCACAAAAATTTACCTTATGCCTTATAAAAAAAGTTGT
AGCCTTTAAAATGTGAGGAAACTTTTGAATATAAAAGGTAGTTACTGACT
TTGTAATGTCTTTTTGGAAAACAGATTTTTCGAAACAATAACCACACGAT
TTGGAGCATTCCATTACCATCCAGGAATAGACTTGTCGATTCTTTGCGAC
GCACAAGCCGTTCTTTTTTAACGTCTCGCAATAAGGACTTTTGTCAGTAC
AATCTAATAAGTAAACAATCTACCAGGTGAATTTTCCCACAAAAAGGTAT
ATTGGACTGAGGATCGTGACANCAGTACAATCTAATAAGTAAACAATCTA
CCAGGTAAATTTTCCCACAAAAATATATTGGACATAGGATCGTGACAAAA
ATACCATTAGATGCTAGAAATTTCCCAGATAACTTGAATTCCTACTTGCA
GCTGTCAGTCCTTTGATATCTAAGTTAATCTATCTTTCTCTAAAGGTGGT
CAGTGATAGAATGCTACTTTTGATTATCTCAAGAGGGAACTTATTTTTGG
CGAGAACTAACTTTGGCAAATTTGAATTTAAAAAACATACTACCTCACCA
AAATAAGTTCCTTGATAAATTTACAACTTTTTAGGATTTTTGCTGTTCGT
CAAAATTAGTTCCCCTAAGAAAGGACTTGACCAGTATTTCTTTTGGGACT
GGTACGTGATAAAACTTCAGGTTATATTCTTTACTAAAGGACGATTTTTT
TATATATTTTTCGGACGGGCAGGGGGTCTCACTGGGTCTGTAGTACGTGG
CTTTTTCAAAGACTTAATAAGTGTTTTACCTTTGCAATATAAGCAACTTT
CTTTGCATGCTTGCGACATCCACTTGGCGTATTTCGGATGATTGCAATAA
TCGTCATCAAAATGATCGGCATAATCGGGACATTTGTCGGAAAGATCGTA
ACAGTCGTCGCCCATCGGTTTCGTTTGATCTATAATCGGGAAAGCTTTTT
TAAAAGACTGAAATTTTATACTGTTAGAAGGGACCTTTGAATTTATGACT
GCGTCTTTTTCTTCAAGTTTAAGTACCGCTGGGCTTATTTATTCAAATAA
AAATCTTAACATTACATGATATCTGCTCACTTTGATGAAATCATTCTCTT
GAGTCACTATGCCTTGTTTCTTACTTTCTTAAAATCGCTTTAAGGCTCAG
AAATTTATTACTCCTTATTTTCGTAGGTAAGTTTGTCCCAAAGTTACTTA
TAATTCTCGCCAAATATGAAAGAAAACATTCAGTTTGCATCAGGAATCGT
CTCGTCATAATCGAATGTTTTTTCCATGATGGTACAATCAAGGTCATAAT
ATTTGAGAAAAAAGGGAAATTCCCCAGGAAGTTTTGAAAACACAATCGAT
TTGTAAGTGCTCTAAAGTAGGTTCGAAGGGTAGAGTTTTAAAGCTAGACT
TAAGACTTAGGATCCAAAAATTCAAAAAAANAGGTCATAATATTTAAGAA
AAAAGGGAAATTCCCCAGGAAGTTTTGAAAACACAATCGATTTGTAAGTG
CTCTAAAGTAGGTTCGAAGGGTAGAGTTTTAAAGCTAGACTTAAGACTTA
GGATCCAAAAATTCAAAAAAAGTCCAATAAGGCTGAGAATATAGCCTGTA
AGTCTGCCAACCCATCCCAAATTGAAATATTTGATTAGATTAAAGAGATA
GCCCAAAAACGACTTTTTCGCCGAAACTTTAAATCTTGAAAACGTTAAAA
TAACCGGAATTCTCAATATATTTCGATCATGATTGTATATTTAGTTTTGC
TAAGTTACATAAGCTCGTCAAGCCTAATAGTTTATCCCTTTTTCCCAAAA
AAGTTCTATCGAAATCTAAAAAAAATCAACCAACTACGAGGGCAAAATTT
GTAGTGGGGTGTGAGTACGACCGGATGCTGTGACACTGGGGTGTTTTTTA
ACTCACTTTTGTTACAATAACCACATGATCTAGCACATTTCCATTCCATC
CAAGCACTGTACTTATCATCAGTGCAATAACCATAACTGACGGACGCGTA
ACCTGGACAATCTCTGTGGTAATTCATACAAGCTGAAAATAAAAAAAATC
AGTTTAAGGCAGATGGCTAGAGAGAAATTATTGGATAGGAAATGAAGTGT
GACCGACGTGGCTTTCAGACAAACGCTGTATTGAAAGTAAAATTTATCGC
TCTAGATCTAGTTAAATATGATGCGCAAAGAAAGAATGCACGATATCCAT
AGTCCATATCCATGATTTGGATGTTTCTCAAATTTGAAGACAATTCTTGC
ACCCTTTGAACGCTTTTTGTGTCGATTCACAATTGCTATTTGATATTATA
CCGACAGATTCTCAATCCTCGGGACATGTCATAAACGGATAGAAATTGTT
AAACAGTTTTGGCAACCTCGTTCCGTGTGTATTACCAGCATTTTCAATGC
TTAGTGATAGCGCTAGATAGTATTCTCTGGCGTCAATCAGTAACGTAGAT
AAAGCCTGGAATACACGGAGACAATGTTGCAGTTTTGGTTGTGTTATGGT
GTGATATTACAAAAGCGCAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAC
AGACAGACAGACTCACGCTCGCAAAAACGGCATGTCTTCTTGCAATCACG
TGTCATTTGTTCTTTCGTATCTTTTTGTCGGCATTCTTTACGACCATTGC
CTGGTGTGACTTTTCTCTTGCAAAAATTAGGAGTCTTGTCCTCGCAAATT
CCTAGAAAAAAACAATTTGTATATGGAATTCTTAAGCACATATAAAATTA
TGCCCCGTTTTTTCCGGGTACAGTGAATGTGCTACGTACAGAAGACAAAT
CAACATATAAGTAGTTTTAACTTAGATTAACTTAGAGGTATTTATAACTG
TGATTATAATTGTATTGTGGTACAATCCTGAACTTAAATGGTGATACAAG
AGTATGATTTGAACTCCCCCTCCCACTCTTTCCCCTAGTGCCGTTGTTAA
AAGAACGGTGAAAAGTCGTTGGGAGGTCGTCTGCTGGGGGAAAGGGTTAC
CTATTTTCCCAGCAATTTTCAGTGGTATTCTGAAACTTTGACGTTATATT
TTGCTCACTTTTTGACAACGTATTATCTACCATGGATAAAGTACTGATAT
TGCTTTCTACCAGAATCTTTGAGGCTCCGAGTTTGAAAGCTAAACTGAAC
TAAAATTAAAAGGAATTCCAAGAACCTAGCAAGAAAATAGCAATCGTTAA
AAGGGTTAAAAAGTTGTGACTAACCGTCTTTCTTTCTTTCATCGTTATCC
CCTGGACAGACAACCTGTCGTTCGCACATGATGATTTGCATTCTCTCTTT
GTCTGCACCACAATTTGGTGGATGCCCATTCAAAGATTCGGGAGTGATGC
AAAAACGGCGTTGAACTTTGAATCCCTTGCCACAAGTTGTCTGCAAAAGA
GAAAGGAAGTTGGTTGCCTAGCTGACACCTAACGTTATTTCAACGTCCAT
CTAACGTTAAAGGGATATAAAAGTAGTAAAATATAACATTGCGCAAACCA
CGTGTCATTAAAGAGAACAATTAAAATCACGTGTCCAAAACAAACTTTTA
AAACAATTGAAACAATTGCAATTCCGATACCGGACACTGGTCTTTACACT
GGCCTTTAATCAGCGTTGTTAAAATTCTTATTGGCTACCACTTACACTAC
AAGTTGAGACGTCAATCCATTCTGTCCATCCGCCTTCACTGGGGATGTAT
AAAAAGTAGACGACTGGTGGTGGTTGCTTCTTCGGTGTCAAATAAGCCTC
TGTCACAGTCACCTCTGAAAAATAAAATAAATTAAAGATGATATTTAATT
ATATCATTAACAAAGGGAAAGTTGGAAAACCTTGTGAAAATAAGAGAGAA
ACTACCGTATTGTTGTCCTAATCNCGACCATTGCCTGGTGTGACTTTTCT
CTTGCAAAAATTAGGAGTCTTGTCCTCGCAAATTCCTAGAAAAAAACAAT
TTGTATATGGAATTCTTAAGCACATATAAAATTATGCCCCGTTTTTTCCG
GGTACAGTGAATGTGCTACGTACAGAAGACAAATCAACATATAAGTAGTT
TTAACTTAGATTAACTTAGAGGTATTTATAACTGTGATTATAATTGTATT
GTGGTACAATCCTGAACTTAAATGGTGATACAAGAGTATGATTTGAACTC
CCCCTCCCACTCTTTCCCCTAGTGCCGTTGTTAAAAGAACGGTGAAAAGT
CGTTGGGAGGTCGTCTGCTGGGGGAAAGGGTTACCTATTTTCCCAGCAAT
TTTCAGTGGTATTCTGAAACTTTGACGTTATATTTTGCTCACTTTTTGAC
AACGTATTATCTACCATGGATAAAGTACTGATATTGCTTTCTACCAGAAT
CTTTGAGGCTCCGAGTTTGAAAGCTAAACTGAACTAAAATTAAAAGGAAT
TCCAAGAACCTAGCAAGAAAATAGCAATCGTTAAAAGGGTTAAAAAGTTG
TGACTAACCGTCTTTCTTTCTTTCATCGTTATCCCCTGGACAGACAACCT
GTCGTTGGCACATGATGATTTGCATTCTCTCTTTGTCTGCACCACAATTT
GGTGGATGCCCATTCAAAGATTCGGGAGTGATGCAAAAACGGCGTTGAAC
TTTGAATCCCTTGCCACAAGTTGTCTGCAAAAGAGAAAGGAAGTTGGTTG
CCTAGCTGACACCTAACGTTATTTCAACGTCCATCTAACGTTAAAGGGAT
ATAAAAGTAGTAAAATATAACATTGCGCAAACCACGTGTCATTAAAGAGA
ACAATTAAAATCACGTGTCCAAAACAAACTTTTAAAACAATTGAAACAAT
TGCAATTCCGATACCGGACACTGGTCTTTACACTGGCCTTTAATCAGCGT
TGTTAAAATTCTTATTGGCTACCACTTACACTACAAGTTGAGACGTCAAT
CCATTCTGTCCATCCGCCTTCACTGGGGATGTATAAAAAGTAGACGACTG
GTGGTGGTTGCTTCTTCGGTGTCAAATAAGCCTCTGTCACAGTCACCTCT
GAAAAATAAAATAAATTAAAGATGATATTTAATTATATCATTAACAAAGG
GAAAGTTGGAAAACCTTGTGAAAATAAGAGAAAACTACCGTATTGTTGTC
CTAATTCCAGATGCCTTTTTTTAACTCTGTCATTTTATTTAAGGATGAAA
AAGATGAAAGATTAAAATAAAAAACTGATTATATTTTCGATCTTGGTAAG
CTGAAAGATCACCAAAGGCTGACGAAATGGCTGACATGAATTAAAATATA
GAGATCAACTAAACGGTATATCATTTATTCAGCTTTCCAATTTTCGCTAA
GCTTCCAATTTTTCTTTTCTTTTAAGACAAGTCTGAGATCATTGTGTTAA
TTTAAGTTAGAGTATGAAATAAAACTTTATTTGGATGGCCGATGAAAATT
TGTCGAGTTTAGCGCTGGATATGAAGATTTATGCCTGTACATATTTTTTA
TAAACAACTCCAATTTTCAGAGGTGGAGTTGCTAAGGATTTTCAGGATTA
TTAGGATATCAAACTTTATAATTTCGCTGATGGATTTAACCAAGATTGAC
TTTTTACGCTCGACTTTGATAATGTTAATGTCGGGATAACAAAAAATTTT
TTTTTAGGTGCTTATGGTTGCCTTCACAGTCCATAATTAGTTTCAGGGCA
ATATTTGTAAGCCAAGTTACTTGTATTTTTAGTAATTTTTAGGGCCGGGT
CTTTAGCACTCTGTTCGTGTTTATTGCAAAATGTAGCNGTAATTTTTAGG
GCCGGGGGTCTTTAGCACTCTGTTCGTGTTTATTGCAAAATGTAGTTTCC
CAGCTGGTGCAAAACGTTGTTTCAACGTCATCTAATGTTCACAACGTCCA
TATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAGCGTTGTGTGCCAAGCTGGGTTGG
AACTTACTTTCTTTAGGTTTCGGGATTCTGTAGCTGCTTTTGTAAAAATC
ATTTTCGTTTGGAACACCATCGAAACGAGCTACAGTGTAGGTACATTCGA
TATCGTAATCATAAGATATTCCCACACCAAAATATTTTGTTGTCGGCCAC
ATTAGTGCTATAAAATGACCGTGGCCGTTCGCATCCACGTTGTACACTGG
TTTATCGTAGTTGTAATGGGTACCTTTGAATTGTTCACTTATAAAAAAAC
AGAATGAAATATTTCACATGTTAAAAGTAAGTGGCGCCACTAATCGGGGA
TGACTGACAGTTGATATACAAACATTCGCTTATTCGAGCTTCTTTTATGC
GAATCTTTCTATAATTCGATCTTGTTTCCAGCCCCATTTAGTACCTTCTA
TAAAGTATTTTCTCTTTGTAACTCGAACGAATAACATTCCCGTTCGAGTT
CGAATTAGCGGGAGACAGACCTAGTTTAGACAGTCGACTTTCTGCCTTGC
CTCCTTTCGATGTGAGAGACGGCACAAGATTGACGGTAAATTTGCAGATT
AATGAATTAAATCAGGAGAAGGATTACGGAATATAACTGTTGTCTTTCTC
TGATGAAGGATATATTTAACTCTACAATGCCGTGCTTGGTCTATGTAGTG
CCGTCCTGCAATGAGCGTTGCTGCCTATTTAAGTAAACAAGGCAATATCC
GTCCATTATTTGTTTCATTTACAGTAGATGATGATTTTTACAACCAAGCA
ATGGTTTCATTTGAGTTTCGTTAACGAGCCATTTATCCATCAGATAGTAT
TAGTCGAACGTTAATTCTATTAATACCAGTAGTAAAAACGTCAATCTTTA
ACAAATTCAAATGTTCTTCTTTCAGGTAAAACCATTCAATGGCTGTGGAC
GTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGTAATACTAATAATACCAATACTA
ATAATAATAATAATAATAATAATAATACGGGATTTAGTTTGTATAAACGA
CTGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1575043694:118115..118212 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1575043694:118115..118212 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1575043694:108609..108737 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1575043694:108609..108737 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1510915933:118115..118212 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1510915933:118115..118212 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1510915933:108609..108737 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1510915933:108609..108737 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1491911889:118115..118212 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1491911889:118115..118212 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00016970-exon-sc0000255-1491911889:108609..108737 | TCONS_00016970-exon-sc0000255-1491911889:108609..108737 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000255 | supercontig | sc0000255:108609..118212 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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